Pseudoalteromonas maricaloris SCSIO 43202: CTT31_07125
Help
Entry
CTT31_07125 CDS
T08529
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pfli
Pseudoalteromonas maricaloris SCSIO 43202
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfli00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pfli02000
]
CTT31_07125
Transporters [BR:
pfli02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CTT31_07125
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USE68892
LinkDB
All DBs
Position
1:1658246..1661104
Genome browser
AA seq
952 aa
AA seq
DB search
MSKFKPSMLTLALIAAGVSHAAPVEDNTANNEENNVEVIEVRGISRSIIASIDKKRFSDT
IAEVVDAGDLASLPDVSIADSLSRLPGITAVRASGQSSQLNIRGMNGDFIQTTLNGREQA
STSGYTAGSRWISFDQYPSELINQAAVYKSPKASLIEGGVAATVELKTANPLDAEKEHNF
NSSVRYSYNDAASDVGADSTGERISFSYRGKFLNETLGFAIGGAYLNQPNNAIDISAHAP
TRSQDFDGDGTEERSVNGFQYRSAKGSDERLGLLSTLVYQPTDAFKVQFDYFHSKFESED
KKSGLNIEGFSKDINSLYTVDNAVVKDGFLVAGDVTITDPNGPWVEMRSEDQSTDSTTDS
FGLNLQYTTDSWELKFDWAHSEGEKTRRDMIASMHAYEYGTSTLEDGTLVNTWQELRNQT
FSFEQREKDSPLLTLGNGYTDLSNMRLGDWEQFPHKYTDELDSVKVDFKYFIENSFISSI
EVGARWSDREFTDQRSTFRWGAREGQNGYQLPDGTIVTNKGCEFNDQNHPCIPHDLTGYV
SVRDTRGFQYLELDLEGIANEVFGPGNYEAQQTWGHNWTLIESGAVREEVLAGYIMANID
TEIADIPVTGNFGVRVVRTDTKSIGIQQIQGDEVGDSIIDDNGVERTDYRHVNYGPEYTD
TLPSLNLNFRVSDTDQIRFAAAEVIGRPPVYQLRGGAGSWADTANDGTSPRYNVWSKGNP
NLDPFRATQIDLSYERYFEDGGAFVAAIFWKDIESLIESITYQEGEVDWADIGLEVPDGF
VAGQYQTTQNNDQGGYIRGIELAYTTMFDNLPGVFSGLGFNANYSYTESETTVDGGGNFP
DQQLPLPGLSKNVWSATVFWNIDSFTTHLNIRYRDEYVYEGASPGGSSLAWADEYTVVDW
QASYNFENGLEAVLQVNNLTDEPNTTNYGTALATGEYKEFGRQYYLGFNYSF
NT seq
2859 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaagttcaaaccgagtatgctaacgcttgcgctgattgctgcgggtgtgagccat
gctgctcctgttgaagataacactgctaataatgaagaaaataacgttgaggtgatcgaa
gttcgaggtatttcgcgcagtatcatcgcctcaatcgataaaaaaagatttagcgacacc
attgcagaagtagttgatgctggagacttagcttccttacctgacgtgtcaatcgctgac
tcgctaagccgtctacctgggatcaccgcggtaagagcaagtgggcaatcttcgcaactt
aatattcgcgggatgaacggcgactttattcaaaccacattaaacggacgtgagcaggcg
agtaccagtggatataccgcaggtagtcgctggatttcattcgaccaatatccgtcagaa
ttaattaatcaagccgcagtgtataaatcaccaaaagcatcgctgattgaaggtggtgtt
gcggctacggttgaacttaaaacggcaaaccctctcgatgctgaaaaagaacataatttt
aattcttcggtaagatattcctacaatgatgcagcgtcagatgtaggcgcggattcaaca
ggcgaacgtattagtttttcataccgaggtaaattcctaaatgagacacttggttttgct
attggtggggcgtatctaaaccaaccaaataacgcaattgatatctcagcgcatgctcct
acacgctctcaggattttgatggcgatggtactgaagagcgctcagtcaatggctttcaa
tatcgctcagccaaaggcagcgatgaaagacttggcctgttaagcaccttggtgtatcag
ccaacagacgcattcaaagtacaatttgattatttccattctaagtttgaatcggaagat
aaaaagagcggcttaaatattgaagggttttcaaaagatattaactcgttgtatacggtt
gacaatgcagttgttaaagatggttttctagtcgctggggatgtaactattacggatccc
aatggcccatgggttgagatgcgctctgaagaccaatcaacggactcaaccaccgacagc
tttggcttaaacttgcaatacacgacagattcgtgggaattaaagttcgactgggctcat
agtgaaggggaaaaaacgcgtagagatatgattgcttcaatgcatgcatacgagtacggt
acttctacactggaagatggaacattagttaacacctggcaagaattaagaaatcaaacg
ttttcttttgaacaaagagagaaagattcaccactgttaacacttggcaacgggtatacc
gacctatctaatatgcgactgggtgattgggaacaattccctcacaagtacacagacgag
ttagatagcgttaaagttgattttaaatattttattgagaacagctttatttcttcgatt
gaagttggtgcacgttggtcagaccgagaatttacggatcaacgctctacatttagatgg
ggcgcacgcgaaggccaaaatggttaccagttaccggatggcaccatcgtcacgaacaaa
ggctgtgaatttaatgatcagaaccacccgtgtattccacacgatttgacgggatatgtt
tcggttagagatactcgaggcttccaatacttggaattagaccttgaaggtatcgctaac
gaagtatttggtccgggtaattatgaggcgcaacaaacttggggccacaattggacgctc
attgaaagtggagcagttcgagaagaagtattagccggttatattatggcaaatatagat
accgaaattgctgacataccagtgacgggtaattttggcgttcgagtagtaagaactgat
acgaaatcaataggcattcaacagatccaaggtgatgaagttggtgactcaattatcgat
gacaatggcgttgaaagaaccgattatcgccatgttaattatggtcctgagtatacagac
acattgccttcactaaacctcaatttcagagtgagtgacacagaccaaattaggtttgca
gcagcagaagttattggccgtccacctgtctaccagcttagaggtggtgcaggttcttgg
gctgacaccgcaaatgatggtactagtcctcgttataatgtgtggtcaaaaggtaaccca
aatttagacccgtttagagcgactcaaattgatttatcttatgagcgttactttgaagat
ggtggtgcttttgttgccgcgatattctggaaagatattgaatctttgattgaaagtatc
acttatcaagaaggtgaagttgactgggctgatattggcctagaggttcctgatggattc
gttgcaggtcaataccaaacgactcagaataatgatcaaggtggatacataagaggtatt
gagcttgcttataccactatgtttgataatttaccgggcgtcttttcaggtttaggtttt
aacgctaactattcatatactgagagcgaaacaacggtagatggcggtggtaacttccct
gatcagcaattgccactcccaggtctatcaaaaaatgtttggagtgctacggtattttgg
aacatagactcgttcacaacacacctgaatatccgttaccgtgatgagtatgtgtatgaa
ggggcttcacctggtggctcttctctagcttgggctgatgaatatactgtggttgattgg
caggcatcgtacaactttgagaatggtttggaagccgtcttacaggttaataacctaact
gatgagccaaataccactaactatggtactgcacttgccactggtgagtacaaagagttt
ggtcgccagtattatttagggtttaactatagcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system