Plasmodium falciparum HB3: PFHG_00744
Help
Entry
PFHG_00744 CDS
T01052
Name
(GenBank) pre-mRNA-processing-splicing factor 8
KO
K12856
pre-mRNA-processing factor 8
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PFHG_00744
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pfh03041
]
PFHG_00744
Spliceosome [BR:
pfh03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
PFHG_00744
Complex C
U5 SnRNP specific factors
PFHG_00744
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PROCN
PRP8_domainIV
U6-snRNA_bdg
PRO8NT
U5_2-snRNA_bdg
RRM_4
PROCT
JAB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KOB58992
UniProt:
A0A0L7K6P7
LinkDB
All DBs
AA seq
3154 aa
AA seq
DB search
MSHNGSFEQSSEDNKNEGSDVLTNSTQHLENNVINNYDDANKSDELNSSHNVMNDKASVE
NKQDNMCNNINDIFFDKPDNINNNNNNNEKNNMNDINNIPQNVPNGFINNIGNVPYNNMN
AFPPNMPKLPTNMPFLPPNMPILPPHLQHMPNVLPHLQNMPNVPPHLASFPNMINLPNLP
PHMHNLPPNMHSLPPHMHNLPPNMHSLPPNMNYIPPGINNYMPNMMNMPPPYMMKMPNMK
MKSNKIINNVSNNVADNVRNSNLYNEEGIQPNNIHNNIHNNIHNNNNDHGGQDINSSPYY
LSQGSYLPNNIKMNNNEIDQLEVNGLSLSSPFNEQQKKKKDMNNKNKKAKKYHDFEGDEE
NYNTSERDENSMYDSNAFSIIKEKARKWKMLNSKKYSKKKKFGVVEEKEEMPCEHLRKIV
KEHGDMSNKKYRYDKRVYLGALKYIPHAVFKLLENIPMPWEQIKNTKVIYHITGAITFVN
ETFVVIDPLYIAQWGTMWIMMRREKRDRKHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDIEPLEC
IQMKLDKDEDKSVIDWFYDSKPLLYNRNHIPGTSYKKYKLSLEQMGVLYRLGNQLFSDFQ
DDNYFYLFNLKSFYTAKALNMAIPGGPKFEPLYRDIYEDDEDWNEFNDINKIIIRQQIRT
EYKIAFPYLYNNRPRKIAVSKYHSPMCVYIKLEDIDLPPFYFDLIINPIPSYKIRKFNKS
SEKKDSELFDDDFYLTYTRKEIYYYDHGDDDEKKKSTSKSRKHSKHSDADDNRYDKGYRK
YRKSSSSYKSFKRDKRKSTNSSNDKDIDEEDYNSGVSSIDNNDNSDTYISSSKYNSNNMS
SRTSKNKDETYEIDSTVENDSHDGSLKKEKNKKKRKNPYNDDNYKGDDKNKSDDDDNYKG
DDKNKSDDDDNYKGDDNNDNNNKYKSDNISSCKKNKKMIIKHVEYGILPLLHNYPLYTER
TINGIQLYHAPYPFNKKCGYTRRGIDIPLVQSWFKEHISTKYPVKVRVSYQKLLKCWVLN
HLHSKRPKSMKKKYLFRIFKSTKFFQCTEMDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLH
LDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKSIVDSHVQYRLGNIDAYQLADG
IQYIFAHVGQLTGMYRYKYRLMRQVRMCKDLKHLIYYRFNTGSVGKGPGCGLWAPLWRVW
IFFLRGVIPLLERWLSNLLARQFEGRVSKGIAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDIIDMI
PEGLKNNKGKARLILQHLSEAWRCWKANIPWKVVGLPLPVENIIIRYIKLKADWWVNATY
YNRERIKRGATVDKTVCKKNLGRLTRLWLKAEQERQHEYLKDGPYVSGEEAVALYTTAIH
WFESRKFTHIPFPPLNYKHDTKLLILALEKLKETFTVKNRLNQSQREELGFIEQAYDNPY
ETLSRIKRHLLTQRAFKEISISFLDLYTHLVPVYEVDPLEKITDAYLDQYLWYEGDLRNL
FPNWVKPSDNEPQPLLVYKMCQGINNLHNIWDTKNNECVVMLQTQFSKIYEKIDLTLLNR
LLRLIVDHNIADYITAKNNTNITFKDMNHINSFGIIRGLQFSSFVFQYYTIIIDLLILGL
TRAYDIAGPYNDVNQFLTFQNVQIETRHPIRLYCRYVDKIWILFKFTNEESKDLIQKFLT
ENPDPNNENIVGYNNKTCWPRDCRMRKMKHDVNLGRATFWEIQNRIPRSLTSLDWDHYNT
FVSVYSKDNPNLLFSIAGFEVRILPKIRQLSYGYNGIMYTSYMNEYPRGVGTKDETSKKN
GLLHDDEKSKKVGSLKDEVTKGKSHVDKNEENSDNNKNDNKNDSTHANTHDMVGDNNYDG
GVKNNFYNSSGGEKNVVVSSSVKEGTWKLQNEMTKEITAEAYLKVSDNSMKRFENRVRQI
