Polistes fuscatus (common paper wasp): 122516728
Help
Entry
122516728 CDS
T07683
Name
(RefSeq) DENN domain-containing protein Crag isoform X1
KO
K20163
DENN domain-containing protein 4
Organism
pfuc
Polistes fuscatus (common paper wasp)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfuc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
pfuc04131
]
122516728
Membrane trafficking [BR:
pfuc04131
]
Protein recycling
Rab GTPases and associated proteins
Other Rab GTPase associated proteins
122516728
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DENN
dDENN
uDENN
DUF2464
PPR_2
PPR_long
PPR
PPR_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122516728
NCBI-ProteinID:
XP_043490716
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1603 aa
AA seq
DB search
MDERRVADYFVVAGLPGHNDDIIGENEVNDELEDWCQEGTHLKDIHMQPPITDLAVIFPA
LGEHCPEGYTLLEYTVSGIPADLNHGSLRTNECYLCYRRGRDKPPLVDIGVIYEGKERIM
QDAQMVLETPKGHIANVNNSTSKIFVTYRRASQKMPCNSLVVTDICVILKNKGETPPHAF
CVINKNLNKGMLGSDVFLCYKKSMNRANLISFKPAILYKYPTTDYNSFVFPNSVAMFCLP
MGATIECWPKMACKPKSLFSTFVLTVSDAAQKIYGSAITFYEEFTLPPDALSCKGNLDME
DIEENTKNNTDSIELTEEFHQSKAKMFRKYGILKKLNISQWAKLQFTDPSSQSLNISKSI
CILSHWPFFDTFEKFLVFLHSMVNGKPQNVSIEKYISYFLCDIPFPSPQRSRILVQLSSK
DRLILTQPEDLVLPRSGASFRQLLINLGPDNCLLILLLILTEQKILVHSLRPDVLTSVSE
AIAMILFPFKWQCPYIPLCPLGLAEVLHAPLPFLIGVDSRFFDLYDPPSDVNCVNLDTNN
IAICDDKKYLNVKLLPKKAARQLRNCLEHLYSKLTSLGKIYSSQKDQEHGDFSVDKEFQQ
KQKEQALELEIQDAFLKFTATILKGYRSFLLPITKAPTVGSTDPTSLFNMQEFLRSRDKA
HAKFYNMLVRTQMFIRFIEERSFVSDMDMAGLAFFDECTERVEEENVTLLELDESQHSER
TVFIPPPEAGPNQGPFIYRTFKLNSELMRPEKNFNLRNPALNAFGIVPGSPMARRTKHEI
KVAQKMARKQAAMPDRWARCLLGTCYSLWFLHLPAMLQASSQPAAILHQAYELLVRMQKL
HLDPMEEVCYRAMMQLCGVYGQPVLAVKLLFHMKRSGVQPNALTYGFYNKAVLEATWPSD
MTNSSQLMWNKLRNVIVGAALFKKAGRKGARRRHNSNVDFLNTDGITEEMEHALSRSSLD
SSHSQDTEAAHSDSTKGSSVPDLPGFGSYELKTKLLRQNSIVKDQALPNMVQSEKLNRSF
SNPRIVRSTESPLKSPVRTPVTENDPLGALINDETPVVSPSEENDSNCSTSTLTVLNNTV
EERPGGPLLFRSNNLPRSATFHQAVDESSTTVSGNLQRSETMPHSVAPPGEEREKERLEI
SSLWSQKDSVTSSLSSLGSSLKLSFGRYSASGLAFTKNKELISSNQLIESLSLSSYISPS
GLTGKRSNEIILGGLNSLKSAATSVAKKFDEIKEAISATSTPVKLKERDQKLGCGISHES
LDSCTDGSLQDRNEVSARLSGDGTLDVYLYELGECLYPKGSRELEERAAIEFVLSSASRC
HHCAAILYDEEIMAGWQPEDSNLNTVCQYCDKATVPLLTVTILDYRCKTNEKSSDPLMGA
LIELSDKPREQLEPITIPYLNPLVLRKELESVLSQEGDVCLTRHIFIEEHPIVYWNLIWY
FERINLTSHLSDLWLHNDANKQLQSNSNYVSIRTMWDNERIHMGRLPMYLQWKLNTTEDR
TLMQTIISYVRCNDLTEPIKKVALERSKNQSEEEAPFSIYRDILFLAFIAVGGGNIHQGV
FDKQYGSALERLTENEEHLLHKQDAPPSLMSLCCRHYFKQLIV
NT seq
