Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAa2028
Help
Entry
PSHAa2028 CDS
T00282
Symbol
ecfK
Name
(GenBank) putative outer membrane protein assembly factor
KO
K07277
outer membrane protein insertion porin family
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pha00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03029 Mitochondrial biogenesis [BR:
pha03029
]
PSHAa2028 (ecfK)
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pha02000
]
PSHAa2028 (ecfK)
Mitochondrial biogenesis [BR:
pha03029
]
Mitochondrial protein import machinery
Outer membrane
TOB/SAM complex
PSHAa2028 (ecfK)
Transporters [BR:
pha02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSHAa2028 (ecfK)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Omp85
POTRA
POTRA_1
YqfD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI87084
UniProt:
Q3IIY2
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2141672..2144143)
Genome browser
AA seq
823 aa
AA seq
DB search
MAIKKHLVVSSLLGASFAALGQNSFIVEDLKVEGLQRVALGAALTHIPINVGDNVDEYTI
SKTIKSLYRSGHFDNIKALRDGNNVVFKVTERPTISFIEFDGNKDIKDEQLNQSLDQQNI
RQGEPLDKTVIDNIEKGLTEFFHSIGKYNAKVDISITKLPRNRVKLKLKFDEGDAASIRQ
INLVGNELFSNEELLQLAESQQDLPWWQFMGSDRYQKQTIEGDLEKIRSFYLDRGYLRFN
IDSTQVSVSPERESVYVTANLTEGVKYKVKGFDFIGDLLGREDLIKSVIPLRAGELYNGS
VVTSSEEFIKSYLARFGYANAEVRTIPQIDDENQEVQLTLSVNPGKRVYVRRIIVGGNQS
TADEVLRREMTQLEGAWLSNQSLERSKLQIQRLPYMEKVDFNVVPVPGVDDQVDVDFTVK
EQSAGSFNAGLAYGSYLGLQFNIGVTESNFLGTGNQIGFNINTSRGSERVSVSYTDPYFT
PDGVSQGSSIFYSNYDASKFSLIDYKSKSYGLGTNIGFPIDAVNRINFGVRWIQEELSDI
AEYEQTRVLRETFLDQDNPDAGFDFTKYELSAGWSRVTVNRGLFPTAGSRQTLNLTATTP
NSDLKYFKLNYDSRFYWPISNDHRWVFSTRAALGYGNGYGSTNGYDQVLPFQEYFRITEM
ELRGFDRNTILPRAIARIPQSIPGTPLPDGSTTGNIGGSSEFDVLVPQGRIGGNAKAVAG
MELIVPTPFLDEENTSSVRTSFFVDAANVWDTEFNVDRYQNLAADERAKLDDYSDPMRFR
VSTGLSLQWISPMGPMLISFAYPLQKEEDDDTKTISFNISNSF
NT seq
2472 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctataaaaaaacatttggtagtttcaagtttattgggtgcaagctttgcagcccta
ggccaaaactcctttattgttgaagatctcaaagttgaaggtttacagcgtgtagcactg
ggtgctgcattaacgcatattcctattaacgtgggcgataatgttgatgagtacacgatt
tcaaaaacaatcaagtctctctaccgctcaggtcactttgacaatataaaagcgctacgc
gacggtaataacgttgtttttaaagtaactgaacgcccaacaattagctttattgagttt
gatggcaataaagatattaaagatgagcagcttaatcagtcacttgatcagcaaaatatt
cgccaaggcgagccactagataaaaccgttattgataatatagaaaaaggcttaactgaa
tttttccatagtattggtaaatacaacgctaaagttgatattagtatcactaaactgccg
cgtaaccgggttaaacttaaattaaaatttgatgaaggtgatgctgcatcaattcgtcaa
attaacttggtaggtaatgaacttttttctaatgaagagctattacaactggctgagtcg
caacaagacttaccttggtggcagtttatgggcagcgaccgctaccaaaaacaaaccatt
gaaggcgatttagaaaaaattcgtagcttttatttagaccgtggttacctacgttttaac
atagactctacccaagtgtcggttagcccagagcgtgagtctgtatacgttacagctaac
ttaacagaaggggttaaatataaagttaaaggttttgactttattggtgacttacttggt
cgcgaagacttaattaaaagtgttattccactacgagcgggtgagttatataacggctca
gtggttacctcttcagaagaatttataaaaagctacttagcgcgttttggttatgccaat
gctgaagtacgcacaattccgcaaattgatgacgaaaatcaagaagtacaactaacctta
tcggttaaccctggtaagcgtgtttatgtgcgccggattattgttggtggtaaccaaagt
actgcagatgaagtgctacgccgcgaaatgacacagcttgaaggcgcatggttatctaac
caaagcttagagcgttcaaaattacaaattcagcgtttaccttatatggaaaaagttgat
tttaacgttgtgccagtcccaggtgttgatgaccaagtagatgttgattttacggttaaa
gagcagtcggctggtagctttaatgccggcttagcgtatggctcatacctaggcttacag
tttaatattggtgtaacagaatctaactttttaggtactggtaatcaaataggctttaat
attaatacctcgcgtggttctgagcgtgtgagcgtgtcttataccgacccatactttacg
ccagatggcgtatcgcaaggtagcagtattttttacagtaactacgatgcaagtaagttt
agtttgatcgactataagtcgaaaagctatggattggggactaatataggcttcccaatt
gatgcggttaaccgcattaactttggtgttcgttggattcaagaagagctttcagatatt
gcagagtacgagcaaacgcgtgtactgcgtgaaaccttcttagaccaagacaacccagat
gctggttttgactttactaaatatgagttaagtgctggctggtctcgcgttacggtaaac
cgtggtttattcccaacagcgggctcacgtcaaaccctaaacttaacagcaacaacgccg
aattctgacttaaaatactttaagttaaactatgattcgcgtttttactggccaatatcg
aacgaccatcgctgggtgttctcaacccgtgcggcgttaggttacggtaatggttatggc
tcaactaacggctacgaccaagtactgccattccaagaatacttccgtattactgaaatg
gaactacgtggttttgaccgaaatacaattttaccacgcgcaattgcacgtataccgcaa
tcaattccgggtacacctttaccagatggctcaaccacaggtaatataggcggctcatct
gaatttgatgtgctagtaccacaaggtcgaattggtggtaatgctaaagcggtagcaggt
atggaattaattgtacctacaccgtttttagatgaagaaaataccagttcagtacgtacc
agtttctttgttgatgctgctaacgtatgggataccgagtttaacgtagaccgttaccaa
aatttagcagccgatgagcgagctaaattagatgattactctgatccaatgcgttttagg
gtttcaaccggtttatcattacagtggatctctccaatgggtccaatgctgattagtttt
gcgtatccattgcaaaaagaagaagatgacgatacgaagaccatcagttttaatattagt
aacagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
