Plasmodium falciparum HB3: PFHG_03337
Help
Entry
PFHG_03337 CDS
T01052
Name
(GenBank) DNA polymerase alpha
KO
K02320
DNA polymerase alpha subunit A [EC:
2.7.7.7
]
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
PFHG_03337
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
pfh03032
]
PFHG_03337
Enzymes [BR:
pfh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
PFHG_03337
DNA replication proteins [BR:
pfh03032
]
Eukaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
DNA polymerase alpha / primase complex
PFHG_03337
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KOB61591
UniProt:
A0A0L7KEQ5
LinkDB
All DBs
AA seq
1921 aa
AA seq
DB search
MSSVFDKLKKQRSKECKATDFYEVKNKNDEIYEVVDEEGYMKNKRSLQNFIVGGDKDFDS
SDDVIVENINFTLLKKKNVDKEPKVKRNQTLDDFIREKKLRKTLSGNKLSKEEIHKTKNI
EELMDQNTSSDSDGESRTRKRKTRESYENSMYKNMNKSSCYIRSKDYEYNIYDMKHTNEY
NKKIIENNNNNNNYYYYYNNYNDMSFSNKDLEYSKYTKVKNEKEDIDKHQPYDIHRDMGS
SLKKKENYVKQEEQSNMINVGNDDDINEKKNKIHLMKNELVLKKEIQIKENEENIKEVKE
QGSKNNNNKNNNDNNNNNNNVDDFYNDYILNEMNISPLFIKIENETLKKEEKKLKENDIN
DKEEDILENDIDSEMLKNKYEQLIKYEENNNLFVNVYVFDICKHRNSIILFGKTLTKFKK
YKSISIFIENLDRYYYFLLNKNKVYYENGEEIKFNHEKFKIHIMSEFLEEFKIIREYHNI
KMAKYKIVKRKNLNLSSYDDELYIKVLYSYNNDPIHEKFQKGSSYLSFYCCNEDIVENFI
IKKNFKLPCWIKIKNLRKNDLSNLTYCYFDCIVEDKKSILLCDKVHEKKVDTSKNIDEQT
SPKINNVNSNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNSSNNFGRVIISDDGPKKI
EQTYQQLSDINLNKLYIKVVSLLNEENVHEIFSICSLVQIDKLKYINFCGISRKCSKKGT
MYNYNKTLCKLFDNEKELLHTFLEKIKDLDIDIYIGYNILNFDLEFLIHRCNVHNLNSYI
LSRKKKMKKNEKMKVNKFNGTNSTGSMYNIIQNIKGRLIVDIYLLCKDSIKLTTYCLDEI
IDHVKNKFQDKSKQVTNKTNKSTNLNKTNYTNQQSVVSQQSVVSQQSVVSQQSVVSQQSV
VSQQSVVSQQSVTSQSTQSSQANQPNHTNQSTHMNHVKTEEHIHASNKATGNHDIPTDVA
STNSHKSSNTHINIFKDFLVNNINLINCSNIHLYDAQSIIANNLNTYVNSQIFCINETVN
VCNILQIIEKTRDLTKLSGYIWMRSLLCYTSERVEFFLLHEYNKKKFITPLIKKRTKKIE
TNQMKNKNTAKYLGGLVLDPLCGYYDTFVLYLDFNSLYPSIIIEYNVCFSTLKLKNCDVS
IEDNKLNTKKNGNINNDYEKNIHSDAEKNIHSDDDKNIHSDDEKNYDNDKSYNKLEDDNL
LENNVEIDEFDRSKPGILPCILKSLVEKRSVIKKLISNEKNKEKKELLLIQSLSIKLISN
SIYGCLGNTNNRFYAKHIASYITSKGRNLLQHTKFKVEKEFNLKVIYGDTDSIMIDTGIK
ANNINNYKESFKLAHLIKNSINKNYKKLELDLECIFSKLLLLKKKKYACAKVIDNNLEKY
EYEMKGINFIKRDFSKISKLIGNEVLRIIFTNRDVDSKNIPVPLENDLSEQIHEYLRTIN
QRIQNDEFDLDYYIITKKLTKNVHEYQDKNSLGHVLVAERMIKDGYNICVNKEIQYCVCT
SEDASRFYKKTSEKLNNSQCCFSINEIKKYNLKIDKEYYIRNQILSPINRLCQYIEGTSA
EKLSSCFNIYDVKEIKTDKQIEENYLETNVLSLLNESDERFKDIHLKGFLVCSNCMHNVK
PNIFIKYFKCNKCLTYLSIEQIRNYIFSFIHHLCNTFYKQLYICQGCTLKTRRIFLKNDK
NCPNINCEYNKNSLKPLISKKYIYLILEYFLFLLKDNLKKIPSNLVEKNKSEQLNETQDT
NNENDITSNQKEEAKDPNGSISNIHDDINNEHSEKNNHNIYKKNNSNNNNNNNNKDIENE
EYCNDFIVCLCIDEGFKTYIIHDDINKYKNIKVEAYDDICKYRELSVNITKGLKMKYPNI
SNFLSYLNLRNNVFFINYNEERDIIRNSIKYIVHNNIYSQIFFDQVFSIFHLPLSTHITE
M
NT seq
5766 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagtgtttttgataaactcaagaaacagagatcaaaggaatgtaaggcaaccgat
ttttatgaggttaaaaataaaaatgatgaaatatacgaagtagtggatgaggaagggtat
atgaaaaataaaaggtccttacaaaattttatagttggaggtgataaagattttgattca
