Pseudomyrmex gracilis (graceful twig ant): 109861531
Help
Entry
109861531 CDS
T05003
Name
(RefSeq) zinc finger BED domain-containing protein 4-like
KO
K24637
zinc finger BED domain-containing protein 1 (E3 SUMO-protein ligase ZBED1) [EC:2.3.2.-]
Organism
pgc
Pseudomyrmex gracilis (graceful twig ant)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
pgc03000
]
109861531
04121 Ubiquitin system [BR:
pgc04121
]
109861531
Transcription factors [BR:
pgc03000
]
Eukaryotic type
Zinc finger
Cys2His2 BED
109861531
Ubiquitin system [BR:
pgc04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
UBL E3 ligases
109861531
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
zf-BED
ZBED1_RNase-like_helical
ZBED1_RNase-like
DUF659
MULE
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109861531
NCBI-ProteinID:
XP_020296809
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
633 aa
AA seq
DB search
MFYIMPPSRSEYWKYFIRTSEGCGKCNICQKIIKTSGNTTNLRVHLTRAHPKLQFQMXDK
TDIDTTDTDFSTSAKQRKIILQDKTNKNIVDDDFNLPVISSPSSSSLSIMSGMSSHSQSE
SSVLSLPIVRKKQITLDSTFXNQKSFYDGGTKAAEFTXNLIFMIAKDNLPFATVEKEGFK
TFMKTIAPLYKIPSRKKITSLIEEKYEFLSSMIKTQFLNIKNLCLTTDIWTDTINTKSFL
GITAHYILKETYKSVTIGVIELNXRHTSDNIKLWLLNIICEWNIDKENIIVVVSDNAANI
KKAITEAFGTEKXLPCFAHTLNLIPSNIIKDDAIVSEFCKKIKNIVTYFKHSVVAADELR
AQSNLKLIQSVETRWNSTYDMLERFIEVADKVSGILLNQPTAPIMLNASELQAAREFVQL
LKPFEEXTKIMCGEDYLTGSKVIPIINTLKNKLYMLVPNTEIGIHFKIELEXHFSKRFIN
IEKVQPLAISSILDPRFKNIXFSDKIACAHSINKITQMINNTNAKDLDESNYQNVHNNSI
ESDNFWMYHEYLVNISKSKHNDFTMADELKYYLNQPPIKMDDNPLKYWLMNMHSRLKDIA
LKYLSIIPTSVLGATHCRTCSSTGDAPLPFTAV
NT seq
1902 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttacataatgccgccntcnagaagtgaatattggaaatattttattcgaaccagt
gaaggttgtggtaaatgtaatatttgccaaaaaattataaaaacttcgggaaatacaaca
aatttacgtgttcatttaactcgagcacatcctaagcttcagtttcaaatgaangacaaa
actgatattgatacaacagacacagacttttcaacctcagcaaaacagagaaaaattata
ctacaagataaaaccaataaaaatattgtagatgacgattttaatttaccagttatttca
tctcctagttcttcgtctttatcaataatgtcaggtatgtcaagtcattcacaatcagag
tcatcagtgttgtcattgccaattgtgagaaagaagcaaattactcttgattctactttt
naaaaccaaaaatcattttatgatggaggaacaaaagcggctgaatttactancaatctc
atttttatgattgcaaaagataatttgccatttgcaacagtagaaaaggaaggatttaaa
actttcatgaagacaatagcaccgttgtacaaaattcctagccggaaaaaaattacgagc
ctaatagaagagaaatatgaatttttgtcaagtatgataaaaactcaatttttaaacatt
aaaaatttatgtttaacaaccgacatttggacagacacgataaatacaaaaagcttttta
ggcataacagctcattatatattaaaagaaacatataaatctgtgactattggtgttata
gaattaaacnatcgacatacttctgataacataaaactgtggttgttaaatataatatgt
gagtggaacatagataaagaaaacattatagttgttgtatccgataatgcagccaatata
aaaaaggcaattacagaagcgtttggtactgaaaaanacttgccgtgtttcgcacacact
ttaaatttaattccatcgaatattattaaagatgatgctattgttagtgaattctgtaaa
aaaattaaaaatattgttacgtactttaaacattctgtagttgctgcagatgaattgcga
gctcagtcaaatctcaaattaatacaaagtgtcgaaactcgatggaattcgacttatgac
atgcttgaacggtttattgaagtggcagataaagtaagtggtattcttctgaaccaacct
acagcaccaataatgttaaatgcatctgaattgcaagctgcaagagaatttgttcaatta
ttaaaaccgtttgaagaagnnactaaaattatgtgcggtgaagattatcttactggcagc
aaagtgattccgattattaatacgctaaaaaacaaattgtatatgcttgtaccaaatact
gaaataggtattcactttaaaattgaattagaacntcacttctcaaaaagatttattaat
attgaaaaagttcagccattggcgatatcctccattttagatcctcgatttaaaaacatt
canttttctgataaaattgcgtgtgctcattctattaacaaaatcacgcaaatgataaat
aatacaaacgcgaaagacttagatgaaagcaattatcaaaacgtgcacaataattcgata
gaaagtgataatttttggatgtatcatgaatatttagttaatatatccaagtcaaaacat
aacgattttacaatggcagatgaacttaaatattatttaaatcaaccaccaattaaaatg
gatgataatccattaaaatattggctaatgaatatgcattccagattaaaagatatagca
ttaaaatatttaagtataattccgacctccgtgctaggtgcaactcactgccgcacctgt
agcagcacaggggacgctccactcccgttcactgctgtctag
DBGET
integrated database retrieval system