4812 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgaaaggagagtagcagattattttgttgtcgctggcctacctggtcataacgac
gacattataggggagaatgaagttaatgatgaattagaagattggtgtcaagaaggaacg
catttgaaagatatacatatgcaaccacccatcacagatctcgctgtcatttttccagct
ttgggcgaacattgtcctgaaggttatacattgttagaatataccgtgtccggtatccca
gctgatttaaatcatggcagcttacgaacaaatgaatgttatttatgctataggagaggt
cgggataaaccacctttagttgatattggtgtaatatatgaagggaaagaacgtataatg
caggatgcacaaatggtattagaaactcccaaaggacacatagcgaacgtaaacaattca
acttcaaaaatttttgtaacatatagacgagcaagtcaaaaaatgccttgcaattctctt
gttgttactgatatatgtgttattttgaaaaacaaaggggaaactcctccacatgcattc
tgtgttattaataagaatttaaataagggaatgttgggcagtgatgtattcttatgctac
aagaaatccatgaatcgtgctaatcttatatcgttcaaaccagcaatactttataagtat
cctacaactgattataacagcttcgtttttccaaattcagttgccatgttttgtttacct
atgggagcaaccatagaatgttggccaaaaatggcttgcaagcctaagtcattattttca
acatttgttttaacagtctcggatgctgcacaaaaaatatatggctcggctataacgttt
tatgaagagtttacattaccaccagatgctctaagctgtaaaggaaatttggatatggaa
gatatagaggaaaatacaaaaaataatactgatagtattgaattaacggaggaatttcat
caatcaaaagcaaaaatgttcagaaaatacggaatacttaagaagcttaatatatcccaa
tgggcaaaattacaatttacagatcctagcagtcagtcattaaatatcagcaagtcaata
tgtatattatcgcattggccattttttgatacatttgaaaaatttctagtctttctgcat
agtatggtcaatggaaaacctcaaaatgtttctatagaaaagtatatttcttattttttg
tgtgatatacctttcccaagtccacaaagatctagaattcttgtgcaacttagcagtaaa
gataggctaatcttgactcaaccagaagatttagttttgcctagatctggtgccagtttt
aggcaattattaataaatttgggccctgataattgcttattgatattgctcctaatatta
acagagcaaaaaatattggttcattcattacggcctgatgtgctaacttcagtgagtgaa
gctattgcaatgattttgtttccattcaaatggcaatgcccgtatataccactctgtcca
ttaggtttagccgaggtcttgcacgcaccgctaccatttttgattggtgttgactccagg
tttttcgatttatatgatccaccatctgatgttaattgtgtcaatcttgatacaaataat
atagccatttgcgatgacaagaaatatttgaatgtaaaattactccctaagaaggcagct
agacagcttagaaattgtttagaacatctctattcaaaattaacctctcttggaaagata
tattcttctcaaaaagatcaagaacatggtgattttagtgtagataaagaatttcaacaa
aaacaaaaagaacaagcattagaacttgaaatacaagatgcttttttaaaattcactgct
actattttaaaaggctatcgatctttcttattaccaattacaaaggctcctactgtagga
tcaacagatccaacaagtttatttaatatgcaagaatttttaagaagtcgtgataaggct
catgcaaaattttataatatgcttgttagaactcaaatgttcataagattcatagaagaa
agaagttttgtatctgatatggatatggctggcctagctttttttgatgaatgtactgaa
cgtgtggaggaagagaatgttacactcttggaattggatgaatctcaacatagcgaacgt
acagtattcatacctcctcctgaggcaggaccaaatcaaggaccttttatatatagaacg
tttaaattaaattctgaattaatgaggcctgaaaaaaattttaatttaaggaatccagct
ttaaatgcttttggaattgtacctggaagtcctatggcacgtaggactaaacatgaaata
aaagtagctcagaaaatggcgcgaaaacaggcagcaatgcctgatagatgggctagatgt
ttacttggaacatgttatagtctttggtttctacatttaccagcaatgttacaggcttcc
