Plasmodium gaboni: PGSY75_1103800
Help
Entry
PGSY75_1103800 CDS
T08136
Name
(RefSeq) putative CCR4-NOT transcription complex subunit 1
KO
K12604
CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Organism
pgab
Plasmodium gaboni
Pathway
pgab03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
PGSY75_1103800
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pgab03019
]
PGSY75_1103800
Messenger RNA biogenesis [BR:
pgab03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
PGSY75_1103800
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ccr4-NOT complex
PGSY75_1103800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Not1
DUF3819
CNOT1_TTP_bind
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29776758
NCBI-ProteinID:
XP_018640959
UniProt:
A0A151LIB4
LinkDB
All DBs
Position
11:57259..67221
Genome browser
AA seq
3320 aa
AA seq
DB search
MNNNFNINIQMDEESVKKYESEVNNYFAKLYTGDITVNTMLDILKGLCNSPKGSKNNDVY
KCMLLVLFNECKFFPKYPPEELDITAKLFGKLIKNNLLMDYGNALNIALMCILEAIRKEN
DIKMFNFGITALEQFEEYLLCYPSFLSSLLTMNNLRKYNPQYVTHYNDLLSLLPEHIRSM
PYIEPSIIIKIKQLYSMNTNKINPTINNVQFVNDDHNNFISLNRNNNNINNINNYHNNNI
SENIKIGLHIDRSNYNNENIAFINDNTNNINNNNNNNINNDIYNNNINGYDINHDNINNR
NNSISVVNVLNGILNNNNNINNDNLLSSINNIVPNYQQQVPNFSQHINNDISSNINDNII
LKNKNMNNNINSNVFNTNNFPITNKNNISYNNNNNNISNILNNENSNNNINNNENQLYLN
RPYLNSTKDLIHQFNKNINTLGTNNNIKRDINSKLTHAFNQNNLESNISNVIDNSINMGI
KEHTKNMLDHKKDHMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNMNNM
NNMNNMNNMNNINNVNNMNNINNVNNINNVNNLNIQNNNNNYNLIKAKEQSSDIIEIFYD
QIQKKLPNHLSANNINGFGLGQIECLMDATELTKNIILPSSIIIGEVFSIFNTLCLFNID
EKIKILKDFMQPDYFNWLAFYIVKSRASKEVNLHNVFLEFIDKLSYPLFIDTIISMTYDC
ILILFKYINELKEVSAFRTVLKNLGSWLGFITLGRNRPLKSKILDLKVVLFEAYDKGCLV
CILPMVCKILESIKLSKNFKPPNPWTTAMLCLLTEIHELPNVKTYIIFEVEVLFKNLSLN
IQEFQNKTVLLSKRMPPQNKKSDFVMAKNNRNNRNIITNNNNNNNNNNINNNNNNSNNNN
NMNGLNFISSTNNLNLPVDIKNIYMKENISNVNNIFNINNSINDSTQIQELQNISQNILS
NNRINTEIDTYFNTNEQPTLNTIESNWNPNEINKKIDPLRNDSSLVSSFNPPDLKMINSN
APQKLIYNKNRNHYTINNDQHISNVNSNMNTTSNINNDICDVNKNSNNKFIQSLSNAVII
SPSIALFQIQPTLKRVVPLAVDKAIREIISSILERSVSICCVTTREIICKDFCLETNEYL
IRKAAHIMVASLASSLALATCKEPLRISLTQHLRQLLQPTSTKDCNDQVLIEQVVQILCA
DNLELGCNLIEQAVIEKAIKDINEALEPLFLTKEIARESDISLRESSHLNKSKKMQLEFS
HILNLENPITSKHLNIYTNFINISPLKKLEAAVKALTLIYKNMNDVKDSNKPSLPYIYNT
NIMQNNEEINNYSKANTMTHASSRNEKIYISKDDIKINKNMNLEKYNINNKSKNEHLIAN
IQNNDKENYNEQNDLSNNITLEVNLQLHKVLKKLELATGQLKEAINDIINLPPILFNVNK
EINICNINKMNLYLLYSLSVDGNIFNLIKSIPEIASLTKNKNETIISYTNKIYTFLIEIT
