Polaribacter haliotis: H9I45_09615
Help
Entry
H9I45_09615 CDS
T06834
Name
(GenBank) leucine-rich repeat domain-containing protein
Organism
phal
Polaribacter haliotis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_1
Por_Secre_tail
Ig_3
Ig_2
LRR_9
CHU_C
I-set
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QOD59618
UniProt:
A0A7L8AC68
LinkDB
All DBs
Position
complement(2258092..2265447)
Genome browser
AA seq
2451 aa
AA seq
DB search
MKTKLLLLFTFFSFAITAQISQSERQALIDFYNATDGDNWTNNTNWDTDINSTSDVSTWF
GVTVQNNTIIEIRLFENNLSGNISNLYNLTNLRRLELSNNSISDEIAVSNFPDNINYIGL
RENNLFGNFPDLSQLSSLRIINLIDNKLTGEISQDLFPSNINSVWIAKNPFSGSLDFSQF
NAITTVQIYDTNISFLKLSSNTVSGQNITQNGRLRVQNTPNLAFIEIPNVASFTNLGSDY
FDLGLKIVAYDQADKTATPNTLEREALKKLYENKTYTYANTIKSGVNDTEWLNVEVLNGE
TRITEIHTTGSGINGPMPVEIGVFTELKHLHIPNSGINTIATELKNASKLEDLYLNNNSI
TAIPANFYDLVNLKILNISNNQIPSIASGLGSFTDLEQLYFSNTQIDLIPTTIGNLKKLE
ILEFANTKISLLPPQIGGLVELRRLVAAPNNIASIPSEFGQLTKLQFLDFANCELSNTPA
AFANLTQLETLFLNDNELQVVSGLGGFTKLKFLRLHNNRLGEENANFNTDLPEDMSDLVL
LEELTLQNNKLTKLPANIGNINKLTSLNLNSNRLTSLPTTIGSLSNLEELSITSNLLTGL
PSTIGNLLKLKIASLSSNKLESLPEEIGNLSSLEDLDIQSQYTSGSPYVYHLTSLPSALN
NLTTLKTLNASNNKIEGDLDFSNLTSLTSLSLGTNLITGIKLGGSPFYAYITSNPNLTCV
EVPTAELSSWKSSNQLSVDNGVAISDNCTGYRVPQKEREALIAFYKSTGGGANTSDEGTT
WVGTNWDINPSGLSNVGSWQGITTGLVNGQKHITSIHLEVYGVEGAIPSEIKDLTELVVL
NLGDANYPTRSCSITSLPKEIGLLGKLESLHLYNNKLTELPDEIGDLPNLTYLNLSSNEL
TSLPAGIGNFEKLERLIIDSQCTGNCYEGDQTLMVLPNEIGNITNLKLLNLDSNGLTSLP
STIGSLTNLEELSITSNSLKGLPSTIGNLSKLKIASLSSNKLESLPEEIGNLSSLEDLDI
QSQYTSGSPYVYHLTSLPSALNNLTTLKTLNASNNKIEGDLDFSNLTSLTSLSLGTNLIT
GIKLGGSPFYAYITSNPNLTCVEVPTAELSSWKSSNQLSVDNGVAISDNCTGYRVPQKER
EALIAFYKSTGGGANTSDEGTTWVGTNWDINPSGLSNVGSWQGITTGLVNGQKHITSIHL
EVYGVEGAIPSEIKDLTELVSLNLGDGRYPNGSCNITSLPKEIGMLVKLETLYLINNKLT
ELPDEIGDLPNLTYLNLSSNELTSLPAGIGNFAKLERLIIDSQCTGNCYEGDQTLMVLPN
EIGNITNLKLLNLDSNGLTSLPSTIGSLSNLEELSITSNLLTGLPSTIGNLSKLKIASLS
SNKLESLPEEIGNLSSLEDLDIQSQYTSGSPYVYHLTSLPSALNNLTTLKTLNASNNKIE
GDLDFSNLTSLTSLSLGTNLITGIKLGGSPFYAYITSNPNLTCVEVPTAELSSWKSSNQL
SVDNGVAISDNCTGYRVPQKEREALIAFYKSTGGGANTSDEGTTWVGTNWDINPSGLSNV
GSWQGITTGLVNGQKHITSIHLEVYGVEGAIPSEIKDLTELVVLNLGDANYPTRSCSITS
LPKEIGLLGKLESLHLYNNKLTELPDEIGDLPNLTYLNLSSNELTSLPVGIGNFAKLERL
IIDSQCTGNCYEGDQTLMVLPNEIGNITNLKLLNLDSNGLTSLPSTIGSLTNLEELSVTS
NSLKGLPSTIGNLLNLKELRLNNNLIKGDLNLENLKILTSLYLNYNGIKKLKLGVSPTIF
GGNSVSNFSAKRNALGCIEVPTDELVAWQLSEANEKNNKIDNGVVYSNNCSAVTNNSIPD
LERDALIAIYNNTKGMDWRNDLSASYNGVTWLNDTTQKRNVGAWYGVTTAIINGQKHVTK
VELNSNQLDGTIPSVIKNLTQLKELEINSNAISEIPAEIGELGNLEQLTFTSQLKDSEYI
LKTIPTEINNLTSLKRLELGSNQLEGNLDFSNLVNLTSLIVSSNQITGLKIGVLPNVFDR
SYDSENQFRNDFSFYNQYLNCIAVPQNTISDWEATTHATNYPSIVWGQDCSAYNNIPENE
MQALVDMYNNLDGANWRNNTNWNGNLAKALINNPYNATKWQGVTTKIVDGGKHITNISLS