LMSSGSTTFTKIANKWNTTLIGLMTYFREAVLDTEELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKM
PSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHILIPESDLRYMKQTDNGRITHFRSGLSHEEDQLIP
NLYRYISTWESEFLESQRVWCEYALKRNECHNQNKKITLEDLEDSWDKGIPRINTLFQKD
RHTLAYDKGWRIRQLFKQYQIIKSNPFWWTNQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILE
HTLFKGTFFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRAN
VYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESLVMDICQVFDLNCDLLDI
ETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFANYKWGISKPSLLTDEDHIFTNNTLGSTSGTNNN
IMLNSNMINSGSNNSSSNNMNSVSFGSFPYTSNQFWIDIQLRWGDFDSHDIERYSRAKFL
DYTTDNLSIYPCLTGVLIGVDLAYNLYSAYGNWFNNLKPLMQKALQKIVQSNPSLYVLRE
RIRKGLQLYSSEPTEPYLNTQNYNELFSSQTIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPING
AIFILNPKTGQLFLKIIHTSVWIGQKRLSQLAKWKTAEEVASLIRSLPIEEQPKQIIVTR
KGMLDPLEVHLLDFPNIIIKGTELNLPFQALLKLNKIGDLILKATQPQMLLFNLYDDWLN
SISSFTAFSRLILILRSLHINPQQTKILLQPNKNIVTTQPHHIWPSFNNNQWIHLEVQLK
DLILNDYSKRNNVHIASLTQNEIRDILLGMEITPPSIQRQQIAELEKNNLDLMEQQMKVT
TSKTTTKHGNEIIVSTLSPHEQQTFTTKTDWKIRYLANNSLLFRTKNIYVNNNNMSNMSN
INTISASASSHNILNKNGTNSDNQNSHYHTSINSINDYTYVIAKNLLEKFICISDLKIQV
GGFLFGSSPEDNSYVKEIKCILIPPQIGNYQSVTLSSYMPSSKYLQNLELLGWIHTQTTN
CSNTNNHLTAYDMVAHFNFLQECKRQMSKGKKVADASHNDDDVDDYDDDDYNNNEDDYNN
NNEDDNINNNSEGGTKRDETYKMWDKNKTIILTCSFTPGSCTINAYKLTSDGYSFAKSKK
NSSDLYVFPNVNNLYEPVQILLSNVFVGYFLIPDDHIWNYNLMGIKFNNNQKYTPHLDIP
QPFYADIHRPNHFLQFSLLDQRDADEADVETSFI
NT seq
9465 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtcataatggatcatttgaacaatcttcagaagataataaaaatgaggggagtgac
gttttaacaaattccacacaacatttggaaaataatgtaattaacaattacgatgatgca
aataaaagcgatgaattaaattcatcacataatgtcatgaatgacaaggcaagcgtggaa
aacaaacaagataatatgtgtaataatatcaatgacatattttttgataaacctgataat
attaataataataataataataatgaaaaaaataatatgaatgatataaataatatacca
caaaatgtacccaacggttttataaataatattggaaatgttccatataataatatgaac
gcatttcctcctaatatgcccaaattaccaacgaatatgccatttttaccaccaaatatg
cccattttaccaccacacttgcaacacatgccaaacgtattaccacatttacaaaatatg
ccaaatgtcccaccacatttagcaagttttccaaatatgataaacttgcctaatttacca
ccacatatgcataaccttcccccaaatatgcatagtcttccaccacatatgcataatctt
ccccccaatatgcacagtcttccaccaaatatgaattacataccaccaggtataaataat
tatatgccaaatatgatgaatatgccacctccttatatgatgaaaatgccaaacatgaaa
atgaaaagtaataaaattattaacaatgtatcaaataatgtagcagataatgtaagaaat
tccaacttatataatgaggagggaatacaacctaataatattcataataatattcataat
aatattcataataataataatgatcatggtggacaagacataaactcttctccttattat
ttatcacaaggttcatacctacccaataatataaaaatgaataataatgagatagaccaa
ttggaggtgaatggactctctttgtcatcaccttttaatgagcaacaaaagaaaaaaaaa
gatatgaacaataaaaacaaaaaagcaaagaaatatcacgattttgaaggggatgaagaa
aattataatacaagtgaacgagacgaaaattcgatgtatgattcaaatgcattttctatt
ataaaggaaaaagctcgaaaatggaaaatgctaaatagtaagaaatattccaaaaaaaaa
aagtttggtgtagtagaagaaaaggaagaaatgccatgtgaacatttaagaaaaattgtt
aaggagcatggtgatatgagtaataaaaaatatagatatgataaaagagtttatttaggt
