Pedobacter ginsengisoli: CPT03_04245
Help
Entry
CPT03_04245 CDS
T05145
Name
(GenBank) CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
pgs
Pedobacter ginsengisoli
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pgs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pgs02000
]
CPT03_04245
Transporters [BR:
pgs02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
CPT03_04245
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
OEP
Sensor_TM1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATP55731
UniProt:
A0A2D1U2A6
LinkDB
All DBs
Position
1029391..1033767
Genome browser
AA seq
1458 aa
AA seq
DB search
MLKKIIQFSINNKLVVGLFTLALIAWGVYSLRQLPIDAVPDITNNQVQVITLSPSLATQE
VERLISYPVEQTMSTIPEIEQVRSISRFGLSVVTIVFHDKVDIYWARQQVNEKLAEARNN
IPGNLGNSEISPISTGLGEIYQYVIHAKPGFEKKYNARELRTIQDWIVRKQLLGTPGIAE
VNSFGGLLKQYEIALDPDKLRSFNLSISDVFEALEQNNQNTGGAYIDKKPNAYFIRSEGL
VGNLDDINKIVVKNNDNGIPVSIRDIATVQIGSSIRYGALTRATSTAQGEAVGGIVMMLK
GANAKNVVQQVKSKIERISKTLPEGVTIEPFLDRSGLVDRAMGTVAKNLIEGALIVIFVL
VLFLGNFRAGLVVASVIPLAMLFAISLMNLFGVSGNLMSLGAIDFGLIVDGAVIIVEATM
HILAGNKLGRAYTQVEMDEQVEKSAVRMMSAAAFGQIIILIVYLPILALVGVEGKMFVPM
AQTVSFAILGAFILSLTYVPMVSSLLLSKKVVHKKNFSDRMMDFFQRKYYPMIKAALNRR
IIVVASAIVLLVISVFVFTRMGGEFIPNLEEGDFAVETRLLTGSSLSQTIDKVNQASSIL
VKKFPEVKEVIGKIGAAEIPTDPMPMEACDLTIILKDKKEWTSANTREELTELMSNALKE
VPGVSFGFSQPIQLRSNELISGVRQDIGIKIFGDDLETLTSISQQIGKIVSGVEGAKDLY
LEQAEGLPQIVVKINRDRIAQYGLSVGTVNQALNTAFAGQSAGMVYEGEQRYDMVVRLSQ
QNRQGIDDVKNVYVTAPNGIQVPLDQLADVEFKIGPNQIQREDTKRRIIVGLNVRGRDIQ
SVVTEIEQKINQKIKLPAGYFITYGGQFENLKEATKRLSVAVPVALLLILLLLYFSFGSV
KQSLLIFSAIPMAAIGGIFALLLRGMPFSISAGVGFIALFGVAVLNGIVLITEFNRLKKL
GKYTLNEIVLKGTEIRLRPVLMTATVASLGFLPMAISTAAGAEVQKPLATVVIGGLLTST
ILTLIVLPVLYTYFESWKGKTKPVPATAATIIIASMIFFSPVAKAQTPGEPLTMNQAIDL
AIKNNQAIKSSELQISQQQALKGSSTDLGKTNFDVQYGQFNSIRKDNNFSVSQSIPNPGV
FKNQRGLYDAKIKSAEINLAITEKELTYQVKSAYTQLAYYVALEDLYKSQDSVYSNFVKA
ASLRYKAGETNLLESTTAETQYNEVLNQMSKNRSDILAYTAELQRLLNSQQTIEIAKDQF
KQEEYKNLVTDSAISANPLLALQRQQIVIADKALGLEKARSGPDFTVGYFNQSIIGTQSV
NGTDQYFSGSKRFQGVQAGISLPIFFKAFSSRIKAAKIEKQVAKSQFSLFETNLEGQYKQ
AYQDLQKNARSIEYYKKSALPNVNLILKQSQIAFKNGEIGYVEYLQGLRTYSEIRFNYLQ
AINQYNQSVYTLQYLMGL
NT seq
4377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgaagaaaattattcagttttccatcaataataagctggttgttggcttgtttacg
ttggcactgatagcctggggagtttattccctcagacaattaccaatagatgccgttcca
gatatcactaataatcaggttcaggttatcacgctaagtccttctcttgccacccaggag
gtagaacgtttaatatcctatccggttgaacagaccatgtctacaatacccgaaattgaa
caggttaggtccatttcaagattcggtttatcagtagttaccattgtttttcacgataaa
gtggatatttactgggcccgtcaacaggtaaatgagaaacttgcagaggcccggaataat
atcccaggtaacctgggaaattccgaaatatcgccgatatcgacgggtttgggagagatt
taccagtatgtgatacatgccaagccgggttttgagaaaaaatataatgctcgtgaactg
aggactattcaagactggattgttcgtaagcaattgttgggtactcctggcattgccgag
gttaacagttttggaggattgttaaagcaatatgagattgccttagatccagataaatta
agaagctttaacttaagcatcagtgatgtttttgaggctctggaacagaataaccagaat
acaggtggtgcctatattgataaaaagccaaatgcctattttatcagaagtgaaggcttg
gttgggaatttggatgacatcaacaagattgttgttaaaaataatgataatgggatccct
gtatccataagagacattgcaactgtgcagattggcagctctatccgttatggcgcatta
acacgagcaacatctacggcacaaggagaggctgttggtggaattgtaatgatgcttaaa
ggagctaatgcgaagaatgttgttcaacaagttaaatcaaaaattgagcgtataagcaag
acactgcctgagggtgtcacaatagaacccttcctggaccgaagtggattggttgaccgg
gcaatgggaactgttgctaaaaacctgattgagggggcgctgattgttattttcgtgtta
gtgcttttcttgggtaatttccgtgccgggctagtcgttgcatcagtgattccactggca
