Plasmodium gaboni: PGSY75_0318600
Help
Entry
PGSY75_0318600 CDS
T08136
Name
(RefSeq) putative cleavage and polyadenylation specificity factor
KO
K13148
integrator complex subunit 11 [EC:3.1.27.-]
Organism
pgab
Plasmodium gaboni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pgab03041
]
PGSY75_0318600
Spliceosome [BR:
pgab03041
]
Other splicing related proteins
Proteins involved in snRNP biogenesis
Integrator complex
PGSY75_0318600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-Casp
Lactamase_B_6
RMMBL
Lactamase_B
Lactamase_B_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29774657
NCBI-ProteinID:
XP_018643621
UniProt:
A0A151LVT4
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(645532..648750)
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MNYYHQTKIIIQVLGAGQTVGRSCVIVELENRKVMFDCGCHLGYKDERKYPNFNLLIRGP
DKIDQCQKEDYIDDENEDNVDDENEDNINEENINNINDEYINKINDEIVNNINDENVNNI
NDENVNNINDEHINDKYKYKDKDSSGPKKNNRDIEKVEENVDEPNFYDNSNTEVNISIVN
SSITDKENLINNLKRINEIIDCVIISHFHMDHIGALPFFTEILKYRGIILMSYPTKALSP
ILLLDSCRVTDMKWEKKNFERQIKMLNEKSDELLNYNINCIKKDPWNINEDNIYNCIDKV
IGLQINETFELGDMSITPYYAGHVLGACIFKIQVRNFSVIYTGDYNTIPDKHLGSANIPS
LNPEIFISESTYATYVRPTRKASELELCNLVHECVHKGGKVLIPVFAIGRAQELSILLDD
YWKKMKINYPIYFGCGLTENANKYYKIYSSWINSSCMSNEKENLFDFVNISPFLNNYLNE
KRPMVLFATPGMLHTGLSLKAFKAWAGNPQNLIVLPGYCVQGTVGHKLIMGEKQISLDGT
TYIKVLCKIIYLSFSAHADSNGIQQLIKHVSPKNVIFVHGEKNGMQKLAKYISNKHMINS
MCPSLGQHCHFDFIKHNINYIYMHKNIHKQILQLKKKIMKYKHNNTHINTTDTQETALYV
NENKKKKKKKRKKEYTYVNKKINVPFNAYMFYIPLTHKPYIFLFSKKTLIQYLKRKHIPI
IIEHKEEIINSDHLFIYKNEKISNYHKTHNKLNKILKNDKQKNSNPINEHKIKVRNKIIQ
KKINIQTKYENFENYKNKCFNKYFNHSYVPLKDDNISNNLPKQQRSNVIDHPYTDEQFIG
ENQNEHIITNMNDLINKNNSNCYHTNQNIDSLSNITIQSPKSDDDDISPISNNDNEESDM
SQKKKEPLIKNNTINSDDKSKNQNINEHQINNNNDNNTYEQNILENDSSSNDEQKPFNFV
HKKDKVNLPLLNLRFKEIITIAYQTFYNFVLTFFQEIVNTENKDKIDFLGKRVLIKNVKY
NDNYFFYLSFHSLRAIHDGQNKLIMQWSYVDDYPNSVIHKFIQCIHKYNQME
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattattaccaccaaacgaagattattatacaagtactgggcgcagggcaaaccgtg
gggaggtcttgtgttatcgtcgagctagaaaatagaaaagtcatgtttgactgtggttgc
catttgggttataaggatgaaagaaaatatccgaattttaatttattgataaggggccca
gataaaattgatcagtgtcaaaaagaagattatatagatgatgaaaatgaagataatgta
gatgatgaaaatgaagataatataaacgaggaaaatataaataatataaatgatgaatat
ataaataaaataaatgatgaaattgtaaataatataaatgatgagaatgtaaataatata
aatgatgaaaatgtaaataatataaatgatgaacatataaatgataaatataaatataaa
gataaagatagttcgggtcctaaaaaaaataatagggatattgaaaaagttgaagaaaat
gtagatgaaccaaacttttatgataattccaatacagaagtaaatataagtatagtaaat
agtagtataacagataaagagaacttaataaataatttaaaaagaataaatgaaataatt
gattgtgtgattataagtcattttcatatggatcatataggtgcattaccattttttaca
gaaatattaaaatatcgaggaataatacttatgagttatcctactaaagctttaagtccg
