Candidatus Phytoplasma fraxini: AshY1_04200
Help
Entry
AshY1_04200 CDS
T10424
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase beta subunit
KO
K03043
DNA-directed RNA polymerase subunit beta [EC:
2.7.7.6
]
Organism
pfra Candidatus Phytoplasma fraxini
Pathway
pfra03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfra00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
AshY1_04200
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pfra03021
]
AshY1_04200
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pfra03400
]
AshY1_04200
Enzymes [BR:
pfra01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
AshY1_04200
Transcription machinery [BR:
pfra03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
AshY1_04200
DNA repair and recombination proteins [BR:
pfra03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
AshY1_04200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_1
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb2_45
DUF5887
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WYY26532
UniProt:
A0ABZ2UCQ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(420914..424642)
Genome browser
AA seq
1242 aa
AA seq
DB search
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nt +downstream
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aaggagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