SPNEQTEVNIKSINVTGIYLEVFLCILEKLKYKCPLLKDHITNIIMFNRNKYENVSNNNN
NNNNNNNNNNNINVNHPNRQISDICVNAEEHNDKINLENKNKDINTDNFSNDQYINMYKY
NINVTAGLIRYNLVDIEKYKKYLEKELINNKEDYINILEFVILLLKNILIDFHIYRHSDF
QNIFSLINKFKTEGKKKKNLIHNKNIYVHGWGNVNIKEAIDKLNVESQKIKENKETVYFS
DVMKFCVEYFKMEQEEDEKEPEQENQNEMNQKEKMSEQIIKSKGEEIKNNEKINNEENQS
SKKKDDLTKANENDIKNDENKIHIDNKSEIKQTNEEKIESKKKKKEKQKKTKALLQSNEN
INNLENKQSQENIINESINNNKKEDIHITKSLDNHSENLKRECIDILVNTNKDQHCDMAS
QESNELNNNSGIKKKNNKKNAKKNKKLNEENKEKIDEHKKKEQIDEQQTKEKKDEHQTKE
QIDEQQTKEQIDEQIDEQIDEQIDEQIDEQIDQQIDQQKNNKLMKESLINKNDKNHLKFP
CSNNEDKPDNMKYTQYKKKYLKILMNPKHLTTLTQIIDFCLNTNWNIIQIKNKSKIFKDK
GVGGLRVVPRPQQVTNEHEEIISLAFNQWVKLTSLNNIDNPNESYMKFFQTISNQGLLKI
DSNIDNFFTVCIYKALEGACKILNIYQEQKEQGTQCGSANMDLHKKININKSLDEMHNNM
NNLNQEQTTEFMNNNNGNATEQFSVNKDNTINNESNKNNNSTKKGKSYKTEEADINSLKS
EQEKKDTEDANNTSEKKKDKKKKKDKKNNHDINNNSKNETCIEKTHIVEEKTNDTNNEFN
KNKDIYIANNEETYFDDTYSDISSCYLTFYSNISNKSEHILDEEEYTDCIINNENTTKDF
NYKKDEILKNLTSAINQSIGINIDDMQNKVQSNVINGINLDNKLNDIYEMDVDKKIEDLY
KSENFNMGDIKYEDMIIGVYEKMEQNKIKNEIINKNNNNNDDNNNNNNNNNKNDNYNIDR
NSYPQNDKTNNIYNVNTNTIDNENSNLTSHANIKNQFNNNLNKNNINKTNLYTYDSNDKN
LSDLERNILLNDTLDTTSIDALAKMIICMMRLINIQHISPFVLFQKVMNIFCRIIVYESR
KNKSNFNQRPYYRLLLSILIEINKYEKSFEDLYNKFILAIGYYLCILNPIRVPAFVFAWL
ELINHKLFLPEILKSSKGWYIYNKLLIYLLEFLYIFLKNNYLTDSITILYRGTLRTFLIL
LHDFPEFLCVYNFSLCNVIPLNCIQLRNLILSAFPRNLKLPHPFNPNLKIDELPEIKIAP
VILNNFTFILIDYNIKKDINNYFLKRDLIYLQKIHKKLIIKNKMKALYLKTKYNVSLINA
VVLYIGMSLPSSILIFHNTSQSHPAIELLLYLTYKFDMEGRQYLFSSITNHLRYPNSHTH
YFSCLLLWIFKVSNTEIIKEQITGILIERLIVHRPHPWGLLITFIELIRNPIFKFWQCAF
VSVVPEIENMFQSIAHSCLINQMEQYQNVENIELDNNTNNNNNSVNENNKMNVIDNINIY
SNNNSNNNNNSNNSGNNNSSNHNNHYNILNNSNVAHHLKNMNHSNMVNLKNINIQNNYRN
NDINSTNKNNTNHINLDNINYNNYSISTQNMINNIKNFNSLNINNISSNNLNNINNIDNT
ITKANINNYFIKNNIPSNISNHVSFNAQNNMNMNKQNPFNEPNNNKEFSNINQNIIHNFN
IYSHPTQTSETNIMDPLIFNIHDNKSKNIPIEKDAYMKEIKRNIQNNNFINHENNNNTNT
FHNNMVEHNVKNFLNLQKKI
NT seq
9963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataattttaatataaatatacaaatggatgaagaatcagttaagaaatatgaa
tcagaagtaaataattattttgcaaaattatatacaggggatattacagtaaatactatg
ctagatatattaaaggggttatgtaattcccctaaaggatcaaaaaataatgatgtgtat
aaatgtatgttattagtattatttaatgaatgtaaattttttccaaaatatccacctgaa
gaattagatataacagctaaattatttggaaaattaattaaaaataatttattaatggat
tatggaaatgcattaaatattgctttgatgtgtatattagaagctattagaaaagaaaat
gatataaaaatgtttaattttggtataactgcattagaacaatttgaagaatatttatta
tgttatccaagttttttatcatcattattaacaatgaataatttaagaaaatataatcct
caatatgttacacattataatgatttattaagcttacttccagaacatataagatccatg
