KEGG   Plasmodium falciparum Dd2: PFDG_03504
Entry
PFDG_03504        CDS       T01051                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K10843  DNA excision repair protein ERCC-3 [EC:5.6.2.4]
Organism
pfd  Plasmodium falciparum Dd2
Pathway
pfd03022  Basal transcription factors
pfd03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfd00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03022 Basal transcription factors
    PFDG_03504
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    PFDG_03504
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:pfd03021]
    PFDG_03504
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pfd03400]
    PFDG_03504
Enzymes [BR:pfd01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     PFDG_03504
Transcription machinery [BR:pfd03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase II system
   Basal transcription factors
    TFIIH
     PFDG_03504
DNA repair and recombination proteins [BR:pfd03400]
 Eukaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TFIIH complex
     PFDG_03504
SSDB
Motif
Pfam: ERCC3_RAD25_C Helicase_C_3 ResIII Helicase_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: KOB87345
UniProt: A0A0L7M483
LinkDB
AA seq 827 aa
MNSLKDSSNYSPNLSHTRGSRKRSDIFNENYYAKNLKRRKLKAAKKLKDSTNGEFTKKVK
KQLKDYYEMRFDKKVINLPFSTDSINIQQRGFHDYSKDMKLKKNHMNKPLWICSDGFIYL
EMFNSCSKQASDFLITIAEPICRPELIHEFQLTIFSLYAAISVGITLDELLINLDKFSKN
VLPNELISNITKSAESFGKVKLVLRENKYYIEATNKSELDYLLNNDTIQNARIYSTDNNN
DKNMISLYNLNNRHRDNNKNDNKNNNDDNNNIDKTTKVYSFEVNCDKIEEVKQEALQTMQ
RPLLMEYDFRRDKKNPNLICSLKSHVQIRYYQEKALRKMFSNGRSRSGIIVLPCGVGKTL
TGITAASTIKKSALFLTTSAVAVEQWKKQFEDFTNIHPRHIRILTSDYKLDLWPINEAGV
LISTYTMLSYSGKRSEQSLRIVNDIRRREWGLLVFDEVQFAPAPSFRRINDIVKSHCKLG
LTATLVREDLLIRDLHWIIGPKLYEANWVELQNKGFLAKALCKEIWCSMPCSFYKYYLKS
NSFIKRRLYTCNPRKLMMCEYLIKYHEQNNDKIIVFSDNIFALLHIAKTLNKPFIYGKLS
PIERIAIINKFKPDSSINTILLSKVGDNAIDIPIANVVIQISFNFASRRQEAQRLGRIIR
PKNKANEKKNINDPDSFFYSLVSKDTIEMCYSDKRQRFLINQGYAYNVLSDNIVDFNKLN
LVYKNKKIQENLLKCILASTDDGNMDEDDDLFEDQSFKKDNTKVNKTNSNILLNKKEDSL
KKIDNTTGGLLKLSSNMDVTFADKKKIPTKKFADKHILFRKFLSQNK
NT seq 2484 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatagtttgaaggattcatctaattatagccccaatttgtctcatacaagaggttca
aggaaaagatcagatatttttaatgagaattattatgcaaaaaatttaaaaagacgtaaa
ttgaaggctgccaagaaattaaaagatagcacaaatggagaatttacaaaaaaggtaaaa
aaacaattaaaagattattatgaaatgcgatttgataaaaaggtaataaacttaccattt
agcacagattcgataaatatacaacaaagaggttttcatgattatagtaaagatatgaaa
ttaaaaaagaatcatatgaataagcccttgtggatatgttcagatggatttatatattta
gaaatgtttaatagttgtagtaagcaagcatctgattttttaataacaatagctgaacca
atatgtagaccagaattaattcatgaatttcaattaacgattttctctttatatgctgca
atatcagttggtataacacttgatgaattattaattaatttagataaattttctaaaaat
gttttacccaatgaattaatatctaatatcacaaaaagtgctgaatcgtttggaaaagta
aaattagtgttaagggaaaataagtattatatagaagcaacaaacaaatcagagttagat
tatttattaaataatgatacaatacaaaatgcaagaatatattctactgataataataat
gataaaaatatgataagtttgtataatttgaataataggcatagagataataacaaaaat
gataataaaaataataacgatgataataataatatagacaaaactacaaaagtatattct
tttgaagtaaattgcgataagatagaagaagtaaaacaagaagcattgcaaacaatgcaa
agacccttattaatggaatatgattttagaagggataagaagaatccaaatttaatatgt
tctttaaagagtcatgttcagataagatattatcaagaaaaggcactgaggaaaatgttt
agtaatggtagaagtcgctcaggtataatagtgttaccttgtggtgtaggtaaaacatta
accggtataactgcagcaagtactattaaaaagtctgctttatttttaacaacatcagct
gtggctgtagaacaatggaagaaacaatttgaagatttcacaaatatccatccgagacat
attagaatattaacatcagattataaattagatttatggccgattaatgaagcaggtgta
ttaatatcaacatatactatgctttcttattcaggaaaaagaagtgagcaaagtttaaga
atagtaaatgatataagaagaagagaatggggtttattagtttttgatgaagtacaattt
gctccagctccatcatttagacgaataaatgatattgtaaaatcacattgtaaacttggt
ttaacagctaccttagtaagagaggatttattgattcgagatttacattggattattggt
cctaaattatatgaagctaattgggtagaattacagaataaaggttttttagcaaaggcc
ttatgtaaggaaatatggtgtagtatgccatgttcgttttataaatattatttaaaatca
aatagttttattaaaagaagactatatacatgtaaccctagaaaattaatgatgtgtgaa
tatttaataaaatatcatgaacagaataatgataaaattattgtttttagtgataatata
tttgctttattacatatagctaaaactttaaataaaccatttatatatggtaaactatca
ccgattgaaagaatagcaattattaataaatttaaacctgactcttcaattaataccata
ttattaagtaaagtaggagataatgctattgatatacccatagcaaatgttgttatacaa
atttccttcaattttgcttcaagaagacaagaagctcaaagattaggaagaattattcga
ccaaaaaataaagctaatgaaaaaaaaaatattaatgatcctgattcctttttttatagt
ttagtaagtaaagatacaatcgaaatgtgttattctgataaaagacaaagatttcttatt
aaccaaggatatgcttataatgtgcttagtgataatattgtcgattttaataaacttaat
ttggtttataaaaataaaaaaattcaagaaaatttgctcaaatgtattttggctagtacg
gatgatggaaatatggatgaggatgatgatttatttgaagaccagtcttttaagaaagat
aatactaaagttaataagaccaattcaaatattttattaaataaaaaagaggattcatta
aaaaaaatagataatactacaggaggattattaaaattatcatcaaatatggatgtaaca
tttgctgataaaaaaaaaatacccacaaaaaagtttgcagataagcatatactttttaga
aaatttctaagtcaaaataaatga

DBGET integrated database retrieval system