gctctcaaatatatcccacatgctgtctttaaattattagaaaatattcctatgccatgg
gaacaaataaagaatacaaaagtaatttatcatataacaggtgctataacatttgtaaat
gaaacatttgttgtcatcgacccattatatatagcacaatggggtactatgtggataatg
atgagaagagaaaaaagagatcgaaagcattttaaaagaatgagattcccaccatttgat
gacgaagaaccacctttagattatgcggataatatcctagatattgaaccattagaatgt
atacaaatgaaattagataaagatgaagataaaagtgttattgattggttttatgattct
aagccattattatataatagaaatcatatacctggtactagttataaaaaatacaaattg
tcgttagaacaaatgggagtattatatagactgggaaatcaactatttagtgatttccaa
gatgataattatttttacttattcaatttaaagtcattttatacagctaaagcattaaat
atggctataccaggagggcctaaatttgaacccttatatagagatatatatgaagatgat
gaagactggaatgaatttaatgacataaataaaattattatacgtcagcaaataagaaca
gaatataaaatagcatttccatatttatataataatagaccaagaaaaattgcagttagt
aaataccattcaccaatgtgtgtatatataaaattagaagatattgatttgccaccattt
tattttgatttaattataaatcctataccatcctataaaattagaaagtttaataaatct
tctgaaaagaaagacagtgaactatttgatgacgatttttatttaacatatacaagaaag
gaaatttattattatgatcatggtgatgacgacgaaaaaaagaaatcaacctccaagagt
aggaaacattccaaacattctgatgctgatgataatcgatatgataaagggtatcgaaaa
tacaggaaaagttcgtcatcttataaaagttttaaaagagataagagaaaaagcacaaat
tcaagtaatgataaagatattgacgaagaggactataattctggtgtaagtagcattgac
aataatgataatagtgatacgtatatatccagtagtaaatataactcgaacaatatgagt
agtcggacaagcaaaaataaagatgaaacgtatgaaattgatagtactgtggaaaatgat
tcacatgatggtagtttaaaaaaagaaaaaaataaaaaaaaaagaaaaaatccgtacaac
gatgataattacaaaggtgatgataaaaacaaaagtgatgatgatgataattacaaaggt
gatgataaaaacaaaagtgatgatgatgataattacaaaggtgatgataataatgacaat
aataataagtacaaaagtgataatattagttcctgcaaaaaaaataaaaaaatgattatt
aaacatgtggaatatggaattctcccattgttacacaattatcctttatacacagaacgt
actataaacggtatacaattatatcatgctccttatccatttaataagaaatgcggatat
accagaagaggtatcgatattcctttagtacagtcatggttcaaagaacatatatcaaca
aaatatcctgtaaaggttagagtctcttatcagaaacttttaaaatgttgggttttgaat
catttacattctaaaagaccaaaaagtatgaaaaagaaatatttatttcgtatatttaaa
agtacgaaattttttcaatgtacagaaatggattgggtggaagttgggttacaagtatgt
cgacaaggttataatatgttaaatttattaatacatcgtaagaatttaaattatttacac
ctagattataattttaatttaaaacctgtaaaaacattaacaaccaaagaaaggaaaaaa
tctcgatttggtaatgcatttcatttgtgtagagaaatattaagattaacgaaatcaatt
gttgattcgcatgtacaataccgattaggtaatatagatgcatatcagctagctgatggt
attcaatatatttttgctcacgttgggcaattgactggtatgtatcgatataaatatagg
ttgatgagacaagtacgtatgtgtaaagatttaaaacatttaatatattatcgatttaat
actggatctgttggtaaaggtcctggttgtggtttatgggctcctttatggagagtgtgg
atttttttcttaagaggtgttatcccactattagaaaggtggttaagtaatttattagct
agacagtttgaaggaagagtatcgaaaggtatagcaaaaacggttactaagcaaagagtc
gaaagtcatttcgatttagaattgagagcagctgttatgcatgacattatagatatgata
ccagagggattaaagaataataaaggtaaagctagattaatattacaacatttaagtgag
gcatggaggtgttggaaagcgaacataccatggaaagtggtagggcttccattacctgtg
gaaaatataataattagatatataaaattaaaagcagattggtgggttaatgcaacgtat
tataatagagaaagaataaaaagaggggcgaccgtagataagactgtatgtaaaaagaat
