Plasmodium falciparum HB3: PFHG_03500
Help
Entry
PFHG_03500 CDS
T01052
Name
(GenBank) DNA-dependent RNA polymerase
KO
K10908
DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial [EC:
2.7.7.6
]
Organism
pfh
Plasmodium falciparum HB3
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
pfh03029
]
PFHG_03500
Enzymes [BR:
pfh01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PFHG_03500
Mitochondrial biogenesis [BR:
pfh03029
]
Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
Mitochondrial transcription and translation factors
Mitochondrial RNA polymerase
PFHG_03500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol
RPOL_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
KOB61763
UniProt:
A0A0L7KEL6
LinkDB
All DBs
AA seq
1513 aa
AA seq
DB search
MFVCKKCSRYVIKKIFYTFICESKYQLLFLRKGNDYKNIFFLEKGYISTHVRGDKKERTQ
KKKNDLDIKRLFLDKPSTPNIKDEYEKKTNDNNNMEEYNICNNNIITNNNKIKNSSHMNT
FNSNRKKVCVKDNINNNTINNNYEEQKENKEEYINTPKAKNNLYNLPYKNKDTHIIDKKK
LDEQVVKELHNLIISIKKIDKDKKENIIKYINTLNKKYVKNINKNIIVFFENLDIYMSVN
GLLICDIGGEEIFNYINKIKLTNNIDIKKETYNDDIEKHNVNTNERFLHMDDVTKEDNIN
INNMFDINYIKEKKKRIYGDNIYPIVVKSEEKEEVVPKKKKKNSNNIIVHNNNIINNKCG
DYNIINCTNDLGEKTKNHQTNYSNNPKFDYQYNEEKEKEEEKESNIINVRRQMLIERSSY
KKAIEEAEEFVSNLHDLKKITEIQGLCKIYLNWISELEKRIILYKEKNKNKKKKKIFPDF
IDDKLLATITVKWTIQYTFNPLKKKYSNNVSTQSKYFEHEYSYQSLFTHIAIKIGEEINN
ELNFQLLEKKNHLYNYMKKNKNNSSFSHFQKYRIIKQMKQQIGKGNHMKQHAMLGGDNQT
SHLNSCANNNFDINSCANNNFDINSCANNNFGINSCGNNNFGINSCGNNNFGINSCDEYY
GHTNNHVHIKHDDDNIIEWNSVKKATIGGLLLNMLIENAKMDVDINVAKNEFKNEYKYYL
FLHKTAKNNAEDLYEECKYKKELNYQKFYEEESNTLKFIILDKYKKNNSYDNNFKKNYME
KKICTYNYGTHDKNVVKQNNGDKQNNGDKHNCANRQELQLSDNKKESNFCQKQREKLMRK
EIILYRSKRDRNKIELPVFIHSYVWKNNNWYGVIHMRECCANYLLNNAINSHIPLNYLPM
ICKPKRWENFEGGMLLLKNSFIRCNIKPLFNLNVCNLNRIKNIVSEIGNVGWKINKEILH
YIEYAYIHGITIGKIPLYKNYTLPKYINLKEQNNEEIKKYLLLKEEINRLNKCLISERPT
FLQKLAVAKTFKDNDIIYFPHNIDFRGRMYPLSPHLHHMSDDICRSLITFAEQKEIGNKG
LFWLKIHLANTFGKDKLSFQKRIQWVDQNINNIKKLTQQPFDNIEFWNMAEKPWQALAVA
IDLKNALESPNASKYKSSIPIQQDGTCNGLQHYAALGKDKYGGKAVNIIPSDEPQDIYSV
VLDIVISKIKNDLMNISNGHHNNIISFSINENIKTNKKYNNNINNNINNYNNNNHNRNSN
SNVNKNELASYCFKFDLLKRKVVKQTIMTICYGVTSIGAKNQVKGKIQTMIGKELDKNII
NKLSQYIANYIFESISEIFKRAMIIKKWFNNLSKVTNELNIPITWISPIGLPCEQPYRLG
NRILVNTPLQSISVISYKNSQLHKNKQRLGFPPNFVHSLDASHLMMTAEKMVIQNNFSFA
AVHDSYWAHACNVDIMNQFIRESFITLYNEPILENIYNNFRIRLGKFATKIPSSPEQGEL
DISMVKDSLYFFS
NT seq
