Plasmodium gaboni: PGSY75_1125300
Help
Entry
PGSY75_1125300 CDS
T08136
Name
(RefSeq) DNA-directed RNA polymerase
KO
K10908
DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial [EC:
2.7.7.6
]
Organism
pgab
Plasmodium gaboni
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
pgab03029
]
PGSY75_1125300
Enzymes [BR:
pgab01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
PGSY75_1125300
Mitochondrial biogenesis [BR:
pgab03029
]
Mitochondrial DNA transcription, translation, and replication factors
Mitochondrial transcription and translation factors
Mitochondrial RNA polymerase
PGSY75_1125300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol
RPOL_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29776970
NCBI-ProteinID:
XP_018641171
UniProt:
A0A151LIY4
LinkDB
All DBs
Position
11:842971..847917
Genome browser
AA seq
1648 aa
AA seq
DB search
MFVCKKCSSYVIKKIFHTFVGDDKYKLVFLKKGGDAYKNIFLFHKGYISTNVRSEKKERT
KKNKNDVDIKKVFVGTHSESNIQDENKTTGNDNKNMEIYNICNNNNNIRSYNNIKEFTDI
NIFNSNNKSLPIKDNINNMIDDNYDXXXXXXXXNIQDENKTTGNDNKNMEIYNICNNNNN
IRSYNKIKEFTDINIFNSNNKSLPIKDNINNMINDNYDNEQKKKKKKEEEEEEEYINSSS
VKNDLYNLQCNNNINNNNDTLIIDKNKLDEQVIKELSNLIISIKKIDKEEKENIIKYINT
LNKKYLKNINKNIIVFFENLDIYMSVNGLLICDIGGEEIFNYINKITLSSNNMDNIKKQT
NVLTEKNNVNTNETFLNIDDMSKEDNININNMFNINYIKEKKKKIYGDNIYPIVIKSEEK
EVVTKKNDYNNINISNDNNNNNNNSSSNNSSSNISDDYNMSNCKNDLEEKRKSHQSNYSR
IPNLHFASNVEKEKNIINIRRQMLIERSSYKKAIEEAEEFVSNLHDLKKITEIQGLCKIY
LNWISELEKRIILYKEKNKNKKKKNVFPDGIDDKLLATITVKWTIQYTFNPLKKKYSNNV
TTQSKYFEHEYSYQSLFTHIAIKIGEEINNELNFQLLEKKNLLYNYMKKNKNKSSFSHFQ
KYRIISQMKQKIGKGDQLRQQSVLGGKKESSVCNYVGMDRDGIYEDDIYKDDIYKDDIHK
DDIHKDDIHNDDIHKNNIHKNNIHMCDEYYRLMNNPTHIKNDDDNIIQWNSVKKATIGGL
LLNMLIENAKMDVDINVAKNEFKNEYKYYLFLHKTAKNNADELYEECKYKKELNYQKFYE
DESNTLKFIILDKYKKTNCYDNSFKKNKSQKKKSTYNYSANGKNGDKIFMPSKEHIGGCS
YVGEPPNVEEPPNVEDPPNVEEPPNVEDPLNVEDPLNVDTPDQPHISDNKKQSSFCQKQR
AKLMKKEIILYRSKRDRNKIELPVFIHSYVWKNNNWYGVIHMRECCANYLLDNAINSHIP
LNYLPMICKPRRWSNNEGGMLLLKNNFIRCNIKPLFNLNVCNLNRIKNIVSEIGNVGWKI
NKEILYYIEYAYIHGITIGKIPLYKNYSLPKKYINLKEQNNEEIKKYFLLKEEINRLNKC
LISERPTFLQKLAVAKTLKDNEVIYFPHNIDFRGRMYPLSPHLHHMSDDICRSLITFAEQ
KEIGHKGLFWLKIHLANTFGKDKLSFQKRIQWVDQNINNIKKLTQQPFDNIEFWNMAEKP
WQALAVAIDLKNALESDNVFKYKSSIPIQQDGTCNGLQHYAALGKDKYGGQAVNIIPSDE
PQDIYSVVLDIVINKIKNDLLNIPSDHNNNIISFNMNQNIKTNNKYNINSNNSSSCSSSS
YSSSRCSNYSNSNNNSNLNKNELASYCFKFDLLKRKVVKQTIMTICYGVTSIGAKNQVKG
KIQTMIGKELDKNTINKLSQYIANYIFESISEIFKRAMIIKKWFNNLSKVTNELNIPITW
ISPIGLPCEQPYRLGNRILVNTPLQSISVISYKNSQLHKNKQRLGFPPNFVHSLDASHLM
MTAEKMVIQNNFSFAAVHDSYWAHACNVDIMNQFIRESFITLYNEPILENIYNNFRIRLG
KFATKIPSSPEQGELDISLVKDSLYFFS
NT seq