ccatatattgaaccttctattataataaaaataaaacaactttattctatgaatacaaat
aaaataaaccctactataaataatgttcaatttgtaaatgacgatcacaacaattttatt
tcactcaacagaaataataacaacatcaataatattaataactaccataataataatata
agtgaaaatattaaaattggtctccacatagatagatcaaattataataatgaaaatata
gcctttataaatgataatacaaataatatcaacaataataataataataatattaataat
gatatatataataacaatattaatggatatgatattaatcatgataatatcaacaatcgc
aataattccataagtgttgtgaacgttctcaatggcatcctaaataataataataatata
aacaatgataatttattatcaagtattaataatatcgtacccaattatcaacaacaagta
ccaaacttctcacaacatattaataatgatatctcatcaaatattaacgataatattatt
ttaaaaaataaaaacatgaacaataatataaatagtaatgtttttaatacaaacaatttt
cccataactaacaaaaataatattagttataataataataataataatatttccaatata
ttaaataatgaaaattcaaataacaatattaataataatgaaaatcaattatatttaaac
agaccttacttaaattcaacaaaagatctcatacatcaatttaataaaaatataaacaca
ttaggaactaataacaatattaagagagatataaattcaaaacttacccatgcatttaat
caaaataatttagaaagtaatatatcaaacgtaatagataattcgataaacatgggtata
aaggaacataccaagaatatgttagatcacaaaaaggatcatatgaataatatgaataat
atgaataatatgaataatatgaacaatatgaataatatgaataatatgaataatatgaac
aatatgaataatatgaataatatgaacaatatgaataatatgaataatatgaacaatatg
aataatatgaataatatgaataatatgaataatataaataatgtgaataatatgaataat
ataaataatgtgaataatataaataatgtgaataatttaaatatccaaaataataataat
aactataatttaattaaggcaaaagaacaatcatctgatattatagaaattttctatgat
caaattcaaaaaaaattaccaaatcatctaagcgcaaacaatataaacggtttcggctta
ggacaaatagaatgcttaatggatgccacggaacttaccaaaaatattattcttccctca
tcaattattataggagaagtttttagtatttttaacacattgtgcctatttaatatagat
gaaaaaataaaaattttaaaagattttatgcaacctgattattttaattggttagcattt
tatatcgtaaaatctagagcttctaaagaagtaaatttacacaacgtatttttagaattt
attgataaattaagttatccattatttatagatacaattattagtatgacctatgattgt
atacttatattatttaaatatataaacgaactaaaagaagtcagtgctttcagaactgtt
ttaaaaaatttaggttcatggttaggattcataaccttaggaagaaatagaccactgaaa
tcaaaaatattagatttaaaagtagttctatttgaagcatatgataaaggttgtttagtt
tgtatattacctatggtatgtaaaattttagaatctataaaattatcaaaaaattttaaa
cctccaaatccttggactactgctatgttatgtttattaacagaaattcatgagcttcca
aatgtcaaaacatacatcatatttgaagttgaggtattatttaaaaatctatctttaaat
attcaggaattccaaaataaaactgtattgcttagtaaaaggatgcctccacagaataaa
aaaagcgattttgttatggcaaaaaataataggaataatagaaatattataacaaataat
aacaacaacaacaataataataatattaataacaataataataacagtaataataataat
aatatgaatggtttaaattttatttctagtactaataatcttaacctacctgtagatata
aaaaatatatatatgaaagaaaatatatcaaatgttaataatatatttaacataaataat
tctattaacgatagtacccaaatacaggaattacaaaacatatcacaaaacatattatca
