Pedobacter ginsengisoli: CPT03_01475
Help
Entry
CPT03_01475 CDS
T05145
Name
(GenBank) protein translocase subunit SecDF
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
pgs
Pedobacter ginsengisoli
Pathway
pgs02024
Quorum sensing
pgs03060
Protein export
pgs03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgs00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
CPT03_01475
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
CPT03_01475
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CPT03_01475
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
pgs02044
]
CPT03_01475
Secretion system [BR:
pgs02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
CPT03_01475
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
ACR_tran
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATP55224
UniProt:
A0A2D1U148
LinkDB
All DBs
Position
complement(382633..385599)
Genome browser
AA seq
988 aa
AA seq
DB search
MQGKGFIKFMAILLGIVCVYSLSFNFVTSKVEKDAKAYAKGDLDKEKAYLDSMATVPVYP
LFGFNYQFCKEKEINLGLDLKGGMNVTMEISLSELVKSLAGNPDDANFNKALVTAQTQLN
AGGKDFINLFVNEFEKLSPNTKLADFFSNQDNSKLLKPDASNSEVKSFLSKEATSAIDRS
FVIIRSRIDGFGVVSPNMQKQEGTNRILIEMPGVQDKERVHKLLQGSAELQFWQVYNNEE
VYPVMENINKTLASSLKVVDTTATAKTSTDTTAAKSESKLAGLAKNKDTKDSAGVKNAEL
AKSNPLFSVLNIPTYQGQNGQPSLRPGPVIGWVAQKDTAKVNAFFKRPEIASIIPQSYKF
MWSVKPMDIAQSGGAKIFELYAIKSLSADGKPDLGGEAISDARHDYDQKGRPEVTMYMTG
EGAAKWKKITAEASADPNNKKSIAIVLDNTVYSAPTVQNEIPNGISSITGSFTVNDTQDL
ANILKAGKLPAPARIVGEFVVGPSLGEVAIHNGLLSFVLAFVVILVFMALYYNKAGWVAN
LALVINLFFIMGILVSLGAVLTLPGIAGIVLVIGLSVDANILIFERVREELTLGKPTPVA
IKEGFKHAMSSIIDSNVTVFVLGAILYIFGSGPVQGFATTLCIGILSSLFCAVLISRLVF
EYLLDKKSNITFGNKYTIHAFKNIAFNFVGHRKLYYSISSAIIILGFIFYFKNGGLNLGI
DFKGGRTYIVHFDKGMHTEEVKATLNSSFPESETIVKTAGADNELKITTTYHITDQDQGA
DKLVEKALHEGLAKTGVKYTIESNEKVGPIIASDIVYGAYGAILFSCLVMFFYIVVRFKK
LNYGLGAVIALFHDVLLVLSFYTILDGVLPFSLEIGQDFIAAILTVMGYTMTETVVVFDR
IREKLAESGKEDLHGEERNKLINFALNSTLSRTILTSLTVFFVLLVIFIFGGASIRGFIF
ALLIGRIIGTYSSLCISTPIVIDLGKNK
NT seq
2967 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagggtaaaggttttataaaatttatggcgatccttctgggtatcgtctgtgtgtat
tctctctcattcaactttgttacttctaaagttgaaaaagacgcaaaagcttatgctaaa
ggagacctggataaggaaaaagcttatttagactcgatggcaacagtaccggtatatcct
ctttttggatttaattaccagttctgtaaagaaaaagaaataaaccttggtttagactta
aaaggtggtatgaacgtaacgatggaaatttcgttatcagaactggttaaatctttagcc
ggaaatcctgatgatgctaatttcaacaaagcgttggttactgctcaaactcaattgaac
gctggtggtaaagatttcattaacttgtttgttaacgaatttgaaaaactttctcctaac
acaaaattagctgacttcttttctaaccaggacaactctaaacttcttaaacctgatgcc
agcaattcagaagtaaaaagctttttatcaaaagaagctactagtgctattgaccgttca
