Pseudomonas fluorescens UK4: HZ99_18680
Help
Entry
HZ99_18680 CDS
T03319
Name
(GenBank) RNA helicase
Organism
pfn
Pseudomonas fluorescens UK4
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
Zot
AAA_34
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIG04107
LinkDB
All DBs
Position
complement(4095147..4098455)
Genome browser
AA seq
1102 aa
AA seq
DB search
MFDNDTVELINSAPKLDGLDLAELPKQLTEAYASIVSARVCLREGADQAGLPDEVIEIVK
RMTRLAFSHEAIVSASEDMENRAAAAFVAGSAHHVILLAQELLSRDIKFSTLSAFSVSPE
VSATLLFLIAEASSDAAETAKNIVVSAELSVEAALLKAIYHLANGSLLKILAMRVPGLGN
FDSADSMGQAVESLYYMLLHGVRAMAASLLGTIDEFDLIDHDSKVIFDRVRELCVEKIDN
LVGFENHPVHNIFPGPLHLASLLAMVADHLIPSGVINAKPPNGVETAKWFVMKQDIASIR
PYLWRNHRQAISSGYLEIGVSSVISFPTGAGKSTLSELKIATALLRNVKVVFLAPTLSLV
DQTTRALANTFPNADVQREILDELLFDLENDVLPAISVMTPERCLAMLSFDPDIFSNVGL
LVFDECHLLHPRDTDHSRRSIDSMLCLLNFTSVAPNADLLLLSAMMKNSEEIADWVSELT
KRPCLPMSLTWKPTRQVRGCVVYAGDEISKLKKRLRAVRSEVTNINAPTSLKRELLVQPF
GFFCLNQTWHSASRKDYALMPVLNEAVQLSTGTAPAGGWYLTPNGNQVSATIAVSTARQK
IKTLVFTQTITLANNASKRISDDLESSGCILTDEEVRLYETVVDEFGGKEHIYIEVTDEG
RLISSSACHHGLLLTMERHLHESLFKRADGLNVLVATSTLAQGMNLPSEVVIISGDSRFD
QEADAMQRLEAHELLNAAGRAGRAGDSSYGFVLVVPSKVVNFDNSTNQIHNHWMDLRSIF
SQSDQCLIIDDPLTAILDQIHSEVLPLSGVASYFLSRLPVDYDEEQVGRDVLARATINRS
FAAFRARKKGDQQWIASRIESAILSRNSNLDISQVLTWADRLAAASGISVGIIRELGEPL
SKSVNHWATTDAWYQWLREWLKRRSALLPTLIRTETLEGFFGSSYKKLKDDNSRGKYAAE
IIFPLLELWMSGHTLASIEASTGTQINKVGKCEFAREFVLRIIPELSYIFGLPNQIFRAI
TVDRGEDIESPVGLNCLALCVKEGLNSVEKVALREISKKRLARRELHRKYQRIEAYAGVL
KEGESFGDVVNRITQALALVDL
NT seq
3309 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgataacgataccgtagaattaattaatagtgctccaaaacttgacggcctcgac
cttgctgagctaccaaaacagctgactgaagcttacgcatcgatagtttctgctcgtgtt
tgcttgcgtgagggagcggatcaggcaggattgcccgatgaggtgatagaaatagtcaag
cggatgacgcgccttgctttttctcacgaggctatagtttccgcttcagaagatatggaa
aaccgagctgccgcagccttcgtcgctggttcggctcatcatgtaatactgcttgctcag
gagttgttatcaagagatattaaatttagcacattgagtgcgtttagtgtctctcctgag
gtttctgcaactttgctgttcctaatcgcggaagcaagttctgatgctgctgaaacggca
aaaaatattgtagtaagcgctgaactctctgttgaagcagctttgcttaaagcaatctat
catttggcaaatggaagtcttctaaaaatacttgctatgcgtgtgcccggactaggaaac
tttgatagcgctgacagtatggggcaggccgttgagtcgctgtattacatgctattgcat
ggggttcgtgcgatggcggcatcattgctcggaactattgatgaatttgatttaatagac
catgactcgaaagtaatttttgatcgagttagagagctatgcgtcgaaaaaattgataat
ttagttggctttgaaaatcaccctgtacataacatttttccagggccactgcatttagca
tctcttttggcgatggttgcggatcaccttattccatctggggttataaatgcaaaacca
ccaaatggtgtcgaaacagctaaatggtttgtgatgaaacaagacatagcgtcaatcaga