aataatagaataaatacagaaatagatacttattttaatacaaatgaacaaccaacctta
aatactatagaatctaattggaacccaaatgaaattaataagaaaattgatcctctaagg
aatgactctagtttagtttcttcctttaatcctccagatttaaaaatgattaattcaaat
gcaccacaaaaattaatatacaataaaaatagaaatcattatactattaacaatgatcag
cacatatcaaatgtaaattctaatatgaatacaacttccaatataaataatgatatatgt
gatgttaacaaaaatagtaataataaatttattcaaagtttaagtaatgcagtaattata
tctccatctattgcattatttcaaatacaaccaaccttaaaacgagtagtcccactagct
gttgataaagcaattagagaaataatatcttccatattagaaagatcagtatccatttgc
tgtgtgactactagagaaatcatatgtaaagatttttgtttagaaacaaatgaatattta
atacgtaaagcagctcatattatggttgcatcattggccagctctttagcattagctaca
tgcaaagaaccattacgtatatcactaacacaacatttaagacaattattacaaccaact
agcacaaaggattgtaatgatcaagtactcatagaacaggtcgttcaaatattatgtgca
gataatttagaattaggttgtaatttaattgaacaggctgttattgaaaaagctataaaa
gatattaacgaagcattagaaccattatttttaaccaaagaaatagctagagaaagtgat
atctctcttagagaatcaagtcatcttaataaatcaaaaaaaatgcagttagaattctca
catattttaaatttagaaaatccaataacaagtaaacatttaaatatatataccaatttt
ataaatatatctcccctaaaaaagttggaagcagctgttaaagcattaacattaatttat
aaaaatatgaatgatgttaaagattcgaacaaaccatctcttccatacatatataataca
aatataatgcaaaataatgaagaaatcaataattattcaaaagcaaatacaatgacacat
gcatcaagcagaaacgaaaaaatatatatatcaaaagatgatataaagataaataaaaac
atgaatttagaaaagtataatataaataataaatcaaaaaatgaacatcttattgcaaat
atacaaaataatgataaagaaaattataacgaacaaaatgatttatcaaataatattaca
ttagaagtcaatttacaattacataaagttttaaaaaaattggaactagctacaggacaa
ttaaaagaagctattaatgatattattaatttacctcctatattatttaatgtcaataaa
gaaataaatatatgtaatattaataaaatgaatttatatctattatatagtctatctgtt
gatggaaatattttcaatctaataaaatccattccagaaatagcttcattaacaaaaaat
aaaaatgaaactataatttcatatacaaataaaatatatacctttcttatagaaataaca
tcaccaaacgaacaaacagaagtaaatattaaatccattaatgttacaggtatatactta
gaagtctttttatgtatattagaaaaattaaaatataaatgtcctttattaaaggatcat
ataacgaatataataatgttcaacagaaacaaatatgaaaatgtatcaaacaacaacaac
aataataataataataataataataataataatattaatgtgaaccatccaaaccgtcaa
atatcagatatttgtgtaaatgcagaagaacataatgataaaattaatttagaaaataaa
aacaaagatataaatacagataatttttcaaatgatcaatatataaatatgtataaatat
aatataaatgttactgcaggtttaataagatacaatttagttgatatagaaaaatataaa
aaatatttagaaaaagaacttattaataataaagaagattatattaacatattagaattt
gttatattacttctcaaaaatattttaatagattttcatatatatagacatagtgatttt
caaaatatattttctttaataaacaaatttaaaacagaagggaagaaaaaaaaaaactta
attcacaataaaaatatttatgtacacggttggggaaatgtaaatataaaagaagcaatt
gataagttaaatgtagaatctcaaaaaatcaaagaaaataaagaaactgtctatttttca
gatgtaatgaaattttgtgtagaatattttaaaatggaacaagaagaagatgaaaaagaa
