Pedobacter gandavensis: QG516_00425
Help
Entry
QG516_00425 CDS
T09013
Name
(GenBank) two-component regulator propeller domain-containing protein
Organism
pgj
Pedobacter gandavensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
Y_Y_Y
HisKA
HTH_AraC
SGL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGQ10118
LinkDB
All DBs
Position
108770..112924
Genome browser
AA seq
1384 aa
AA seq
DB search
MFPGRTLVFLLFLLICSEVSAQPGQIQFSRMDLSDGLSHNQVNAVLKDSKGFIWFATLSG
LNRYDGQVIKVFKHNPRDTSSIIDDFITNIYELPGHKLYLETRSGPNIYDPETESFIRNT
TSWFKSIGIDSKGIREVLKDKAGDFWFNAQEQGIYKYEVSSASTKHLKLKKNNEKSLSDS
PVSGIQSDPAGAIWIIHRDKTMERLDRKTAELKQRILTFKTSNPSEMQDFKLFADEDGDL
WMYTLNNQRGITYFNPKTGQHRQIDKAPGALNSNLISGMLQDPHGQIWIGTDHGGVNVLN
KKTFKLSYLLHKEDDPKSIGQNSITCLYKDISGIIWVGTFKKGLSFYHEKILKFPLFRHQ
GASPDGLVYDDVNRFAEDDQGNLWIGTNGGGLFYFNRKTKQFKRYQHQHNNPNSLSNDII
VSLFVDKGKRLWIGTYFGGLDSFDGKTFKHYRHEPGNPTSLSDDRVWDILEDRSGNLWVA
TLSGGLNLLDRSTGKFSHFRAGAKNGIHSDFLSCLIEDKKGNLWIGSSDGIDQLKPDGSF
VHHKHEDNNVNSLINNIVYDLMEDSYGFIWAATRDGLSRLDPARKAFRNFDTKDGLGEKA
TLKIVEDNQRNLWVSTANGLFNVVVKPLAKRDFSYTFHKYDEHDGLQGSAFNANAGYKTS
TGDLAFGGANGFNLFQPERIKNDLSKPVIVFTDLQVENKSVGIGEPVNGRILLEKSLSFT
DGITLKHNQNGFAIEFAALNYFNPHKIRYRYKLEGFDEHWQEPQPNSRRATYTNIDPGAY
TFKVMSTDASGNWVNNEADLKIIIQPPFWSTWMAYLLYALAIGGGLLWIRHRGIARLNKE
FLLKQERQQASRMHELDLMKIKFLTNVSHEFRTPLSLIITPLEKLIGQNVIPKKQELQLM
HRNGKRLLNLVNQLLDFRKMEVRELRLHPKPGEAISFIRELCLSFNDLAEQRRINFSFHT
EAQTLMVAFDHDKVERIVFNLLSNAFKFTPEGGKIWVTLEIVQQQISHTTLLLKVSDTGI
GMEADKTARIFERFFQNDMPDSIVNQGTGIGLSITKEFVKLHDGKIHVNSVLNEGSEFCV
SLDLANSHSAADAGKTEAGVEKQELVDEGAALMNTSEDPKENFTWKSKKQILMLVEDNED
FRFYLKDNLSEFYQIVEASNGKEGWQKILSSHPDLIVSDVTMPEMNGTELCKKIKSDKRT
AHLPVILLTAVSNEDQQLLGLETGANDYMTKPFNFEILLSKIRNILKQQALAKKTYQKQV
EFKPAESEVESLDDKFMRQLGLHLEKNLSNSAYSVDQLGSDLNMSRVGLYKKILPLTGKS
PIEYIRSYRLHKSKALLLKSQLSIAEIAYEVGFSNPKHFSRYFKQEFDILPSAYANQKIG
ETSF
NT seq
4155 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttccaggaagaacactcgtttttttactctttttattgatttgttccgaagtttcc
gcacagccaggacagattcagttctctagaatggatttgtcggacggactgtctcacaac
caggtgaatgctgttttaaaagactctaaaggctttatttggtttgcgacactttcaggg
ctcaaccgttacgatggacaggtgatcaaggtttttaaacacaatccacgggataccagc
tctattatagatgattttatcactaatatctatgaacttccagggcataagctctatctg
gaaacacgcagcggtcctaatatttacgatcctgaaacagaaagctttatccgcaatacg
acatcctggtttaaaagcattggcatcgattccaaaggcattagagaagtactgaaagat
aaagccggtgatttttggtttaatgcacaggaacagggcatttataaatacgaagtttcc
agtgcctcaacaaaacatttaaagcttaaaaagaataacgaaaagtctttgtcggatagt
ccggtctctgggattcaaagcgaccctgccggagcaatctggatcattcaccgcgacaag
accatggagcggctggatcggaaaaccgcagaattgaaacaacgcattttgactttcaaa
acttctaatccctcagaaatgcaggattttaagctatttgcggatgaagatggcgacctc
tggatgtataccttgaacaaccagcgggggatcacttattttaatcctaaaactggacag
caccgtcagattgataaggctccaggtgctttaaacagcaatttgattagcggaatgttg
caggatccacatggtcagatttggattggtaccgatcatggcggggtgaatgtgctcaat
aaaaagacctttaaactgagttatctgcttcataaagaggacgatcctaaaagcataggt
caaaatagcattacatgtttatataaagatatctcagggattatatgggtgggtaccttt
aagaaagggctgagtttttaccatgagaagattcttaaatttcccttgttcagacaccag
ggtgcaagtccggatggattggtttatgatgatgtgaaccgctttgcggaggatgatcag
ggaaatctgtggattggcacaaatggcggtggattgttctacttcaaccgaaaaaccaaa
