Ptychodera flava: 139133845
Help
Entry
139133845 CDS
T10724
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: laminin subunit alpha-2-like
KO
K05637
laminin, alpha 1/2
Organism
pfll Ptychodera flava
Pathway
pfll04512
ECM-receptor interaction
pfll04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfll00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
139133845
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
139133845
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_1
Laminin_G_2
EGF_laminin
Laminin_N
Laminin_B
EGF_LMN_ATRN
Laminin_G_3
Laminin_I
Laminin_II
3keto-disac_hyd
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139133845
NCBI-ProteinID:
XP_070556708
LinkDB
All DBs
Position
5:38014832..38124877
Genome browser
AA seq
3091 aa
AA seq
DB search
MQLYWLALVLSAVCLVTEISCQQNQGDDRGLFPVIFNLANNARITSNATCGENGPERYCK
LVEHVPGEPAPNPQCRVCDANSFDPRERHPIENAIDGTNSWWQSPTIANGMAYHYVTITL
DLQQIFQIAYVIVKSANSPRPGNWILEKSNDGVTYEPWQYYAVSDSECLTLYNIEPTIGN
PRYEEDDDVICTSFYSKLNPLENGEIHTSLVNGRPSVLKPTAELMEFTSARFIRLRLQRV
RTLNADLMTLTSNEPGFIDPLVTRRYYYSIKDISIGGQCICFGHARVCPRDPITLASRCE
CEHNTCGDQCQECCPGFNQKAWKPGTQEESNICEPCNCHGHAVDCYXDQGVEDRGESLDI
FGNYEGGGVCIGCRDNTMGINCELCIDRYYRPANVLRTDPDPCIPCSCNPFGIREVPDMA
FGSCVKDDSQVNEGLNPGDCFCKEGYAGAQCDRCARGYQGFPDCEKCPCSIEGSVNEDVC
EPPCVCKNNVEGENCDICKSGYYNLDGDNSVGCSACFCFGITTICSSAAVTQYEVQSLDG
WAIGDKTGNVLVPVNRSPGQTILTVKHSDYLKQVDSDILYWYAPAEYLQNKLSSYGGMLT
YTVRYNENSNANVSTPVLDSDVILKGSNGVTLKQRPSRWVVPDREETFQFAMQEDTWFHE
NSERYVSKVEFMTILQDVQALMIRATYHTAHAETSLYDVSLEYGVLDDNSTNSFGSVEQC
SCPPGFEGLSCEECLPGYRRIDGKIFEGECVPCECNGHAVECDDFTGACIECQHFTTGKE
CAECDDGYYGDATQGSPEDCVRCACPLRESSNNFSPTCIPDGNGGFICDYCDIGYEGPRC
DRCADGYYGNPLVLNDTCKPCMNICNGNLNLAMDGNCNTLTGECLRCAGNTAGPTCNRCA
DGFYGDAIFEKNCQLCQCYRTGSESEICDHLTGQCQCKPFVTGQFCNICEPGYWDILSGK
GCGPCFCDPDGSVGPECDIVTGQCFCKPGVTGRTCDRCQPGYYNFTSNGCTLCDCERTGG
SCDSNTGECICPPNTVGKRCQRCVPNAWGHDRVTGCKLCNCSVDGSRSQQCDVNTGECDC
LEDYRGRQCDQCLFGYHDFPKCRQCSCSSDGTDPESCDEDGLCGCEDDGQCQCKLNVNSE
KCDLCADDSFGLRDELETGCTQCFCFGIIDQCDQADYVKDEIVMTASTNGFFVSDDRSVV
QTQSGVLFTPSEVRLNASLAYGEMTTRPTLYWNLPPAFLGNKITSYGGRIRYTVQYFGED
LGEDDVFDILIKGHYHTLVKSIPNPFSGVPQSFDLELIETEWQLRDAIYLETAPRDVFMM
ALYDVKAIMIRATYGPGMTELILSDLSFEVGIPRSDNPSLPEALGVEECECPDGYQGLSC
QECAPGFVRVANGPYLGTCRPCTCNNHGAMCDSSTGVCEDCEHNTSGPMCEECADGFFGN
