Ptychodera flava: 139144974
Help
Entry
139144974 CDS
T10724
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K20994
Notch 2
Organism
pfll Ptychodera flava
Pathway
pfll04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfll00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
139144974
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
EGF_TEN
hEGF
EGF_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
139144974
NCBI-ProteinID:
XP_070571941
LinkDB
All DBs
Position
12:10905212..10933989
Genome browser
AA seq
1908 aa
AA seq
DB search
MFFRRMIFCGLVSFLEQICSFACEVNVSLTEISSLVGIKIIKYVSVADDPCRSQPCHNGG
TCTLVQGDSIGFSCQCVDGFTGNDCSTVVSACNSSPCVNNGQCYPTTAGYTCMCTGDFTG
TNCEIVVACLSNPCQNSGTCLAHPLLSQGYFCLCAPDFMGTNCELDHVPCDPNPCLNSGM
CGLVDGNEVCICQPPYEGERCESVNPCGNRPCRNGGTCNRDSNQGAGFRCACTEYFAGDF
CEEVYACLSQPCQNGGTCQPHPVQTGGYLCLCAQGFMGTNCEQGNSQCSPNPCLNNGICA
VSSGNELCICVGLFEGERCEILNPCKSQPCKNGGTCVQESGREYNCLCTQYFTGTECEQV
YACFSQPCQNGGTCQPHPIQSGEYFCSCAEGYAGKNCEQGDLLCVPNPCLNDGICAISNG
NELCVCVGVFEGERCEIFNPCESQLCKNGGTCSSDSTEARGYRCTCTQYFHGDDCEQAYA
CSSQPCQNGGICQAHPVQLGGYFCACAQGFTGTNCEQGEVCNPNPCQNNGICAISEGNVI
CVCDGSYEGNRCEIFNPCKSQPCRNGGTCMQDTVQPSGYSCLCSEYFSGVECEQVYACFS
QPCQNGGSCQPHPVQLGGYLCTCAQGFAGTNCEQGSSLCDSNPCLNNGLCAVSEGRQLCI
CVGLYEGERCEVLNPCNSQPCKNGGTCVQDSSTSESKGYRCQCSQYFSGEECERVYACIS
QPCQNGGTCQRHPVEIDGYLCSCAQGFSGTNCEQGTPLCNPNPCSNNGDCVVADGSVRCI
CRGPYEGNLCEIFNPCIASEQRCENGGTCRQETSLPRGYSCSCSQFFTGENCEQVYACVS
QPCQNGGACGPHPVQQGSYFCSCQADFTGINCEQANLACDSSLCQNGGVCVISEGRMTCV
CSGPYEGDLCERFAPCSTQPCQNGGNCEVDPSQQNGYRCSCLQWFFGPNCEEVNACFSQP
CQNSGTCQTRQNGGYSCLCMQGFTGTNCEQGEVFCEPNPCQNGGACVISGGREICDCDGP
YEGEFCQIYNQCRIRPCQNGGTCTSDLTNNQGYRCSCLQWFMGDNCEEVNPCFTSPCQNG
GTCNSDTLQPGNYACSCVQGFIGNNCEQVDPCLLTRPCQNGGTCTRNPAVIGGYSCTCMQ
GFSGQNCDRANPCLLSFPCQNGATCRPDESMTEGYRCTCVEGYTGPRCEQVDPCQSQPCQ
NDGMCFQDATQSGGYRCNCLQGFAGMNCEQVNPCLVSRPCQNGGLCLPDSGQSSGYICSC
SQGFTGQNCEQVDPCLIATPCRNGGTCFQDSIQPGGYRCSCFQGFAGVNCEQVNPCVISQ
PCQNGGMCSPDSSQNGGYSCSCPSGFTGQNCEGVNPCVVSEPCLNGGTCSRDSTQPAGYV
CLCPQGFTGLTCDQVNPCLLSQPCRNGGTCTPDSSRPTGYLCACFQYFEGENCEQVNPCR
ISYPCQNGGTCSPDPTLNEGYRCVCSEGFAGHNCQEVNACLISQPCQNGGSCSPDSTQVD
RYRCYCAQGYTGSHCEQVNPCALGQPCQNGGTCTREPSRTGGYQCYCPLGFAGVNCEQGD
PCYSQPCRNGGTCSRDPSMPSRYVCACTSGFTGSTCGQENRCHTLRPCKNGGTCEIDPTQ
PGGYTCSCTEQFVGEKCDIGSPCASQPCQNDGTCERDPVREDFYVCLCSSFYIGKNCEEV
DRCLRYQPCRNGGTCHRDPEKTEGYFCSCVLGYIGFNCEQADPCVTRQPCQNDGTCQVDS
EEQGGYVCTCHVGFTGKNCDQAQRTCPDIYRGLCLNGGVCFVSDDEELGYVCTCPDGFNG
INCEMDMNMCDGNGPCERGTCRKTPSGPICVCPDEYYGETCERKSEVCNPNPCANSGRCI
VFEGRAVCGCMDGYEGVTCDALIGSYGNRPLSWIPVIALSFIIIGVVL
NT seq
5727 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttctttcgtcgtatgatattttgtggactggtgagctttctggaacagatttgttca
tttgcttgtgaagttaatgtgtcattgacagagatttcctccctcgttggtattaaaata
atcaaatacgtgtccgttgcagacgatccgtgtaggagtcaaccctgtcacaatggcgga
acttgcaccctcgttcaaggcgactctatcggtttctcttgtcagtgcgttgatggattc
