Plasmodium falciparum HB3: PFHG_02091
Help
Entry
PFHG_02091 CDS
T01052
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PFHG_02091
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pfh03019
]
PFHG_02091
03041 Spliceosome [BR:
pfh03041
]
PFHG_02091
Messenger RNA biogenesis [BR:
pfh03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
PFHG_02091
Spliceosome [BR:
pfh03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
PFHG_02091
Complex C
PFHG_02091
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_M
HAT_Syf1_CNRKL1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KOB60258
UniProt:
A0A0L7KA35
LinkDB
All DBs
AA seq
881 aa
AA seq
DB search
MALFGELYECEEFFNEETFNIKEGEFYNYDDYRDLEESFDYSAHPEYVESNDVTLINKNN
DDYDDNKSYIKNIEIDIKENFDKISTRYLFLYINKYKEMYIKNMKGLYEVHFYDIHLKGD
KKSILATDHNIIEYCMENLMNINNNPDDNNNDTNNKSVHSSDNMHINKDERYNIYRDKKK
KKKKKRVYDLFCIYAIILKYFPYSFKLWYHYIKDSIEMITDVYYRNKKNYKYINKIFDQC
LLYMYNFKSIYIMYIQFLYIQRDINNKVINYEYIKRYVTIYPEQIIHLFKHYVKYKMYKN
AMITFFYILNSEDNFDLGNFSKYDIYQEIYKLLNSKGSLNNDIIHLLRNNLYIFKNYESI
TSIYILLANNFIYDGRWNKAMDSYEEGISECYTVNDFITLFDNYIEMLKIVDIDTNLIID
LYMDKINYLLDQRKTYIADIKLKNNKNNVYIWLSKIDSIINEEEKIHLYDESLRYFEKND
YIGKLSDIYISYAYYYYNKNEYTNCINIFKLALKQNAYFKSANEIANIFCAWIEIELLER
NYKEALNIARLSIDINKKSYNTLYKSSTSILLYEDISLNNNLKNKNNYHTNFNLLSCMKL
VSLIIDMEMNYGTIETTLNMFDFFYHSKCINVKMVLTLATYLYEKKYFNESFKVYEKALS
VFHYPYVYPIYVNYINKYIQRYKDKNISYVRDLFKQAIYGNDNKTFIPKEFAKHIFLMYA
NFESNYGFIKKELSIYKEAIPFLEEPDKIKFYKIFISKVSRAYGIQKAREAFEEAIQTLS
DDSARQLCMIYIDMEYKLNEYERDWREFEALHGNENTFREMIRIKRSVLNIFSNSRNNME
DEKQQKANMDALENTKRKLKEIIEKEEEHQKKLKRSELYNY
NT seq
2646 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttatttggagaactgtatgagtgcgaagaattttttaacgaagagacatttaac
ataaaagaaggtgaattttataattatgatgattatagggatttagaagaatcgtttgat
tactcagcacaccccgagtatgttgaatctaacgatgtaactttaataaataagaataat
gatgattatgatgataataagagttatattaaaaatattgaaatagacataaaagaaaat
tttgataagatatcaacaagatatttatttttatatattaataagtataaagaaatgtat
ataaaaaatatgaaaggattatacgaggtccatttttatgatatacatttgaagggtgat
aaaaaatcaatccttgcaactgatcataatattatagaatattgtatggaaaatttaatg
aatataaataataatccagatgataataataatgatactaataataaaagtgtacatagt
agtgacaatatgcatattaataaggacgaacgttacaatatttatagagataaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaagagtatacgaccttttttgtatctatgcaataatattaaaatat
ttcccttatagttttaaattatggtatcattatattaaagatagcatagaaatgataaca
gatgtatattatagaaataaaaaaaattataaatatataaataaaatatttgatcaatgt
ttattatatatgtataattttaaatcaatatatattatgtatattcaatttttatatatt
caaagggatataaataataaagttataaattatgaatatattaaaagatatgttaccatt
tatcccgaacaaatcatacatttatttaagcattatgtaaaatataaaatgtataaaaat
gctatgatcaccttcttttatatcctaaatagtgaagataattttgacctcgggaatttt
tcaaaatatgatatttatcaagagatatacaaacttctaaattctaaaggatccttaaat
aatgatattatacatttgttgaggaacaatttatatatatttaaaaattatgaaagcata
acatccatatatatattattagccaataattttatatatgatgggagatggaataaagct
atggattcttatgaagaggggatatcagaatgttacaccgttaatgattttataacttta
tttgataattatattgaaatgttgaagattgttgatatagataccaatttaattatagat
ttatatatggataaaataaattacctattagatcaacgtaaaacatatatagcagatata
aaattaaaaaataataaaaataatgtttatatatggttaagtaaaatagattctattatc
aacgaagaagagaaaatacatttatatgatgagtctttaagatattttgaaaagaatgat
tacataggaaaattaagtgatatatatattagttatgcttattattattataataaaaat
gaatatacgaattgtataaatatttttaaattagctttaaaacaaaatgcatattttaaa
agtgctaatgaaatagcaaatatattttgtgcatggatagaaatagaattgttagaaaga
aattataaggaggcattaaatatagctagactatccatagatataaataaaaaatcttat
aatacattatataaatcatcaacttctatattactatatgaagatatatcattaaataat
aaccttaaaaataaaaataattatcatactaattttaatttattaagttgtatgaaatta
gtatctctaattatagatatggaaatgaattatggaacaatagaaacgacattaaatatg
tttgatttcttttatcattcaaaatgtataaatgtaaaaatggtattaaccttagctacc
tatttatatgaaaaaaaatattttaatgaatcttttaaagtatatgaaaaagcattatct
gtttttcattatccatatgtatatcctatatatgttaattatattaataaatatattcaa
agatataaagataaaaatatatcatatgtaagagacttattcaagcaagcgatatatggt
aatgataataaaacatttataccaaaggaattcgccaaacatatattcttaatgtatgct
aactttgaaagtaactatggatttattaaaaaagaactctctatatataaagaggctata
cctttcttggaagagccagacaaaattaaattttataaaatttttatctccaaggtatct
agagcatatggaattcaaaaggctagagaagccttcgaagaagcaatccaaactctatca
gatgatagtgctcgacaattatgtatgatatacattgatatggaatataagttaaatgaa
tatgagcgtgattggagagaatttgaagccttgcatggaaacgaaaacacctttcgagaa
atgataagaataaagaggagcgttttaaatatattttcgaattctcgtaacaatatggaa
gatgaaaaacaacaaaaagctaatatggatgcattggaaaatacgaaaagaaaattaaaa
gagataattgaaaaagaagaggagcatcaaaaaaaacttaaaagaagtgaattgtataat
tattag
DBGET
integrated database retrieval system
