Pedobacter gandavensis: QG516_01555
Help
Entry
QG516_01555 CDS
T09013
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
pgj
Pedobacter gandavensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
SNF2_assoc
P-loop_SecA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGQ10338
LinkDB
All DBs
Position
complement(388546..391908)
Genome browser
AA seq
1120 aa
AA seq
DB search
MEVRKEYVLADFDFSELTDLYILKHVNDRVDTGVKGFYDLVPQHIDIDVVFFTDPGSSIP
FPGVGISQRDRKTVITCGCSDANPKLCSHQAQALHNILNRPSLRLFFDYKLRQERMLLQA
KDYGLETEANLTDFFELEYLQGQTQIKAKMRELYPLTGQSRQDLKKKLLPKEGLQLPVSG
GLKSRHKMGLVFGQHRFYSHLTLEIIEAQTTLEGKFKNPIQTISPSDLLWKAEDNAVIKF
FSGVLKFQNNYNAERADSDLDALRAVAKNPLKMEVFLHDTKVSINVTANAIIPIKLNTLN
VDMALHVSQRHEFYEVSGKLTLNGTVFSLDHIQLKYNYFIQIDQCLHLIDNPNYLRVIDF
FKQHHDRILIHHSKFEAFQEEILSKLENKIKVTYDYLKPATKKQIEEKGFDLENEQLIYL
SESEDFVLLTPVMRYGSLEIPVLSRKQIQSRDKNGNLFTLKRDTETELQFISNIMRQHPY
FEDQMESNDCFYLHKTRLLEDQWFLHAFEEWRNKNISILGFNKLKDNNLNPYKANISINV
MSGIDWFKTAVKLKYGNQVVSLRHLHKSIRNKSKFIKLDDGTMGILPDEWIEKFSKYFNA
GEVVEEHIQTPRISFTAIEELYEAQVLDESVKDQLAMYKSQLSGSASMITAIKVPEGLNA
TLRPYQKEGLNWLSFLDEFNFGACLADDMGLGKTIQIIAFILAQREKAHHNTNLIVVPAS
LIFNWQQEIQKFAPSIKVMTIYGADRIKGHKDFDQYEVILTSYGTLLTDIRFLKDYRFNY
VFLDESQTIKNPESQRYKTVRLLQSRNRVVLTGTPIENNTFDLYGQLSFACPGLLGSKQH
FREIYSTPIDQFKDKRAATQLQQRISPFLLRRTKEQVAKELPDKTEMVIYCEMEADQRKV
YDGYEKEIRDYLTNQTDEEVASNTMNVLKGITKLRQICNSPALLSEDEFYGSSSAKMEVL
LEQIENKSSAHKILVFSQFVGMLDLIRKELKDRGISFAYLSGQTKNREAVVDSFQNDPEI
RVFLISLKAGGVGLNLTQADYVYLVDPWWNPAVENQAIDRTYRIGQQKNVIAVRLICPDT
IEEKIMKLQSSKKELVKDLIKTDHSIYKSLSKKDLLGLFS
NT seq
3363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggttagaaaagaatacgtattagcagattttgatttctcagaattaacagactta
tatatactaaaacacgtcaatgatcgggtggatacgggagtaaaggggttttatgaccta
gttccgcagcacatagacattgacgttgttttttttacggatcctggaagcagtattcca
tttccgggtgtgggaatcagccaaagagaccgtaaaacggtcattacctgcggatgttca
gatgcaaaccctaaattatgcagtcaccaggctcaagccttgcacaatattttgaacagg
ccttctttacgtcttttcttcgattataaattgcggcaagagcggatgctgctgcaagcg
aaagattatggattagaaactgaagccaatctgactgattttttcgaactggaatatctg
caagggcagacacaaattaaagctaaaatgagggagttatatcccttgactggtcagagc
agacaagaccttaaaaagaaactgcttccaaaagaaggattgcaattaccggtttctgga
ggcttaaaatccagacataaaatgggtctcgtgttcggtcagcaccgtttctatagtcac
ctaacgttagagattattgaggcgcagaccacgcttgagggcaagtttaagaacccaatt
caaaccatcagtccttctgatttgctttggaaagcagaagacaatgctgtgataaaattc
tttagcggggtattaaaatttcagaacaattacaatgcagagcgtgctgattcagatttg
gatgcacttagggctgtggcaaagaatcccctgaaaatggaggtctttttacatgataca
aaagtatcgattaatgtgactgcaaatgcgatcattccaataaaactaaacacactaaat
