Plasmodium gaboni: PGSY75_1235900
Help
Entry
PGSY75_1235900 CDS
T08136
Name
(RefSeq) putative pre-mRNA-splicing factor SYF1
KO
K12867
pre-mRNA-splicing factor SYF1
Organism
pgab
Plasmodium gaboni
Pathway
pgab03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PGSY75_1235900
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pgab03019
]
PGSY75_1235900
03041 Spliceosome [BR:
pgab03041
]
PGSY75_1235900
Messenger RNA biogenesis [BR:
pgab03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
PGSY75_1235900
Spliceosome [BR:
pgab03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
PGSY75_1235900
Complex C
PGSY75_1235900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_Syf1_CNRKL1_C
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_M
HAT_PRP39_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29777523
NCBI-ProteinID:
XP_018640797
UniProt:
A0A151LGQ9
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(1307174..1310657)
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MALFGELYECEEFFNEETFNIKKSEYYNYDDFKDVEELLDNSVDPVYVESEDINLMNKNN
NDDDDNKSYIKNIEIDIKENFDKISTRYLFLYINKYKEMYIKNMKGLYEVDFYDIHLKGD
KKTILTSDNNIIEYCMENLINKNNIPDDNDNKNVHSDNMNINKNESYPIDSDKKVIEKKV
YDLFCIYEIILKYFPYSFKLWYHYIKDSIEMITDVYYLNKKNYKYINKIFDKCILYMYNF
KSIYIMYIQFLYIQRNIKKIRKIFNLSLQNVYLNQQNDLWEYILLFNEKINNKVINYEYI
KRYVTIYPEQIIHLFKHYIKYKMYKNAMITFFYILNSGDNFDLGQYSKYDIYEEIYKLLN
TKGTLNNDIIHLLKKNLYIFKNYESITSIYILLANNFIYDGRWNKAMDSYEEGISECYTV
NDFITLFDNYIEMLKMLIDLNIYEQEEREKDILNKTLKKKKNNNKKKKKNTLNDDNNDDD
NHNNDDNHNNDVNHNNLGVDANLIIDLYMDKINYLLDQRKTYIADIKLKNNKNNVYIWLS
KIDSIINEEEKIYLYDECLKYFETNDYIGKLSDIYISYAYYYYNKDEYTNCINIFKLALK
QNVFFKSANEIANIFCAWIEVELLEKNYKEALNIARLSIDINKKSYNVLYKSSTSILPYE
DKLLNNNMKNNYHTNFNLLSCMKLVSLIIDMEINYGTVETTLNMFDFLYHSKCITVKIVL
TLSTYLYEKKYFNESFKVYEKALSVFHYPYVYPIYVNYINKYIQRYKDKNISYVRDLFKQ
AIYGNDNKTFIPREFAKQIFLMYANFEGNYGFIKRELSIYKEAIPFLEESDKIKFYKIFI
SKVSRAYGIQKAREAFEEAIQTLSDDSARQLCMIYIDMEYKLNEYERVRALYIYTAQYTN
PLIYVDFYKDWREFEALHGNENTFREMIRIKKSVLNIFSNSRNNMEDEKQQKANMDELEN
TKRKLKEIIEKEEEHQKKLKRNELYNY
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttgttcggagaactgtatgaatgcgaagaattttttaacgaagaaacgtttaat
ataaaaaaaagcgaatattataattatgatgattttaaggatgtggaagaactattagat
aactcagtagaccctgtgtatgttgaatctgaggatataaacctaatgaataagaataat
aatgatgatgatgataataagagttatattaaaaatattgaaatagacataaaagaaaat
tttgataagatatcaactagatatttatttttatatattaataaatataaagaaatgtat
ataaaaaatatgaaaggattatacgaggtggatttttatgatatacatttgaagggtgat
aaaaaaacaatacttacaagtgataataatattatagaatattgtatggaaaatttaatt
aataaaaataatattccagatgataatgataataagaatgtacatagtgataatatgaat