ATMGTPDDCQPCACPLVTSSNNFSPTCVLESDGGHHCTDCESGYIGRYCDTCEEGYFGNP
TVPGSSCEPCDCNEYGSLNQTCDPVSGQCVCDEGLSGRACDVCQPRHVFTQQGCTSCDDT
CTGLLLDDIDELTAKLETPNITGIVPAPWSRLRMMVNATQQLQPQLESYKNALEVAADMV
NSLPDGVMGLEDDVMALLKRSEESQTRSSNTAEEANKSDRRAIEVEQLLQDTLDKIKALI
KDLEDLADSISSQPALENEALLEEAKRILDEIMARNFTVRDQDAMDELERAKESLRKAQR
AFMDKVEENIELADRIEDSMMDIMDKFNELINQTELADMMADNTEELNYNSRNTSLEVKE
KMKQLMERETALINVLNSGRHLLENASDAINIGYRELEQTLLKSEDLTAVLPDVRMKVGL
IQQNMADVPEVVARAEQHADSLAEYAASLENLFESTRDLAEVPVKAARVYGEIVDTISDA
NITAHEARQIADEALQQASEGTGAEDSLAARAMNSKERSEILLDGAQTKDSDVNSLEDRL
GLVKQDIDTIKATKKEITDKNSAIQAELPALQTDLSQKAQEAKAKADEASGRAAAAKQKT
QDVLDALPSQLEKFSKLKENTLMASTNINSADRSLDRSKSALSKMLELSESLTRRAANIR
DLQGMMANNLTQITERISLAKSQAASIKLSVDTSGTCIRGYEPDVSRSPYNSVVMNFKTT
QADNLLMYLGSVTTDDFLSIETVNGRVKFQWDVGAGLGSVTHPMSIDDDKWYKVEANRYG
AAAELRVKRSTSSSDTEVARSEAPPEYSVLDADRDSDFHIGGIPESLFSTNNALTSKTFG
GCVGETILDGKNVGLWNFTDAGGSCDGCIESPGPLPAANTYHFDGSGYVIMPKIRKWNTE
STTLLFQFKSFDENALLFYVTDNKKDFMSVELNEGRVVYRYDLGAGIAELITQNKYNTGD
WVRVSARRVKRGGILIVNDVDKVEADAPGTLSGLAVDDFMYFGGVPSEVEVRSGIVSRRF
AGCLREISVNTNSQELSSESIRFVGVTDGCLSKPIRSVGIMGSGYLELPAMDLDDDADIT
VSFATMQPNAIIFVAKDTNARRKRQINADAEGVYYSMMLNNGRLQVQVNAGDGEVLLTTR
KQAGTFNDGNFHVASIVKEGRSIRLTVDDIHSRGGNLPSSNTKVTANRFFVGGVHEDFQS
ELGEAAEVVTPFAGCIQDLVFNGGLIDYATTTDFERAQIGHCMAPSEIEIPTLAPPAITT
QRTEAPQPTEEVSMVTPDTESCYEPSAPETMAGTVQFGKTTNSHLQYEISKKSVNKQFKI
TVEVRSYATTGVIFYLGNGGDGKGDFTALQVIDGVPVFSFDNGAGSVTLTSPTQINDGEW
HSIVVSRNRRSGDLTVDGANEQRGKAPDGATNMDIKPPLYVGGVDESVLVPRLRKVTNSL
DSCIRKFELNDDPLDLQSPTSSKDTMPCHKTVGDSAYFDGTGYAVLDDTFRVGTDMLIEL
EFRTTKNNGVLLTVANERNDCFGLELVNGELILRADNGAGKFEAVYTADSAYTLCDNEWH
TVSAEKVKNALQMTVDGQPVGGGTDKISSSADTNNPLYVGGYPDTAIEQKALTISEKFEG
CIRNIAIRGTTQDMSKAPTLENVQPNSCPYV
NT seq
9276 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagctctactggctagcgttggttttgtccgccgtttgccttgtgactgaaatttct
tgtcagcaaaaccaaggtgatgatcgaggtttatttcctgtgatctttaacttggctaac
aatgcccggataacgtcaaatgcaacatgcggtgaaaatggacctgaaaggtattgtaaa
ttggtagaacacgtacctggagaaccagctccaaatccacagtgtagagtctgtgatgcc
aacagctttgatcccagggagagacatccgattgaaaatgctattgatggtacaaacagt
tggtggcagagtcccacaattgccaatggaatggcctaccattatgtcaccatcacgttg
gatttacaacagattttccagattgcctatgtcatcgttaagtctgcaaattcccctcgt
cctggtaactggattcttgagaagtcaaacgatggagtcacttacgagccctggcaatat