4542 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgtatgtaaaaaatgttcaagatacgtaattaagaagattttctatacgtttata
tgtgagagcaaatatcagcttctgtttttaagaaaaggaaatgattataaaaatattttt
tttttggagaaaggatatattagtactcatgtaagaggtgacaaaaaagaaagaacacaa
aaaaaaaaaaatgatttggatataaaaaggttgtttttggataagcccagtacaccaaac
ataaaagatgaatatgaaaagaaaacaaatgataacaacaacatggaagagtataacata
tgtaataataatattattactaataataataaaataaaaaattcttcacatatgaatact
tttaatagtaataggaaaaaggtatgtgtgaaggataatataaataataataccattaat
aataattatgaggagcaaaaagaaaataaagaagagtatattaatactccgaaagccaaa
aataatttatataatttaccatataaaaataaggacacacatattattgataaaaagaaa
ttagatgaacaagttgtaaaagaattacataatttaataatatctataaaaaaaatagat
aaagataaaaaagaaaatatcataaaatatataaatacattaaataaaaaatatgtaaaa
aatattaataagaatataattgtattttttgaaaatctggatatatatatgtccgtcaat
ggtttgttaatatgtgatataggaggcgaagagatatttaattatattaataaaattaaa
ttaacaaataatatcgatataaaaaaagaaacatataatgatgatatagagaaacataat
gtaaatacgaatgaaaggtttttgcacatggatgatgttacgaaggaagacaatattaat
ataaataatatgtttgatataaattatattaaggaaaaaaaaaaaagaatatatggagat
aatatatatccaatagttgttaaatctgaagaaaaggaagaagttgtaccaaaaaaaaaa
aaaaaaaattctaataatataattgtacataataataatattattaataacaagtgtggt
gattataatataataaactgtacaaacgatttaggagaaaaaacaaaaaatcatcaaacg
aattattctaataatccaaaatttgattatcaatataatgaagaaaaagaaaaagaagaa
gaaaaagaaagtaatatcatcaatgttagaaggcaaatgttaattgaaagatcatcttat
aaaaaagccatagaagaagctgaagaatttgtttcgaatcttcatgatttaaaaaaaatt
acagaaattcaaggtttgtgtaaaatatatttaaattggattagcgaattagaaaaacgt
attatactttataaagaaaaaaataaaaataaaaaaaaaaaaaaaattttcccagacttt
atagatgataaattgttagctacaataacggtcaaatggaccatacaatatacttttaat
cctttaaaaaaaaaatattcaaataatgtttctacacaatctaaatattttgagcacgaa
tattcttatcaatctttatttactcatatagctataaaaataggagaagaaataaacaat
gaactcaatttccaattactagaaaaaaaaaatcatctttataattatatgaagaaaaat
aaaaataattcctccttttctcatttccaaaaatataggataataaaacaaatgaagcag
caaattggaaaaggaaaccacatgaaacaacatgctatgttgggtggcgacaaccaaact
tcgcatcttaattcttgtgcaaataataattttgatataaattcttgtgcaaataataat
tttgatattaattcttgtgcaaataataattttggaatcaattcttgtggaaataataat
tttggaatcaattcttgtggaaataataattttggaatcaattcttgtgatgaatattat
ggacatacaaataaccatgtacatataaaacatgatgatgataatataattgaatggaat
tctgttaaaaaggcaacaataggaggtctattattaaatatgcttattgagaatgcaaaa
atggatgttgatattaatgtagcgaaaaatgaatttaaaaatgaatataaatattattta
tttttacataaaacagccaaaaataatgcagaggatttatatgaagaatgtaaatataaa
aaagaattaaattatcaaaaattctatgaagaggaatccaatacattaaaatttattatt