ccatatctatggaggaatcatcgccaggctatatcctcaggttatttggaaataggagtt
tcatctgtaataagctttccaaccggtgcaggaaaatctacactttccgagttgaaaatt
gctaccgctctgctgcgtaatgtgaaagtagtttttttggcgccgacactttcactggtg
gaccaaacaactagggctctagctaatacttttccaaacgcagacgttcagcgagaaatc
ctggatgaattgttatttgatttggaaaatgacgtacttcctgctatttctgttatgaca
cccgaaagatgtttggcaatgttgagctttgatccggacatattctcaaatgtggggttg
ttggtgttcgacgagtgtcatttgttgcacccaagggacacggatcacagccgacgttcg
atagattctatgctttgccttcttaattttacatcggtcgctcctaacgctgatttgctt
ttattgtcggcaatgatgaagaactctgaggagattgcagattgggtttcagagctaact
aaaagaccttgtctgcccatgtcattaacatggaagcctacccgtcaagtaagagggtgt
gtggtttatgctggcgatgaaatatccaaactaaaaaagcgactcagagccgtgcggtct
gaggtaacgaacataaatgcgcctacctcgttgaagcgagagctgcttgtacagccattc
ggctttttttgcttgaatcaaacttggcattcagcaagtcgtaaagattatgcattaatg
cccgttctcaacgaagctgttcaactatcaacaggtaccgctccagcaggcggctggtat
ttaacgcctaatggcaatcaggtatcggctacgattgcagtctcaacagcccggcaaaaa
ataaagactttagtttttacacaaactataacgctcgcaaataacgcgtcgaaaagaatt
tcagatgatcttgagtcgtctggatgtattttgactgatgaggaagtacgcctttacgag
acagtagtcgatgaattcggaggaaaggagcatatctatatcgaagtgacagatgaaggc
aggctgatatcctctagtgcttgccatcacggacttttgcttactatggagcgacatttg
catgaatcgctttttaagcgagcagatgggttgaatgttttagtggcgacatcaactctt
gcccagggaatgaaccttccaagtgaagtggtcattattagtggcgatagtagatttgat
caagaagccgatgcgatgcaacgcttggaggctcatgagcttctaaatgcagcgggacgg
gcaggcagagcgggcgacagttcctacggctttgtattggtagtaccgagtaaagtcgtt
aattttgataatagcaccaaccaaattcataatcactggatggatttaaggtcgatattt
tctcaaagtgatcaatgcttaattattgatgatcctctcactgcaattctcgaccaaata
catagtgaggtgttacctctctctggtgtggcaagctattttttgagcaggttaccggtc
gattatgacgaagagcaagtggggcgagatgtattagctcgcgcgactattaatcggtct
ttcgcggccttcagggctagaaaaaaaggagatcaacagtggatagcatcaaggatagaa
tctgcaatattgtctagaaattcaaatttagatatctctcaagtgctcacttgggcggat
cgtttggcagcagcatcaggtatatcggtagggataatccgagagcttggtgaaccactt
tctaaaagtgtcaatcattgggcgactacggatgcttggtatcaatggcttcgcgaatgg
ttaaagcgtcgatccgctttgcttccaactcttattaggacggagacgttagaaggcttt
ttcggcagcagttataaaaagctcaaagatgacaattcaagagggaaatacgctgctgaa
ataatattcccattgctggaactctggatgtcaggtcatacactagctagcattgaggcc
tcgactggcactcaaattaataaagtggggaaatgtgagtttgccagggagtttgttttg
aggataatccctgagctttcttatatattcggtcttcccaatcagatttttagggcaatt
accgttgatagaggagaagatattgaatcacctgtcggccttaactgtttggccttgtgc
gttaaggagggtttgaacagtgttgagaaagttgctctgcgtgaaataagtaagaagcgc
ttagctcgaagggagttgcaccgtaagtatcagcgcatcgaagcctacgcaggcgtgctt
aaagagggtgaaagctttggcgacgtagtaaaccgtataactcaagccttggctttagta
gatctttaa
DBGET
integrated database retrieval system