KEGG   Pedobacter heparinus: Phep_0242
Entry
Phep_0242         CDS       T00978                                 
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
phe  Pedobacter heparinus
Pathway
phe02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:phe00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    Phep_0242
SSDB
Motif
Pfam: PKD_4 PKD PKD_5 K319L-like_PKD CHU_C FlgD_ig
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACU02468
UniProt: C6XYY6
LinkDB
Position
complement(280557..286520)
AA seq 1987 aa
MVKRLLFFTFALLFLQISEAFSQITIGTVDAGPYTPGSSIAATFSINPTTCINRDNQFDL
VLVSPAGVELSTIGSYTGFYTTFINGTIPQGTLPGTGYKLRIKTTSPVLTPIAESNTFEI
KTGTAITAAVSSAPVITAPYIFGYCPGRPNAVFNFTNQSTATSTVTGTIKNELSGSIDAN
LTFTTAIQSFTASFAHYTVSIKAQMPDGTIGTRAYMVINNNVFNNFSTSGSNAFVCLPGG
FLQYGVDVNGPTGIQNNYPGNTYQIMWGDGVTDTYTFCDLKSGSVQHEYLRSSCGNPPYS
TGGGTVYNVFGINISVVSPCGQVGGAISTYVRVVDKPVNKFSHPAAACTGRPVTFVNNSI
LGQDPGSNSQVCSNNNVTYNWYVDGQIVLAGVPRSTNLVHTFPTHGVHDVKLESVTSGSC
EGAAITQQICIQDPPQPAFDFNGAPQTGCAPFTIQARDLSVIDNICNANNAYNWIVNGPA
GVQITNQGDKNPIFKFNNPGTYTIILEIQTASCGTVRTQIPQQIVLADGAPVATLSDNVT
LCALNTFTFDNNTGPTRTILTGTQQDLATTYTWSVTESDGSALAPGDFSFEGGTDLHTKF
PIIKFNQFKTYRIKVVHVNSCGQTDDFQLITFSPSPVPNVVTNANPICYDGVINLQGSIT
GGAYASFEWVGNGGSFSPATGNLTTTYTPSIAERNAGTTTIILRVNTGLQGACARVEFPL
VVNIRPNNTGTNATQQICTGNTVSHTPASTVVGSTYSWTVSNPDGNATGQLPGSGTAITD
VIINNSATANAVVIYTITPLSNGCSGVPYTFTVTITPRPVLTAIAAKSTICSNESSAITL
SSNLLNTRYTWTSSVTGNITGNNSVNTQTANSIIDDILINNSTTQGSVTYTITPFSATGC
PGTPVSVTVNVDPALTVANAGADKSICATTSYTMEGNTANVGTGTWTPVSANASGVTFAN
PNSPTTVVNGLSPGNSYTFRWTIDATSACSPTFDEVTITVNEPTIPGTTAGTPTIVCANN
NTGTISLSGNIGNVIRWESSLDGNTWIPIAGNNTTTTYTFNNLTVSTQFRAVVQNGGCTV
ENSTGTTITVSPASTIATAGADQVLCNEPTATLDGNTPAAGETGVWTHASGSPIAVITDP
ANPKTTVTGLTPGQTYRFVWTITGNAPCGPTFDDVTIRNNPPIVQNISSTSAVVCNGQEV
LLNGSAPTGGDGTNYTYSWEIKVDTGPWNLINNATDKDLIITLTTPGTVSFRRIVTSGGC
TSTSNEYSIVVQPAITGNNISADQIICSGTTPALLTGPAPTGGGGTFTYQWQSSPDGTVW
TNIGGANDIDYQPTALTTTTFYRRNASTLACGSLQVPSNTVKITVNPNAKAEFTWTNDKG
CVPFTLPVTVVHYVDRNATYTWYANTTVIGTGTTFPVYTIQNSNESVTIRLVVTSSLGCS
QDEFSHVFSTNQAVPASFTQNTTEGCGPLPVNFVNTSDLTAGATFSWDFGNGTSSTQANP
GTVTYQAEATGKDTTYVVTLTATTSCGSNSVTSTVLVKAKPVAIFSPSRTDGCSPMLVNF
TNTSPGGAGTTYFYDFGDGSPVIQRPDKSPVQHTYNTTVTTTFRATLTVVNECGTDIRAY
NIRVAPQNITPELVVDANEKEGCAPHTVNFDNNSIGASRFTFDFGDGSPIQTVLTTGRVP
HVYTMPGTFTITMTAYNSCSEISTTETVTVLPQPIADFDAVNKLGCTGLAVKFTNNTQNG
VSYLWDFGDGSPTSTEVEPTHVYTGSQEYYTVTLTAVNNLGCPMTVTKTNFIHIVQPPVA
AFNVNPSTLISIPDYTFNFEDQSTNTPTIWEWDFGDGTSSALRNPSHTYLDTGTYKVTLK
VTNQQGCFTTTFKNVTIKGVPGYLFVPNSFIPGDTRPELREFRAKGSGIANWRFSIFNKW
GQLLWETTKLEEGRPAEGWDGTFKGQPMPQGVYFWKIDVQMINGTEWKGMTYDKSVPKRT
GPIHLIR
NT seq 5964 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggtaaaacgtttactcttttttacatttgctctcctatttcttcaaatatctgaggct
ttttctcagataacgattggaacggttgacgctggaccttatacaccaggatcgagtatt
gcggcaacttttagtataaatccgacaacctgtatcaatcgtgacaatcagtttgatttg
gtgttagtatcacctgcaggagtagaacttagtacaattggaagttatactggtttttat
actacatttataaatgggacaatacctcaaggaacattaccaggaacaggttacaagctt
