Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAa0052
Help
Entry
PSHAa0052 CDS
T00282
Name
(GenBank) hypothetical tryptophan-rich sensor protein
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
CHASE
Response_reg
MASE1
HisKA
HATPase_c_3
PDE8A_N
SoxE_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI85162
UniProt:
Q3IF06
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(52869..55586)
Genome browser
AA seq
905 aa
AA seq
DB search
MKNFNSKYYSSVFYIIFSLAYFFVGVILTKLTFDSQIIPVWLPAGIALVGCFVWWWRFIP
ALFLAALAFNLNFFANTTHEMVLVGNSLNEAMYIAFGVVLQAMVGAAILKFWLGHPLRLK
KRQNIIYFIVVVGVLVSLISANFGVFALSQFNAMYSADNHWKNTTYWWLGDILGVLIATP
FLLSLLPEKSDNYNISVLPTLSVCCILFVSVAATTQLYDSESRINAIKIAEREVQVIENS
LYRYTNRSIIAVQSLASQVQSSPTLSQQDFNQYANTLLAKHSFIKALSWNVKIPSHQRQA
FSKEISSIYNLNYDVIGEPLEPNDPLVIVKYIAPFNSNQKAIGFNVYSNPDRKASLLNPA
IKYQPVGTKIIQLVQTEHSDAAYLLFAPVYSQSNEKETIKGYATGVFLVPQIIKQAITEQ
QSKMFSIAIYEDINKPAFYSNSNNLNVAQGSKLISFNVDFGGQQWIVKLALKDAFLAQHN
NQLTLLLLILQVVVCSLILLILLLFNQQQIALTRQVAERTYSLAQAKKQSDLANRAKSQF
LANMSHEIRTPLNAVIGFSSLARKEDDANTLIDYLDKINSSSKSLLNLINDILDISKIES
KRLVLERIPFDLTALIQRINTMFEQSAASKAIVWKINSNIPKDTWFVGDPMRLEQIMLNL
CSNAIKFTNAGSVTLNVDTQLIAPNKAQLTIAVIDTGIGIKATQHEKLFSAFTQADNSTS
RQFGGTGLGLAIAKELSVLMNANIALHSELDKGSTFTFTLEIETVKAQDPLIKPTDNTNI
AALKILVAEDNPVNQMVIKAMLGSLKIVPQVVENGELAVNIIKKQHFDLVFMDCQMPVMD
GYRATALIRQFKTAEELPIVALTADVMPEDKAHAQAVGFNQHLAKPLELIKLTECLAQYA
VVYEQ
NT seq
2718 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaattttaactccaagtattactctagtgttttttacattattttttctttagcc
tatttttttgtaggagtaatacttaccaagctaacctttgactcgcaaattattccggtt
tggttacctgctggtatagccttagttggctgctttgtgtggtggtggcgatttattcct
gcgctatttttagcggctctcgcatttaatttaaatttttttgctaatacaactcatgaa
atggtattggtaggaaattcattaaacgaggctatgtatattgcctttggggtggtattg
caggccatggttggggccgcaatattaaagttttggttaggccaccctctgcgccttaaa
aagcgccaaaacattatttattttattgtagttgtaggtgttttagtcagtttaatttcg
gctaattttggcgtgtttgcactaagccaatttaatgcaatgtacagtgcagataatcac
tggaaaaacacaacttactggtggttaggtgatattttaggggtgttaattgccactcca
tttttactttcgttattaccagagaagtctgataactataatatttcggtgctaccgaca
ctttcggtatgttgcattttatttgtatcagtagcggccaccacacaattatacgatagt
gaaagccgtattaatgcgataaaaattgctgagcgcgaagtgcaagtgatagaaaacagc
ctgtaccgctatactaatcgcagcattattgcagtgcaaagtttagctagccaagttcag
tcatcgccaacattaagccagcaagactttaatcaatatgccaacaccctacttgctaag
cactcatttataaaagctttatcatggaatgtaaaaatcccatctcatcaacgccaagca
ttctctaaagaaatttcaagcatttataacttaaattatgatgttattggtgaaccttta
gagccaaacgatccactcgttattgtaaaatatatagcaccgtttaatagcaaccaaaaa
gcaattgggtttaatgtatattcaaacccagatcgcaaagcatccttactcaaccccgca
ataaagtatcagccagtgggaactaaaataattcaactcgtacaaactgagcactctgat
gctgcttacttattatttgcgcctgtatattctcaatccaatgaaaaagaaactattaaa
ggctatgccacaggcgtatttttagtccctcaaattattaagcaggccattactgagcag
cagtctaaaatgttttcgattgctatttatgaagatataaacaaacccgcattttacagt
aactcaaacaatcttaatgttgcacaaggcagtaagctaatatcgtttaatgtcgatttt
ggcgggcaacaatggatcgtaaaactggcacttaaagatgcctttttagctcaacataat
aatcaactcaccttactgctgctgatacttcaagtagttgtatgctcattaattttattg
attttactactgtttaatcagcagcaaattgcacttactcgccaagtagcagagcgtact
tattcgttagcacaagcaaaaaagcaatctgatttggctaaccgggctaagagtcaattt
ttagctaatatgagccatgaaatacgcacgccactaaatgctgttattggcttttcttcg
cttgcccgtaaagaagacgacgccaataccctaattgattatttagataaaataaattcg
tcatctaaaagcttattaaatttgataaacgatattctcgatatatctaaaattgaatca
aaacggctagtgcttgaacgtattccatttgatttaaccgcacttattcagcgcattaat
actatgtttgaacaaagtgctgcaagcaaagcaattgtgtggaaaataaatagcaacatc
cctaaagacacttggtttgttggcgatccaatgcgattagagcaaataatgcttaattta
tgcagtaacgctattaaatttactaacgctggcagtgttactttaaatgtagatacgcaa
cttattgcgcccaataaagcacagctaacaattgccgttattgataccggaataggtata
aaagcaactcaacatgaaaagttatttagtgcatttactcaagccgataactctacttct
cggcagtttggtggcaccggccttgggttagccatagccaaagagcttagtgtattaatg
aatgcaaatatagcgctacatagcgagcttgataaaggctctacttttacatttacatta
gaaatagagacggttaaagcgcaagacccccttataaaacctacagataatactaatata
gccgctttaaaaattttagtggccgaagataacccggttaatcaaatggttataaaagcc
atgcttggctcactaaaaattgtgccacaggttgttgaaaatggtgagcttgcagttaat
attataaaaaaacagcattttgacctcgtgtttatggattgccaaatgccagtaatggat
ggctatagagcaacggccctaatcaggcaatttaaaacggctgaggaactgccaattgtt
gccttaactgccgacgttatgcccgaagacaaagcacacgctcaggcggttggttttaat
caacaccttgcaaaaccgcttgaactaattaagctaaccgagtgtcttgctcaatatgca
gtggtttatgaacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