SNQLKGELPTSIGNLTKLTNLQISSNEISGALPATFGNLTSLETLYLNSNKITSLPREMS
NMLALKTVYLQNNEIEGNLPDFTNATNLTSLYVNSNKFQFGDFEDEFTNYQNLQTFSYST
QAKVGVEEAIDFGDGFDKTLEAVVSGTNNTYQWYKNWSPITDATNSTYEIKDATSSDAAF
YYCVVSNTVITGLTIETERITLNYDATLNTEDVSFSDKIKLYPNPVNDLLQIKNSDNLKI
STIMIFNVLGKKVKVIRNPENAIDVSDLSKGIYFLNINSENGKIVKRIVKK
NT seq
7356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaactactattattatttacgtttttttcttttgcaataaccgcacaaatt
tctcaatcagaaaggcaagctttaatagatttttacaatgctacagatggcgacaattgg
acaaataataccaattgggatacagatataaactcaacttctgatgtttctacttggttt
ggagtaactgtacaaaataatactataatagagattagattatttgagaataatctgtct
ggaaacataagcaatttatataatttaacaaatttaagaaggttagaattatcaaacaat
tctataagtgatgaaatagcagtcagtaattttcctgataatattaattatataggttta
agagaaaacaacctttttggtaattttccagatttatcgcaattaagtagtctcagaatt
ataaatttaattgataataagttaactggagaaataagtcaagatctttttcctagcaat
attaattctgtttggattgcaaagaacccattttctggtagtttagattttagtcagttt
aatgctatcactactgttcaaatttatgataccaatattagttttttaaaattatcttct
aatactgtttcaggtcaaaatattacccaaaatggaagattacgagttcaaaatacgcca
aatctagcatttatagaaataccaaatgtggcaagttttacaaatttaggttcagattat
ttcgatttaggtttaaaaatagttgcttatgaccaagcagacaaaacagcaactccaaac
actttagaaagagaagcgttaaaaaaactatatgaaaataaaacatacacgtacgcaaac
acaataaaatctggagtaaatgatacagaatggttaaatgttgaagtccttaatggagaa
accagaattactgaaattcatactacaggttcaggaattaatggaccaatgccagtagaa
attggtgtttttacagagttaaaacatttacacataccaaattctggaattaataccatt
gcaacagaattaaaaaacgcgagcaaattagaagatttgtatttgaataataactcaatt
actgcaattccagctaatttttacgatttagtaaatttaaagattctaaatattagtaat
aatcaaattccttcaatagcatctggtttaggtagttttacagatttagaacaattgtat
tttagcaatacacaaatagatttaataccaacaacaattggaaatttaaaaaagttagaa
attttagaatttgccaacacaaaaatatctttattaccaccgcaaattggtggtttagtg
gagttgagaagattagtagcagcaccaaataatattgcaagtattccttcagaatttggg
caactaaccaaactacaatttttagattttgcaaattgtgaattatcaaatacacctgcc
gcttttgcaaatcttacccaattagaaacgttatttttaaatgataatgaattacaagta
gtttctggtttaggtggttttacaaagttgaaattcttacgattacataacaatagatta
ggagaagagaatgctaattttaatacagatttaccagaggatatgtctgatttggttttg
ttggaggagttgactttacaaaataataaattgacgaagttgcctgctaatattgggaat
attaataagttaacatcattaaatttaaatagtaatagattaacgagtttaccaaccacg
attggtagtttatcaaatttagaagagttaagtattacgagtaatttattaactggttta
ccaagtactattggtaatttattaaaattaaaaatagcaagcttaagttctaataaatta
gagagtttaccagaagagattggtaatttaagttcattagaagatttagatatacaatct
caatatacgtcaggttcaccttatgtttatcatttaacgagtctaccaagtgcgcttaat
aatcttactactttaaaaactttaaatgcttccaataataaaattgaaggtgatttagat
tttagtaatttaacttcattaacttccttatcattaggtacaaatttaattacaggaata
aagttaggaggaagcccattttatgcatacataactagtaatccaaatttaacttgtgta
gaagtaccaacagctgaattaagttcttggaaaagttctaatcaattatcagtagacaat
