Pedobacter heparinus: Phep_0242
Help
Entry
Phep_0242 CDS
T00978
Name
(GenBank) PKD domain containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
phe
Pedobacter heparinus
Pathway
phe02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phe00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Phep_0242
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
PKD_5
K319L-like_PKD
CHU_C
FlgD_ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACU02468
UniProt:
C6XYY6
LinkDB
All DBs
Position
complement(280557..286520)
Genome browser
AA seq
1987 aa
AA seq
DB search
MVKRLLFFTFALLFLQISEAFSQITIGTVDAGPYTPGSSIAATFSINPTTCINRDNQFDL
VLVSPAGVELSTIGSYTGFYTTFINGTIPQGTLPGTGYKLRIKTTSPVLTPIAESNTFEI
KTGTAITAAVSSAPVITAPYIFGYCPGRPNAVFNFTNQSTATSTVTGTIKNELSGSIDAN
LTFTTAIQSFTASFAHYTVSIKAQMPDGTIGTRAYMVINNNVFNNFSTSGSNAFVCLPGG
FLQYGVDVNGPTGIQNNYPGNTYQIMWGDGVTDTYTFCDLKSGSVQHEYLRSSCGNPPYS
TGGGTVYNVFGINISVVSPCGQVGGAISTYVRVVDKPVNKFSHPAAACTGRPVTFVNNSI
LGQDPGSNSQVCSNNNVTYNWYVDGQIVLAGVPRSTNLVHTFPTHGVHDVKLESVTSGSC
EGAAITQQICIQDPPQPAFDFNGAPQTGCAPFTIQARDLSVIDNICNANNAYNWIVNGPA
GVQITNQGDKNPIFKFNNPGTYTIILEIQTASCGTVRTQIPQQIVLADGAPVATLSDNVT
LCALNTFTFDNNTGPTRTILTGTQQDLATTYTWSVTESDGSALAPGDFSFEGGTDLHTKF
PIIKFNQFKTYRIKVVHVNSCGQTDDFQLITFSPSPVPNVVTNANPICYDGVINLQGSIT
GGAYASFEWVGNGGSFSPATGNLTTTYTPSIAERNAGTTTIILRVNTGLQGACARVEFPL
VVNIRPNNTGTNATQQICTGNTVSHTPASTVVGSTYSWTVSNPDGNATGQLPGSGTAITD
VIINNSATANAVVIYTITPLSNGCSGVPYTFTVTITPRPVLTAIAAKSTICSNESSAITL
SSNLLNTRYTWTSSVTGNITGNNSVNTQTANSIIDDILINNSTTQGSVTYTITPFSATGC
PGTPVSVTVNVDPALTVANAGADKSICATTSYTMEGNTANVGTGTWTPVSANASGVTFAN
PNSPTTVVNGLSPGNSYTFRWTIDATSACSPTFDEVTITVNEPTIPGTTAGTPTIVCANN
NTGTISLSGNIGNVIRWESSLDGNTWIPIAGNNTTTTYTFNNLTVSTQFRAVVQNGGCTV
ENSTGTTITVSPASTIATAGADQVLCNEPTATLDGNTPAAGETGVWTHASGSPIAVITDP
ANPKTTVTGLTPGQTYRFVWTITGNAPCGPTFDDVTIRNNPPIVQNISSTSAVVCNGQEV
LLNGSAPTGGDGTNYTYSWEIKVDTGPWNLINNATDKDLIITLTTPGTVSFRRIVTSGGC
TSTSNEYSIVVQPAITGNNISADQIICSGTTPALLTGPAPTGGGGTFTYQWQSSPDGTVW
TNIGGANDIDYQPTALTTTTFYRRNASTLACGSLQVPSNTVKITVNPNAKAEFTWTNDKG
CVPFTLPVTVVHYVDRNATYTWYANTTVIGTGTTFPVYTIQNSNESVTIRLVVTSSLGCS
QDEFSHVFSTNQAVPASFTQNTTEGCGPLPVNFVNTSDLTAGATFSWDFGNGTSSTQANP
GTVTYQAEATGKDTTYVVTLTATTSCGSNSVTSTVLVKAKPVAIFSPSRTDGCSPMLVNF
TNTSPGGAGTTYFYDFGDGSPVIQRPDKSPVQHTYNTTVTTTFRATLTVVNECGTDIRAY
NIRVAPQNITPELVVDANEKEGCAPHTVNFDNNSIGASRFTFDFGDGSPIQTVLTTGRVP
HVYTMPGTFTITMTAYNSCSEISTTETVTVLPQPIADFDAVNKLGCTGLAVKFTNNTQNG
VSYLWDFGDGSPTSTEVEPTHVYTGSQEYYTVTLTAVNNLGCPMTVTKTNFIHIVQPPVA
AFNVNPSTLISIPDYTFNFEDQSTNTPTIWEWDFGDGTSSALRNPSHTYLDTGTYKVTLK
VTNQQGCFTTTFKNVTIKGVPGYLFVPNSFIPGDTRPELREFRAKGSGIANWRFSIFNKW
GQLLWETTKLEEGRPAEGWDGTFKGQPMPQGVYFWKIDVQMINGTEWKGMTYDKSVPKRT
GPIHLIR
NT seq
5964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtaaaacgtttactcttttttacatttgctctcctatttcttcaaatatctgaggct
ttttctcagataacgattggaacggttgacgctggaccttatacaccaggatcgagtatt
gcggcaacttttagtataaatccgacaacctgtatcaatcgtgacaatcagtttgatttg
gtgttagtatcacctgcaggagtagaacttagtacaattggaagttatactggtttttat