4947 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgtatgtaaaaaatgttcgagttacgttattaagaagattttccacacgtttgta
ggtgacgacaaatataaacttgtgtttttaaaaaaaggaggagatgcttataagaatatc
tttctctttcataaaggatatataagtaccaatgtaagaagtgaaaaaaaagaaagaaca
aaaaaaaataaaaatgatgtggatataaaaaaagtgtttgtgggtacccacagtgagtca
aatatacaagatgaaaataaaacaacaggaaatgataataagaacatggaaatatataac
atatgtaataataataataatattaggagttataataatataaaagaatttacagatatt
aatatttttaatagtaataataaaagcttacctatcaaagataatataaataatatgatt
gatgataattatgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatatacaagatgaaaataaa
acaacaggaaatgataataagaacatggaaatatataacatatgtaataataataataat
attaggagttataataaaataaaagaatttacagatattaatatttttaatagtaataat
aaaagcttacctatcaaagataatataaataatatgattaatgataattatgataatgaa
cagaaaaaaaaaaaaaaaaaagaagaagaagaagaagaagaatatattaatagttcgagc
gtcaaaaatgatttatacaatttgcaatgtaataataatattaataataataatgacaca
cttattattgataaaaacaaattagatgaacaagtcataaaagaattatctaatttaata
atttctattaaaaaaatagataaagaagaaaaagagaatataataaaatatataaataca
ttaaataaaaaatatttaaaaaatattaataagaatataattgtattttttgaaaatcta
gatatatatatgtcagtgaatgggttgttaatatgtgatataggtggggaagaaatattt
aattacatcaataaaattacattatcatcaaataatatggataatataaaaaaacaaaca
aatgttcttacagagaagaataatgtaaatacaaatgaaacgtttttgaatatagatgat
atgtccaaagaagacaatattaatataaataatatgtttaatataaattatataaaggaa
aaaaaaaaaaaaatttacggagataatatatatccaatagttattaaatctgaagaaaaa
gaagttgtaacaaaaaagaatgattataataatataaacataagtaatgacaacaacaac
aataataataatagtagtagtaataatagtagtagtaatatttctgatgattataatatg
tccaattgtaaaaacgatttagaagaaaaaaggaaaagtcatcaatctaattattcgaga
attccaaatcttcattttgcatccaatgtagaaaaagaaaaaaatatcatcaacattaga
agacagatgttaattgaaagatcttcttataaaaaagccatagaagaagcagaagaattt
gtttcgaatttacatgatttaaaaaaaattacagaaattcaaggactgtgtaaaatatat
ttaaattggattagtgaattagaaaaacgtattattttgtataaagaaaaaaataaaaat
aaaaaaaaaaaaaatgtttttccagatggtatcgatgataaattattagctacaattaca
gtcaaatggaccattcaatatacttttaatcctttaaaaaaaaaatattcaaataatgtt
actacacaatccaaatatttcgaacacgaatattcttatcaatctttatttacacatata
gccataaaaataggagaagaaataaacaatgaactcaattttcaattactagaaaaaaaa
aatcttctttataattatatgaagaaaaataaaaataaatcatccttttctcattttcaa
aagtataggataataagtcaaatgaagcagaaaattgggaagggggatcagttgagacaa
caaagtgttcttgggggtaaaaaggaaagtagtgtttgtaattatgttggcatggatagg
gatggcatatatgaggatgacatatataaggatgacatatataaggatgacattcataag
gatgacattcataaggatgacattcataatgatgacattcataagaataacattcataag
aataacattcatatgtgtgatgaatattaccgacttatgaataaccctacacatataaaa
aacgatgatgataatataattcaatggaattctgtcaagaaggcaacaataggaggacta
ttattaaacatgcttattgagaatgccaaaatggatgttgatattaatgtagctaaaaat
gaatttaaaaatgaatataaatattatttatttttacataagacagccaaaaataatgct