ggagttgctattagtgataattgtacaggctacagagttccacaaaaagaaagagaagct
ttaattgctttttataaatctacaggaggaggagcaaatacgagtgatgaaggtacgact
tgggttggtacgaattgggatattaatccttcaggattaagtaatgttggttcttggcaa
ggaattactacaggtttagtaaatggtcagaagcatattacttccattcatttagaagtt
tatggagtagaaggagcaataccgtcagaaataaaagatttaacagaactagttgtttta
aatttaggtgatgctaattatccaactagaagttgtagcataacaagcttgccaaaagag
attggtttgttaggtaagctggaaagtctgcacttatacaataataaattaacagaatta
ccagatgaaataggagatttaccaaatttaacttatctaaatttatcgtctaacgaatta
acaagtttacctgctgggattggtaatttcgaaaaattagaaagattgataatagatagt
caatgtacaggtaattgttatgaaggagaccaaacattaatggttttaccaaatgagata
ggaaatattacaaatttaaagttactaaatttagatagtaatggtttaacaagtttacca
agcactattggtagtttaacaaatttagaagagttaagtattacgagtaattcattaaag
ggtttaccaagtactattggtaatttatcaaaattaaaaatagcaagcttaagttctaat
aaattagagagtttaccagaagagattggtaatttaagttcattagaagatttagatata
caatctcaatatacgtcaggttcaccttatgtttatcatttaacgagtctaccaagtgcg
cttaataatcttactactttaaaaactttaaatgcttccaataataaaattgaaggtgat
ttagattttagtaatttaacttcattaacttccttatcattaggtacaaatttaattaca
ggaataaagttaggaggaagcccattttatgcatacataactagtaatccaaatttaact
tgtgtagaagtaccaacagctgaattaagttcttggaaaagttctaatcaattatcagta
gacaatggagttgctatcagtgataattgtacaggctacagagttccacaaaaagaaaga
gaagctttaattgctttttataaatctacaggaggaggagcaaatactagtgatgaaggt
acgacttgggttggtacgaattgggatattaatccttcaggattaagtaatgttggttct
tggcaaggaattactacaggtttagtaaatggtcagaagcatattacttccattcattta
gaagtttatggagtagaaggagcaataccgtcagaaataaaagatttaacagaattggtt
tcactaaatttaggtgatggtcgttatccgaatggaagttgtaatattacaagtttacca
aaagaaataggtatgttggttaagctggaaactctatatctaattaataataaattaaca
gaattaccagatgaaataggagatttacccaatttaacttacttgaatttatcttcaaac
gaattaacaagtttacctgctgggattggtaattttgcaaaattagaaagattgataata
gatagtcaatgtacaggtaattgttatgaaggagaccaaacattaatggttttaccaaat
gagataggaaatattacaaatttaaagttactaaatttagatagtaatggtttaacaagt
ttaccaagcactattggtagtttatcaaatttagaagagttaagtattacgagtaattta
ttaactggtttaccaagtactattggtaatttatcaaaattaaaaatagcaagcttaagt
tctaataaattagagagtttaccagaagagattggtaatttaagttcattagaagattta
gatatacaatctcaatatacgtcaggttcaccttatgtttatcatttaacgagtctacca
agtgcgcttaataatcttactactttaaaaactttaaatgcttccaataataaaattgaa
ggtgatttagattttagtaatttaacttcattaacttccttatcattaggtacaaattta
attacaggaataaagttaggaggaagcccattttatgcatacataactagtaatccaaat
ttaacttgtgtagaagtaccaacagctgaattaagttcttggaaaagttctaatcaatta
tcagtagacaatggagttgctatcagtgataattgtacaggctacagagttccacaaaaa
gaaagagaagctttaattgctttttataaatctacaggaggaggagcaaatactagtgat
gaaggtacgacttgggttggtacgaattgggatattaatccttcaggattaagtaatgtt
ggttcttggcaaggaattactacaggtttagtaaatggtcagaagcatattacttccatt
catttagaagtttatggagtagaaggagcaataccgtcagaaataaaagatttaacagaa
