Pelosinus fermentans: JBW_01207
Help
Entry
JBW_01207 CDS
T03813
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor plug
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
pft
Pelosinus fermentans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pft00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pft02000
]
JBW_01207
Transporters [BR:
pft02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
JBW_01207
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
DUF2606
DUF4944
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ26559
UniProt:
I9NRH1
LinkDB
All DBs
Position
1451207..1453150
Genome browser
AA seq
647 aa
AA seq
DB search
MKMGQTQKKSKVALLSFGIMAALSLPAYAEEEPYQFSEVVVTATRTKQNVKDIPASVEVI
TRQDIETMGADSVVAALKLAMNLNLSEAGMTGNQVSLRGMNTNQSLILIDGRRMAGEDTG
STMNYYELNRININNVERIEIVRGPVSSLYGSDALGGVINIIMRKSEKPQTTVGLSNSSK
QQNASFRFDLGKEGKWSWVVDTLFTDIKERARTDSTNMYGPRQFYNISGTYDMSAGKNLD
VFYERMSEHLKSGFTDGSRDYYTNTRNSYGINYRGINSRGNYELRAYFNQLEKNNDTLLE
SGTYSDFDRAKYKTWVVDGKNTVKLDDEHVLTFGGEYRSSEYRGTRLEDNGDHASTIIEH
GISKSISEKEIKYQAAYVQDEWAVNSKLLIIPSLRYDNSNKFGDDFSPKIGMTYKMDNNY
RFKANLGKGFKAPSVSELYMKMTHRPIPNMTVIVAGNPDLKPEKSTNYDISFEGERGNDF
GKLTYFYNDVTDLIGTNDTMSYIPGTGVVYNSKYINIDKAKIRGIELEAGRHLNDKFTLK
SAYNYLDAEDSKTHERLSSRAKNRYSLQLHYDDIQNTGISGILWHEWVRDYRYVETDYNY
NTLNFVINKKWNDKYDSYFGIDNILDKKIDALILEGRLWRFGMSITI
NT seq
1944 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatgggacaaactcagaagaaaagcaaagtggcgttattaagtttcggtattatg
gcggcattgagtttgccggcttacgccgaggaggaaccttaccagtttagtgaggtggtg
gttactgccactcggaccaagcagaatgtgaaggatataccggccagtgttgaggtcatc
acccggcaagatatcgaaaccatgggggctgacagcgtagtagcggcattgaagctggcg
atgaatttaaatctttctgaagcgggaatgacaggtaatcaggttagtttgcgtggtatg
aatacgaaccagtccctaattttgattgatggtcgacgtatggcaggggaagatacggga
tcaaccatgaattattacgaattaaaccggattaatattaataatgtggaacggatcgaa
atcgtacggggaccggttagttctctttatggatcagatgctttgggcggcgtcatcaat
attattatgcgtaaatcggaaaagccacagactaccgtgggtttgtcgaacagcagcaag
caacagaacgcttccttccgttttgacttaggtaaagaagggaaatggtcatgggtagtt
gatacactttttaccgatattaaagagagggcacgaacagatagtacgaatatgtatgga
ccacgccagttctataatatcagtggaacatacgatatgtcggcaggtaagaacctcgat
gtcttttatgaaagaatgagtgaacatttgaaatcgggattcactgatggcagcagagat
tattataccaatacgagaaattcctacggtatcaattatcgtggtatcaattcacgaggt
aattatgaattgcgggcttattttaatcagctggaaaaaaataatgatacattgcttgaa
agtggaacatatagtgactttgacagagcaaagtataaaacctgggtagttgatgggaaa
aatacggtgaaattggatgatgaacatgtactgacatttggtggtgaataccggtcgtct
gaatatcgtgggaccaggctggaagacaatggtgatcatgcttctacgatcattgagcat
ggaataagcaagtccatatcagaaaaagaaataaaatatcaggccgcctacgtacaagat
gaatgggctgttaatagcaaacttttaattattccatccctgcgatatgataacagtaat
aaatttggcgatgattttagtcctaaaattggtatgacttacaaaatggataataattat
cgctttaaggcaaatttggggaaagggtttaaagcacccagtgtcagtgagttatatatg
aaaatgactcatcgccctatacccaacatgactgttattgttgctggtaatccagattta
aaaccggagaaatcgactaattatgatataagcttcgaaggagaaagaggaaatgatttt
ggaaaattaacttacttttataacgatgttaccgatctgattggaacaaacgacacaatg
agttacattcctgggactggtgtggtttataattcaaaatacatcaatattgataaagct
aagataagaggcattgaacttgaagctggaaggcatctgaacgataaatttacgctaaaa
tctgcttataattatttggacgctgaagattccaaaacccatgaacgcctgagcagcagg
gcaaaaaacaggtattcgctgcagctgcattatgatgatattcaaaatacgggaattagt
ggtattctatggcatgaatgggtgcgtgattaccgctatgttgagactgattacaactat
aataccttaaactttgtgatcaacaaaaaatggaatgataaatatgactcctattttggc
attgataatattctcgataaaaaaatcgatgccctgatcctcgaaggccgtttgtggaga
tttggcatgagtatcacaatatga
DBGET
integrated database retrieval system