cttgataaatataaaaagaataatagttatgataataattttaaaaaaaattatatggaa
aaaaaaatatgtacctataattatggaacacatgataaaaatgtggtcaaacaaaataat
ggggataaacaaaataatggggataagcacaattgtgcaaatcgtcaggagcttcaactt
tcagacaataaaaaagaaagtaacttttgtcagaaacaaagagaaaagttaatgagaaaa
gaaattattttatatagatcgaagagagataggaataaaatagagttacccgtatttatt
cattcttatgtatggaaaaataataattggtatggtgtaatacatatgcgtgaatgttgt
gcaaattatttattaaataatgcaataaattcccatattccattaaattatttacctatg
atatgtaaaccaaagagatgggaaaatttcgaaggagggatgttattattaaagaatagt
tttattcgttgtaatataaaaccattatttaatttaaatgtttgtaatttaaatagaata
aaaaatattgtatccgaaataggtaatgtgggatggaaaattaataaagagattttacat
tatatagaatatgcatatattcatggaataaccataggaaaaataccactttataaaaat
tatacgttaccaaaatatattaatttaaaagaacaaaataatgaagaaataaaaaaatat
cttttattaaaagaagaaataaatagattaaataaatgcttaataagtgaaagaccgaca
ttcttacaaaaattggcagtagcaaaaacattcaaagataatgatattatctatttccct
cataatatagattttagaggaaggatgtatccattatcaccacatctacatcatatgagt
gatgatatatgtagaagcctaatcacattcgcggaacaaaaagaaataggtaataaagga
ttattctggttaaaaatacatcttgctaatacatttggaaaagataaattaagttttcaa
aaaagaattcaatgggttgatcaaaatattaataatattaaaaaattaactcaacaacct
tttgataatatcgaattctggaatatggctgaaaaaccatggcaagcattagctgtagca
atagatcttaaaaatgctttagaatctcctaatgcttctaagtataaaagtagtatacca
atacaacaagatggtacatgtaacggtttacaacattatgcagccttaggaaaagataaa
tatggtggaaaggcagtcaatataattccttctgatgaaccacaagatatatattccgta
gttttagatatagtcataagtaagataaaaaatgacttgatgaatatatcaaacggtcat
cataataatatcatatcttttagtattaatgaaaatataaaaacaaacaaaaaatacaac
aataacattaacaataacattaacaattataataataataaccataataggaattctaat
tctaatgttaataaaaacgaattagctagctattgcttcaaatttgatcttttaaaaaga
aaagttgttaaacaaaccattatgaccatatgctacggtgtaacatctataggggcaaaa
aatcaagtaaaaggaaaaattcaaaccatgataggaaaagaattagataaaaatataatt
aataaattgtcacaatatattgccaattatatatttgaatctataagtgaaatatttaaa
agagctatgatcataaaaaaatggtttaataatttatctaaagttactaatgaattaaac
ataccaatcacatggatatcacccataggattaccatgtgaacaaccatacagattaggt
aatagaattctagtcaatacacctttacaatcaattagtgttatttcatataaaaatagt
caattacataaaaataaacaaaggttaggattcccacctaattttgttcattcactagat
gcatcacatctcatgatgacagcagaaaaaatggtcattcaaaataattttagctttgct
gctgtacatgattcttattgggctcatgcatgtaatgtagatattatgaaccaatttata
cgagagtcatttataacattgtataatgaacctattctagaaaatatatataacaacttt
agaatcaggctgggcaaatttgctactaaaataccatcatcccctgaacagggagaattg
gatatctccatggtaaaggatagtctttacttttttagctga
DBGET
integrated database retrieval system