agtgatgatgtgattgtggaaaatataaattttactttattgaaaaaaaaaaatgttgat
aaagaacccaaagtcaagagaaatcaaaccctagatgatttcatacgagaaaagaaactt
cgaaaaacgttgtcaggaaataaattaagcaaagaagaaattcacaaaacaaaaaatatc
gaagaacttatggaccaaaatacctcaagtgatagtgatggagaatcgagaacaagaaaa
aggaaaactagggaatcctatgaaaatagtatgtataaaaatatgaacaaatcaagttgt
tatattagaagtaaagattatgagtataatatatatgatatgaaacatacaaatgaatat
aataaaaaaataatcgaaaataataataataataataattattattattattataataat
tataatgatatgtctttttctaataaagatttggaatattcaaagtatactaaagtaaag
aatgaaaaagaagatatagataaacatcaaccatatgatatacatagagatatgggatca
tctcttaaaaaaaaagaaaactatgttaaacaagaagaacaatcaaatatgataaatgtt
ggtaatgatgatgacataaatgaaaaaaaaaataaaattcatcttatgaaaaatgaacta
gtacttaaaaaggaaattcaaattaaagaaaatgaggaaaatataaaagaagtaaaagaa
caaggctcaaaaaataacaacaataaaaataataatgacaataataataataataacaat
gtagatgatttttataacgattatatcttaaacgaaatgaacatatcaccactttttatt
aaaattgaaaatgagaccttaaaaaaagaagagaagaaattaaaagaaaatgatataaac
gataaagaggaagatatattagaaaatgatatagattctgaaatgctaaaaaataaatat
gaacaattaataaaatatgaagaaaataataatttatttgtaaatgtatatgtttttgat
atatgtaagcatagaaatagtataatattatttggtaaaactttaacaaaatttaaaaaa
tataaaagtataagtatatttatagaaaatttagatagatattattatttcttattaaat
aaaaataaagtatattatgaaaacggtgaagaaataaaatttaatcatgaaaaatttaaa
attcatattatgtccgaatttttagaagaattcaaaattataagagaatatcataacata
aaaatggcaaaatataaaatcgttaaaagaaaaaatttaaatttatcttcatatgacgac
gaattatatataaaggtattatattcttataataacgatcctatacatgaaaagtttcaa
aagggtagttcctatttatctttttattgctgtaatgaagatattgtagaaaactttatt
ataaagaaaaattttaaattaccttgttggataaaaataaaaaatttaagaaaaaatgat
ttaagcaatttaacatattgttattttgattgtattgtggaagataaaaagagtatatta
ttatgtgataaggttcatgagaagaaagtggatacaagtaaaaatatagacgaacagacc
agcccaaaaattaataatgttaatagtaataataataataataataacaataataataat
aataacaataataataataataataataataataataataataataataataataataat
aataatagtagtaataattttggtagagttataatttctgacgatggacccaaaaagatc
gaacaaacataccaacaattatctgatattaatttaaataaattatatataaaagttgtg
tctctattaaatgaagaaaatgtacatgagatttttagtatatgtagcttggtacaaata
gataaattgaaatatataaatttctgtggtatatctagaaaatgttcaaagaaaggaaca
atgtataattataataaaacattatgtaaattatttgataatgaaaaagaattattacat
acatttttagaaaaaattaaagatctagatatagatatatatattggttataatatactt
aattttgatttggaatttttaatacatagatgtaatgtacataatttaaattcttatatc
ctaagtagaaaaaaaaaaatgaaaaaaaatgaaaaaatgaaagttaataaatttaatggt
accaacagcacaggatctatgtataatatcatacaaaatattaaaggaagattaattgtg
gatatatatcttctatgtaaagattctattaaattaacaacttattgtttagatgaaatt
atagatcatgtcaaaaataaatttcaagacaaatctaaacaagtcacaaataaaacaaat
aaatcaacaaatttgaataagacaaattatacaaatcaacaaagtgtcgtaagtcaacaa
agtgttgtaagtcaacaaagtgtcgtaagtcaacaaagtgtcgtaagtcaacaaagtgtt
gtaagtcaacaaagtgttgtaagtcaacaaagtgttacaagccaatctacacaaagtagc
caagccaaccaaccaaaccatacaaatcaaagtacccatatgaaccatgtcaaaaccgaa
gagcatatccatgcttcaaacaaagctacaggtaatcatgatattccaaccgatgttgca
tccacaaacagccacaaaagcagcaatacacatataaacatcttcaaagattttctagta
aataacataaacctaataaattgtagcaatatacatttatatgatgcccaatctattata