actacatttataaatgggacaatacctcaaggaacattaccaggaacaggttacaagctt
agaattaaaacgactagtcccgttctaacacctattgctgaatcaaatacttttgaaatt
aagacaggtacagctattactgccgcggtaagttcagcaccagtgataaccgccccttac
atatttggttattgtccgggcaggcccaatgctgtttttaacttcacgaaccaatccaca
gctacgagtacggtaaccggtacgattaaaaatgaactgagtggttcaattgatgcaaat
ctaactttcactaccgccatacaatcctttactgcttcattcgctcattatacagtaagt
ataaaggctcaaatgcccgatggtactattgggacaagagcttacatggttataaataat
aatgtatttaacaacttttccacttcaggatcaaatgcatttgtttgtttacctggaggt
tttctccagtatggtgtagatgtaaacggtccaaccggcatccaaaataactaccctggt
aatacctaccaaataatgtggggagatggcgttacagatacttatacattttgcgattta
aaatcgggatcagttcaacatgaatatttgagatcttcttgtggaaatcccccctatagt
acaggaggggggacagtttataacgtctttggcattaacatctctgttgtaagtccttgc
ggacaagttggcggagccatatcaacttatgttagagttgttgataaacccgtaaataaa
ttttcccaccccgctgctgcttgtacgggcaggccagtaacttttgtgaacaactcgata
ttgggacaagaccccggatccaattcacaggtctgcagcaataataatgtgacttacaac
tggtatgttgacggacaaattgttctggcaggcgtaccaagatctaccaatttagttcat
acttttcctacccatggagttcatgatgtaaaattggagtcggtaacaagtggctcttgt
gaaggtgccgccataacgcagcaaatctgtattcaggatcctccacagccagcgtttgat
ttcaatggggctccacaaacaggatgtgcaccatttaccattcaggcaagggacctctct
gttatagataacatttgtaatgcaaacaacgcttacaactggattgtaaatggcccagca
ggtgtacaaattacaaatcaaggagataaaaatcctattttcaagtttaataatccggga
acctataccatcattctggaaattcagactgcatcttgtggaactgtaagaacacagata
ccacagcaaattgtattggcagacggagctccggttgccacattatccgataatgtaaca
ttatgtgccttaaacacttttacctttgacaataataccggtcctacaagaaccattctt
acaggaacacaacaggacttggctactacatatacctggtctgttacggaaagcgatggt
agcgctcttgcgcctggagactttagttttgagggcggtactgatttgcacaccaaattt
ccaattattaaattcaaccagtttaaaacctacagaataaaggtcgtacacgttaatagc
tgtggacaaactgatgatttccaacttatcactttctctccttcaccagtccctaatgtt
gtcaccaatgcaaatcctatctgttatgatggggtaattaatctgcagggaagcattact
ggtggggcatatgcttcatttgaatgggtaggtaacggcggcagtttttcacctgcaacg
gggaatttgacaacgacttatacgcctagcattgccgaaagaaatgctggtacaacaaca
ataatattaagagtaaatactggtttgcaaggtgcatgtgcaagggttgaattcccacta
gtggtcaacatccggccgaacaacaccggtacaaatgcaactcaacagatctgtacaggc
aatactgtttcccacacccctgcttcaactgtcgtcggcagtacatatagttggacagtg
agtaatccagatggaaatgccacgggtcaacttcctggatccggaactgcaattacggat
gtcattatcaacaatagtgctacagcgaatgcagttgtaatctatactattactccactt
agtaacggctgctccggtgtgccatatactttcactgttacgataactccaaggcctgtt
ctgacagcaatagctgccaagtcaacaatttgcagtaatgaatcttcagctatcacatta
agctctaatttactaaataccagatatacctggacaagttccgttactggtaatattaca
ggaaataacagtgtaaatacgcaaacagcaaacagtataatcgatgatatactaattaat
aacagtaccacccaaggttcagtaacttataccatcacaccattctccgctacgggatgc
ccaggtacaccggtttctgttaccgtaaatgtagatcccgcattaacagttgccaatgca
ggggctgataaaagtatttgtgctactaccagctatacgatggaaggaaatacggctaat
gttggcacaggaacatggacacccgtatcagccaatgcctcaggtgttacctttgctaat
cccaatagccctactacagtggttaacggcctaagccctggaaatagctataccttcagg
tggacaattgatgccacaagtgcctgcagcccgacatttgacgaagttaccattaccgtt
aacgaacccaccataccaggaactacagctggaaccccaacaatagtttgcgccaataac
aataccggaaccatttccctgagtggaaatattggcaatgtgatcagatgggaaagcagt
