Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAb0254
Help
Entry
PSHAb0254 CDS
T00282
Name
(GenBank) putative Outer membrane TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pha00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pha02000
]
PSHAb0254
Transporters [BR:
pha02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PSHAb0254
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI89296
UniProt:
Q3IDB8
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(299838..302255)
Genome browser
AA seq
805 aa
AA seq
DB search
MFKPSLLTLAISSTLSSVVLFSNTASAQEQVVTKNKSLEVIEVTATRRSGSVQAAPLNIT
ALDADVMKDQNISELADVARWVPGLTITDQGGREGSPIIVRGLNTNSSGPASDGGTVATY
INEIPVSVDMRLVDIERVEVLIGPQGTLYGAGTLGGAIRYMLKAPELDYTSGEIYGDVFQ
TQESDSVGGEGGFIFNLPIIEDTLAIRTSLNLYKDPGFVDYNYVVREPGVSLSDPDWSNT
DAVNNNLKQVKDANGETTTTGRISVRYKASESFEGTLNYFYQKQDSEGRSIVHSNSLNAN
NGLSDIIGKYESAYRYEEPRVKEDQLLSLELKADLGFAELVSATGISSFEAEGQRDQTDL
LIRLDYGYEEFPAFSTFTREIDEVDTFTQELRLVSQSDSDFSWIVGGFYNKKDTDASSRE
FTPGFDQFAVDNFGATQLRPDALEYLEITSSKVTESALFGEVGYQITDKLDITLGVRFYE
YDVKSKAAFDFPLANTLYDGAGPNDIAINFEENAASDNGNLLKFNAKYQFNDTVMGYVTV
SEGFRIGGSNGLVPCPDPLPDDQQTGCGKPDEMLFDADITTNYELGFKSTWFRSQLHFNA
ALFNVDWDNAQITGATAVGQLPYLSNAGSANAKGIEIATRAILSDSFSAYATYAYTKAEL
TSDAPFLFNADGTDGAADGDRLPGSPEHQFSLGINYQTDVFNDKTLDINYGLTAQSDVIS
KVGLRDNGEVLPGYSLSNISAKLTADAWSTTLYVDNMFNKYAVTSVRRSDADITSANGAE
IQRNYGHYINRPLTVGIKFNYKFEI
NT seq
2418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaaccaagcctgttaaccttggctatttcaagcacactttcaagtgtggtttta
ttctctaataccgcttcagctcaagaacaagtggttacaaaaaacaaatcacttgaagtt
atagaggttacggcaacacgacgcagcggctctgtacaagcagcaccacttaatataacc
gcgcttgacgctgatgtaatgaaagatcaaaacattagtgaacttgccgatgtagcacgc
tgggttcctggtttaacaattactgatcaaggtggccgcgaaggctcacctattattgta
cgtggtttaaatactaactcatcgggtccagcgtcagatggcggcactgtagcaacttat
atcaacgaaattccggtaagtgttgatatgcgcctcgttgatattgagcgcgtagaagta
cttattgggccacaaggtacattatatggcgcaggtacattaggcggcgccattcgttac
atgctaaaagcgccagagcttgattatacctcaggcgaaatttacggtgatgttttccaa
acccaagaaagtgactcagtaggcggtgaaggcggctttattttcaacttaccaattatt
gaagatacgcttgccatacgtactagcttaaacctatataaagatccgggttttgtagat
tacaattatgttgttcgtgagccgggagtatcgcttagcgatcctgattggagcaatact
gatgccgttaacaacaaccttaaacaagtaaaagatgccaatggcgaaacaaccactaca
gggcgtatatcagttcgttataaagcgagtgagtcttttgaaggtacgcttaactatttt
tatcaaaaacaagacagcgaaggtcgttcaattgttcatagcaacagcttaaatgcaaac
aatggcttaagcgatataattggtaagtacgaatcagcgtatcgttacgaagagccacgc
gtgaaagaagatcaattacttagcctagaactcaaagcagacttaggctttgcagagtta
gtatcggctaccggtatatcaagctttgaagctgaaggtcaacgcgaccaaacagattta
ctgatccgtcttgattatggctacgaagaatttccagcattttcaacatttacccgcgaa
attgatgaagtagatacttttacccaagagctgcgtttagtatcacaaagtgatagcgat
tttagttggatagtaggtggtttttataataaaaaagacacagatgcatcaagtagagaa
tttacaccaggttttgatcagtttgcggttgataactttggcgcaactcaacttagacct
gatgcactagagtacctagaaataacgagcagcaaagtaacagagtcggctctttttggt
gaagtgggttatcaaataaccgacaaactagatataacgcttggtgtgcgcttttacgaa
tacgatgtaaagtctaaagccgcttttgactttccgttagcaaatacattatatgatggt
gctggccctaacgatatcgctattaactttgaagagaatgcagcaagtgataacggtaat
ctgttaaagtttaacgcaaagtatcaatttaatgacaccgtaatgggctatgtaacggta
agtgaaggctttagaattggtggttcaaatggcttggttccgtgccctgatccacttcct
gatgatcaacaaacaggctgtggtaaaccagatgaaatgctatttgatgccgatataacg
accaattacgagcttggctttaaaagtacatggtttagaagtcagttacactttaacgct
gcactctttaacgtagattgggacaatgcgcaaattactggagcaaccgcggtaggacaa
ctgccttacctttcaaacgctggcagtgctaacgcaaaaggcattgaaattgctactcgc
gctattttatcagactcatttagcgcctatgcaacatacgcttacactaaagcggagcta
acatcagatgcaccatttttatttaacgccgacggtactgatggcgctgcagatggcgat
cgtttacctggttcaccagagcatcagttttcattaggtattaattaccaaactgacgtg
tttaacgacaaaacattagatataaactacggcttaactgcgcaaagcgacgttatttca
aaagttggtttacgtgataacggtgaagtactaccaggttacagcctaagtaatatttca
gctaagttaacagcagatgcgtggtcaactacattgtatgttgataatatgtttaataaa
tatgctgttacatcggtacgtcgctcagatgccgatattacaagtgctaatggcgcagaa
atacaacgtaactatggccattacattaaccgccctcttacggtaggcattaaatttaac
tacaagtttgaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