ccagaacaagaaaatcaaaacgaaatgaaccaaaaagaaaagatgagtgaacaaattata
aaaagcaaaggagaagaaattaaaaataatgaaaaaataaataatgaagagaatcaaagt
agtaaaaaaaaagatgatctaacaaaagcaaatgaaaatgacataaaaaatgatgaaaat
aaaatccatatagataataaatcagaaataaaacaaacaaatgaagaaaaaatagaatct
aaaaaaaagaaaaaagaaaaacaaaaaaaaacaaaagcattattacaaagtaatgaaaat
ataaataatttagaaaataagcaaagtcaagaaaatatcataaatgaatctataaataac
aataaaaaagaagacatacatataacaaaatcattagataatcattcggagaacttaaaa
agggaatgtattgatattttagtaaatacaaataaagatcaacattgtgatatggcttct
caagaaagtaatgaacttaataacaattcaggaattaaaaagaaaaataacaaaaaaaat
gcaaaaaaaaataaaaaactaaatgaagaaaataaggaaaaaattgatgaacacaaaaaa
aaagaacaaatagatgaacaacaaacaaaagaaaaaaaagacgaacaccaaacaaaagaa
caaatagatgaacaacaaacaaaagaacaaatagatgaacaaatagatgaacaaattgat
gaacaaattgatgaacaaattgatgaacaaatagatcaacaaatagatcaacaaaagaat
aataaattaatgaaagaatctcttataaataaaaatgacaagaatcacttaaaatttcca
tgctccaataatgaagataaaccagataatatgaaatatactcaatataaaaagaaatat
ttaaaaattttaatgaaccccaaacatttaacgaccttgacacaaataattgatttttgt
ttaaatacaaattggaatattatacaaattaaaaataaaagtaaaatttttaaagataaa
ggagtaggaggtttaagagtagtacctagaccacaacaagttacaaatgaacatgaagaa
attattagtttagcatttaatcaatgggttaaactaaccagtttaaataatatagataat
cctaatgaaagctatatgaaattttttcaaactatatcaaatcaaggattattaaaaatt
gatagtaacattgataacttttttactgtatgtatatataaagctctagagggagcatgc
aaaatattaaatatatatcaagaacaaaaggaacaaggtacacaatgcggtagtgcaaat
atggatttacacaaaaagattaatataaacaaatcacttgatgaaatgcataataatatg
aacaatttgaatcaggaacaaacaaccgaatttatgaataacaataatggtaatgctact
gaacaattttcggttaataaagataatactataaataatgaatccaataaaaacaataat
agtacaaaaaaaggcaaaagttataaaacagaagaagcagatataaattcattaaaaagt
gaacaggaaaaaaaagacacggaagatgcaaataacacaagtgaaaagaaaaaagataag
aaaaaaaaaaaagataaaaaaaataatcatgatataaataataatagtaaaaatgaaact
tgtatagaaaaaacacatatcgttgaagaaaaaactaatgatacaaataatgaatttaat
aaaaataaagatatatatattgcaaataatgaagaaacatattttgatgatacctattca
gatatatcttcatgttatttaacattttattctaatatatcaaataaaagtgaacatatt
ttagatgaagaagaatatactgattgtattataaataatgagaatactactaaagatttt
aattacaaaaaggatgaaatattaaaaaatctaacttcagctataaaccaatccatagga
attaatatagatgatatgcaaaataaagtacaatcaaacgttattaatggaataaatcta
gataataaattaaatgatatttatgagatggatgtggacaaaaaaatcgaagatctctac
aaatctgaaaattttaacatgggtgatataaaatatgaagacatgataataggagtatat
gagaagatggaacaaaataaaataaaaaatgaaattattaataaaaataataataataat
gatgataataataataataataataataataataaaaatgataattataatatagatcga
aatagctatccacaaaatgacaaaacaaataatatctacaatgttaatactaatacaatt
