Pedobacter ginsengisoli: CPT03_02340
Help
Entry
CPT03_02340 CDS
T05145
Name
(GenBank) transketolase
Organism
pgs
Pedobacter ginsengisoli
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
E1_dh
Transketolase_C
Transket_pyr
PFOR_II
Transketolase_N
RsaA_NTD
FMN_red
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATP55384
UniProt:
A0A2D1U1K0
LinkDB
All DBs
Position
574237..576660
Genome browser
AA seq
807 aa
AA seq
DB search
MTPNSKLTTNPIDASELSFDDFKTIVINDYKIAYESRQASLLGRKEVLTGKAKFGIFGDG
KEIPQIAMAKAFKNGDWRSGYYRDQTFAFATGICTLKEFFAQLYANPSVEADPASAGRQM
NCHFATRSLNDDGSWKDLTEIKNSSSDIAPTGGQMARLVGLAYASKLYRQNPELSYLKNF
SVNGNEVAFGTIGNASTSEGVFFEAINAAGVLQIPMAISIWDDAYGISVPAEFQTTKEDI
SEVLKGFQRDEDTNGYEIFKVRGWDYPALCETYQRAIDVCRTEHVPVLIHVTEVTQPQGH
STSGSHERYKGKDRLEWEREYDCIPQMRKWMLESAIISEEEISELEATAKKLVRETQREA
WNEFLATIKVEKEQVIDMINRIANGNPIITKIAALLAGTPDALRKEVVSSARKALRFSIN
NPSPERDELINWYNSQASLNEDRYNSKLFTDGIESPLLVNKVRAKYTEESKMVDGRELLN
ACFDANFARDERLVAFGEDLGAIGDVNQGFAGLQAKYGNLRITDTGIREMTIIGQGIGLA
LRGLKPIAEIQYLDYLLYALNILSDDLASLSYRTKAGQKAPVIIRTRGHRLEGVWHSGSP
MAMILGSLRGLHICVPRNMTQAAGIYNTLFRSDEPALVIECLNGYRLKEKLPENVGEYTV
PLGEAEIVRTGNDVTIVSYGATLRVVEEAAEELAQLGISVEIIDPQTLLPFDTKQICAES
LKKTNKLLVVDEDVPGGGAAFILQQVLEEQNGYYHLDGQPRTLTAKAHRPPYGSDGDYFS
KPSVDDIIETVYQIMHDNNASKYPSIF
NT seq
2424 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgccaaatagtaaacttacaacgaacccaattgatgcttcagagttaagttttgat
gatttcaaaacgattgttattaacgactataaaatagcctacgaaagcagacaggctagt
ttattaggacgtaaagaagtattaacgggcaaggcgaagtttggtatttttggtgatggt
aaagagattcctcagatagctatggccaaagcgtttaaaaatggcgattggcgttctggc
tactatagagatcagacttttgcctttgcaaccggaatttgtacgctaaaggagtttttt
gcacaattatacgcaaatccaagtgttgaggctgatccggcatctgcaggccgacaaatg
aattgtcactttgctacacgttcacttaatgatgatggtagctggaaagacctgacagag
ataaaaaactcttcatctgatattgctcctactggcggacaaatggctcgtttagtaggc
ttggcttatgcttctaaattatacagacaaaatccagagttaagctaccttaaaaacttt
tctgtgaatggaaatgaagttgcttttggtactataggcaacgcatctacttctgaaggg
gtgttttttgaagcaattaatgctgccggggtattgcaaattccaatggcgatttctatc
tgggatgatgcctacgggatttcagttcctgctgagtttcaaactactaaagaagatata
tcagaagttctgaaaggatttcaacgtgatgaagatactaatggttacgaaatatttaag
gtaaggggatgggattatcctgcgttgtgcgaaacttatcagcgtgccatagatgtatgc
agaactgaacatgttcctgttttgatacacgttacagaggttacccagccacaagggcac
tctacttcaggttctcatgaacgttataaaggtaaagaccgtttagagtgggagcgagaa
tatgattgtattccgcagatgcgtaaatggatgcttgaatcggctattatttcagaggaa
gaaatatcggaactggaagcaactgcaaaaaagctggtgcgcgaaacgcagagggaagcc
tggaatgaattccttgccactattaaagttgagaaggaacaggtaattgatatgatcaat
agaattgcaaatggcaatcctataatcacaaaaattgcagcattgttagctggtacacct
gatgcattacgtaaagaagttgtgtcttctgccagaaaagcgttgcgctttagtataaat
aatccttctccagaaagagatgagctgataaattggtacaatagccaggcctcgttaaat
gaagacaggtacaattccaaactatttactgatggaatagaaagcccattattggttaac
aaggtaagggcaaagtatactgaggaaagtaaaatggttgacggccgtgagctattgaat
gcttgctttgatgctaattttgcacgtgatgagcgtttagttgcctttggcgaagatttg
ggcgcaattggcgacgtaaatcaaggttttgcaggcttacaggctaagtatggcaattta
agaattaccgatacaggcattagagagatgacaattattggtcagggtattggcttggct
ttgcgtgggttaaagcccattgcagaaattcagtatcttgattatttattatatgcactt
aatattttaagtgatgatctggccagtttatcatatagaactaaagccggtcagaaagca
ccggttattatcagaacccgtggacacagattagaaggtgtatggcattccggctctcca
atggcaatgattttgggttcattaagaggcttacatatttgtgtgccacgtaatatgaca
caagcagcaggcatttacaataccttattcagatctgatgaacctgctctggttattgaa
tgccttaatggttacagattaaaagaaaaactacccgaaaatgttggcgaatacactgtt
cctttgggagaggcagagatcgtaagaactggaaatgatgttacaattgtatcttacgga
gctactttaagggttgttgaagaagcagcagaagaattagcccaattagggatttcagtt
gaaataatagatcctcaaacattactgccttttgatactaaacagatttgtgcagaatct
ttaaagaaaacaaataaactattggtggttgatgaagacgttccgggtggaggcgctgcg
tttattttgcagcaagtactggaagaacaaaatggttattaccacttagatggtcaacca
agaacacttacagctaaagctcaccgtccgccttacggatcagatggagattattttagt
aagccatctgttgatgatattattgaaaccgtgtatcaaattatgcacgacaataacgca
tcaaaatacccttctatattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
