KEGG   Plasmodium falciparum HB3: PFHG_04758
Entry
PFHG_04758        CDS       T01052                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K12603  CCR4-NOT transcription complex subunit 6 [EC:3.1.13.4]
Organism
pfh  Plasmodium falciparum HB3
Pathway
pfh03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pfh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PFHG_04758
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
    PFHG_04758
Enzymes [BR:pfh01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.13  Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.13.4  poly(A)-specific ribonuclease
     PFHG_04758
Messenger RNA biogenesis [BR:pfh03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   mRNA cycle factors
    P-body specific factors
     PFHG_04758
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Ccr4-NOT complex
     PFHG_04758
SSDB
Motif
Pfam: Exo_endo_phos
Other DBs
NCBI-ProteinID: KOB62982
UniProt: A0A0L7KI08
LinkDB
AA seq 2480 aa
MYIYPSTVNRQHCTKKKKKKKTITHFFSYNMENQKGKTNFTFYKKNKSNDCETTYKSEEK
KNKKNVEKNYKVVETYKSSFKVQEENVNVNNNYFLRSINNVDKNYNVIYKKCSNSIGGAT
VVTNSSELHANDEADHIGTDSNILGHKKKKVHQMVKVKMKQDPKEGQDHITYKNKKKSNM
NEMNNNDDNNDDNNNDNNNNDNNDDNNDDNNNDNNDDNNNDNNNDNNNNNDNNNNNNNND
SNNNCNNNNDYSSYYYNSDVDVESLIYTQETKKIKNTKNKKNSTDYNNNNVTSKDIKIRK
SNIIELNKLLKENLRIEQNLQKQKKDKIDEVDVYVEEEEDNYEEKKDYQQTGKEISNTKN
MGKEEENSRKKKNKQKEKHNECRDANDKELSVQQRNDQNNINEHYEELSKDTKKEKGKKK
NKDNKNNTENKDNKDNKDNKDNKNNTENKDNKDNKNNIDNKNDKENNNNKGNKENNNNKG
NKENNNNKGNKENSNNKANTDNKNNKDNKEKDKSNITIIEKNASKGKKTKNKKTSQNKKN
DICDNKEIININYISEQNINENHYSLKEKNMQNKKDEYNYSTIETDNNNNNDDINYYNKN
ITKNIINNDIKQFVNKNYMEHNYVHNNTYIYNNNNINNNNNNNNNSVPYNYDNSIFTCDI
NDDQKNYKDELKNEILKTNKKFVVNNISFNKNINNLKLLKDYNLNDIVNNFEQYKSMNKH
LANDNNNNIDDENMPGNINRGKKKNHNNNKYHNGKDNHMSTTREYNINNNNNNDSIHNPY
FQYTEDYKNINDDIANNQDNKNVKNHLFNYNNHMYKKFVSNQYLENVPNVHVTNNQKSDF
NNAYGNICSYNYNVNKNILNNNKVTNNNSLNSNNVNIMNSINTMSVNDQNYITNRNYNNI
LSNTNMNVSNIPSENNNIGELNKTNNNMNIQNSISKENIHNIMDNTTTYTHPNSVCNSHY
MNNTVIYDTNHIMCNDKVSNMNKCMPNQNVDVYSYGYMPDNIPVNVVYNNFNDTPTYFAN
NNNNNNININHDMVYTNMEEKRPGDVAPHANNHILKFSCQVNNSSKMLSDTLIKTNKGKV
HLNLLTDVKCSTRKNINNNNNNDNNNNNDNNNNNNDECHINIQKDDTKIDNGQKEDNITT
NNNNSNCNSEGKDNRHDNKNNDINNNDINNNDINNNDINNNDINNNDKNLLILDKNKKKT
SNNKKNICDKDPPNNKKNICEKDTQNNKKNTCEKDTQNNKKNTCEKDPPNNKKNTCEKDP
PNNKKNTCEKDPPNNKKNICEKDPLNNNSNSIKKNGQHMKDGDNKLKIEEVEKKQESNKE
DSTTNKITKNNSVNNKDNENIDVDKTLKEKNNSITSTDVIEKFELNKNGLYTSKNKCENK
DEIKSIKLNNSCKNKMNELLEKKKNKNKYLAEIIRCELIWGPTKNKEPITPVESCELHPV
VIIKDQYGHLYDDDEDNENNPIGKTVNIFYRWSRGPPRTVCFFHPQKIACLQCTVTFRCF
CSYECFMKGFDHLHKYYKSNGSINIPSHPNLHTYGVPCSPFDWDNYEKNIEFDEKHYNSL
IQSGLLNEPNKEKWEIINNERNYIPCQKDIGHQIMLETMILDKNSISSGNLIDSNINPFD
QQQNELNESSEYESSSEDDDASQNNQNKMSSVKYSDVQQNEINLMNNQILLRSYNESLDF
NNNKNMYLFKNNNNNNNDNNSSNNNNNNNNNINSGTHNVNNTNMVVHMNNSTTNFYNLYD
MDNNNNNNVANFHLQNRETDYLPINNTYNTLPISINNKTNNVNNMNSVNNNLNSHSQSVD