gataatgaaaatagtaatttaaccagtcatgctaatattaaaaaccaatttaataataat
cttaataagaataatataaataaaacaaacttgtatacatacgatagtaatgataaaaac
ctttcagatctagaaagaaatattttattaaatgatactttagatacaactagtattgac
gcattagcaaaaatgattatttgtatgatgagattaattaatatacaacatatatcacct
tttgtcttatttcaaaaagttatgaatatattttgtagaattatagtatatgaatctaga
aagaataaaagtaattttaatcaaagaccatattatagattattgttatctatattaatt
gaaataaataaatatgaaaaatcatttgaagacttatataataaatttatattagctatt
ggatattacttatgtattttaaatccaatacgtgtacctgcatttgtattcgcatggtta
gaattaattaatcataaattatttttaccagaaatattgaaaagttctaaaggatggtat
atatataataaattattaatatatctattagaatttttatatatttttttaaaaaataat
tatttaactgattcaataacaattttatatagaggaacattaagaacatttttaatctta
ttacatgatttccctgaatttttatgtgtatataatttctcactttgtaatgtcatacct
ttaaattgtattcaattaagaaatttaatattatcagcatttccaagaaatttaaaatta
cctcatccatttaatcctaacttaaaaatagacgaattaccagaaattaaaatagcacct
gttatattaaataattttacatttatattaattgattataatattaaaaaagatataaat
aattattttttaaaaagagatctaatatatttacaaaaaatacataaaaaattaattatc
aaaaataaaatgaaagctttatatttaaaaacaaaatataatgtatcattaattaatgca
gttgttttatatataggaatgtcattaccatcaagtatattaatatttcataacacatcg
caatcacatccagctatagaattattactttatttaacatataaatttgatatggaaggt
agacaatatttattttcatccataactaatcatttaagatatccaaattcacacacacat
tatttctcttgtttattattatggatatttaaagtatccaacacagaaattattaaagaa
caaattacaggtattttaatagaacgtcttatagtacatagaccacatccttgggggttg
ctaataacatttattgaacttataagaaatcctatttttaaattctggcaatgtgcattt
gttagcgtggttccagaaatagaaaatatgtttcagtctatagctcattcatgtttgata
aatcagatggagcaatatcaaaatgtggaaaatatcgaattagataacaacacgaataat
aataataacagtgtgaatgaaaataataaaatgaatgtaatagataatattaatatttat
agtaataataatagtaataataataataatagtaataatagtggtaataataatagtagt
aatcataataatcattacaatatcttgaataactcaaatgtggcacatcatttaaaaaat
atgaatcattcaaatatggtaaatcttaaaaatattaacatacaaaataattatagaaat
aatgatataaattcaaccaataaaaataacacaaatcatataaatctagataatatcaat
tataataattatagtatttccacacaaaatatgatcaataatattaaaaattttaatagt
ttaaatataaataatatttcatcaaacaatttgaataatataaacaatattgataataca
attacaaaagcaaatataaataattattttataaaaaataatataccttctaatatatca
aaccatgtatcatttaatgctcaaaataatatgaacatgaataaacagaatcctttcaat
gaaccaaataataataaagaattttctaatattaatcaaaacattatacacaattttaat
atatattcacatccaacacaaacatcagaaacgaatatcatggatcctcttatttttaac
attcatgataataaaagcaaaaatatacctattgaaaaagatgcttatatgaaggaaata
aaaagaaatatacaaaataataattttattaatcatgaaaataacaacaatacaaatacg
tttcataataatatggttgaacataatgttaaaaattttctaaacctccaaaaaaaaatt
taa
DBGET
integrated database retrieval system
