Plasmodium falciparum HB3: PFHG_03440
Help
Entry
PFHG_03440 CDS
T01052
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K13177
ATP-dependent RNA helicase DDX1 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pfh03041
]
PFHG_03440
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pfh03016
]
PFHG_03440
Enzymes [BR:
pfh01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PFHG_03440
Spliceosome [BR:
pfh03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
RNA helicase-like proteins
PFHG_03440
Transfer RNA biogenesis [BR:
pfh03016
]
Eukaryotic type
tRNA spricing factors
tRNA splicing ligase complex
PFHG_03440
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
SPRY
ResIII
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KOB61691
UniProt:
A0A0L7KF32
LinkDB
All DBs
AA seq
841 aa
AA seq
DB search
MSAFEELGLHSDLCAVLEKNGIDLPTAIQQESIPLTLGGGDLCACAETGTGKTLSFIFSS
LQIVHELVRNIGNYEDVSIRKNNNNMENNNDSNISNIIDDNDKNKKSSYIKTINKNSKVI
IKDNECICNNNNNNNSNNFLFEEVKVDCEITNGLYAYEIEILSKSYVNVGFCPSIKETLK
YNYTYCSNGNKYNNNRQEHYGEYFSNNDIITCLINKNNNTISFKKNGKFLGNAFKIFYKY
NDVAFFPYIWGKYFHIKLHFENLKYGDRSLHFNELCILLTSNCNDNDTLSDRKIFFSSEN
IRDEKNFKLEKANMQTHNYQNNNSIINEYTHNYNQQNFNNKKKLYCIVLCPTRDLAQQTY
NNYLTYSECFNNPSINIGILVGGEQRNKGHHMNDDGSYNIVVGTCFKLIECIRKNSIKVN
DIRLLILDEADELINNDEKTVLEIKDSCMKYGHRVQTLFFSATLQDKNVKDCINKITNKP
IFVDLKYGKNSIPSHIYVCLYYVNDENSNLSYIIKENDNNNHNKEIYNILYNEKLYHMNT
RELYEYTDKVHILNNSNSNLKKNDKEQISLNIKMNKLKKLVQIINVFNMQNGIIFCRTNL
DCDNVYNFLNAVGDGKAYKGTVESLKENKYSCVILKGKMSNDERKNNLQAFKKGEVRFLI
CTDVAARGIDIQNLRYLIIMTLSDNINTFFHKIGRVGRDGKNSLCIVLSADNEQEEKVWF
HTCPSRGINCYNRNLKENKGCTVYIKESDYIKTINDMLEVPIHVLDSKYYYAENVVDPLN
YFKKHPVSNKSRRNKNQNANSIFQESSHIDVLSSFASNINSIKKLQSAISYKHYELLNFQ
I
NT seq
2526 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcggcttttgaagagttggggttacatagcgatttgtgcgcagttttagaaaaaaat
ggcattgatttaccaacggctattcaacaagagtccattcctctgacattagggggagga
gatttatgtgcttgtgctgaaactggtacaggaaagacgttaagtttcatattttcttct
ttacaaatagttcatgaattggttcgaaatataggtaactatgaagatgtgagtattaga
aaaaataacaataacatggaaaataataatgatagtaatatttctaacattatagatgat
aatgataagaataagaagtcaagttacataaaaactattaataagaactcaaaagtaata
attaaagacaatgaatgtatatgtaataataataataataataatagtaataatttcctt
ttcgaagaagtaaaagttgactgtgaaataacgaatggattatatgcatacgaaattgaa
atattatctaaaagttatgtgaatgttggtttttgtccatccattaaagaaacattaaaa
tataattatacctactgtagtaatggtaataaatataataataatagacaagaacattat
ggtgaatatttttcaaataatgatattataacatgtttaattaataaaaataataatact
atatcttttaaaaaaaatgggaaatttttaggtaacgcttttaaaattttttataaatat
aatgatgttgcattttttccatatatatggggaaaatatttccatataaaacttcatttc
gaaaatttaaaatatggtgatcgttcattacattttaatgaactatgtattttattaact
tcaaattgtaatgataatgatactttaagtgataggaaaatatttttttcgtctgaaaat
ataagggacgaaaaaaattttaaattagagaaagcaaatatgcaaacacataattatcaa
aataataatagtataataaacgaatatacacataattataatcaacaaaatttcaataat
aaaaaaaaactatactgtattgttttatgtcctactagagatttagcacaacaaacttat
aataattatttaacgtactctgaatgttttaataacccttctattaatattggaatatta
gtaggaggagaacaaagaaataaaggtcatcatatgaatgacgacggatcttataatatt
gttgtgggtacatgctttaaattaattgaatgtataagaaaaaattctataaaagttaat
gatataagattattaatattagatgaagcagatgaattaataaataatgatgaaaaaaca
gttttagaaattaaagattcttgtatgaaatatggacatcgtgtgcaaactttatttttt
tctgctactttgcaagacaaaaatgttaaagattgtattaataaaataaccaataaacca
atatttgttgatttgaaatatggaaaaaatagtataccatcacacatatatgtgtgtcta
tattatgtcaatgatgaaaattcgaatttatcgtatattataaaagaaaatgataataat
aatcataacaaagaaatatataatatcctttataatgagaaattatatcatatgaataca
agggaattatatgaatatacagataaagtacatatcttaaataattcaaatagtaattta
aaaaaaaatgataaggaacaaatttctttaaatataaaaatgaataaactaaaaaaatta
gttcaaataattaatgtttttaatatgcaaaatggtattatattttgtcgaaccaattta
gattgtgacaatgtatataattttttaaatgctgtaggtgatggtaaagcttataaaggt
accgttgaatcacttaaagaaaataaatattcctgtgttatattaaaaggaaaaatgtca
aatgacgaaagaaaaaacaatcttcaagctttcaaaaaaggtgaagtacgttttttaata
tgtacagatgtcgctgcaagaggtattgatatacagaatttaagatatcttattattatg
accttgtctgataatattaatacattttttcataaaattggtagagtaggaagagatgga
aaaaacagtttatgtattgtcttaagtgcagataatgagcaagaagaaaaggtatggttt
catacatgtcctagtagaggaattaattgttacaatagaaatttgaaagaaaataaagga
tgtactgtatatattaaagaaagtgattatattaaaactattaatgatatgttagaagta
cctatacatgtgttagattccaaatattattatgctgaaaatgttgttgatcctttaaat
tattttaaaaaacatccagtttctaataaaagcagaagaaataaaaatcaaaatgctaac
tccatttttcaagaatcatcccatatagatgtgttatcttcttttgcttcaaacattaat
agtataaaaaaattacagtctgctattagttataagcattatgaattgttgaactttcaa
atatga
DBGET
integrated database retrieval system