atgctttttgcaatttcgctaatgaacctttttggggtatcgggaaacctgatgagtctg
ggtgcaattgactttggtttgattgtggatggagccgtaatcattgtggaagccactatg
catattttggcgggcaacaaacttgggagggcttatacccaggtagaaatggatgagcag
gttgagaaatctgcggtaagaatgatgagtgctgctgcctttggacaaattattattctg
atagtttatctcccaattcttgcgctggtaggtgttgaaggtaaaatgttcgtgccaatg
gcgcagacagtttctttcgctattcttggtgcatttattctgtcgctaacctacgtaccg
atggtatcctccctgttgttgagtaaaaaagtggtccacaaaaagaatttttctgatcgt
atgatggattttttccaacgaaaatattatccaatgatcaaagcagcacttaacagaaga
attattgttgttgcctctgcaatagtattattggtgatcagtgtatttgtatttacacgt
atgggtggagaatttattccaaacttagaggaaggcgattttgcagtagaaaccaggttg
ctgacaggaagttccttgtctcaaactattgataaagtaaaccaggcatcttctattctg
gtaaagaagtttcctgaagtaaaagaggtaatcggaaagataggcgctgctgaaattcca
acagacccaatgccgatggaggcatgtgaccttaccatcatattaaaggacaagaaagaa
tggaccagtgctaatacccgggaagaattaacagagctaatgagtaatgcattgaaagaa
gtgccaggagtaagctttggtttctctcagcctatccaattgcgctctaacgagctgata
tctggcgtaaggcaggatatcgggattaagatttttggcgatgatctggaaacacttact
tctatctctcagcaaatagggaaaatagtttctggggttgaaggtgcgaaagatttatac
ttagagcaggccgaaggactgcctcagattgtagttaagatcaatcgagatcgaattgcc
caatatggtttaagtgtaggaactgttaaccaggctttaaatacagcttttgcaggtcaa
tcggccggaatggtttatgaaggggagcagagatatgatatggtggtgcgtttgtcgcag
caaaaccgtcagggtatcgatgatgtgaaaaatgtatatgtgacagctcctaacggaatt
caggttcccttagatcaactagccgacgtggaatttaagatcggacccaaccagatccag
cgtgaggataccaaacgaaggattatagttgggttaaacgtacgcggaagggatatccag
agtgtggttacggagatcgagcaaaaaatcaatcaaaagatcaaattgcctgccgggtat
tttattacctatggcgggcagtttgaaaacctgaaagaggcaacaaaaagactatctgtt
gcagttccggtggcattgctgctgattttgttattactgtatttttcttttggatcagtt
aaacaatcgttacttattttttcggctattcctatggctgccatcggtggtatttttgca
ttgctgcttaggggtatgccttttagtatctctgccggggtcggatttatagccctattt
ggggtagcagtattgaatgggattgtgttgattactgaatttaacaggcttaaaaagctg
gggaagtacaccctgaatgagattgtgcttaaaggtactgaaattagattgagaccagta
ctaatgacggcaaccgtagcatctcttggctttttgccaatggctatatcaacagcagca
ggggcagaggtacaaaaaccacttgccacagtagtaattggtggactacttacttcaacc
attcttacactaattgtgttgcccgtgttatatacttattttgaaagctggaaaggcaaa
acaaagccggttcctgcaactgccgcaacgattatcatcgccagtatgatattttttagc
cctgttgctaaagcacaaacaccaggcgaacctttaacaatgaatcaggctattgatctg
gcaataaagaataatcaggctataaaatcgtcggaattacaaattagccagcaacaggcc
ttaaaagggagttcaaccgatttggggaaaactaattttgatgtccagtatggccagttt
aacagtatacgaaaggataataattttagtgtttctcagagtattcccaatcctggtgta
tttaaaaatcagcgagggctttacgatgcaaagattaaaagtgctgaaataaatttagct
ataaccgaaaaggaattgacttatcaggtgaaaagtgcgtatactcaattggcttattat
gtggccttagaggatctgtataaaagccaggattcggtatacagtaatttcgtaaaggcc
gcatcattacgctacaaagcaggtgagactaacctgctggaaagtaccaccgctgaaaca
caatacaatgaggtgttgaaccagatgagcaagaaccgctcagacattttggcctatacc
gcggagttgcaaagactactcaactctcagcagactattgagatagcgaaagatcaattc
aaacaggaggaatataaaaacctcgttacggacagcgcaatttcagcaaatccattgctg
gctttgcaaagacagcaaattgttatagcggataaagcactgggattagaaaaggcccgt
tcaggacctgattttacggttggctattttaaccagtcgattattgggacacaaagtgtg
aatggcactgatcagtattttagcggaagtaaaagatttcaaggcgttcaggccgggatc
tctttgccaattttctttaaagctttttcatcacgcataaaagctgcaaaaatagagaag
caagtggctaaaagccaatttagcttgtttgaaaccaatcttgagggacagtataaacag
gcatatcaggatttgcaaaaaaatgcaagaagtatagaatactataaaaagagtgcttta
cccaatgtaaacctgattttgaagcagtcgcagatcgcttttaaaaacggtgaaattggt
tatgtagaatacttgcaaggtttacgtacttattcggagatccgctttaactacttacag
gcgataaaccaatataatcaatcagtttacactcttcaatacctaatgggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