acgggaaacgattgttcaaccgttgtgtctgcctgtaacagcagcccgtgtgtcaacaat
ggtcagtgttatcccaccaccgccggttacacgtgcatgtgcacaggtgacttcaccggt
acaaactgtgaaatagtcgttgcctgcttaagtaacccgtgtcaaaatagtggaacgtgt
ctggcacacccgctgctttcgcaaggatacttctgcttatgcgcaccagacttcatggga
accaactgtgaacttgaccacgtaccttgtgatcctaacccatgcctgaatagcgggatg
tgtggtcttgttgacggcaatgaagtgtgtatatgtcagccaccttacgaaggagaacgt
tgtgaatctgttaatccatgcggaaacagaccttgtcgaaacggtggaacgtgtaataga
gactcaaatcaaggagcaggattcagatgtgcctgtacagaatattttgcaggcgatttc
tgtgaagaagtttatgcatgtttgagtcagccttgtcaaaatggcggaacctgtcaacca
catcctgtccaaactggtggctacctgtgtctatgtgcgcaaggattcatggggacaaac
tgtgaacaaggtaattcacaatgtagtcctaatccttgcctaaacaacggaatttgtgct
gtgtctagtggtaatgaactctgtatatgcgtgggactattcgaaggagaaagatgcgaa
atcctaaatccatgtaagagtcaaccgtgtaaaaatggtggaacatgcgttcaagaatcc
ggcagggaatacaactgcttatgcactcagtactttactggaacggagtgtgaacaagtg
tacgcatgtttcagtcaaccgtgtcagaatggcggaacatgtcaaccccatcctatccag
tcaggggaatacttctgttcatgcgcagaagggtatgctgggaagaactgcgaacaaggt
gacctgctttgcgtacccaatccttgtctaaatgatggaatatgtgcaatatcaaatgga
aacgagctatgtgtatgtgtaggagtcttcgaaggagagagatgtgaaatatttaaccca
tgtgagagtcaactttgtaaaaatggcggtacatgtagctcggactcaaccgaagccaga
ggataccgatgcacgtgtacacaatattttcatggagatgactgtgagcaagcttatgca
tgctccagtcagccatgtcaaaatggcggaatatgccaagcacaccctgtccaattgggg
ggatatttctgtgcatgcgcacaaggcttcacggggacgaattgtgagcaaggggaagtc
tgcaatccaaacccttgtcagaataacggaatctgtgccatatccgagggaaatgtaatt
tgtgtatgtgatgggtcttacgaaggaaacaggtgtgaaatatttaatccatgcaaaagt
caaccatgtagaaatggcggaacctgcatgcaagatacagtccaaccaagcgggtatagc
tgtctatgttcagagtatttttcaggcgtggaatgcgaacaggtttatgcgtgctttagt
cagccttgtcaaaatggcggatcgtgccagccacatcctgtacagcttggcggatatctg
tgtacgtgcgctcaaggctttgctgggacgaattgtgaacagggtagctcactttgtgat
tcaaatccatgtctcaacaacggactttgcgcggtatcagaaggacgccagctctgcatt
tgtgtaggactgtacgaaggagagagatgcgaagttttaaatccatgcaacagtcaaccc
tgtaaaaatggtggtacctgtgtgcaagattctagtactagtgagtcaaagggatatcga
tgccagtgttctcaatatttttcaggagaagaatgtgaacgagtctacgcatgcatcagc
caaccttgtcaaaatggcggaacctgccagcgtcatcctgtagagattgatggatacctg
tgttcgtgtgcgcaaggattcagtggaacaaactgtgaacaagggaccccgttgtgcaat
ccaaacccatgctctaacaacggggattgtgttgttgcggacggaagcgtacgatgcatt
tgccggggaccatacgaaggaaacctctgtgaaatcttcaatccttgcattgctagtgaa
cagcggtgtgaaaacggcggtacctgtcgtcaagagacgagtcttccgagaggatacagt
tgttcttgttcacaattctttacaggagaaaactgcgaacaagtgtacgcgtgcgtgagc
cagccatgtcaaaatggcggagcttgtggaccacatccggtacagcaaggaagttacttc
tgttcatgccaagctgactttaccgggatcaactgtgaacaagcaaacctagcctgtgat
tcctcgttatgccagaatggcggagtttgcgtcatctcggaaggcaggatgacatgtgtg
tgcagcggaccgtatgaaggagacttgtgtgaaagatttgctccatgctcaacccaacct
tgccaaaatggcggaaactgtgaagtagacccaagtcagcagaatggatatcgatgttcc
tgcttgcagtggtttttcgggccgaattgtgaagaagtgaatgcctgtttcagtcagcct
tgtcaaaatagtggaacatgtcagaccagacaaaatggtggatatagctgtttgtgtatg
caaggttttactgggaccaactgtgaacaaggtgaggtattttgcgaaccgaacccgtgt