ttcgtgatcatcagaagtcgtattgatggtttcggagttgtaagtccgaacatgcagaaa
caagaaggtactaaccgtatccttattgagatgccaggtgttcaggacaaagaaagggtt
cacaaattattacaaggttctgccgaattacaattctggcaagtatacaacaacgaagag
gtgtatccggttatggagaacatcaacaaaacacttgcatcttctttaaaagttgttgat
acaactgcaaccgcaaaaacttctactgatactactgctgctaaatcagaaagtaaatta
gcaggtttagctaaaaataaagacactaaagattcggccggagttaaaaacgctgagctt
gcaaaatctaatcctttattctcggtattaaacatccctacttaccaaggtcagaacgga
cagccttcattacgtccgggaccagttattggttgggttgctcaaaaagatactgctaaa
gtaaacgctttctttaaaagacctgaaattgcttctatcattcctcagagctacaaattc
atgtggagtgttaagccgatggacattgctcaatcaggtggcgcaaagatttttgaattg
tatgcaatcaaatctctatctgctgatggtaaacctgatttaggtggtgaggcaattagt
gatgcccgtcatgattacgatcaaaaaggtcgcccagaggtaaccatgtacatgactggt
gagggtgctgcaaaatggaaaaaaattactgctgaagcttctgctgatccaaacaataaa
aaatctattgctattgtattagataatacagtttactctgcacctactgtacaaaatgaa
atccctaacggtatttcttctattacaggaagtttcactgttaacgatactcaggattta
gcaaacatcttaaaagcaggtaaacttcctgctcctgccagaattgttggtgaattcgtt
gttggtccatcacttggtgaggttgctattcacaacggtttattatcattcgtactagcg
tttgttgttatccttgtatttatggctttatattataataaagcaggatgggttgctaac
cttgcattggtaatcaacttattctttatcatgggtatcttggtatcactgggtgctgtg
ttaacattgcctggtattgctggtatcgtattggtaattggtttatcggtagatgcgaac
attcttatatttgaacgtgttagggaagaacttactttaggcaaacctactccggtagct
attaaagaaggcttcaaacatgcaatgtcatctatcattgactcaaacgttacagtattt
gtattaggtgctatcctttacatctttggtagtggcccggttcaaggttttgctactaca
ttatgtattggtattttatcatctctattctgtgcggtattaatctcacgcttagttttt
gaatatcttttagataaaaaatctaacatcacttttggtaacaaatacactattcacgcg
tttaaaaatattgccttcaactttgttggtcatagaaagctttactattctatttcatca
gcaatcattattttaggttttattttctacttcaaaaatggtggtttaaaccttggtatc
gactttaaaggtggtagaacttatatcgttcacttcgataaaggaatgcacactgaagaa
gttaaagctactttaaattcgtctttccctgagtcagaaactattgttaaaactgcaggt
gctgataatgaactaaaaattacaactacttaccacattactgatcaggatcagggtgct
gataaattagttgagaaagctttacatgaaggtttagcaaaaaccggtgttaaatacact
attgaaagtaatgagaaggtaggtcctattattgcgagtgatattgtttacggagcttac
ggagcaattctattctcttgtttagtgatgttcttctacatagtagtaaggtttaagaaa
ctaaactatggtttaggtgcggttatcgcattgttccatgatgtgcttctggtactttca
ttctacacaatattagatggcgtattaccattctcattagaaattggacaggactttatt
gcagcgatcttaacggtaatgggttataccatgactgaaacagtagttgtgtttgaccgt
atccgtgagaaacttgctgaaagcggtaaagaagatcttcatggcgaggaacgtaataaa
ttaatcaactttgcattgaacagtactttaagtcgtactattttgacttcattaactgta
ttcttcgtattattggtaatcttcatcttcggtggagctagtatccgtggatttatcttt
gctttattgattggtcgtattatcggtacatactcatcattatgtatctctacccctatc
gttattgaccttggtaagaacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system