attaataaaaatgaatcctaccctattgatagtgataaaaaagtaatagaaaaaaaggtg
tatgatcttttttgtatttatgaaataatattaaaatattttccatatagttttaaatta
tggtatcattatattaaagatagtatagaaatgataacagatgtatattatttgaataaa
aagaattataaatatataaataaaatatttgataaatgtatattatatatgtataatttt
aaatctatatatataatgtatattcaatttttatatattcaaaggaatataaaaaaaatt
cgtaagatatttaatctttcattgcaaaatgtttatttgaatcaacaaaatgatttatgg
gagtatatattattatttaatgagaagattaataataaagttataaattatgaatatatt
aaaagatatgttactatatatcctgaacaaataatacatttatttaaacattatataaaa
tataaaatgtataagaatgctatgatcacctttttttatattctaaatagcggagataat
tttgatttaggtcaatattcaaaatatgatatctatgaagagatatacaaacttttaaat
actaaaggaaccttaaataatgatattatacatttattgaagaagaatttatatatattt
aaaaattatgaaagcataacatctatatatatattattagcaaataattttatatatgat
ggcagatggaacaaagctatggattcatatgaagagggtatatccgaatgttatacagtt
aatgattttataactttatttgataattatattgaaatgttgaagatgttaatagatcta
aatatatatgagcaagaagagagagaaaaggatattttaaataagacattaaaaaaaaaa
aaaaataataataaaaaaaaaaaaaaaaacacattaaatgatgataataatgatgatgat
aatcataacaatgatgataatcataataatgatgttaatcataacaaccttggtgtggat
gccaatttgattatagatttatatatggataaaataaattacttattagatcaacgtaaa
acatacattgcagatataaaattaaaaaataataaaaataatgtatatatatggttaagt
aaaatagattctataataaacgaagaagaaaaaatatatttatatgatgaatgtttaaaa
tattttgaaacaaatgattatatagggaaattaagtgatatatatattagttatgcttat
tattattataataaagatgaatatacaaattgtataaatatatttaaattagctttaaaa
caaaatgttttttttaaaagtgcaaatgaaatagctaatatattttgtgcatggatagaa
gtcgaattattagaaaaaaattataaagaagctttaaatatagcaagactatcaattgat
ataaataaaaaatcctataatgtattatataaatcatctacttctatattaccatatgaa
gataaattattaaataataatatgaaaaataattatcatactaattttaatttattaagt
tgtatgaaattagtatctctaattatagatatggaaataaattatggaacagtagaaact
acattaaatatgtttgattttctttatcattcaaaatgtataacagtaaaaatcgtatta
acattatctacatatttatatgaaaaaaaatattttaatgaatcatttaaagtatatgaa
aaagcattatctgtttttcattatccttatgtgtatcctatatatgttaattatattaat
aaatatattcaaagatataaagataaaaatatatcatatgtaagagacttattcaaacaa
gctatatatggtaatgataataaaacatttataccaagagaatttgctaaacaaatattc
ttaatgtatgcaaactttgagggtaactatggatttattaaaagagaactttcaatatat
aaagaagctatacctttcttggaagaatcagacaaaattaaattttataaaatttttata
tccaaggtatctagggcatatggaattcaaaaggctagggaagccttcgaagaagcaatc
caaactctctcagatgatagtgctcgtcaattatgtatgatatacatagatatggaatat
aagttaaatgaatatgagcgtgtaagggccttatatatatatacagcccaatacacaaac
cctttaatttatgtggatttctacaaggactggagagaatttgaagctttgcatggaaat
gaaaacacgtttagagaaatgataagaataaaaaagagcgtcctaaatatattttcgaat
tctcgtaataatatggaagatgaaaaacaacagaaagctaatatggacgaattggaaaat
acgaaaagaaaattaaaagagataattgaaaaagaagaggagcatcaaaaaaaacttaaa
agaaatgaattgtataattattag
DBGET
integrated database retrieval system
