KEGG   Plasmodium falciparum Dd2: PFDG_02112
Entry
PFDG_02112        CDS       T01051                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K03002  DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2 [EC:2.7.7.6]
Organism
pfd  Plasmodium falciparum Dd2
Pathway
pfd03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfd00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    PFDG_02112
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pfd03021]
    PFDG_02112
Enzymes [BR:pfd01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     PFDG_02112
Transcription machinery [BR:pfd03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Core subunits
     PFDG_02112
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_1 RNA_pol_Rpb2_7
Other DBs
NCBI-ProteinID: KOB86462
UniProt: A0A0L7M0U3
LinkDB
AA seq 1517 aa
MAEEVNRNIKGTSELINNNKVDKSFLKNINLQITDGEIKLHLKIIEALYPNMKLKVDKLI
NGSYNIFTKFLVQSHIDDFNSFINVYIKNIAENIPIMEFSPQQNNYSLLNMNKNNSESVK
FFVSDIQIKNPMIKNDKGEYRADYPYLCKLSARTYEGELLIKINRQYKDEIASTTICAGH
IPIMIMSNLCNLSNLNKKELAQKGEDQSLLGGFFVVSGRLKVIRYVIHPKYNTLLLNADN
KIHINCLLNDNTVVINFLTLTRNNSYVYGFRFQNAVCSLPFHLLLMILSPIKKKSYIFNK
IKLGVENENAIKYIELFINSIFLKDTFNEKELFEKYNLSYLGRIAYLRRGIFKYNLNCYE
KKAKDILKYCILPHIKNNSEKFETMCFMFKKLIYSNFKLITPINKDSLENHAVTTCSNLL
ANLLKDQVMNSLCRLYIRYTRSFFKYFETKYNTFKLSVKQIYLRYKMFVLEEMQEDRLNQ
ISLSKSSEDINDSSYQDNNDYKNESKKKLKSIFINEKEKLFRSVDNYFKELYNDNYMFLE
NCKSFSNTSSAILFFFKTGNISSENLHYQQKSGWVIAADEINNLRLITNFRAIHRGTFFQ
DVKVLTPRKLLGESWGFICPVHTPDGTPCGLLNHLAQYCHIHNLSSNEAHKLNIKLYLKK
IGINVNLDDTSGIHTIYDDENIPIIVDSIPITYIGEKDFNRTVYKLKYAKNNNLFNLKSY
FEINAYLNEPLIMNSIIINTFPGRLIRPLLNLKTKDIEFISPSYQPYISVAINNEDVKKN
NLARKLLKKKEQVVNSMKIDRTPGSIKQKFLYHQNRENLLWKLKKESKDGSYKYEKHKID
RKLLKILDQKKNNDSDTNTDNYVSSSEYDTDSDYDYGYDSNSDGDSKSNSNFDSKSDNIS
GSDNNMSTTTYIDSDENINIDMYEQIPQKFEYMELKETSFLSFLASLTPFSDHNQSPRNI
YQCQMLKQTMGIQSLNNVYTFTNKIYRMITPQFPLVVTRDYEFYGVDNFPSGTNAVVAIL
AYTGYDMEDALIINKASADRGIFRTHIYKTEFIDLQKVGESSNFVFGNNIRYLNNNKNNN
KNLAYENKGKFLNKDGLPCVQQKITEGSPLYSYINKGNELTTYESFRNHGEYFVDFVSIG
KNNSNQVAVVKLRSTRQPQVGDKFASRHGQKGVVSRLFPQEDMPFAESGIVPDIIFNPHG
IPSRMTIGMLIESICGKAASLYGKRIDATPFRKYTQQKSFNNPWIDNCGIKGFLEKNDTI
KSDLDTCQKEKDKNKNINNNNNNKIKENKYNNSNDSNASIDSDDNTNNCNDKRDEEEKKA
NITYDEKIDYFAKLLLNKGYDYYGTELLYSGIYGVPLQAHIFIGVIYYQRLRHMAYDKAQ
VRRTGPVCNLTHQPLKGKRKHGGIRVGEMERDGIISHGCSFVINERFLMSSDGHECFVCP
KCGLILSPIMQFNTTGKIMKGRSIGGKSKMAVCKSCDVSCKIIFIPYVIRYLLNELICLN
VTIRLNMKSVENVFDMK