IKKCEGGVMYFPEKSLDYSRNSYKYSTNNITKIIDKRIDNFEMTYMNTTHGKIDSNNNNN
NNNNNINGSIMNNHHSTTLGSSNNVGNINDKYVNNFSYSIDNNHIYVNNEIHFMNNMNIP
SSQQKIYNDISIESSKDLNISSNNLLTPYTNNMIDGINIQSTNEARTINTKMILMNPLIN
ADNNKIAYKNMLNNKYLNVSSISINDNNYMNETHMNINDDNRNSILPVQENNFLVKQKKK
KKKKKDSKTNNKKKKKKIYVLDDKVWNSIKDPNIYHKIITGCCIPNITVFPNYNITCFKN
YNHTNPQNQFTIMTWNVLAEIYGTIEAFPHCDPYMLAWSYRKTKIIQEILNNSPDIVCLQ
EIQNEHFLDFFKPSLGEFGYEGVYKQKTKEIFTSPSGKRRGGKYTIDGCAIFYNKKKLKF
VETYALEFSKLIKEASVLTLPKEIQKNPSLVKRLLKDNVALVILLECIQQYSKIYDKSEE
KQNKKLLIVANTHIVANPEANYVKIWQTQILVKVIEYLKINFIKKYETIPSLIICGDFNS
TPSSAVYQLIYKKTCSRTHEDFNSDKYSLLTDLKLGHNLNLKSAYAISKLLSQKLNPEEY
NNLELYEPLFTNYTSNFIGCLDYIFYNDENLNIISTVNVADENQLIQEAQMYQLSDCALP
SPIRPSDHLPLIAQFEFKVF
NT seq 7443 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatatatatccaagtactgtcaaccgccaacattgcacaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
aaaacaatcacacatttcttctcatataatatggagaatcagaagggtaaaactaacttc
acgttttataaaaagaataaaagtaatgattgtgaaactacatataaatctgaagaaaaa
aaaaataaaaaaaatgtagagaagaattataaagtggttgaaacatataaaagttccttt
aaagttcaggaagaaaatgtaaatgtaaacaacaattattttcttagatctataaataat
gtagacaaaaattacaacgtaatatataaaaaatgttctaattctattgggggagctacg
gttgtaacaaattcatcggaattacatgcaaatgatgaagcagatcatataggaacagat
tcgaatatattaggacataaaaagaagaaagttcatcaaatggtcaaggtgaagatgaag
caagatcctaaggagggacaagaccacatcacttataaaaataagaaaaaaagtaacatg
aacgaaatgaacaataatgatgataataatgatgataataataatgataataataataat
gataataatgatgataataatgatgataataataatgataataatgatgataataataat
gataataataatgataataataataataatgataataataataataataataataatgat
agtaataataattgtaataataataatgattattcttcatattattataatagtgatgtg
gatgtagaatctttaatatatacacaagaaaccaagaaaatcaaaaatacgaaaaataaa
aaaaactcaacagattataacaacaacaatgttacgtcaaaagatattaagataagaaaa
agtaatattatcgaattaaataaattattaaaagaaaatttaaggattgaacagaattta
caaaaacaaaaaaaagataaaatagacgaagttgatgtgtatgttgaggaggaagaagat
aattatgaagaaaaaaaggattatcaacaaacaggaaaagaaatatcaaatactaaaaat
atgggaaaggaggaagaaaattcaagaaaaaaaaaaaacaaacaaaaagaaaagcataac
gaatgcagagatgctaatgataaggaactaagtgtacaacaaagaaatgatcaaaataat
attaacgaacactatgaggaattatcaaaggataccaagaaagaaaaaggaaaaaaaaaa
aataaagataataaaaataacacagaaaataaggataacaaggataataaagataacaag
gataataaaaataacacagaaaataaagataacaaggataataaaaataacatagataat
aaaaatgataaagaaaacaacaataacaaaggtaacaaagaaaacaacaataacaaaggt
aacaaagaaaacaacaataacaaaggtaacaaagaaaacagcaataacaaggctaacaca
gataataaaaataacaaagataacaaggaaaaggataaaagtaatattaccataatagaa
aaaaatgcatcgaaaggcaaaaaaacaaaaaataaaaaaactagccaaaataaaaaaaat
gacatatgtgacaataaagaaattataaatataaattatatatcagaacaaaatataaat
gaaaatcattattcattaaaggaaaaaaatatgcaaaataaaaaagatgaatataattat
agcaccatagagacagacaataataataataatgatgatattaattattataataaaaat
attacaaagaatattataaataatgatatcaaacaatttgtcaataaaaattatatggag
cataattatgttcataataatacctacatatataataataataatattaataataataat
aataataataataatagtgttccttataattatgataatagcatctttacctgtgatata