tatgcagtgtcagattctgaatgtttaaccctgtacaacattgaaccaaccatcggcaat
ccacgttatgaagaagacgatgatgtcatctgtacatctttttactccaagttgaatcca
ttggaaaatggtgaaattcacacttcattggtaaatggacgacctagtgttctcaaacca
actgctgagttgatggaatttacatctgcccgtttcattcgtctgagattacagcgtgtt
cgcactctgaatgctgatttgatgaccctgacatccaatgaacctggatttattgatcca
ttggtaaccagaagatattactattccatcaaggatatctctatcggtggtcagtgtatc
tgttttggtcatgccagggtttgccctcgagatcccataacgctggcatcaagatgtgag
tgtgaacataacacttgtggagatcaatgtcaagaatgttgccctggattcaatcagaaa
gcctggaaacctggcactcaagaagaaagcaacatctgtgaaccctgtaactgccatggc
catgctgttgactgttacnttgatcaaggagtagaagatcgcggagaaagccttgacatt
tttggaaactatgaaggcggaggagtttgtattggttgccgtgacaacaccatgggtatt
aattgtgagctctgcatagaccgttattacaggccagccaatgtgctccgaaccgatcca
gatccctgcattccatgtagctgcaatccattcggtattcgtgaggtgcctgatatggca
tttgggtcctgtgtaaaagatgacagtcaagtaaatgaaggattgaatcctggtgattgt
ttctgtaaagaaggctatgccggagcacagtgtgaccgatgcgcaagaggataccaaggt
tttccagactgtgagaagtgtccctgcagtatagagggcagcgtcaacgaagatgtttgt
gaaccgccatgtgtctgtaaaaacaatgttgaaggtgaaaactgtgatatatgtaaatct
ggttactacaacttggacggtgacaattcagttggatgttctgcatgtttttgtttcgga
attactacaatctgtagcagtgctgccgtcacacaatatgaggtacaatcattggacggt
tgggctattggtgacaagacaggtaatgtacttgtccctgtcaatagatctcctggacag
acaatcttgacagttaaacactcagattatctcaagcaagttgattctgatatcctctac
tggtatgcacccgccgaatatcttcaaaataagctgagtagctatggtggtatgctgact
tacacagtacggtacaatgaaaattctaacgcaaatgtttcaacaccggtgctggactct
gatgtcattcttaagggcagcaatggtgttacactgaaacaacgccccagtcgttgggtt
gtaccggatagggaagagactttccagtttgcaatgcaagaagatacttggtttcatgaa
aactctgagagatacgtcagcaaagtggaatttatgactattctacaagatgtacaagct
ttgatgatcagggctacctaccacacagcacacgcagagacaagtttatatgatgtcagt
cttgaatacggtgtacttgatgataacagcactaatagctttggatctgtagaacaatgc
agttgtccccctggatttgaagggttatcatgtgaggaatgtttaccaggctacagacgt
attgatggaaaaatctttgaaggagagtgtgttccttgtgaatgtaatggtcatgccgtg
gaatgtgatgattttactggagcgtgtatcgaatgtcaacatttcacaactggtaaagaa
tgtgcagaatgtgatgatggttactatggtgatgccactcaaggcagtccagaagactgt
gttcgttgtgcgtgtccactgagagaatccagtaacaatttcagcccgacatgtatacct
gacggcaatggtggctttatttgtgactactgcgatattggctatgaaggaccacgttgt
gacagatgtgctgatggttactatggtaatccgctggttttgaacgacacctgtaaaccg
tgtatgaacatctgcaatggcaatttgaaccttgctatggacggtaactgcaatacattg
actggagaatgtttaaggtgtgcaggaaacactgcgggaccaacttgtaaccgatgcgca
