Pedobacter gandavensis: QG516_25885
Help
Entry
QG516_25885 CDS
T09013
Name
(GenBank) caspase family protein
Organism
pgj
Pedobacter gandavensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DUF7379
Pept_C14_Metacaspase
Peptidase_C14
Abhydrolase_1
LCAT
PGAP1
Palm_thioest
DUF676
Abhydrolase_6
Lipase_2
Hydrolase_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGQ09946
LinkDB
All DBs
Position
6086352..6089720
Genome browser
AA seq
1122 aa
AA seq
DB search
MAIYAVLIGINGYPVQPLSGCIQDIIAVEEYLKHFAQQNNQQLFVSKLTDQERTQPTRSN
FLKSFEFFEPAATGDFCLFYYSGHGSFTLAPKEFWTESDGYNESFVCIDSRVGNGRDVTD
KEFSFLAWKTFKNKPEVTFLAFTDCCHSGTIVKAFENNSELKLRMMPPSTAAALIEDYYG
YGELVDAEPGYLISDDQQRITVKQSKNIHFAASRDDQTSKELVIDGLNRGVFTYSLLKTL
YKYDGLISYKNLIDHVSVLVGNIVSNQEPQLSFNGTWPGSEKEHLFLSQTNAAANPLYAV
YYDAELGSWCIKAGRLNDVNPGDIVVVDGLCETAVTGAISADISTIKSKLELGSKDQIHT
AAVKRLRMPAFSLSFAPDLDQALQTLLKTTAGNRDSIYFQLSDQTGQYFIHQSKGEVYLA
LPDSNIPVFKPLQINNEVTANIFFQKVEAVSKWTQLKMLDNPTTSFSSDTYQLTLYRNIL
PFNSELDNFEKIPIKAINDFPYKRKDQDWGEPAFRLSISNNSPGPLWFCCTYLGVDYSVT
QISEAITVGAGRTAWLTFNMGAVPTDVIPLHLQDKFMELGYQQITEYLKVFVSTDKIDLG
IYDVEGIELAQQMQEGQEFEINSRGFGSQILKTLPLNDWKTELIGFCISRPLQEVPLSAD
QITQINGLKIENPAKLEAKVKLSSSSFVFKSAEKGIASDLLRKNSNTAPFDLLFATGTGN
VLDVLELTEVQNPEVVNTENPLIIVPDKTRSMAEERVVPVGFDTESGLYYPVGYTNNQGN
IVVDTLPSQTGADPLVTDKSLFGSIKIYFQKVIGDTLGFGYNYPRLAVAMVSKSGEVTYH
DEEVADQVAAAENILLFIHGIIGDTEGMLKSIHFTRSDGSKLSDAFDLIMAFDYENLNTP
LEDTAALLKSRLNEAGIKPGDHKRLTIVAHSMGGLLSRYFIEKLDGDQVVDHLVMLGTPN
NGTPWADVRDMAEVLLTYAMNGAAFLKPWMFLLSGVGKLLNGVQHTLKQMDAESEFYRHL
NSGASPKIPYTIIAGDTRLIVPDFDKIASGIGKLFARIKTRGVYDSLDVLLFRKPNDIAV
TDESISVLEGAEAWAEHKPTLHTVACDHLNYFLTKEALDIIR
NT seq
3369 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccatttacgcagtattgatcggtattaatgggtatccggtgcaacctttgtcggga
tgtatccaggatatcatcgctgttgaagagtatttaaaacatttcgctcagcagaataat
cagcagttgttcgtcagcaaactaacggatcaggaaagaacgcagccaacacggagtaat
ttcctgaaaagctttgagttttttgaacccgctgccactggagatttctgcctcttttat
tacagtggtcatggttcttttacccttgccccaaaagaattctggacagaatctgatggc
tataatgagtcatttgtttgtatcgatagtcgggtgggcaatgggagggatgtcacggat
aaggaatttagtttccttgcctggaaaacatttaagaacaaaccagaagtgacctttctt
gcttttaccgactgctgccattcaggaacaattgtaaaggcttttgaaaacaattctgaa
ctcaagttgaggatgatgccgccatctactgccgctgccctaatagaagattattatggg
tatggagaactggtggatgctgaacccggctaccttatttctgatgatcagcaacggatt
actgtgaaacaaagtaaaaacatccattttgcagcttccagggatgatcagacttctaaa
gagctggttatagatggtttaaacagaggagtctttacttattctctgttgaaaacattg
tacaaatatgatggactgatcagttataaaaacctaattgaccatgtttctgtcctggtg
ggcaatattgtgagcaatcaggaacctcagctgagttttaacggaacttggccaggctcc
gaaaaagagcatttgtttttatcacaaacaaatgctgccgccaatcccttgtatgcggta