cagtttaagcgataccagcaccagcacaacaacccgaatagtttaagtaacgacatcata
gtgagtttgtttgtagataagggcaagcgcctgtggatcggtacctatttcggcggactg
gattcttttgatgggaaaacctttaagcattatcgacatgaacctggaaatcctaccagc
ttatctgatgatcgggtatgggacattctggaagatcgtagcgggaacttatgggtagcc
actttgagtggtggtctgaacctgctggatcgaagtaccgggaagttcagccattttcgt
gctggggcaaagaatgggattcattctgatttcctttcctgtctgattgaagacaaaaaa
ggcaacctctggatcggaagttccgatgggattgaccagttaaaacctgatggcagcttt
gttcatcataaacatgaagataacaatgtaaatagcttgattaataacattgtatacgac
ctgatggaggacagttatggctttatttgggcggctaccagagacggtttgagcaggttg
gatccagccagaaaagcgttcaggaacttcgataccaaggacggcctcggggaaaaggca
accttgaaaattgtagaagataaccaacggaatctatgggtaagcaccgcaaacgggctg
tttaatgtagtcgtaaaacctcttgccaagcgtgatttctcttatacttttcataaatat
gatgaacacgatggtttacagggaagtgcatttaatgccaatgccggctataaaaccagt
actggcgacctggcttttgggggagcaaatggcttcaatctatttcagcctgaaaggatt
aaaaacgacctttccaagcctgtaattgtctttacagacctgcaggtggaaaacaaaagt
gtaggcatcggagagcctgtaaatggccgtattttattggagaagtcactctcttttaca
gatggtattaccttgaaacacaatcaaaatggatttgcaattgaatttgcagcactgaac
tattttaatccgcataaaatcaggtatcgatacaagctggaaggctttgatgaacattgg
caggagccccagccaaacagccgtcgcgcgacgtatacaaacatagatccgggtgcttat
accttcaaagtgatgtctacggatgcctccggaaattgggtcaataacgaggcggattta
aagatcatcatacagcctccgttctggagcacctggatggcgtacctattatatgcactg
gccattggaggtggattgctatggatcaggcatcgtggaatagcacgtttgaataaagaa
ttcttactgaaacaagagcgtcagcaggccagcaggatgcatgaactggacttaatgaag
attaagtttttgactaatgtaagtcatgagttcaggactccattgtctctgattattacg
cctttagaaaaactgatcggacagaatgtcataccgaaaaagcaagaacttcaactcatg
caccgcaatggaaagcgcttgttgaacctggtgaaccagcttttggatttccgtaaaatg
gaggtgcgggaattgaggttgcaccctaaacctggagaagcgatttcctttatcagggag
ctttgcctttcctttaatgacctggctgaacagcgacgcatcaatttcagttttcatacc
gaagcacagactttaatggtcgcttttgatcatgataaagtggaaaggattgtgtttaac
cttctttcgaacgcatttaagtttacgccggaaggtggaaagatctgggtaacgctggaa
attgtccagcagcaaataagccataccacgcttttattgaaggtttcagatacaggaatc
ggcatggaagccgataaaacagcacgcatatttgagcgtttcttccagaacgacatgccg
gattctattgtcaatcaaggcacaggaattggcctttctattactaaagaatttgtaaaa
ttacatgacggtaagatacatgtaaacagtgttttaaatgaaggatctgagttttgtgtt
tcattggatctagccaatagccattcagcagctgatgctggtaaaacagaggctggagtg
gaaaagcaggaactggttgatgaaggcgctgctctgatgaatacctccgaggatcccaaa
gaaaactttacctggaaaagtaaaaagcaaatcctgatgctggtcgaagacaatgaggat
ttccgcttttacctgaaagacaacctcagcgaattttaccagattgtagaggcttcaaat
ggcaaagaaggctggcaaaagattttgtcctctcacccggacctgattgtaagcgatgtg
accatgccggaaatgaatggtactgagctttgtaagaaaatcaaatctgataaacgaacc
gcgcatctgccagtcattctactcacggctgtcagcaatgaagatcagcagctgctgggc
ttagaaaccggtgccaacgattacatgaccaaaccttttaactttgaaattctcctgtct
aaaatcagaaatatcctgaaacagcaggccttagcgaagaaaacctatcagaagcaggta
gagtttaaacctgcggaatcggaagtggaatccctggatgataagtttatgagacaactg
ggattacatttggaaaagaacttatcaaattctgcctattctgtggatcagctgggttcc
gacctgaacatgagcagggtaggtttgtacaagaaaattctaccgctgaccggaaaatcc
ccgatcgaatatatccgttcgtatcgattgcataaatcaaaagctttattgttaaaatca
cagctcagtattgccgaaatcgcttatgaagtaggtttcagtaaccccaagcattttagc
cgttattttaaacaggaattcgatattcttccatcggcatacgcaaatcaaaaaatcggg
gaaacctctttttaa
DBGET
integrated database retrieval system