gatggtttctatggtgatgccatctttgaaaagaattgtcaactgtgtcagtgttacaga
actggatcagagtctgagatctgtgaccatctcaccggacagtgtcagtgcaagccgttt
gtcactggtcaattttgcaacatctgcgagcctggttactgggatattctttctggaaaa
ggttgtggcccttgtttctgtgatcctgacgggtctgttggtccagaatgcgacattgtc
actgggcagtgtttctgtaaaccaggagtgacaggcagaacctgtgatagatgtcaacca
ggatattacaatttcacctcaaatggatgtacattgtgtgactgcgaaagaactggcggc
tcatgtgactccaacactggagagtgtatctgcccacctaacactgttggaaaacgttgt
caacgatgcgtaccaaatgcctggggacatgatagagttactggatgtaaactttgtaac
tgcagcgtcgatggttctcgcagccagcagtgtgatgtcaacactggagaatgtgattgt
ctggaagattatcgtggcagacagtgcgaccagtgtctgtttggttaccacgatttcccc
aaatgtcgccagtgcagttgcagcagtgatggcacagaccctgaaagttgtgatgaagat
ggtttgtgtggctgtgaagatgacggtcaatgtcagtgcaagctgaatgttaattcagag
aaatgtgacctgtgtgcggatgattccttcggtttgcgcgatgaactggagacaggatgc
acccagtgtttctgttttggtatcatcgatcaatgtgaccaggcagactatgtcaaagac
gagattgtgatgacagcatccaccaatggcttcttcgtaagcgacgatcgcagcgttgtc
cagacgcagtctggtgtgctctttacaccttcagaagtacgtctcaatgcaagtttggcg
tatggtgaaatgaccaccagaccaactctgtactggaatctaccgccagcgttccttgga
aacaagattacttcatatggtggccgtattcgttacactgtgcagtactttggtgaagat
ctaggggaggatgatgtctttgatatcctaatcaaaggtcactatcatacattggtcaaa
tccatacccaatccattcagtggagtaccacagagctttgacttggaactaattgaaacg
gaatggcagctccgtgatgccatttatctagagactgctcctagagatgtattcatgatg
gctctctatgatgtcaaggcaattatgattagagcaacctatggtcccggcatgactgaa
cttatcctgagtgatttgagttttgaagttggtattcctcgttctgataatccatcatta
cctgaagctcttggagttgaagagtgtgaatgtccagatggatatcaaggattatcttgt
caggaatgtgccccaggctttgtgagagtagctaatggtccatacttaggaacttgccga
ccatgtacttgcaataaccatggagcaatgtgtgattccagcactggtgtctgtgaggac
tgtgaacataataccagtggaccaatgtgtgaagagtgtgcagatggtttctttggcaat
gctaccatgggaacccctgatgattgccaaccttgtgcctgtccactggtgacatcatcc
aacaatttcagtcccacctgtgtactggaaagtgatggcggtcatcactgtacagattgt
gaatcaggttatataggcagatactgtgacacgtgtgaggaaggctatttcgggaatcca
acggttccaggaagcagttgtgaaccctgtgactgtaatgagtatggatcattgaatcag
acatgtgacccagtgagtggacagtgtgtctgtgatgaaggtctcagtggaagggcatgt
gatgtatgtcaaccaagacatgtctttacacagcagggatgtacttcatgcgatgatact
tgtactggattattattggatgatattgatgaattgacagcgaagttggaaacaccaaat
attactggcatagtacctgcgccatggtctcgtcttcgtatgatggtcaatgctacacaa
cagttacagcctcagcttgaatcctacaaaaatgctctggaagttgctgctgatatggtc
aattctctacctgatggtgtgatgggtttagaagatgatgtgatggctcttttgaagagg