tattatgatgcggagctgggcagctggtgcattaaagcggggcgtctgaatgatgtaaat
ccaggcgatatagtcgttgtggatggactttgcgaaaccgctgtcactggcgcaatttca
gctgatatttccacgattaaaagtaaactggaactggggagtaaagatcagatacatact
gcagctgttaagagactgcgtatgccagccttcagtttgtcatttgccccagatttggat
caggccttgcaaacgctattgaaaactacggccggaaatagagattctatatatttccag
ctgagtgatcagactgggcagtattttattcatcaaagcaaaggagaggtatatctggct
ttgccggattccaatattccggtatttaagccgttgcagattaacaatgaggtaacagca
aatattttctttcagaaagtagaagcggtcagtaaatggacacagctaaaaatgctcgat
aatcctactacctcttttagttccgatacttaccagctaacgctttaccggaatatattg
ccctttaattccgagctggataattttgaaaagataccgattaaagcgatcaatgatttc
ccttacaaaagaaaagatcaggattggggagaaccggcttttcgattaagcatcagcaat
aacagcccggggccgctttggttttgctgtacttaccttggggtagattatagcgtcact
caaatctctgaagccatcacagtaggcgcggggagaaccgcatggctgactttcaatatg
ggtgctgtgccaaccgatgtgattccactgcacctccaggataagttcatggaactaggc
tatcagcagatcacagagtatctaaaagttttcgtttccacagataaaattgacttaggg
atttatgatgtcgaagggattgaattggcacagcaaatgcaagagggacaggagttcgag
atcaactcgaggggctttggcagtcaaatactgaagacattacctctgaacgactggaaa
accgagctcattggtttttgtatttccaggccattacaggaagtccctttgtcggcggat
caaattacccaaatcaatggactcaaaattgaaaacccggctaaactcgaagcaaaagtt
aagctcagcagttcttcttttgttttcaaatctgcagagaaagggatcgcttcagatctg
ctcagaaaaaattcgaatactgcgccttttgatttgctttttgctactggaacgggaaat
gtacttgatgtactggagctaacggaagtccaaaatccagaagtggttaatacagaaaat
cccctgatcattgtaccggataaaaccagatccatggccgaagaacgtgtggttccggta
ggatttgatacggaatctggcttatattatcctgtaggatataccaataatcaggggaat
attgtagtggatactttgccctcacaaacaggtgcagatccgctggttaccgataaaagt
ctgttcggatcgattaagatttattttcaaaaggtaattggagatactttgggattcggt
tataattatccgcgtctggcagtagcaatggtcagcaaatccggggaagtgacctatcat
gatgaagaggtagctgatcaggtcgcggctgctgaaaatatcctgctatttatccatggc
attatcggagatacagaaggcatgctgaaaagtattcattttacaagatcagatggcagt
aaattatcggatgcttttgacttgataatggcctttgattatgaaaatttaaatacaccg
ctcgaagatactgctgctttacttaaaagtaggttaaatgaagctggcattaaaccaggc
gatcataaacggctaacgatagtcgcccattctatgggtggcctgctgagccgttacttt
attgaaaaactggatggcgaccaggtggtagatcatctggtgatgctgggaacgccaaat
aatggcaccccgtgggccgatgtgagggatatggcagaggtgctgcttacttacgccatg
aacggtgccgcatttttgaagccttggatgttcctgctttcaggagtagggaaattgctg
aatggcgttcagcataccctcaaacaaatggatgcggaaagtgaattttaccgacatcta
aacagcggagccagtccaaaaattccctatacgatcattgctggagacacccggttaatt
gttcctgatttcgataaaattgccagcggaatagggaagctgtttgcccggatcaagacc
cgtggggtctatgattctttagacgtattgctgtttagaaagcccaacgatattgcggtt
actgatgaaagtatcagcgtattggaaggagcggaggcttgggcggaacacaaaccgaca
ttacataccgtagcatgtgatcatttgaattactttttaacaaaagaagccctggacatc
atccgttaa
DBGET
integrated database retrieval system