aatgatgatcaaaagaattataaagatgaattgaaaaatgaaatattgaaaacaaataaa
aaatttgttgtaaataatattagttttaataaaaatataaataacctaaaactcttgaaa
gactataatttgaatgacatagttaataattttgaacaatacaaaagtatgaataaacat
ttagcaaatgacaataataataatattgatgatgaaaatatgccaggtaatattaatagg
gggaaaaaaaaaaatcataataataataaatatcacaatggtaaagataatcatatgtct
actacaagagagtataatataaacaataataataataatgatagtatacataatccttat
ttccaatatacagaagattataaaaatataaatgatgatatagcaaataatcaggataat
aaaaatgttaagaatcatctttttaattataacaatcatatgtataaaaaatttgtgtct
aatcaatatttggaaaatgttcctaatgtacatgtaacaaataatcaaaagagtgatttc
aataatgcttatggaaatatctgttcttataattataatgtaaataaaaatatattgaat
aacaataaagtaactaataataatagtctcaattctaataatgttaatattatgaattca
ataaataccatgagtgtgaacgatcaaaattatataacgaatagaaattataataatata
ttgagtaacactaatatgaatgtttctaatatacctagtgaaaataataatataggagaa
cttaataaaacgaataacaatatgaatattcaaaatagcatatcaaaagaaaatatacat
aacattatggataatactactacttatacacatcctaattcagtatgtaattctcattat
atgaataatactgtaatatatgatacaaaccatattatgtgtaatgataaggtatctaat
atgaataagtgtatgcctaatcaaaatgtagatgtatattcatatggatatatgcccgac
aacatccctgttaatgttgtatataataattttaacgacacacctacatatttcgcaaat
aataataataataataatattaatattaatcatgatatggtttatactaatatggaagaa
aaacgaccaggagatgtggcacctcacgctaataatcatattcttaaattttcttgtcaa
gttaataattcttcaaaaatgttaagcgacacgttaatcaaaactaacaaaggaaaggta
cacttgaatttattaacggacgtaaaatgctccacaaggaagaatatcaataataataat
aacaacgacaacaacaacaataatgataataataataataataatgatgaatgtcatatt
aatatacaaaaggatgacaccaaaattgataatggtcaaaaagaggataatattactaca
aataataataatagtaattgtaatagtgaaggtaaggataatagacatgataataaaaat
aatgatataaataacaatgatataaataacaatgatataaataacaatgatataaataac
aatgatataaataacaatgataagaatttgttaatactagataaaaataaaaaaaaaacc
tcaaataataaaaaaaatatatgtgataaagaccccccaaacaataaaaaaaatatatgt
gaaaaagacacccaaaacaataaaaaaaatacatgtgaaaaagacacccaaaacaataaa
aaaaatacatgtgaaaaagaccccccaaacaataaaaaaaatacatgtgaaaaagacccc
ccaaacaataaaaaaaatacatgtgaaaaagaccctccaaacaataaaaaaaatatatgt
gaaaaagaccccctaaacaacaattccaatagcataaaaaagaatggacaacatatgaag
gatggtgataataaattaaaaatcgaagaggtagaaaagaaacaagaaagcaacaaggaa
gatagtactacaaataaaattactaagaacaattcagttaataataaagataatgaaaat
attgatgtggataaaaccttaaaagaaaaaaataattcaataacatccactgatgtaata
gaaaaatttgaattaaataaaaatggtttatatacatcaaaaaataaatgtgagaataaa
gatgagattaaaagtataaaactaaataacagttgtaagaataaaatgaatgaattatta
gaaaagaaaaaaaataaaaataaatatttggcggaaatcataagatgtgaacttatatgg
ggaccaacaaaaaacaaagaaccaataacaccagtagaaagttgtgaactgcatcccgtt
gttattataaaagatcaatatggacatttatatgatgatgatgaagataatgaaaataat
cctataggtaaaacagtaaatattttctatagatggagtagaggacctccaagaactgtt
tgtttttttcatccacaaaaaattgcatgtttacaatgtactgtaacgtttagatgtttt
tgttcctatgaatgttttatgaaaggttttgatcatctacataaatattataaaagtaat
ggatcaattaatattccatcacatcctaatttacatacgtatggtgttccatgttcacct
tttgattgggataattacgaaaaaaatatcgaattcgatgaaaaacattataattccttg
atacaatcaggattattaaatgaaccaaataaagaaaaatgggaaattataaataatgaa