tctgaagaatcccagacaagatcttccaacacggcagaggaagccaacaagagtgatcgt
agagccattgaagtggaacagcttcttcaggataccctagataaaatcaaagcgctgatc
aaggaccttgaagacttagcagacagtatttcaagtcaaccagcattggaaaatgaagct
ttactggaagaagctaagcgcatcttggatgaaataatggcaagaaattttacagtccgg
gatcaggatgctatggatgaattagaacgtgccaaggagtccttgagaaaagctcagaga
gctttcatggacaaagtggaagagaacatagagctggcagatcgtatcgaggatagtatg
atggacatcatggataaattcaatgaattaatcaatcaaacagagctagccgacatgatg
gctgataacactgaggaactcaattataacagtcgcaatacctcattggaagtaaaagag
aaaatgaaacaactaatggagagagagactgcattgataaatgttctgaactctggaaga
cacttgcttgaaaacgcatcagacgcaataaatattggatacagagaacttgagcaaacg
ttactgaaatcagaggacctaacagcagtcttaccagatgtgcgaatgaaagtcggctta
attcaacaaaatatggcggatgtacctgaagtagtagcccgtgctgaacagcatgctgat
agcctggctgagtatgcagcttcccttgaaaatctctttgaaagcacccgtgatctggct
gaggtgcctgtcaaagcagccagagtgtatggtgaaattgtagacacaatcagtgacgct
aacataacagcccatgaagcaagacagatagctgatgaagcattacaacaggcatcagag
ggaaccggtgcggaagactcccttgcagccagggccatgaactccaaggaaagaagtgaa
atcctactagatggcgcccagactaaggattccgatgtaaattccctggaagacagactt
ggattagtcaaacaagacatagatacaataaaggctactaaaaaagaaataacagacaaa
aattctgcaatccaagctgaattaccagctctgcaaacagacttgagtcagaaagctcag
gaagccaaggccaaggctgatgaagcatctggccgtgctgcagcagctaaacagaagacc
caggatgtgctcgatgcattaccatcacaacttgagaaattttcgaagttgaaagaaaat
actttaatggcctcaacaaacatcaactcggctgacagaagcttggacaggagcaaaagt
gctctgagtaaaatgcttgagctgtcggaatcattgactcgcagagctgcaaacatccgg
gatttacaaggaatgatggcaaataacctcacacagataactgaaaggatatctttggca
aagagccaagctgcaagtatcaagttgtcagtcgatacatcaggtacctgtatccgtggt
tatgaaccagatgtctcacgaagcccttacaattctgtcgtcatgaatttcaaaacaaca
caggctgacaatctgttgatgtatttgggatctgtcaccactgatgatttcctgtcaata
gagactgtgaatggaagagtgaaattccaatgggatgtaggagccggtcttggaagtgtt
acacatccaatgtcaatagatgatgacaagtggtacaaagtagaagctaacagatacggc
gccgcagcagagctgagagtcaagcggtcaacttccagttcagatactgaggtggcaagg
agtgaggctcctccagaatacagtgttttagatgccgatagagacagtgacttccacatt
ggtggaattccagaatctcttttctcaacgaacaatgctttaacttctaagacatttggc
ggatgtgttggtgaaacgattcttgatggcaaaaacgttggactttggaactttacggat
gcaggtggttcatgtgatggatgtattgaaagccctggcccacttcctgctgccaatacg
tatcactttgatggatctggatatgtcattatgcccaaaattcgcaagtggaatactgaa
tctacaactctccttttccagttcaaatcatttgatgaaaatgctttattattttatgtt
actgacaataagaaggacttcatgtctgtggagctgaacgagggcagagttgtttatcgc
