Pedobacter ginsengisoli: CPT03_21130
Help
Entry
CPT03_21130 CDS
T05145
Name
(GenBank) multidrug transporter
Organism
pgs
Pedobacter ginsengisoli
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF2723
DUF3725
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATP58789
UniProt:
A0A2D1UB29
LinkDB
All DBs
Position
complement(5019773..5022799)
Genome browser
AA seq
1008 aa
AA seq
DB search
MNYSKINNITGWFCFAIATLTYILTLEPSVSFWDCGEFIASALKMQVVHQPGAPLFLMIQ
RFFSLLALGDATKVAYFMNVGSAVASGATILFLFWTITALAKKILVKDKEEISKANLISI
MGAGIVGALAYTFSDSFWFSAVESEVYALSSLFTAIVFWAILKWEAHADEPRADRWLLFI
AYIMGLSIGIHLLNLLTIPAIAFVYYFKKTKKATTAGIVKTGLVGILILAFIQYGIIQYL
VSFGAYFDLFFVNTLGLGFGSGVIFFAILLIGGLVWGIRYSIKHQKKILNLALLSTVLII
FGYGSFAMIIIRAKADPNLNNSDPDNAFSFLGYLNREQYGDRPLLFGPNYNSQKVDIKQG
KTLYRKGADKYEVAGRKTDYEYDKTTLFPRMYSDDPRHVGYYKDMMGFDDSHFPNLIDNI
GFFFGYQTGQMYMRYFMWNFVGRQNDDQGQGSLYEGQWLSGIKPIDAARLGDQSHLPPTI
VDNSAYNRFFFLPLILGLLGAIWHFQRNQKDAGIVALLFFFTGIAIVLYLNQKPMEPRER
DYAYAGSFYAFAIWIGLGALALKEWLFKKVSPATGAVLATVAGLFAAPVIMAAQGWDDHD
RSSKLVAHDIAVDYLESCAPNAILFTYGDNDTYPLWYIQEVENVRPDIRLVNLSLFDTDW
YINGMKRKQNESEPLPISMKESQYVQGNRDVMYYQDYKIAGSIELSKIFEVLTSDNDEDK
LALNDGSKENFIPTKNFKLTVNRADVIKNGVVSAADSAKIVPAIEWKFNKNYVTKGTLAM
FDILVHNNWKRPIYFASTVPSEQYNGLDNYLYNEGLAIRLMPLKLDSAAGKSDLVNTPVL
YNNLMNKFKWGNVKNASYLDTQSADDISIFTSMFNNAITGLVKEGKIEDAKKVANRYFEV
MPDKFYGMRSMMGAYFMAENLYTLNDNKRANTLIEKSADYIQKELTYLADVSKSKNKFIG
GQNVQLGMSFLNQMAKITESHKETKLSQSLTKQFNELEGRFSQYFAQQ
NT seq
3027 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattattcaaaaatcaataacattaccggttggttttgttttgccattgctacctta
acctacattttaacgctagagccctcagttagcttttgggattgcggtgaattcatagcc
tcagctctaaaaatgcaggtggtacatcaacctggagcgcctttatttttaatgatccaa
cgctttttctctttattagctttgggtgatgctactaaagtagcatatttcatgaatgtt
ggatcagcagttgcaagtggtgctactattttatttttgttctggacaattactgctctt
gcaaaaaagattctagtaaaagataaagaagaaatatctaaagctaacctaatctctatc
atgggagctggtattgtaggggctcttgcttatactttctctgatagcttctggttttcg
gcagttgaatctgaggtatatgctttatcttcgttatttactgctatagttttttgggcc
atattaaaatgggaagctcatgctgatgagcctcgtgctgatagatggttattatttata
gcttacattatggggctttcaataggtatacacttattaaacttattaaccatacctgct
attgctttcgtttactattttaagaaaactaaaaaggcaacaaccgcaggcattgtaaag
accggactagttggtattctaattttagcctttatccagtacggaattatccaatatctg
gtttcatttggggcttattttgatttgttcttcgtgaacacactaggtcttggatttgga