agaaattatattccttgtcaaaaagatattggacatcaaattatgttagaaactatgata
cttgataaaaatagtatctcatctggtaatttaattgattcaaatataaatccctttgat
caacaacaaaatgaattaaatgagagtagtgaatatgaatcttcatctgaagatgatgat
gcttcacagaataatcaaaacaaaatgtcttctgtaaaatattcagatgttcaacaaaat
gaaattaaccttatgaataatcaaattcttttaagaagttataatgaatctctagacttt
aataataataaaaatatgtatctattcaaaaataataacaacaacaataatgataataat
agcagcaacaataataataataataataataatattaatagtggaactcataatgttaat
aatacaaacatggtcgtccatatgaacaattcaacaacaaatttttataacttgtatgac
atggataataataataataataatgttgcaaattttcatttgcaaaatagagaaacagat
tacttacccataaataatacatataatactcttcctatcagtatcaacaataaaacaaac
aatgtgaataatatgaacagtgttaataataacctgaatagtcattcccaatccgtggat
ataaaaaagtgcgaaggaggggtcatgtactttcctgaaaaaagcctagattattcgcgt
aacagttacaaatacagtacgaataatattaccaaaattattgataaaaggatagacaat
tttgaaatgacctatatgaacacaacacacggaaaaatagatagtaacaataataataat
aataataataataatataaatggaagtattatgaataatcatcattccacaactttagga
tcatcaaacaatgtgggaaatataaatgataaatatgtaaataattttagttattcaata
gataataatcatatatatgtaaataatgaaatacattttatgaacaatatgaatattcca
tcatctcaacaaaaaatatataatgatataagtatagaatcaagtaaagatttaaatatt
agttccaacaatttgcttactccatatacaaacaatatgattgacggaataaatattcaa
agtactaatgaggcaagaacaataaatactaaaatgatattaatgaatcccttaataaat
gcggataataacaaaattgcttataagaatatgttaaataataaataccttaatgtatca
tccataagtattaatgataataattatatgaatgagactcatatgaatataaatgatgat
aacagaaatagtatactacctgtacaagaaaacaattttttagttaaacaaaaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaagatagcaaaacaaataataaaaagaagaaaaagaaaatatatgtt
ttagatgataaagtatggaatagtataaaagatccaaatatatatcataaaataataaca
ggttgttgtatacccaatataactgtttttccgaattataatataacttgttttaaaaat
tataatcataccaatccacaaaatcaatttactattatgacttggaatgtgttagcagaa
atttatggaaccattgaagcttttccacattgtgatccttatatgttagcatggtcctat
agaaaaacaaaaataattcaggagatcttaaataatagtccggatatagtatgtttgcag
gaaatacaaaatgaacactttttggacttcttcaagccgtcccttggagagtttgggtat
gaaggtgtttacaaacaaaaaacgaaagaaattttcacgtccccttcaggaaaaaggaga
ggagggaaatatactatagatggatgtgcaatattttataataagaagaaattaaaattt
gtagaaacatatgcattagaatttagtaaattaataaaagaagcttctgttttaacatta
ccaaaagaaattcaaaagaatccttcgttagttaagagattattaaaggataatgtagca
ttagttatattattagaatgtatccagcaatactcgaaaatatatgataaatcagaagaa
aaacaaaataagaaattactaatagttgcaaatacacatattgtagcaaatcctgaagct
aattatgtaaaaatatggcaaactcaaatattagttaaagtaatcgaatatttaaaaata
aattttattaagaaatatgaaacaataccaagtttaattatatgtggagattttaatagt
actccttcaagtgctgtatatcaattaatatacaaaaaaacttgtagtagaacccatgaa
gactttaactcggataaatatagtttattaacagatttaaaattaggtcataatttgaat
ttgaaatcagcatatgctatatccaaattattatcacaaaaattaaatcctgaagaatat
aataatttagagttatatgaaccattatttactaattatacaagtaattttattggatgt
ttagattatatattctataatgatgaaaatcttaatattatttcaaccgtaaatgtagca
gatgaaaatcaattaatacaagaagcgcaaatgtatcaactttcggactgtgctctacca
agccctataagaccatctgaccatctaccattaatagcacaatttgagttcaaagtattt
tga

DBGET integrated database retrieval system