gcaaacaatttaaatacatatgtaaacagtcaaatattttgtattaatgaaacggtcaat
gtatgtaatatattacaaattattgagaaaacaagggatttaacaaaattgagtggatac
atatggatgagaagtttattatgttatacaagtgaacgagttgaattctttctattgcat
gaatataacaagaaaaagtttattacacctttaataaaaaagagaactaaaaaaattgaa
accaatcaaatgaaaaataaaaacactgctaagtatttgggggggttagtattagatcct
ttatgtggttactatgatacgtttgtgttatatttagattttaatagtctgtatccatct
attattatagaatataatgtatgttttagtactctcaagttaaaaaattgtgacgtatcc
atagaggacaataagttgaacacaaaaaaaaatggcaacatcaataatgattatgaaaaa
aatattcatagtgatgctgaaaaaaatattcatagtgatgatgataaaaatattcatagt
gatgatgaaaaaaattatgataatgataagagttataataaattagaggatgataactta
cttgagaacaatgtagaaatagacgaattcgatagaagcaaaccagggattttaccatgt
attttaaaatctttagtagaaaaaagatcagttattaaaaaattaatttcaaatgaaaaa
aataaagaaaagaaagaattattattaatacaatctttatcaataaaattaatcagtaat
agtatttatggttgtttaggaaatacaaataatcgattttatgctaaacatatagcttct
tatataacatccaaaggaagaaatttattacaacatacaaaatttaaggtagaaaaagaa
tttaatctaaaagttatttatggtgatacagattctattatgatagatactggtattaaa
gctaataatattaataattataaagaatcattcaaattagcacatcttataaaaaatagt
attaataaaaattataaaaaattagaattagatctagaatgtatttttagtaaattatta
ttattgaaaaaaaaaaaatatgcatgcgcaaaagttatagataataatctagaaaaatat
gaatatgaaatgaaaggaatcaattttattaaaagagattttagtaaaatatccaaactt
attggtaatgaggtattaagaattatatttacaaacagagacgtggattcaaaaaatatt
cctgtccctttagaaaatgatttatctgagcagatacatgagtatttgagaaccataaac
cagaggatacaaaacgatgaattcgatttggactattacattattactaaaaagcttaca
aagaatgtacatgaataccaagataagaattccttaggacacgtacttgtggcggaaagg
atgataaaagacggatataatatttgtgtaaataaagaaatacaatattgtgtatgtacg
agtgaagatgcttctaggttttataaaaagacaagtgaaaaattaaataattctcaatgt
tgttttagtataaatgaaataaaaaaatataatttaaaaatagataaagaatattatata
aggaatcaaattctgtctcctattaatagattatgtcaatatattgagggaactagtgct
gaaaaattatcatcatgttttaatatatatgatgttaaagaaataaaaacagataaacaa
atagaagaaaattatttagaaacaaatgtattatccttattaaatgaatcagatgaaaga
tttaaggatatccatttaaaaggatttttagtatgttcaaattgtatgcataatgtaaaa
ccaaatatatttattaaatattttaaatgtaataaatgtcttacatatttatctatagaa
caaatacgaaattatatattctcatttattcatcatttatgtaatacattctataaacaa
ttatatatatgtcaaggatgtacattaaaaacaagacgtatttttttaaaaaacgataaa
aattgtccaaatattaattgtgaatataataaaaattctttaaaacctttaatatcaaaa
aaatatatttatctaatattagagtatttcttattcttattaaaggacaatttaaaaaaa
ataccctccaatttggttgaaaaaaacaaatcagagcaattaaatgaaacacaggacaca
aacaatgaaaacgatatcacaagtaatcaaaaagaagaagcgaaagatccaaatggttct
atatcaaatatacatgatgatataaataatgaacattctgaaaaaaataatcacaacata
tataaaaaaaataatagcaataataataataataataataacaaagatatagagaatgaa
gaatattgtaacgattttattgtctgtttatgtatagatgaaggctttaaaacttatatt
attcatgatgatattaacaaatataaaaatataaaagttgaagcatatgatgatatatgt
aaatatagagaattaagtgttaatattaccaaaggattaaaaatgaaatatccaaatata
tctaactttctttcctatctaaatttaagaaacaatgttttttttattaattataatgaa
gaaagagatattataagaaattcaatcaaatatattgtacacaataatatatattcacaa
atattttttgatcaagtcttttcaatctttcatttaccattatcaactcacataacagaa
atgtaa
DBGET
integrated database retrieval system