agaattaaaacgactagtcccgttctaacacctattgctgaatcaaatacttttgaaatt
aagacaggtacagctattactgccgcggtaagttcagcaccagtgataaccgccccttac
atatttggttattgtccgggcaggcccaatgctgtttttaacttcacgaaccaatccaca
gctacgagtacggtaaccggtacgattaaaaatgaactgagtggttcaattgatgcaaat
ctaactttcactaccgccatacaatcctttactgcttcattcgctcattatacagtaagt
ataaaggctcaaatgcccgatggtactattgggacaagagcttacatggttataaataat
aatgtatttaacaacttttccacttcaggatcaaatgcatttgtttgtttacctggaggt
tttctccagtatggtgtagatgtaaacggtccaaccggcatccaaaataactaccctggt
aatacctaccaaataatgtggggagatggcgttacagatacttatacattttgcgattta
aaatcgggatcagttcaacatgaatatttgagatcttcttgtggaaatcccccctatagt
acaggaggggggacagtttataacgtctttggcattaacatctctgttgtaagtccttgc
ggacaagttggcggagccatatcaacttatgttagagttgttgataaacccgtaaataaa
ttttcccaccccgctgctgcttgtacgggcaggccagtaacttttgtgaacaactcgata
ttgggacaagaccccggatccaattcacaggtctgcagcaataataatgtgacttacaac
tggtatgttgacggacaaattgttctggcaggcgtaccaagatctaccaatttagttcat
acttttcctacccatggagttcatgatgtaaaattggagtcggtaacaagtggctcttgt
gaaggtgccgccataacgcagcaaatctgtattcaggatcctccacagccagcgtttgat
ttcaatggggctccacaaacaggatgtgcaccatttaccattcaggcaagggacctctct
gttatagataacatttgtaatgcaaacaacgcttacaactggattgtaaatggcccagca
ggtgtacaaattacaaatcaaggagataaaaatcctattttcaagtttaataatccggga
acctataccatcattctggaaattcagactgcatcttgtggaactgtaagaacacagata
ccacagcaaattgtattggcagacggagctccggttgccacattatccgataatgtaaca
ttatgtgccttaaacacttttacctttgacaataataccggtcctacaagaaccattctt
acaggaacacaacaggacttggctactacatatacctggtctgttacggaaagcgatggt
agcgctcttgcgcctggagactttagttttgagggcggtactgatttgcacaccaaattt
ccaattattaaattcaaccagtttaaaacctacagaataaaggtcgtacacgttaatagc
tgtggacaaactgatgatttccaacttatcactttctctccttcaccagtccctaatgtt
gtcaccaatgcaaatcctatctgttatgatggggtaattaatctgcagggaagcattact
ggtggggcatatgcttcatttgaatgggtaggtaacggcggcagtttttcacctgcaacg
gggaatttgacaacgacttatacgcctagcattgccgaaagaaatgctggtacaacaaca
ataatattaagagtaaatactggtttgcaaggtgcatgtgcaagggttgaattcccacta
gtggtcaacatccggccgaacaacaccggtacaaatgcaactcaacagatctgtacaggc
aatactgtttcccacacccctgcttcaactgtcgtcggcagtacatatagttggacagtg
agtaatccagatggaaatgccacgggtcaacttcctggatccggaactgcaattacggat
gtcattatcaacaatagtgctacagcgaatgcagttgtaatctatactattactccactt
agtaacggctgctccggtgtgccatatactttcactgttacgataactccaaggcctgtt
ctgacagcaatagctgccaagtcaacaatttgcagtaatgaatcttcagctatcacatta
agctctaatttactaaataccagatatacctggacaagttccgttactggtaatattaca
ggaaataacagtgtaaatacgcaaacagcaaacagtataatcgatgatatactaattaat
aacagtaccacccaaggttcagtaacttataccatcacaccattctccgctacgggatgc
ccaggtacaccggtttctgttaccgtaaatgtagatcccgcattaacagttgccaatgca
ggggctgataaaagtatttgtgctactaccagctatacgatggaaggaaatacggctaat
gttggcacaggaacatggacacccgtatcagccaatgcctcaggtgttacctttgctaat
cccaatagccctactacagtggttaacggcctaagccctggaaatagctataccttcagg
tggacaattgatgccacaagtgcctgcagcccgacatttgacgaagttaccattaccgtt
aacgaacccaccataccaggaactacagctggaaccccaacaatagtttgcgccaataac
aataccggaaccatttccctgagtggaaatattggcaatgtgatcagatgggaaagcagt