agtcaaccagctgcaattttgcatcaagcatatgaattattagttcgtatgcaaaaatta
catcttgatcctatggaagaggtttgttacagagctatgatgcaactttgtggagtatat
ggacaaccagtattagctgttaagttattatttcacatgaaacgtagcggtgtacagcca
aatgccctaacatatggattttataataaagctgtccttgaagcaacatggccttctgat
atgacaaattcaagtcagttaatgtggaataaattacgaaatgttattgttggggcagct
ttgtttaaaaaggctggtaggaaaggtgctagaagaagacataattccaatgttgatttt
ttaaatactgacggaataaccgaggaaatggaacacgctctttccagatctagccttgat
agtagtcattctcaagatacagaagctgctcatagtgactcaacaaaaggtagttctgtg
cctgatttaccaggatttggatcatatgaattgaaaactaagcttcttagacaaaacagt
atcgtaaaagatcaagcgttgccgaatatggtgcaatcagagaaattaaatcgttctttt
agtaatccaagaatagtacgcagtaccgaatcgccattgaagagtcctgtacgaacacct
gttactgaaaatgatccattgggggctctaattaatgatgaaacgccagttgtatcgcct
tctgaggaaaatgactccaattgctcaactagtactttaacagttttgaataatactgtt
gaagaaagaccaggtggaccacttttatttagaagtaataatttaccacggagtgcaaca
tttcatcaagcagtagatgaaagtagtacaacagtaagtggtaatttacaaaggagcgaa
acgatgcctcattcagtagcaccaccaggtgaggagagagaaaaagagagactggaaata
agcagtctttggtcgcaaaaggacagcgtgacatctagtttatctagcctaggatccagt
ttaaaacttagttttggacgatactcagccagtgggttagcatttactaaaaataaggaa
ttaatatcgtcaaatcaactcatcgaatctcttagtctatccagttatatcagtccatca
ggcttgactggaaaaagatccaatgaaataatattgggtggcttgaacagtttgaaatca
gctgcaaccagcgttgctaaaaagtttgacgaaataaaagaagctatatctgcaactagt
actcccgttaaacttaaagaacgcgatcaaaaattaggatgtggaatatcacacgaatca
ttagattcttgtactgatggatccttgcaagatcgaaatgaagtatccgccagattgtct
ggtgatgggactttagatgtatatctgtatgaacttggggaatgtttatatcccaaaggc
tctagagagttagaagaacgtgctgctattgaatttgtcctttcaagtgctagcagatgc
catcattgtgctgcaatactttatgatgaagaaataatggcaggatggcaaccagaagat
tctaacttaaataccgtttgtcagtattgtgacaaggccaccgtcccccttcttacagtt
actatattagattacagatgtaaaacgaatgaaaaaagcagtgatcctttgatgggagct
ttaattgaactttcggataaaccgagggagcaactggaaccaattacgataccatatcta
aatccattggttttaagaaaagaattagagagtgtattaagtcaggaaggtgatgtatgt
ttaacccgacatatattcatagaagaacatccaatagtatattggaatctaatatggtat
tttgaaagaattaatttaacaagtcatctctctgatctttggttgcataatgatgcaaac
aaacaattacaaagcaactctaattatgtgagtataagaacaatgtgggataacgagaga
attcatatgggtcgattaccgatgtatctacagtggaaactgaatactacagaagatcga
acattaatgcaaacgataatatcatacgtacgttgcaatgacttgacagaacctattaaa
aaggtggccttggaaaggagtaaaaatcaatctgaagaagaagctccattttctatttat
agagatattttgtttttggcatttattgctgtgggtggaggaaatattcaccaaggagtt
ttcgataaacagtacggttctgctttagaacgattaacggaaaatgaagaacatctactt
cataagcaggatgcccctccgtccctaatgtcactatgttgtagacattattttaaacaa
ttaatcgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system