NT seq 4554 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcagaggaggtaaatagaaatattaaagggacgtctgaattgattaataataataaa
gtagataaaagttttttaaaaaatatcaacctacaaattacggatggagaaataaagtta
catttaaaaattattgaagccttatatcctaatatgaaattaaaagtcgataaattaata
aatggaagttataatatttttaccaaattcttagtacaatcacatatagatgattttaac
tcctttataaatgtttatataaaaaatattgctgaaaatataccaataatggaattttca
cctcagcaaaataattattctcttttaaatatgaataaaaacaattctgaatctgtaaaa
tttttcgtgagtgatatacaaataaaaaatccaatgataaaaaatgataaaggagagtat
agagcagattatccttatttatgtaaactatctgcaagaacatatgaaggagaattatta
ataaaaataaatagacaatataaagatgaaatagctagtacaaccatatgtgctgggcat
attccaattatgattatgtccaatttatgtaatttaagtaatttaaataaaaaagaatta
gctcaaaaaggagaagatcaaagcttattaggtggtttttttgtagtatctggaagatta
aaagtaataagatatgtaattcatccgaaatataatacattattactaaatgctgataat
aagatacatataaattgcttattaaatgataatactgttgtaattaattttttaacatta
actagaaataattcatatgtttatggattcagatttcaaaatgcagtatgttctcttcct
tttcatttattattaatgattctaagtccaatcaaaaagaaaagttatatttttaataaa
attaaactaggagtagaaaatgaaaatgccattaaatatatagaactttttattaattct
atatttctaaaagataccttcaatgaaaaagaactttttgaaaaatataatttaagttac
ttaggtaggattgcctatttaagaagaggtatttttaaatataatttaaattgctatgaa
aaaaaagcaaaagatattttaaaatattgtatattaccgcatataaaaaataattctgaa
aaatttgaaaccatgtgttttatgtttaaaaaattaatctatagtaatttcaaattaatt
actcctataaataaggattctttagaaaatcatgctgtaactacatgtagtaatttatta
gcaaatttgttgaaagatcaagtaatgaattctttatgtcgtttgtacattagatataca
agatccttttttaaatattttgaaactaaatataacacattcaaattaagtgttaagcaa
atatatttgagatacaaaatgtttgtgttagaggaaatgcaagaagaccgcttaaaccaa
atatctttgagtaaatcatctgaagatatcaatgattctagttatcaagataataacgat
tataagaacgaatcaaagaaaaaactcaaatccattttcataaatgaaaaagaaaaatta
tttaggagtgtcgataattatttcaaagaattatataatgataattatatgtttttagaa
aattgtaaaagtttttcaaatacttcatcagctattttatttttctttaaaacaggaaat
atctcctcagaaaatttacattatcaacaaaaaagtggttgggtaatagcagcagatgaa
attaataatttaagattaataaccaattttagagctatacacagaggaaccttttttcaa
gatgttaaagtattaactcccagaaaattattaggagaatcatggggtttcatatgccct
gtacatactcctgacggtaccccttgtggtttattaaatcatttggctcaatattgtcat
attcataatttatctagtaatgaagcacataaactcaatataaaattgtatcttaaaaaa
ataggtataaatgtaaatttagatgatactagtggtatacatacaatatatgatgatgaa
aacattccaattattgttgattcaatacccattacatatataggtgaaaaagattttaat
agaacagtgtataaattgaaatatgcaaaaaacaataatttgtttaatttaaaatcatat
tttgaaataaatgcttatttaaatgaaccgttaattatgaacagtataataattaataca
tttccaggaagacttatacgacctttattgaatttgaaaacgaaagatattgaatttatt