tatgacttaggtgctggtattgccgagttaatcacacaaaataaatataacacgggtgac
tgggttcgtgtttctgcaagacgagtcaaacgaggcggaatattaattgtaaatgatgtt
gataaagttgaagctgatgctccaggtactttatcaggccttgcagtcgatgatttcatg
tactttggaggtgtcccatcagaagtggaagtcagatctggcattgtgtcgagaagattt
gcaggttgtctaagagagatttctgtaaatacaaattcccaagaattgagttcagaaagt
attcgctttgttggtgttactgatggttgcttgagcaagcctattcgcagtgttggtatc
atgggtagtggttatttggagttacctgccatggatttggatgatgacgcagatatcacc
gtgtcattcgcaacgatgcagcctaacgccattatcttcgttgctaaggataccaatgcg
agacgcaagaggcaaattaacgcagatgctgaaggagtgtactactctatgatgttgaac
aatggcagacttcaagtgcaggtcaatgctggagacggagaagttttactgacaacgcgc
aaacaagctggcacatttaacgatggtaacttccacgttgcaagcattgtcaaagaaggc
agaagtattcgtttgacggtcgatgatattcattcacgtggtggtaatctgccatcaagt
aatacaaaagttacggccaatcgtttctttgttggcggcgttcatgaagatttccagagt
gaactgggagaggcagctgaggtggtaacaccgtttgcgggatgtattcaagacttggtc
ttcaatggcgggttgatagactatgcaacaactactgattttgagagagcacaaattggc
cattgcatggcaccttcagaaattgaaataccaacattagcaccaccagcaatcacaaca
cagaggactgaggctccccaaccaacagaagaagtttccatggtaacaccagatacagag
agttgctatgaaccgtctgcaccagagaccatggcaggcactgtccagtttggtaaaact
acaaacagtcacctacagtatgaaatcagcaaaaagagtgtcaacaaacagtttaaaatt
actgtggaagttcgaagctatgctaccaccggtgttatattttatctcggtaatggtggt
gatggaaagggagatttcaccgcactacaagtgattgatggagtccctgtcttcagcttt
gataatggtgctggttctgtgacattgacaagtccaacacaaatcaatgatggagagtgg
cattccatcgttgtgagtcggaatcgcagaagtggtgacctgacagttgatggtgctaac
gaacaacgcgggaaggctccagatggtgcaacaaacatggacatcaaacccccattgtat
gttggtggagttgatgaaagtgtcttggtgccaagacttcgaaaggttaccaacagtttg
gacagctgtatcagaaaatttgaattgaatgatgacccacttgatctacagtcaccaaca
tcgagtaaagacactatgccatgtcacaaaacagttggagatagtgcctactttgatggt
actggttacgctgtactagatgatacattcagggttggaactgatatgcttatagaactt
gaattccgtaccaccaagaacaatggagttctattgacagtagccaatgaaagaaatgat
tgttttggattggaacttgtcaatggagagctgatccttcgtgctgacaatggagctggc
aaatttgaagccgtgtacacagcagattctgcatatactctgtgtgacaatgaatggcat
acagtcagtgctgaaaaagtcaagaatgcattacaaatgacagtagatggacaaccagtg
ggtggtggtacagacaagataagcagttctgctgatacaaataatccactgtatgttggt
ggatacccagatactgctattgaacagaaggctttgacaataagtgagaaattcgaagga
tgtatccggaatatcgcaattcgaggcacaacacaagacatgagtaaagcaccaacgctg
gagaatgtacagccaaactcttgtccatatgtctga
DBGET
integrated database retrieval system