ttaggtagattaactagattatggcttaaagcagaacaagaaaggcaacatgaatattta
aaagatgggccttatgtaagtggagaagaagcagtagcattatatacgacagctatacat
tggtttgaatcaagaaaatttacacatataccttttcctcctttaaattataaacatgat
acgaaactactaattttagctttagaaaaattaaaagaaacctttactgtaaagaataga
ttaaatcaatcacaaagagaagaattgggttttattgaacaggcatatgataatccatat
gaaacattatcaagaataaagagacatttattaacacaacgagcttttaaagaaatatct
atatcctttttagatttgtacacgcatttagtacctgtatatgaagtagaccctttagaa
aaaataacagatgcatatttagatcagtatttatggtatgaaggtgatttaagaaattta
tttccgaattgggttaaaccatcagataatgagccacaaccattattagtatataaaatg
tgtcaaggtatcaataatttacataatatatgggacacgaagaacaatgaatgtgtagtt
atgcttcaaactcaatttagtaaaatttatgaaaaaattgatttaactttattgaatagg
ttattaagattaatagtagatcacaacatagcagattatataacagcaaagaataatact
aatataacatttaaagatatgaatcatataaattcgtttggtataatacgtggtttgcaa
ttttcgtcatttgtatttcagtattataccataataatagatttgttaatattgggttta
acaagagcatatgatatagcaggtccttataatgacgtgaatcaatttttaacatttcag
aatgtgcagatagaaaccagacacccgattaggttgtattgtagatatgtggataagata
tggatattgtttaaatttaccaatgaagaatctaaagatttaatacagaaatttttgaca
gaaaacccagatccaaataatgaaaatatagttggatataataacaaaacatgttggcct
agggattgtcgtatgaggaaaatgaagcatgacgttaatttgggaagagctaccttttgg
gaaatacaaaaccgtattccaagatcgttgacatccttagattgggatcattataataca
tttgtgagtgtgtattcgaaagataaccctaatttgttattttccatagctggttttgag
gttcgtatattaccgaaaatacgtcagctaagttatggttacaatggcataatgtatacg
tcatatatgaatgagtacccccgaggcgtgggtaccaaagatgaaacgagtaagaagaat
ggattgctccatgacgatgagaagagcaaaaaggtaggttcattgaaggatgaggtaaca
aagggtaagtctcatgtggacaaaaatgaagagaacagtgataataacaaaaatgacaac
aaaaatgacagtacgcatgccaatacgcatgatatggttggtgataataattacgatggt
ggggtgaagaacaatttttataattccagtggaggtgaaaagaacgtagttgtttcgtca
agtgttaaggagggtacgtggaagttacagaacgaaatgactaaagaaataacagcagaa
gcttatttaaaagtttctgacaacagcatgaaaagattcgaaaatcgtgtacgtcaaata
ttaatgtcttctggtagtacaacctttactaagatagcaaacaagtggaatactacgttg
attggtttgatgacatattttagagaggctgttttagatactgaggagttattagattta
ttagtaaaatgtgagaataagatacagacacgtattaagattggattaaattcaaagatg
ccatctcgttttccgcctgttgttttttatactcctaaagaattaggagggttgggtatg
ttatccatgggtcacattttaataccagaatctgatttacgatatatgaaacaaaccgat
aatggtagaataacacatttcagatcaggtttgtcacatgaagaagatcaattaataccc
aatttgtatagatacatatctacatgggaaagtgaatttttagaaagtcaacgagtttgg
tgtgaatatgctttaaaaagaaatgaatgtcataatcagaataagaaaataacattagaa
gatttagaagattcatgggataaaggtataccaagaataaatacattatttcaaaaagat
aggcatactttagcatatgataaaggatggcgaataagacaattatttaaacagtatcaa
attattaagagtaatccgttttggtggactaatcaaagacatgatggaaaattatggaat
ttaaataattatagaacggatatgatacaagcattaggaggtgtggaaggtatattggaa
catacattatttaaaggaacattttttccaacatgggaaggattattttgggaaaaagct
agtggttttgaagaatcaatgaaatataagaaattaaccaatgcacaaagaagtggatta
aatcaaatacctaatagacgatttacattatggtggtccccaacaataaatagagcaaat
gtatatgtaggttttcaagtacagttagatttgacaggtatatttatgcatggaaaaata
ccaactttaaaaatatccttaatacaaatattccgtgcacatttgtggcaaaaaatacat