ctggatggcaatacctggatcccgattgcaggaaataatactactacgacctataccttt
aataaccttaccgtttctacacaatttagggctgttgttcaaaatggcggttgtacagta
gaaaattctaccggaacaaccatcacagtatcccccgcatccaccattgcaactgcaggt
gcagaccaggtgctgtgtaatgagccgactgctacattggatggaaatactcctgctgca
ggtgaaacaggggtatggacacatgcctctggcagtccaattgcagtcataaccgatcct
gctaatcccaaaaccactgtaactggattaacaccaggtcaaacttatcgtttcgtatgg
actataacaggcaatgcgccatgcgggccaacttttgacgacgttaccataagaaacaat
ccaccaattgtccagaacattagcagtaccagtgctgtggtttgtaacggccaggaagta
ctccttaatggcagtgcaccaacgggcggcgatggaactaattacacctattcctgggaa
attaaagtagatacagggccctggaatcttataaataatgcaaccgacaaagacctgatc
attaccctcactacgcctggaacggtcagcttcaggagaatcgtaactagcgggggttgt
acttctaccagcaatgaatattccattgttgttcaacccgcaataacaggcaataacatc
tccgcagaccaaattatctgtagtggcactacacctgcattacttactggccctgcacca
acaggtggcggcggaacatttacctatcagtggcaatccagtccggatggaacggtatgg
acaaacattgggggtgccaatgacatagattatcagccaacagcccttaccacaaccact
ttttacaggcgtaatgccagcacccttgcctgcgggtccctgcaagttcctagtaataca
gttaaaataaccgttaacccgaatgcaaaagccgaatttacctggacaaacgacaagggt
tgtgttccttttaccctccctgtcacagtagtgcattatgtagataggaatgcgacttac
acttggtacgcgaatactacagttattggaaccggcacaacattccctgtttacaccatt
cagaacagtaatgaatcagtgacgatcagactggtggtaaccagtagcctgggttgttct
caggatgaattcagtcatgtatttagtaccaaccaggctgtaccggcatcatttacacaa
aacaccaccgaaggctgcggaccattacctgtaaattttgtaaacacttctgaccttact
gcaggagcaacattttcatgggattttggcaatggcacgagctcaacgcaagccaatccg
ggcactgtaacctaccaggctgaagcaaccggaaaagacacgacttatgtggtaacctta
accgctactacttcttgcggaagtaattccgttacttcaaccgtacttgtaaaagcaaag
cccgtagccatattttcaccaagcagaacagatggttgttcacctatgcttgtcaacttt
actaatacttctccgggtggtgcaggtactacttatttttatgatttcggcgatggcagc
cctgttatacagcgaccggataaatctcctgtacaacatacctacaataccacggtaacc
actaccttcagggccacgttaacagttgtaaacgaatgtggtaccgatatccgtgcgtac
aatatccgtgttgctccgcaaaacattacgcctgaactggtagttgatgccaatgaaaaa
gaaggctgcgcaccacataccgtcaattttgacaacaactctattggtgcatcccggttt
acatttgattttggcgatggcagtccaatccagactgtgctaaccaccggcagggttccc
catgtgtatactatgccaggcacattcaccatcacaatgaccgcctacaacagttgctca
gaaatctctactacagaaaccgttactgttctgccccagccaattgctgatttcgatgca
gtaaacaaattaggttgtaccggccttgccgttaaatttacaaacaacactcaaaacggg
gttagctatctatgggattttggagacggttctccaacttctacagaagttgaaccaacc
catgtctataccggcagccaggaatactataccgtgacgcttacagctgtaaacaacctg
ggctgcccaatgacggttaccaaaaccaacttcatccacatcgtacaacctcctgttgcc
gcctttaatgtcaacccttctaccctgatcagcattccggattatacctttaatttcgaa
gatcagagtaccaatacccctaccatctgggaatgggattttggcgatggcaccagttcg
gcactaagaaacccgagccatacctacctggatacaggcacctataaagtgacactcaag
gtaaccaaccagcagggctgctttaccactacttttaaaaatgtaaccattaaaggtgtt
ccgggctatttatttgtacctaattcttttataccgggcgatacacgtccggagctgcgg
gagttccgcgccaaaggatcgggaatcgctaactggcgcttcagcatctttaacaaatgg
gggcaactgttatgggaaacaaccaagctggaagaaggccggcctgccgaaggctgggat
ggcacatttaaagggcaacctatgcctcagggagtttacttctggaaaatagatgtgcaa
atgatcaatggaacagaatggaaaggcatgacctacgacaaatctgtacctaaacgaaca
ggaccaatacatttaatcagatag

DBGET integrated database retrieval system