Pelosinus fermentans: JBW_04283
Help
Entry
JBW_04283 CDS
T03813
Name
(GenBank) 3-isopropylmalate dehydratase
Organism
pft
Pelosinus fermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Aconitase
Aconitase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ29614
UniProt:
I9DBC4
LinkDB
All DBs
Position
complement(4771332..4773677)
Genome browser
AA seq
781 aa
AA seq
DB search
MVEVLDQAIYLLKGQVVIKDADKLSLVEINNRLAYEGLAPLLESNIEQERARTGTIAYQI
LTEHNMTADKRNLKLRFDALASHDITYVGIIQTAIASGLKEFSLPYVLTNCHNSLCAVGG
TINEDDHVFGFSAARKYGGIFVPTHQAVIHQYMREMMAGCGKMILGSDSHTRYGALGTMA
IGEGGGEIAKQLLERTYDIRYPEVIAVYLEGCPAPGVGPQDVALAIIKAVFKNGMVKNKV
MEFVGPGITNLTVDYRNGIDVMTTETTCLSSIWRTDEQVEEYYKIHGRSDAYRKLDPQEV
SYYDGLVKVDLSRVEPMIALPFHPSNAWTISELNQNMADILHQVEAEGRKLIDNPNVTFQ
LTDKIVNARLKVEQAVVAGCAGGTYENIVAMAQILGKKSLGEFSLSVYPSSQPVFLELMN
NRSIEKLTIAGASIRSAFCGPCFGAGDVPANHALSIRHTTRNFLNREGSKPDNGQLASVA
LMDARSIAATALHGGILTAATEVDFSSVVLPYTFNQEIYRNRIYQGFGKPHPEEDLVFGP
NIIPWPKIRSLPENLLLKISAVLLDPVTTTDELIPSGETSSYRSNPLKLAEFTLSRRDPQ
YVGRAKAIQKMEQKRQALLEQGQGFEEIEELFLANLEDGQTAEQLQNLIINTGLGSIIFA
IKPGDGSAREQAASCQRVLGGDANIAIEYATKRYRSNLMNWGMIPFTIDEDDKGKLSVDD
FLYIPEIRKAIENGADKIQAFIINSHGKNAIDLKLENLSRNDRDIILAGSLINYYVKSNK
G
NT seq
2346 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgaagtattggatcaagctatctatcttttaaaggggcaggtcgttataaaagat
gctgataagcttagcttagtagagattaataatcggttggcttatgagggacttgctcca
ttgttggagtctaatatagagcaagagcgtgctcgcacaggtaccattgcatatcaaatt
cttactgagcacaatatgacagcggacaaacgcaatttgaagctgcgttttgatgcgtta
gcttctcatgatattacgtatgtgggaattattcagaccgctattgccagcggtttgaaa
gaattttctttgccttatgtactgacaaattgtcataatagcctgtgtgctgttggcggt
accattaatgaagatgatcatgtttttggcttttcagccgctcgcaaatatggaggaatc
tttgttcctacgcatcaagcggtcattcatcagtacatgcgtgagatgatggctggttgt
ggcaagatgattctcggttccgacagtcatacccgttatggagccttaggaactatggct
atcggtgaaggcggcggggaaatcgctaaacaacttcttgagcgtacctatgatattcgt
tacccagaagtgattgcggtatatcttgaaggctgcccggcaccaggtgttggacctcaa
gatgttgctcttgctatcatcaaggcagtgtttaaaaatggcatggtcaaaaacaaggtc
atggagtttgttgggcctggcatcactaaccttactgtggattatcgcaatggcattgat
gttatgactacagagaccacttgtctatcttccatttggcgtactgatgaacaggtagaa
gaatattacaagattcatggtcgttctgacgcttatcggaagttagatcctcaggaagtg
agttactatgatggattagtaaaagtagatttaagtcgtgttgaaccgatgattgcgttg
ccttttcatcccagcaatgcctggaccatttctgagctaaaccaaaatatggctgacatt
ctgcaccaagtggaagccgaaggccgcaagttgattgacaatcccaatgttacatttcaa
ttaacagataagatcgttaatgcccggctaaaagtagagcaagctgttgttgctggctgt
gctggcggtacttatgaaaatattgtggcgatggcgcagatccttgggaaaaaatctctg
ggcgagttttccttaagtgtatatccttccagccaacctgtatttcttgaacttatgaat
aaccgttctattgaaaaattgacgattgcaggcgctagcatacgatcggcattctgtggt
ccttgttttggtgctggcgatgtccctgctaatcatgcccttagtattcgtcatactact
cgaaatttcctgaaccgtgaaggctctaaaccagataatggtcaattagcctcagtggca
ttgatggatgcccgttccattgcagcgactgctttacatggcggcatcctaacagcggca
actgaagttgacttttcctccgtggtattaccatatacattcaatcaggagatctatagg
aatcgaatataccaagggtttgggaagcctcatccggaagaagacctagtttttggacct
aatattattccgtggccaaagatacggtcattgccagagaacctgttacttaaaatttcg
gctgtgcttttagatcctgttacgacaacggatgagctcataccttcaggtgaaacttca
tcttatcgttcaaaccccttaaaactggctgagtttactttatctcgcagagatcctcaa
tatgtcggcagagcgaaagcaattcaaaaaatggagcaaaaacgccaagctttattagag
caagggcaagggttcgaagaaattgaagagctttttttagcaaatctagaagatggacaa
acagcagaacaactgcaaaacttgatcataaatacagggcttggcagtattatctttgcc
atcaaacctggtgatggctcagcacgagaacaggcagcttcttgccaaagagttttaggg
ggggatgcaaatattgctattgaatatgctaccaaacgatatcgcagcaatttgatgaat
tggggcatgattccttttacaattgatgaggatgacaaagggaagctttccgtggatgat
ttcctatacatcccagaaattcgtaaggcaattgaaaatggtgcagataaaattcaagct
ttcattataaattctcatggtaaaaatgctatcgatttaaagcttgagaatttgtcaagg
aatgaccgagatattatcttggcgggttctttgatcaattattatgtgaaatctaacaaa
ggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