tcaccatcctatcaaccatatatatctgtagctataaacaacgaagatgtaaaaaaaaat
aatttagctagaaaacttttaaaaaaaaaagaacaagttgttaattcgatgaaaatagat
agaacccctggaagtataaagcagaaatttttatatcatcaaaatagggaaaacttatta
tggaaattaaaaaaggaatcaaaagatggctcatataaatatgaaaaacataaaattgat
agaaaattattaaaaattttagatcagaaaaaaaataacgattcagatacaaatacagat
aattatgttagtagttctgaatatgatacagattcggattatgattatggttatgattct
aattctgatggtgattcaaaatctaactctaattttgattcaaaatctgataatatatca
ggaagtgataataatatgtcaacaactacatatattgatagtgatgaaaatattaatatt
gatatgtatgaacaaataccacaaaaatttgaatatatggaactaaaagagacatcgttt
ttatcctttcttgcttctttgactcctttttcagatcataatcaaagtccgcgtaatatt
tatcagtgccaaatgttgaaacaaactatgggaatacaaagtttaaataatgtatataca
ttcacaaataaaatatatcgaatgataactcctcagtttccattagttgtaacaagagat
tatgaattttatggagtagataattttcctagtggtacgaatgccgtagtggctatatta
gcttatacaggatacgatatggaagatgcattaataataaataaagctagtgcagataga
ggtatatttcgaacacatatatataaaactgaatttattgatttacaaaaagttggagaa
tctagtaattttgtgtttggaaataatataagatatttaaataataataaaaataataat
aagaatttggcttacgaaaataaaggaaaatttttaaataaagatggtttaccttgtgta
caacaaaaaataacagagggtagtccattatattcatatattaataaaggtaatgaatta
actacttatgaatcttttaggaaccatggagaatatttcgtagactttgtaagtatagga
aaaaataattcaaatcaagtagcagttgttaaattaagatcaacaagacaaccacaagtt
ggtgataaatttgcatctagacatggacaaaagggggttgtttctcgattatttcctcaa
gaagatatgccatttgctgaaagtggaatcgttcctgatattattttcaatcctcatggt
attccatctcgtatgactataggtatgcttatcgagagtatttgtggaaaggctgcatct
ttatatggaaaaagaatagatgctactccatttagaaaatatacgcaacaaaaaagtttt
aacaatccatggattgacaattgtggtatcaaaggtttcttggaaaaaaatgatacaata
aaatctgacttggatacatgtcagaaggaaaaagataaaaataaaaatattaataataat
aataataataaaataaaagaaaataaatataataactcaaatgatagtaatgcatctatt
gatagtgatgataatactaacaattgtaatgataaacgtgatgaagaagaaaaaaaagct
aatataacttatgatgaaaaaattgattatttcgctaaattgttattaaacaaaggatat
gattattatggcactgaattgttatatagtggtatatatggggttccattacaggcacat
atatttattggtgtaatttattatcaaaggttaaggcacatggcttatgataaagctcaa
gtcagaagaacaggaccagtgtgtaacttaactcaccaacccttgaaaggaaaaagaaaa
catggtggtataagagttggagaaatggaaagagacggtataatatcacatggttgtagt
tttgtaatcaatgaaagatttttaatgagttctgatggacatgaatgttttgtttgtcct
aaatgtggacttattttatcaccaattatgcaatttaatacaactggaaaaataatgaaa
ggaagatctattggtggaaaaagtaaaatggctgtatgcaaatcttgtgatgtttcttgt
aaaattatttttattccgtatgttatacgatatttattaaatgaactcatttgtttaaat
gttaccataaggttgaatatgaaatcagtggaaaatgtttttgacatgaagtaa

DBGET integrated database retrieval system