atcttattattagatagttgtcgtgtaactgatatgaaatgggagaaaaaaaattttgaa
agacaaataaaaatgttgaatgaaaaatcggatgaattattaaattacaatattaattgt
ataaaaaaagatccatggaatataaatgaagataatatatataattgtattgataaagta
attggattacagataaatgaaacatttgaattaggtgatatgtcaataactccatattat
gcaggacatgtattaggagcatgtatatttaaaattcaagtaagaaattttagtgtgata
tatacaggtgattataatactataccagataaacatttaggtagtgctaatataccatca
ttaaatcctgaaatatttatatctgaatcaacatatgcaacttatgtaagaccaactaga
aaagcatcagaattagaattatgtaatctagttcatgaatgtgtacataaaggaggaaaa
gttcttattcctgtttttgctataggaagagcacaagaattatctattttattagatgat
tattggaagaaaatgaaaataaattatcctatatattttggttgtggattaacagaaaat
gcaaataaatattataaaatatactcttcatggattaatagtagttgtatgtccaatgaa
aaagaaaatctgtttgattttgtaaatatatctccatttttaaataattatttaaatgaa
aaaagacctatggttttatttgcaacacctggaatgttacataccggactttctcttaaa
gcatttaaagcatgggcaggaaatccacaaaatctaattgttttaccaggttattgtgta
caaggtactgttggtcataaattaattatgggagaaaaacaaatatctttagatggaact
acatatattaaagtcttatgtaaaattatttatttatcattttctgcacatgctgattct
aatggtatacaacaacttattaaacatgtctctccaaaaaatgttatatttgttcatggt
gaaaaaaacggtatgcaaaaactagcaaaatatatttcaaataaacacatgattaattct
atgtgcccatctttaggacaacactgtcattttgattttataaaacataatattaattat
atatatatgcataaaaatatacataaacaaatattacaacttaaaaaaaaaatcatgaaa
tataaacacaataatacacacataaacactacggacacacaagaaacagctctttatgtt
aatgaaaataagaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaagaatatacatatgtaaacaaa
aaaattaatgttccatttaatgcatatatgttttatataccactaactcataaaccttat
atattccttttttcaaaaaaaactttaatacaatatttaaaaagaaaacatataccaatc
ataattgaacataaagaagaaataattaattcagatcatttatttatatataaaaatgaa
aaaataagcaattatcataaaacacataataaattaaacaaaattcttaaaaacgataaa
cagaaaaattctaatcctatcaatgaacacaaaattaaagttcgtaataaaataattcaa
aaaaaaataaatatacaaacaaaatatgaaaattttgaaaattataaaaataaatgtttt
aataaatatttcaatcattcatatgtgccactaaaggatgataatatatcaaataatcta
cctaaacaacaacggtcaaatgtaatcgatcatccatatacagatgaacagtttatagga
gaaaaccaaaatgaacatatcataactaatatgaatgatttaataaataaaaataattca
aattgttatcacactaatcaaaatatagattctttatctaacataacaattcaatctcca
aaaagtgacgatgatgatattagccccattagtaataatgacaatgaagaaagtgatatg
tcacaaaaaaaaaaagaacctttaataaaaaacaataccattaatagtgatgacaaatct
aagaaccaaaatataaacgaacatcaaataaataataataatgataataatacctatgaa
caaaatatacttgagaatgatagctcatccaatgatgaacaaaaaccttttaattttgtt
cataaaaaagataaagttaatctaccattacttaatctaagatttaaagaaattattacc
attgcttatcaaactttttataattttgttcttacattttttcaagaaattgttaataca
gaaaataaagataaaatagattttctaggtaaaagagttctaattaaaaatgttaaatat
aacgataattattttttttatttatccttccattctttaagagctatacatgatggacaa
aataagttgatcatgcagtggtcctatgttgatgactacccaaattcagttattcacaaa
tttatacaatgtatacataaatataatcaaatggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
