Candidatus Phytoplasma fraxini: AshY1_05680
Help
Entry
AshY1_05680 CDS
T10424
Name
(GenBank) tRNA-5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) synthesis protein MnmG
KO
K03495
tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme
Organism
pfra Candidatus Phytoplasma fraxini
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfra00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
pfra03016
]
AshY1_05680
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
pfra03036
]
AshY1_05680
Transfer RNA biogenesis [BR:
pfra03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
AshY1_05680
Prokaryotic type
AshY1_05680
Chromosome and associated proteins [BR:
pfra03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Other chromosome partitioning proteins
AshY1_05680
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GIDA
SAM_GIDA_C
GIDA_C_1st
Pyr_redox_2
FAD_binding_2
FAD_oxidored
HI0933_like
Pyr_redox
NAD_binding_8
Pyr_redox_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WYY26664
UniProt:
A0ABZ2U9G1
LinkDB
All DBs
Position
complement(590341..592194)
Genome browser
AA seq
617 aa
AA seq
DB search
MTFEGIVVGGGHAGVEAALALAKKHKTVLITGNLQQIASLPCNPSIGGPAKGVVVREIDA
LGGIMGKAADLSQIQIKMLNTSKGPAVRSLRAQIDKLKYPRIILNILKKTPNLTLLEGFV
NDLIIENNKVLGVRLNDGVIINSKVVILTTGTYLASNILIGKKKISSGPNNSITTHNISK
QFKDYGFEIIRLKTGTPPRVKKNTIDFSKTKIQIGDNILQTFSFFSEIKELSIQEPCFLL
HTNKKTHELIKQNLEKSAMYGGYSEGKGPRYCPSIEDKIIRFCDKESHQIFIEPESLELD
EMYLQGLSTSMPEEVQEQILKTIPALEKAEITKYAYAIEYDAFNPNQLNYNLETNKIENL
FFAGQINGTSGYEEAACQGLMAGINASLKLENKESLVLKRNESYIGVLIDDLINKGTTEP
YRLLTSRAEFRLLLRHDNADLRLTPYGYQTGLIDQNLYDKVEKKRADIESLKKELKEFIV
FPNEVNLNFLQKYNSLIKEKMSLYKLLKRTELKINIIFFFIDVHYDKEVLEQTEIQIKYE
DYILKTEKEVQKNLFLETKKIPLEIDYNQIHNLSMEAKEKLTLIKPNNLGQASRISGVNP
VDISLLNVYLQRYKNVI
NT seq
1854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactttcgaaggtattgttgttggtggtggtcatgcaggtgtcgaagctgctttggca
ttggctaaaaaacataaaacagttttaataacaggtaatttacaacaaattgcttctttg
ccatgtaatccttctattggaggtccagctaaaggagttgttgttagagaaatagatgct
ttaggtggaataatgggaaaagcagctgatttatctcaaattcaaataaaaatgttgaac
acttctaaaggacctgctgttagaagtttaagagcacaaatagataaattaaaatatcct
cgaattattttaaatattttgaaaaaaacacctaatttaactttattagaaggttttgtt
aatgatttaattatagaaaataataaagttttaggagttaggttgaatgacggcgttatt
attaacagtaaagtagttattttaacgacaggaacttatttagctagtaatattttgatt
ggcaaaaagaaaattagttcaggtcctaataattctattactactcacaatattagcaaa
caatttaaagattatggttttgagattattcgtttaaaaacaggtactccaccaagagtt
aaaaaaaatactattgattttagtaaaactaaaattcaaataggagataatattttgcaa
acttttagttttttttctgagattaaagaattatctattcaagaaccttgttttttattg
catactaataaaaaaactcatgaattaataaaacaaaatttagaaaaatcagctatgtat
ggtggttattcagaaggcaaaggaccgcgttattgtccttctattgaagataaaattatt
cgtttttgtgataaagaaagtcatcaaatttttattgaacccgaaagtttagaattagat
gaaatgtatcttcaagggctttcaacgagcatgccagaagaagttcaagaacaaatttta
aaaacaattcctgctttagaaaaagcagaaattacaaaatatgcttatgctatcgaatat
gatgcttttaatcctaatcagttgaattataatttagaaacaaataagatcgaaaattta
ttttttgctggtcaaattaatggtactagtggttatgaagaagcagcttgtcaaggtttg
atggctggtataaatgctagtttaaaacttgaaaataaagaaagtttagttttaaaaaga
aacgagtcttatattggagttttgattgatgatctaattaataaaggcacaacagaacct
tatcgtttattaacttctagagctgaatttcgtttacttttaagacatgataatgctgat
ttaagattaactccttatggatatcaaacaggattaatagatcaaaatctttacgataaa
gtagaaaaaaaacgtgctgatatcgaaagtttaaaaaaagaattaaaagaatttattgtc
tttccaaatgaagtcaatttaaattttttacaaaaatataattctttaattaaagaaaaa
atgagtttatataaacttttaaaaagaacagagttaaaaataaatattatattttttttt
attgatgtgcattatgataaagaagttttagaacaaacagagatacaaatcaaatatgaa
gattatattttaaaaactgaaaaagaagttcaaaaaaatttatttttggaaaccaaaaaa
atacctttagaaattgattataatcaaattcataatttatctatggaagcaaaagaaaaa
ttaacattaattaaacctaataatttaggtcaggcgtcaagaatatcaggagtaaatcct
gttgatatttctcttttaaatgtttatttacaaagatataaaaatgttatttga
DBGET
integrated database retrieval system