Pseudoalteromonas flavipulchra: CTT31_15630
Help
Entry
CTT31_15630 CDS
T08529
Name
(GenBank) GGDEF domain-containing protein
Organism
pfli
Pseudoalteromonas flavipulchra
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
CBS
DUF2582
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USE70466
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3508128..3509909)
Genome browser
AA seq
593 aa
AA seq
DB search
MDPSRTLVLNTIIKEKAVFTLFQPIYDLAKRQILGFEALSRGMSGSLLESPDKLFAIASK
QERLSELEIICREAAIKQFVSLNLPGKLFLNVSPKALLDPSHPKGETRHLTEVYGLDPKR
VVIEVTEQDKVDDANLLLTTITHYRELGFQIAIDDLGAGYSGLRKWSELCPDYVKVDRYF
IDHCDQSVVKREFLKSIIELAKATSTQVIAEGIERMEELKLIEQLGIVNAQGFLLAKPTR
KPPTELALLKSLHSEVRSSVNQFEQSMAIGWLAKEANAIHECTQCIDAHRLFEQDRKLTS
LAVVNDAREPVGLLHRDQLTEVFAAPYGHALFDKKSVIKLMDKQPLVVDEQQELDTVSKQ
ITDHEFDIRRHIIITRDGRYLGLAPLRDILKHITEEKIRHAQHANPLTMLPGNVAINEAI
EQRLRSHHDFSLAYIDLNHFKQFNDLYGYASGDSVIKLLAEVTVDVCAQSSSFVGHIGGD
DFMVVFDNNDAEVLCHEIITQFELKSKAFFTPEHVSAGGYWATNREGQKQFVPLLTLSIG
LVRPDLQHCINSHQVAALATDAKKEAKRYRNSYLFVCNRRKPTVSTVRLENAG
NT seq
1782 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggatccttcgcgcacgttagtacttaatacaataataaaagaaaaagctgtatttact
ctgtttcagcctatctacgatcttgcgaaacggcaaatcttagggtttgaagcattaagt
cgtggcatgtccggctcattgttggaatctccagacaagctttttgcgatcgcgagtaag
caggagcgtttgtcagaactcgagattatctgtcgtgaagccgctattaagcagttcgtc
tcactcaaccttcctggtaagttatttttaaacgttagtccaaaagcgttacttgatccg
agccacccaaagggcgaaaccagacatcttacagaagtgtatgggctcgatcccaagcgt
gtcgtcattgaagtgactgagcaagacaaagtagatgacgcgaatctgctactaactaca
attactcattatcgagaacttgggtttcaaattgcgattgatgatttgggagcgggttat
tctggtctcagaaagtggtcggagttatgccctgactacgttaaagtcgacagatatttt
atcgaccattgtgaccaaagtgtggtgaaacgtgagtttttaaagtctattatcgagctt
gctaaagccactagcactcaagtaattgccgagggaattgagcggatggaggagctaaag
ctgatagagcagctcggtattgtaaacgctcaaggctttctgctcgcgaagccaactcga
aagccaccgacagagctggcgttgttaaaatcccttcattcggaagttcgttccagtgtc
aatcaatttgagcagtcgatggcaatcggttggcttgccaaagaggccaatgctatccat
gaatgtacgcaatgtatcgatgctcataggctgtttgaacaagatcgcaagctaaccagc
cttgcagtggttaatgatgctagagagcctgttgggctgctacacagagatcaactgact
gaggtgtttgcggcaccatatggccatgcgctcttcgataagaaatcagtgattaagttg
atggataaacagccgttagtggtggatgagcagcaagagcttgatacggtgagtaagcaa
ataaccgaccatgaatttgatattcgacgtcatatcattattactagagatggtcgttat
cttggcttagcgcccttgagagacatactcaagcacatcacagaagaaaaaattcgtcat
gctcaacatgccaatccattaaccatgttgccgggcaatgtcgcgataaatgaggcaata
gagcaaaggttacgttcacatcatgacttttctcttgcatatatcgaccttaatcatttt
aagcagtttaatgatttatatggatatgccagtggcgatagcgtgattaagctacttgcc
gaggtgacagttgatgtatgtgcacagagctcaagttttgttgggcatatcgggggcgac
gactttatggtggtgttcgataataatgatgcagaagtgttgtgtcatgagatcatcact
cagtttgagcttaaatcaaaagccttttttactcccgagcatgttagtgctggcggttac
tgggcaacaaatcgtgaagggcaaaagcaatttgtacctttactcactttatcgattggt
ttagtgagaccagatttacaacactgtatcaattcgcaccaagttgcagctttagcaacg
gatgctaagaaagaagcaaagcgctatcgtaatagctatttatttgtatgtaaccgtcgc
aagcctacggtatcgactgtacgattggaaaatgcaggttga
DBGET
integrated database retrieval system