gagtctttagtaatggatatatgtcaagtgtttgatttaaattgtgatttgttagatata
gagacggtacaaaaagagaccatacatccaagaaaatcgtataaaatgaatagttcatgt
gctgacatattattatttgcaaattacaaatggggaatatctaagccgtctttattaaca
gatgaggatcatatatttacaaataatacattaggttcaacaagtggtactaataataac
attatgcttaacagtaatatgattaatagtggtagtaataatagtagtagtaacaatatg
aattctgtatcgtttggttcttttccttatacatctaatcaattttggattgatatacaa
ttaagatggggtgatttcgattctcatgatattgaaagatatagtagagcaaaattttta
gattacacaactgacaatttgtctatatatccatgtttaactggtgttttaataggtgtt
gatttagcatataatttatattcagcatatggaaattggtttaataatttaaaaccgtta
atgcaaaaagctttacaaaaaattgttcaatcgaatccttctttgtatgtattaagagaa
agaattagaaaagggttacagttatattcatctgaaccaacggaaccatatttgaataca
cagaattataatgaattattttcatcacaaactatatggtttgtggatgatacgaatgta
tatcgtgttacaatacataaaacatttgaagggaatttaacaacgaagccaattaatggt
gcgatctttatattaaatcctaaaacaggtcaattgtttttaaaaataattcatacatct
gtttggataggacagaagcgtttatctcagctagctaaatggaaaacagcagaagaagtg
gcatcattaattagatcattgcctatagaagaacagccaaagcaaattatagtaacacga
aaaggtatgttagatccgttagaagtgcatttattagatttcccaaatattataatcaaa
ggaactgaattaaatttaccattccaagcattattgaaattgaataaaataggagattta
atattaaaagcaacacagccacagatgttattatttaatttatatgatgattggttaaat
agtatatcttcatttacggcctttagtagattaatattaatattaagaagtttacatata
aatccacaacaaacgaaaatattattacagccaaataaaaacatcgtaacaacacaacca
catcatatatggccttcgtttaataataaccagtggatacatttagaggtacaattaaaa
gatttaatattgaatgattattcgaaacgaaacaatgtacacatagcttcattaacacag
aatgaaataagagatattttattaggtatggaaataacacctccatcgatacaaagacag
caaatagctgaattggaaaagaataatttggatttaatggaacaacagatgaaagtaaca
acatcaaaaacgacaacaaaacatggaaatgaaattattgtatcaacattatcaccacat
gaacagcaaacgtttacaacaaaaacggattggaaaataagatatttagcaaataattct
ttattatttagaaccaagaatatatatgtgaataataataatatgagcaatatgagcaat
attaatactattagtgctagtgctagtagtcataatattttaaataaaaatggaaccaat
tcagacaatcaaaacagccattatcatacaagtattaattctattaatgattatacatat
gtaatagccaaaaatttattggaaaaatttatatgcatatcagatttaaaaatacaagta
ggaggatttttgtttggatcatcccctgaagataactcctacgtgaaagaaattaagtgt
atacttatccctccacaaataggtaattaccaatcagtcacattatcaagttatatgcca
tctagtaaatatttacaaaatttagagttattaggatggatacatacacagacaaccaat
tgttcgaataccaataatcatttgacagcatatgatatggtagcacatttcaacttttta
caagaatgtaagagacaaatgtcaaaagggaaaaaggttgctgatgcgagtcacaatgat
gatgatgttgatgattatgacgatgatgattataataataatgaagatgattataataat
aataatgaagatgataatattaataataatagtgaaggtggtacaaaacgtgacgaaaca
tacaaaatgtgggataaaaataaaactataatacttacatgctcatttactcctggtagc
tgtactatcaatgcatataaattaacgagtgatggatattcttttgctaaaagtaaaaag
aattcatctgatttatatgtgttcccaaatgtaaataatttatatgaaccagtacaaata
ttattatcaaatgtttttgttggatactttttaataccagatgatcatatatggaattat
aatttaatgggaatcaaatttaataataatcaaaaatatacaccacatcttgatatacca
caaccattttatgcagatatacatagaccaaatcactttctgcaattttctttgcttgac
caaagagacgcagacgaagctgacgtcgaaacgtcctttatatga
DBGET
integrated database retrieval system