Candidatus Phytoplasma fraxini: AshY1_05590
Help
Entry
AshY1_05590 CDS
T10424
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
pfra Candidatus Phytoplasma fraxini
Brite
Enzymes [BR:
pfra01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
AshY1_05590
DNA replication proteins [BR:
pfra03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
AshY1_05590
DNA repair and recombination proteins [BR:
pfra03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
AshY1_05590
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WYY26655
LinkDB
All DBs
Position
complement(578084..580609)
Genome browser
AA seq
841 aa
AA seq
DB search
MSNKIKKNSFLNEHNSDTDKNIGIIKDVNINQEMEKSFLDYAMSVIVSRALPEIQDGLKP
VQRRILYSMKELGVSYQSSYKKAARVVGDVMGKYHPHGDSSIYEAMVRMAQNFNYRYPLV
DGHGNFGSIDGDAAAAMRYTEVRMSKIAMEFIKEIDQETIDFVDNYDNSEKEPNILPTSF
PNLLVNGATGIAVGMATNIPSHNLGEVIDALIAYIDDKTVSIASLMKYIKGPDFPTGGEI
LGIDKLQEAYETGKGRIIIRSKTEIITSDKNKSSIVITEIPYQMKKSNLIKNIVYLYRNK
ILDGITDLRDESSNRVGIRIVIDLRKDINPKIFLNNLYKKSRVQMSFNFNMIVLVDKKPK
LVNLKQILEAFFSFRINIINRQKQFELKNALKKQHLVQAAVIILNDIDDAIQLIKSSKDV
KEAREKLMLKYDLDEIQSKYILEMSLQRITNLEIEKFRIEERQLIKQIAECQGIIESQSK
KEKILKQELLQLKTNFQDERKTFIQKDLEINITDEDLIKKEGILITITNKGYIKRLSIDT
YKKQNKGGTGVSGITMNENDFVKYLVNTTTHDYQLFFTNKGKVYRMKGHEIPDYSRQAKG
IPLINLIPLREGEFLTSVASINPDLKQNYNYLVLITKKGLIKRNNIQDYTNIQNKGKIAF
NLKPDDEVLTVLKSIGSQDIIMASSNGKAIRFNEKSIKKTSRIGSGVIGMRLDYDENVIG
AAIVKSDEQDILVVTELGYGKKNKVVEYKNQKRGGKGIKTLKVTPKNGKIIALKVVSNQD
ELILISERGKIIRLENNNTIPTFKSKVTQGIKLSKLKDDDKLFTVVVNKKDKEKNIDIIS
E
NT seq
2526 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaataaaattaaaaaaaatagttttttaaacgaacataattctgacacggataaa
aatataggaattattaaagacgttaatattaatcaagaaatggaaaaatcttttttagat
tatgctatgagcgttattgtttctagggctttaccagaaattcaagatggtttaaaacca
gttcaaagaagaattttatatagtatgaaagaattaggagtgtcatatcaatccagttat
aaaaaagctgctagggttgttggtgatgtgatgggtaaatatcatcctcatggagatagt
agtatttatgaagcaatggtgagaatggctcaaaatttcaattatcgctatcctttagtt
gatggtcatggtaatttcggttctattgatggagatgctgcagcagcaatgcgttataca
gaagttcgtatgtctaaaatagccatggaatttattaaagaaatagatcaagagactatt
gattttgtagataattatgataatagtgaaaaagaacctaatattttacctacaagtttt
ccaaatttgttagttaacggggctacaggtattgctgtaggaatggcaactaacatccct
tctcataatttaggggaagtaattgatgctttaattgcttatatagatgataaaacagtt
tctattgcttctttaatgaaatatattaaaggtcctgattttcctacaggaggagaaatt
ttaggtatcgataaattacaagaagcttatgaaacaggaaaaggcagaattattattcgt
tctaaaacagaaattataacttctgataaaaataaaagttcgatagtaattactgaaatt
ccttatcaaatgaaaaaaagtaatttaataaagaatattgtatatttatatagaaataaa
attttggatggtatcacagatttaagagatgaatcttctaatcgcgtaggaattagaatt
gttattgatttaagaaaagatattaatcctaaaatctttttaaataatttatataaaaaa
tctcgtgttcaaatgtcttttaattttaatatgatcgttttagtggataaaaaacctaaa
ttagttaatttaaaacaaattttagaagcttttttttcttttaggataaatataattaat
cgtcaaaaacaatttgaattaaaaaacgctttaaaaaaacaacatttagtacaagcagca
gtaattattttaaatgatatcgatgatgcgatacaattaattaaaagttctaaagatgtt
aaagaagcacgcgaaaaattaatgttaaaatatgatttggatgaaattcaaagtaaatac
attttggaaatgagtttacaaagaataactaatctagaaatagaaaaattcagaatcgaa
gaacgacaattaattaaacaaattgcagaatgccaaggaattatcgaatcacaaagtaaa
aaagaaaaaattttaaaacaagaattgcttcaattaaaaacaaatttccaagacgaaaga
aaaacttttattcaaaaagatctagaaattaatataactgatgaagatttaattaaaaaa
gaaggtattttaattactattactaataaaggttatattaaacgtttaagcatagatact
tataaaaaacaaaataaaggcggcacaggtgttagcggaattactatgaatgaaaatgat
tttgtaaaatatttagttaatactacaactcatgattatcaattgtttttcactaacaaa
ggtaaagtttatcgtatgaaaggtcatgaaatacctgattattcacgtcaagctaaaggg
ataccgttaattaatttgattcctttaagagaaggagaatttttaacttctgtagctagc
atcaaccctgatttaaaacaaaattataattatttagttttaataactaaaaaaggttta
attaaaagaaataatattcaagattatacaaatattcaaaataaaggtaaaatagccttt
aatttaaaaccagatgatgaagttttaacagttttaaaaagtataggttctcaagatatt
attatggctagttcgaatggaaaagctattcgttttaatgaaaaatctattaaaaaaacc
agtagaataggtagcggcgttattggaatgagattagattatgatgaaaatgtaataggc
gctgctattgttaagtcggatgaacaagatattttagttgtaactgaattaggttatggt
aagaaaaataaagttgtcgaatataaaaatcaaaaaagaggcggaaaaggtattaaaact
ttaaaagttactcctaaaaacggtaaaattattgctttaaaagttgtttcgaaccaagat
gaattaattttaatttctgaacgcggcaaaattattcgattagaaaataataatacaatt
cctactttcaaatctaaagtcactcaaggtattaaattatctaaattaaaagatgatgat
aaattatttacagttgttgttaataaaaaagacaaagaaaaaaatatagatattataagt
gaataa
DBGET
integrated database retrieval system
