Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAa2936
Help
Entry
PSHAa2936 CDS
T00282
Name
(GenBank) conserved protein of unknown function; putative periplasmic calcium binding protein
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pha00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
PSHAa2936
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LTD
Cadherin
Exo_endo_phos
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI87971
UniProt:
Q3IJX3
LinkDB
All DBs
Position
I:3107538..3110258
Genome browser
AA seq
906 aa
AA seq
DB search
MFKTKITPLALIIASISASASAELIISEYVEGSGFNKAIEIYNTSSAEVSLNGYSLSLYS
NGSGSASVTEELTGLLAANSTYVIVTSDSRANDELKLKAQLFSGAVNFNGDDALVLMQGS
NVIDSFGQRGVKEIWSAGGVTTKDKTLRRKENILIGRATPDSTFNPSDEWLQFDKNDFSG
LGFFGIGTTPEPEPEPLEPLICGNDKTTINAIQGTGAASPFVNTTVELEGVVTANFQGDN
QLKGFFISSLPVDDDTNPLTSEGIFVYFAAANVSVGDHVRVQGSVEEYFNATQIGSVTQV
AVCNSGLTVSATKISLPVTNTTDLEAFEGMLITLEQPLIVTNNFGLGRYGEIELATERLY
QGTQVALPGDAANTLEANNLTKKILLDDGSTLQNIEPIYPIPGLSAENTLRTGDTVNTVT
GVLAYSFDTYRIHPTITPQFITTNARKNAPELHVDADLRVASFNVLNYFNGDGQGAGFPT
SRGADSEAEFIRQEAKIVSAISAIQADVIGLMEIENDGFGEFSAIASLVNALNDFDTANQ
YAFVNFGLDKIGSDAITTALIYRVNRVVEVGSAAITTQSPFDFGNRPPIAQSFKVLATDE
VFTAAVAHLKSKGGCSSATGANQDKSDGQACWNETRVAGANAYASWLNSKPTGIDDEDII
LIGDLNAYAMEDPIRAFADNGYKNAVAELDGNTLGYSYSFSGRAGSLDYALVSPSLLSKI
VATNDWHINADEPTLLDYNVEFKSDAQQSSLYAAGPYRASDHDPIIVDIKSEGILTPEEQ
TPVIAANQTFIVNENSPVGTVIGQLAFSDPNANDSPVVEFIVSGSNSVTINNQGQIVVTA
ELDYEQQSLITLVVQAQDSADNISLEQTVTINVNSDKAQNNDDDSGSLFWLTIFLAPLTL
FRRFKS
NT seq
2721 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaacaaaaataaccccattagcgcttattattgcaagcattagtgcatcagcc
tctgccgaactgataatttctgaatatgttgagggaagtggctttaataaagctattgag
atttataacacatcatccgcagaggtttctttaaatggctactcacttagcttgtattca
aatggctctggatcagccagtgtaactgaagagcttacggggttgcttgctgcaaacagt
acctatgttattgtcacttcagactctagagcaaatgatgagcttaaattaaaagctcag
ctatttagtggtgcagttaactttaatggtgacgacgcattagtactaatgcaaggctct
aatgttattgacagttttgggcagcgtggggtaaaagaaatttggtctgccgggggcgta
actacaaaagataaaacgctacgccgtaaggaaaatattcttattggtcgggcaacccct
gactccacttttaacccaagtgacgaatggctacaatttgataaaaacgacttttcaggg
ctaggtttttttggtatcggcacaacacctgaacctgaaccagagccacttgaaccactg
atatgtggcaacgataaaacaaccattaacgccattcaaggtactggtgctgccagccca
tttgttaatactacagtagagttagaaggggttgtaacggccaacttccaaggtgacaat
cagttaaaaggtttttttattagctctttacctgttgatgacgatactaacccactaacc
tctgaaggcatctttgtttattttgcagcagcaaatgtgagtgtaggcgaccatgtgcgt
gtacaaggcagtgttgaagagtatttcaatgccactcaaattggtagcgttacccaagtg
gccgtttgcaattcgggtttaactgtatcagcaactaaaatctcactcccagttacaaat
acaacagatttagaagcatttgaaggcatgcttattacactagagcagccattaatagtg
actaataactttggtttaggacgctatggtgaaatagagctggcaaccgagcgtttgtat
caaggtacacaagttgccctgcccggtgatgccgccaacacacttgaagcgaataactta
actaaaaaaattcttttagacgatggctcaactttacaaaatattgagccaatttaccct
ataccgggtttatctgccgaaaatacgctacgcactggcgataccgttaacactgtaact
ggggtgcttgcatatagctttgatacttatcgcattcaccctaccataacaccgcagttt
atcactaccaatgcacgtaaaaatgctcccgaacttcacgtagatgcggatctaagggta
gctagctttaacgttcttaattattttaatggcgatggtcagggggccggattccccact
agtcgtggtgccgatagtgaagctgagtttattcgtcaagaagctaaaattgttagtgct
attagtgcaatacaagccgatgttattggcttaatggaaatagaaaacgatggctttggt
gagtttagtgcaattgctagcttagtaaatgcgcttaacgactttgacacagctaaccag
tatgcatttgttaattttggccttgataaaattggtagtgatgcaattaccacagcctta
atctatcgtgtaaatagagtagtagaagtaggtagtgcagcaatcaccacacaatctccg
tttgactttggaaaccgcccaccaattgcacaaagctttaaagtattagcaacagatgag
gtatttaccgctgcagtagcgcaccttaaatcaaaaggtggttgcagtagcgcaacagga
gcaaaccaagataaaagtgatggccaagcatgttggaatgaaacacgcgttgccggcgct
aatgcatacgcaagctggcttaatagcaagccaaccggtattgatgatgaggatattatt
cttattggtgatttaaatgcctatgccatggaagatcctattcgtgcatttgccgacaat
ggctataaaaatgcagttgcagagcttgatggtaatacccttggctactcttatagtttt
tctggacgtgcgggtagcttagattatgccttagtaagcccatcattattaagcaaaata
gttgcaacgaatgattggcatattaatgccgatgagcccactttactcgattacaatgtc
gagtttaaaagtgatgctcaacaatcaagcttatacgcagcaggcccatatcgtgcatca
gatcacgatccaataattgttgatataaagtctgagggtattttaacacctgaggagcaa
accccagttatagcagctaaccagacatttattgttaatgaaaatagccctgttggtact
gtgattggccagttagcgtttagcgatccaaatgctaatgactctcccgttgttgaattt
attgtgtcgggtagcaatagcgtaactattaacaaccagggtcagatcgtggtgactgct
gaacttgattatgaacaacaaagtcttattactttagttgtgcaagcccaggatagtgct
gacaatatatcattagagcaaacagttactataaatgttaatagtgataaggctcaaaat
aatgacgatgactctggctcattattttggttaactatttttttggcacctcttacttta
tttcgcaggtttaaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system