ctggatggcaatacctggatcccgattgcaggaaataatactactacgacctataccttt
aataaccttaccgtttctacacaatttagggctgttgttcaaaatggcggttgtacagta
gaaaattctaccggaacaaccatcacagtatcccccgcatccaccattgcaactgcaggt
gcagaccaggtgctgtgtaatgagccgactgctacattggatggaaatactcctgctgca
ggtgaaacaggggtatggacacatgcctctggcagtccaattgcagtcataaccgatcct
gctaatcccaaaaccactgtaactggattaacaccaggtcaaacttatcgtttcgtatgg
actataacaggcaatgcgccatgcgggccaacttttgacgacgttaccataagaaacaat
ccaccaattgtccagaacattagcagtaccagtgctgtggtttgtaacggccaggaagta
ctccttaatggcagtgcaccaacgggcggcgatggaactaattacacctattcctgggaa
attaaagtagatacagggccctggaatcttataaataatgcaaccgacaaagacctgatc
attaccctcactacgcctggaacggtcagcttcaggagaatcgtaactagcgggggttgt
acttctaccagcaatgaatattccattgttgttcaacccgcaataacaggcaataacatc
tccgcagaccaaattatctgtagtggcactacacctgcattacttactggccctgcacca
acaggtggcggcggaacatttacctatcagtggcaatccagtccggatggaacggtatgg
acaaacattgggggtgccaatgacatagattatcagccaacagcccttaccacaaccact
ttttacaggcgtaatgccagcacccttgcctgcgggtccctgcaagttcctagtaataca
gttaaaataaccgttaacccgaatgcaaaagccgaatttacctggacaaacgacaagggt
tgtgttccttttaccctccctgtcacagtagtgcattatgtagataggaatgcgacttac
acttggtacgcgaatactacagttattggaaccggcacaacattccctgtttacaccatt
cagaacagtaatgaatcagtgacgatcagactggtggtaaccagtagcctgggttgttct
caggatgaattcagtcatgtatttagtaccaaccaggctgtaccggcatcatttacacaa
aacaccaccgaaggctgcggaccattacctgtaaattttgtaaacacttctgaccttact
gcaggagcaacattttcatgggattttggcaatggcacgagctcaacgcaagccaatccg
ggcactgtaacctaccaggctgaagcaaccggaaaagacacgacttatgtggtaacctta
accgctactacttcttgcggaagtaattccgttacttcaaccgtacttgtaaaagcaaag
cccgtagccatattttcaccaagcagaacagatggttgttcacctatgcttgtcaacttt
actaatacttctccgggtggtgcaggtactacttatttttatgatttcggcgatggcagc
cctgttatacagcgaccggataaatctcctgtacaacatacctacaataccacggtaacc
actaccttcagggccacgttaacagttgtaaacgaatgtggtaccgatatccgtgcgtac
aatatccgtgttgctccgcaaaacattacgcctgaactggtagttgatgccaatgaaaaa
gaaggctgcgcaccacataccgtcaattttgacaacaactctattggtgcatcccggttt
acatttgattttggcgatggcagtccaatccagactgtgctaaccaccggcagggttccc
catgtgtatactatgccaggcacattcaccatcacaatgaccgcctacaacagttgctca
gaaatctctactacagaaaccgttactgttctgccccagccaattgctgatttcgatgca
gtaaacaaattaggttgtaccggccttgccgttaaatttacaaacaacactcaaaacggg
gttagctatctatgggattttggagacggttctccaacttctacagaagttgaaccaacc
catgtctataccggcagccaggaatactataccgtgacgcttacagctgtaaacaacctg
ggctgcccaatgacggttaccaaaaccaacttcatccacatcgtacaacctcctgttgcc
gcctttaatgtcaacccttctaccctgatcagcattccggattatacctttaatttcgaa
gatcagagtaccaatacccctaccatctgggaatgggattttggcgatggcaccagttcg
gcactaagaaacccgagccatacctacctggatacaggcacctataaagtgacactcaag
gtaaccaaccagcagggctgctttaccactacttttaaaaatgtaaccattaaaggtgtt
ccgggctatttatttgtacctaattcttttataccgggcgatacacgtccggagctgcgg
gagttccgcgccaaaggatcgggaatcgctaactggcgcttcagcatctttaacaaatgg
gggcaactgttatgggaaacaaccaagctggaagaaggccggcctgccgaaggctgggat
ggcacatttaaagggcaacctatgcctcagggagtttacttctggaaaatagatgtgcaa
atgatcaatggaacagaatggaaaggcatgacctacgacaaatctgtacctaaacgaaca
ggaccaatacatttaatcagatag
DBGET
integrated database retrieval system