gtagatatggcgctccatgtgagtcagaggcatgaattttatgaagtctctgggaaactt
acactcaatggaacggttttttcattggatcatattcagctgaaatacaattattttata
caaatagaccaatgtctgcatttgattgataaccctaactatttaagggtgattgatttc
tttaagcagcaccatgatcggatattgatccaccattccaaattcgaagcttttcaggag
gagattctttctaagttagaaaataaaatcaaggtgacttatgattaccttaaacctgct
acaaaaaaacaaattgaagaaaaaggttttgacctagagaatgagcagcttatctacctt
tccgaatctgaagattttgtactgctgactccggttatgcgttatggaagcctggaaata
ccagtgctatctaggaagcaaatccagtcgagggataaaaatggtaatttatttactttg
aaaagagatacggaaacggagcttcagtttatttctaatatcatgaggcagcatccttat
tttgaggatcagatggagagtaacgattgcttttatctgcataaaaccagactgctggag
gatcaatggtttcttcatgcttttgaagaatggcggaataaaaatatcagtatcctggga
tttaataaactgaaagacaataatctcaatccctataaagctaatatttctatcaatgtg
atgagcggaatagactggtttaaaaccgcggtgaagctgaaatatggcaatcaggtagtt
tctttaagacacttacacaaatctatccgcaataaaagtaagtttataaagctggatgat
gggacgatgggaattcttccggacgaatggattgagaaattcagtaagtattttaatgct
ggtgaagtggtagaggagcacattcaaacgccaagaataagctttacagctatagaagag
ctttatgaagctcaggtactggacgaatcggtgaaagatcagttggccatgtataaaagc
cagctttctggttctgcgagtatgatcaccgctattaaggttccagaaggattaaacgca
acactcagaccataccaaaaagaaggattgaattggctaagtttcctagatgaatttaac
tttggtgcttgtctggcagatgatatgggccttggaaagactattcagatcattgctttt
attctggcacaaagagaaaaggcacatcacaatactaatttgattgtggtaccagcttcc
ttgatcttcaattggcaacaggaaattcaaaaatttgcaccatctatcaaagtaatgaca
atatatggcgcagaccggattaaaggccataaagatttcgatcagtatgaagtgatacta
acttcctatggtactttgcttacggacatccggtttttaaaagactataggtttaattat
gtctttttagatgagtcgcaaactattaagaatccagaatcccagcgatataaaacggtt
cgtttattgcaatccaggaatagggtagtgttgacaggtacgcctattgaaaacaacact
tttgacctttatgggcaattgtcttttgcttgtccaggtttactgggcagtaaacagcat
tttagagagatttattctacgccgatcgatcagtttaaagacaaaagagcggccacacaa
ttgcagcagcgcattagtcctttcttgctgcgaagaaccaaagaacaagtagcaaaagaa
ttaccggataagacagaaatggtgatttattgtgaaatggaggctgatcagcgcaaagta
tacgatggttatgaaaaggaaattcgggattacctgaccaatcaaacagacgaagaagta
gctagtaacacgatgaacgtcttaaaaggcattactaaattaaggcagatttgtaattca
ccagcgctattgagcgaggatgagttttacggcagttcttctgctaaaatggaggtgttg
ctggagcagattgaaaacaaatcttcagcacataagatccttgttttttcccaatttgtg
ggcatgttggacttgattcgaaaagagttgaaagaccgcggtattagttttgcttacttg
agcgggcagacaaaaaaccgggaggcagtggtcgattcttttcagaatgatccggaaata
agggtgtttctaatcagcttaaaagcaggaggagtggggttaaatcttacccaggcagat
tatgtgtatttggtagatccatggtggaaccctgcagttgaaaatcaagccatcgatcgt
acttatcgaatcggtcagcaaaagaatgtaattgctgtacgtttgatttgtcctgatact
attgaagagaaaataatgaaactgcagtcttcgaagaaagaactggtcaaagacctcatc
aaaaccgatcattccatctataaatccttatctaaaaaggacttgttgggactgttcagt
taa
DBGET
integrated database retrieval system