tctggggttattttctttgcaatactattaataggaggccttgtgtggggcataagatat
tctataaagcatcaaaagaaaattctaaacctggcactattatctacggtattaataata
tttggatacggatcattcgcgatgatcattattcgtgcaaaagctgaccctaaccttaac
aatagtgaccctgataatgccttctcgtttttagggtaccttaacagggagcaatacggt
gataggccattgctttttggacctaactacaactcacaaaaggttgatattaaacaaggc
aagaccctttacaggaaaggtgcggacaagtacgaagtagcaggaagaaaaactgattat
gaatacgataaaactactcttttcccaagaatgtatagtgatgatccacgacatgtaggt
tattataaagatatgatgggctttgatgattcccattttcctaaccttattgataatatt
ggattcttttttggctatcagacaggccagatgtacatgagatactttatgtggaacttt
gtggggcgtcaaaatgacgatcagggacagggaagtttatacgaaggtcaatggctaagc
ggaattaaacctattgacgccgctcgcttaggcgatcaaagtcatttacctccaactatt
gttgataatagtgcatacaatagattcttctttttaccactcatactaggtttattaggt
gctatatggcatttccaacgtaatcaaaaagatgcaggtatagtagcgttactttttttc
tttactggtatcgcaattgtattatatcttaatcaaaaacctatggagccaagagagcgg
gactatgcctatgccgggtctttttatgcttttgcaatatggattggactgggggcattg
gctttaaaggaatggctattcaagaaggtttccccagctaccggagcagttctggcaacg
gttgccggattatttgcggctcccgtaatcatggctgcacaaggctgggatgatcatgat
cgttcttcaaagcttgtagctcacgatatagcagttgattatttagaatcttgcgcacca
aatgcaattctatttacctatggagataatgacacctatccgctttggtatatacaagaa
gttgaaaacgtaagaccagatattcgtttggttaaccttagtttatttgataccgattgg
tatataaatggcatgaagcgtaagcaaaatgaatctgagccattgccgataagcatgaaa
gaatctcaatacgttcaaggcaatagagatgtaatgtactatcaggattataaaattgcg
ggttcaattgaactaagtaagatttttgaggtattaacttcggataatgatgaagataaa
cttgctttaaatgatggttcaaaagagaattttattccaactaaaaacttcaaacttaca
gttaaccgcgctgatgttatcaaaaacggagtagttagtgctgcagattctgccaaaatt
gttcctgctattgagtggaaatttaataagaattatgttactaaaggtactttagcaatg
tttgacatccttgtgcacaacaactggaaaagaccaatttattttgcaagcacggttcct
tctgagcaatacaatggcttagacaattatttatataatgaaggactggcaatacgttta
atgcctttaaaattagatagtgctgccggaaaaagtgacctggtaaacactcctgttcta
tacaataacctgatgaataaattcaaatggggtaatgtaaagaatgccagctaccttgac
acacaatctgcggatgacatctctatttttacaagcatgtttaacaatgcaattacaggc
cttgttaaagaaggaaaaattgaagatgctaaaaaagttgcaaaccgttattttgaggta
atgcctgataagttctatggcatgcgttctatgatgggagcctattttatggctgaaaac
ctgtacacattaaatgacaacaaaagagctaatactctaattgaaaaatctgcagattac
atacaaaaagaactcacttatcttgctgatgtatctaagagtaaaaacaaatttattggt
gggcagaatgtacaactaggcatgtcgttcttaaatcaaatggctaaaataactgagtct
cataaggaaacgaaattaagtcagagtttgaccaaacagttcaatgagttagaaggacgg
ttttcgcagtattttgcacagcaataa
DBGET
integrated database retrieval system