ctagttgttttaaatttaggtgatgctaattatccaactagaagttgtagcataacaagc
ttgccaaaagagattggtttgttaggtaagctggaaagtctgcacttatacaataataaa
ttaacagaattaccagatgaaataggagatttaccaaatttaacttatctaaatttatcg
tctaacgaattgacgagtttacctgttggtattggtaattttgcaaaattagaaagattg
ataatagatagtcaatgtacaggtaattgttatgaaggagaccaaacattaatggtttta
ccaaatgagataggaaatattacaaatttaaagttactaaatttagatagtaatggttta
acaagtttaccaagcactattggtagtttaacaaatttagaagagttaagtgttacgagt
aattcattaaagggtttaccaagtactattggtaatttattaaatctaaaagaattaaga
cttaataataacctaataaaaggtgatttaaatttagaaaatttaaaaattttaacatca
ttatatttaaattacaatggtattaaaaaattaaaattaggtgtttcacctacaattttt
gggggtaattctgtttcaaatttttcagcaaaaagaaacgcattaggctgtatagaagtg
ccaacagatgaattagttgcttggcaattatcagaagcaaatgaaaaaaataacaaaata
gacaatggcgtagtttattcaaataattgtagtgcagtaactaacaattctattccagat
ttagaaagagatgctttaattgcaatttacaacaatacaaaaggtatggattggagaaac
gatttatctgcatcatataatggtgttacttggttaaatgatacaacccaaaaaagaaat
gtaggtgcttggtatggagttacaacagctataataaacggacagaaacatgttactaaa
gttgagttaaattctaatcaattagatggtactataccatctgtcattaaaaatttaact
caattaaaagaattagaaataaatagtaatgctatttcagaaattcctgcagaaattgga
gagttaggtaatttggaacagttaacttttacgagtcaactaaaagattctgaatatata
ttaaaaacaattcctacggaaattaataatcttacctctttaaaaagattagaactaggt
tctaatcaattagaaggtaatttagattttagtaaccttgtaaatctaacttcattaatc
gtttcaagtaaccaaattactggactaaagataggtgttttaccaaatgtttttgataga
agttatgattcagaaaaccaatttaggaacgattttagtttttacaatcaatacttaaac
tgtattgcagttccacaaaatacaatttcagattgggaagctactactcatgcaacaaat
tacccaagcatagtttgggggcaagattgtagtgcttacaataatataccagaaaacgaa
atgcaagctttggtagatatgtataataatttggatggagcaaattggagaaataacacc
aattggaatggtaatttagctaaagctttaattaataatccatacaatgctacaaaatgg
caaggtgtaactactaaaattgtagatggtggtaaacacattaccaatatttctttgagt
agtaatcaattgaagggtgaattaccaaccagtattgggaatttaaccaagttgacgaat
ttacaaataagttctaatgaaatttcaggagctttaccagcaacttttggaaacttaacc
tcactggaaactttgtatttaaatagtaacaagattacaagtttaccaagagaaatgagt
aatatgttagccttaaaaacagtctatctacaaaataacgaaattgaaggtaacttacca
gattttacaaatgctacaaatttaacaagtttatatgttaatagtaacaagtttcagttt
ggagattttgaagatgagtttacaaattatcaaaatttacaaacatttagttactcaact
caagcaaaagtaggagtagaagaagcaattgattttggcgatggttttgataaaacacta
gaagctgttgtgagtggaaccaataatacttatcaatggtataaaaattggagtccaatt
actgatgcaaccaatagtacttatgaaattaaagatgctacaagttcagatgccgccttt
tattattgcgtagtatctaacacagtaattactggtttaacaatagaaacagaaagaatt
actttaaattatgacgctaccttaaatacagaagatgtgtcattttctgacaaaataaaa
ctctatccaaaccctgtaaacgacttattacaaattaaaaattcagataatttaaaaatc
agtactattatgatatttaatgtgttaggcaaaaaagtaaaggtgatacgaaatccagaa
aatgcaatagatgtttctgatttatcaaaaggaatttattttttaaatattaatagcgaa
aacgggaaaattgtaaaaagaatcgttaaaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