gatgaattatatgaagaatgtaaatataaaaaagaattaaattatcaaaaattttatgaa
gatgaatcgaatacattaaaatttattattcttgataaatataaaaagactaattgttat
gataattcttttaaaaaaaataaatcacaaaaaaaaaaaagtacatataattattctgca
aatggtaaaaatggggacaaaatttttatgccttctaaggagcatattggtgggtgctca
tatgtgggggaacctcctaatgtggaagaacctcctaatgtggaagaccctcctaatgtg
gaagaacctcctaatgtggaagaccctcttaatgtggaagaccctcttaatgtggacaca
ccagaccaacctcacatttcagacaataaaaaacaaagtagcttttgccagaagcaaaga
gcaaaattaatgaaaaaagaaattattttatatcgatccaagagggatagaaacaaaatt
gagttacctgtatttattcattcatatgtatggaaaaataataattggtatggtgtcata
catatgcgtgagtgttgtgcaaattatttattagataatgcaataaattctcatattcct
ttaaattatttacctatgatatgtaaaccaaggaggtggtcaaataatgagggagggatg
ttattattaaaaaataattttattcgttgtaatatcaaaccattatttaatttaaatgtt
tgtaatttaaatagaataaaaaatattgtatcagaaataggtaatgtgggatggaaaatt
aataaagaaattttgtattatatagaatatgcatatattcatggtataacaataggaaaa
atccccctttataaaaattatagcttaccaaaaaaatatattaatttaaaagaacaaaat
aatgaagaaataaaaaaatattttttattaaaagaagaaattaatagattaaataaatgt
ttaataagtgaaagacctacattcttacaaaaattagctgtagcaaaaactttaaaagat
aatgaagttatctattttcctcataatatagattttagaggaaggatgtatccattatca
ccacatctacatcatatgagtgatgatatatgtagaagtctaatcacatttgcagaacaa
aaagaaataggtcataaaggattattctggttaaaaatacatcttgcaaatacatttgga
aaagataaattaagctttcaaaaaagaattcaatgggttgatcaaaatattaataatatt
aaaaaattaactcaacaaccatttgataatatcgaattctggaatatggctgaaaaacca
tggcaagcattagctgtagcaatagatctcaaaaatgcactagaatctgataatgttttt
aaatataaaagtagtataccaattcaacaagatggcacttgtaacggcttacaacattat
gcagccctaggaaaagataaatacggtggacaagcagtaaatataatcccttcagatgaa
ccacaagatatttattccgtagttttagatatagtcataaataaaattaaaaatgatttg
ctaaatataccaagtgatcataataataatattatatccttcaatatgaatcaaaatata
aaaacaaacaataaatacaacatcaacagtaataatagtagtagttgtagtagtagtagt
tatagtagtagtcgttgtagtaattactctaatagtaataataactctaatcttaataaa
aacgaattagctagctattgcttcaaatttgatcttttaaaaagaaaagtcgttaaacaa
accattatgaccatatgttatggtgtaacatctataggggcaaaaaatcaagtcaaagga
aaaattcaaacaatgataggaaaagaactagataaaaatacaattaataaattgtcacaa
tatattgctaattatatatttgaatctataagtgaaatatttaaaagggctatgatcatc
aaaaaatggtttaataatttgtccaaagttactaatgaattaaatatacctatcacatgg
atatcacccataggattaccatgtgaacaaccatacagattaggtaatagaattctagtc
aatacacctttacaatcaattagtgttatatcatataaaaatagtcaattacataaaaac
aaacaaaggttaggcttcccacctaattttgttcattcactagatgcatcacatctcatg
atgacagcagaaaaaatggtaattcaaaataattttagctttgctgcggtacatgattct
tattgggctcatgcatgtaatgtagatattatgaaccagtttataagagaatcatttata
acattgtataatgaacctattctagaaaatatatataacaactttagaatcaggttgggt
aaattcgctactaaaataccatcatcccctgaacagggtgaattggatatttcccttgta
aaggatagtctttacttttttagctga
DBGET
integrated database retrieval system