caaaatggtggcgcatgtgtaatatctggcggtagagaaatctgcgattgtgatgggcct
tacgaaggcgaattttgtcaaatatacaaccaatgtcgaatacgaccctgccaaaatggt
ggcacatgtacctctgatctgactaataaccaaggttatagatgctcatgcttgcaatgg
tttatgggagacaattgcgaagaggttaacccatgtttcacaagtccttgtcaaaatggc
ggaacttgcaattctgatacgttgcagccaggaaactatgcttgctcgtgtgttcaagga
tttatcgggaacaactgtgaacaagttgacccgtgtcttttaacacgaccttgccaaaac
ggcggaacctgcacgcgaaacccggctgtgataggtggatacagctgtacatgtatgcaa
ggattctctggtcaaaattgtgacagagccaatccatgtcttctgtctttcccctgtcaa
aatggcgccacctgtcgtcccgatgagagtatgactgaagggtacagatgcacttgcgta
gaaggatacaccgggccacgttgtgagcaggtggatccgtgtcaatctcagccctgtcag
aatgatgggatgtgttttcaagatgcgactcaatccggaggatacagatgtaactgtctg
caaggtttcgcaggaatgaactgtgaacaagtaaacccttgtctggtttctcgaccatgc
caaaatggcggattatgtttaccggattccggtcaatcgtctggatatatttgctcttgc
tctcagggcttcactgggcagaattgtgaacaagttgacccctgtctcatagcgacaccg
tgtcgaaacggcgggacgtgcttccaggactccatccaaccaggagggtacagatgttct
tgtttccagggatttgcaggagtaaactgcgagcaagtcaatccctgtgtcatctcacaa
ccgtgtcaaaatggcggaatgtgctcgcccgactctagccaaaatggcggatacagttgt
tcctgtccaagtgggttcactggacagaactgcgaaggagtgaacccatgtgtcgtcagc
gagccctgtctaaacggcggtacctgctcacgtgattcgacccaaccagctggctatgta
tgcctctgtcctcaaggattcacgggcctaacctgcgaccaagtgaacccatgcctccta
tctcaaccctgtcgaaatggcggtacgtgtacaccggactctagccgaccaaccgggtat
ttgtgtgcttgctttcaatactttgaaggggagaattgcgaacaagtcaatccttgtcgc
atctcatacccatgtcaaaatggaggcacatgttcgcctgatcctacccttaacgaagga
tacagatgtgtctgttctgaaggctttgcggggcataactgtcaagaagttaatgcatgt
ctcatttcccaaccgtgtcaaaatggcggatcttgctcacccgattcaactcaggttgac
agatacaggtgctactgtgcgcaaggatacactggctcacactgtgaacaagtgaatcca
tgtgccctcggccaaccctgccaaaatggcggaacttgtactcgcgaaccaagccgtact
ggaggataccaatgttattgcccgctgggcttcgcaggcgttaactgcgaacaaggagac
ccgtgttacagtcagccatgcagaaatggtggcacctgctcacgtgaccccagcatgccc
agtcgttacgtgtgtgcctgtacttcaggtttcacgggctcgacgtgtggccaggaaaac
cgatgccatacgcttcgaccgtgcaaaaatggcggaacttgtgaaattgatcccactcag
cctggcgggtatacatgttcgtgcacagaacagtttgtaggcgagaagtgtgacataggc
tctccatgtgccagccaaccttgtcaaaacgacgggacttgtgaacgagacccggtccgc
gaagacttttatgtttgcttgtgctcatcgttctacattggaaagaattgtgaagaagtg
gaccgctgtctccgctaccaaccttgtaggaatggaggaacttgccacagagatccggaa
aagacagagggctacttctgctcatgcgtcctcggatacattggtttcaattgtgaacaa
gctgatccgtgtgtgactaggcaaccctgccaaaacgatggaacttgtcaggttgattca
gaggaacaagggggatatgtttgcacctgtcatgttggctttacagggaaaaattgtgac
caagcacaacgtacttgcccagatatatacagaggcctttgtcttaacggcggtgtatgt
tttgtgagcgacgacgaagaacttggatatgtttgcacttgcccagacgggttcaatggt
ataaactgtgaaatggacatgaacatgtgtgatggcaatggcccctgcgaacgcggtacc
tgtcggaaaacgccaagtggcccaatctgtgtttgtccggacgaatactatggggagacc
tgcgagagaaaatcggaggtatgtaacccgaatccatgcgcgaacagcggtagatgcatt
gtgtttgaagggagggcagtatgtggatgtatggacggctacgaaggagttacatgtgac
gcattgattggcagttatggcaatcgtccgttgtcttggataccggtgatagcgctgtct
tttatcattatcggagtcgtgctttag
DBGET
integrated database retrieval system
