Pedobacter heparinus: Phep_1153
Help
Entry
Phep_1153 CDS
T00978
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
phe
Pedobacter heparinus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
phe02000
]
Phep_1153
Transporters [BR:
phe02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Phep_1153
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACU03371
UniProt:
C6Y3U2
LinkDB
All DBs
Position
1351677..1354868
Genome browser
AA seq
1063 aa
AA seq
DB search
MKRILLLFSMLILCFGLADAQQTRQITGKVTDKTSKQSIPGVSVTVKGAGNVVSTDEKGQ
FKINVPATGNIVLIARYVGYKPQEITVGNESKINFVLEENISSLDEVVINIGYGTVRKKD
LTGAVSSVGADVIAAAPVSSALEAIQGRVAGVNITSTEGSPDAEMVVRVRGGGSITQSNS
PLYIVDGFPVASISDIAPQDIESVDILKDASSTAIYGSRGANGVVLVTTKGGKSGKTNIS
YNVFTGTRKLANKLDVLTPFDYASWQYERALLSNALDVYTKYLGNYQDIDLYRNTPANDW
QELVFGRTGTTFNQNLNISGGGEKTKYSLSHSFVKDKSIMQLSSYERQNVNFKMNHKLYS
KLTLDVGLRYADTKTKGGGVNEQNEVSSADSRLKNAMIYPPFPIQGLTTTTETDDTFNLY
DPLVSISDNDQYIHRKTYNLSAALTYEIIDNLKLRSEVGYDGYRNDQDRFYGTTTYYVRN
VPTSENQNLPAIIFSNTNRNSLRNTNTLSYSFNKLLKKDHNLTVLAGQEFIKIEEGTMTN
VVHGFPKTFTFQNARVLSTQGKANSIDNNFSPDDKLLSFFGRANYDYLGRYLLSATFRAD
GSSKFSTENRWGYFPSVSAAWRISEESFMEDTKSWLADLKLRASYGTAGNNNIPPGQIAQ
TFQNSTTTWVNGFNSYWAPSKIMANPDLKWETTVTRNIGVDFALFNSKVTGTIDAYLNRT
NDLLIQFPVSGTGYDFQFRNIGKTQNKGLEFSASWNAVKKSNFDLSVNANISFNRNKVIS
LGTVKNINGTSGWASTEIGVDYLVEEGASIGRIYGYQSDGRYEVSDFTGYNAATGNWTLK
DGVADASTVISTLRPGSMKLKNLTGDLKIDQNDKTVIGNANPLHTGGFSINSRIYSFDIG
AFFNWSYGNDIYNANKIEYTSTSKYNSRNMISTMATGNRWTNLRADGTISNDPAELTAMN
ANTTLWSPYMRSFVLSDWAIEDGSFLRLSTITLGYTLPRNLSAKLKMQKLRLYASAYNLW
LLTDYSGFDPEVSTRRKTGLTPGVDYSAYPRSRSFVFGLNVNF
NT seq
3192 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaattttactattatttagtatgctcatcctatgtttcggattagcagatgcc
cagcaaaccaggcaaataacgggcaaggtaacagacaaaacgagcaaacaatctattccc
ggagtatctgtaactgtaaaaggtgccggcaatgtggtcagcacagatgaaaagggacaa
tttaaaataaatgttcctgcaaccggaaacattgttttgattgccagatacgtaggttat
aaacctcaggaaattacggtaggaaatgagtccaaaattaacttcgtactcgaagaaaac
atttcctcattggatgaagtggtgatcaatattggttacggtacagtacgtaaaaaagac
ctgacgggtgctgtttcttctgtaggtgcagatgtaattgctgctgcaccggtttcttca
gctttagaagctattcaagggcgtgtagcgggggtaaacattacttcaacagaaggctcg
cctgatgccgaaatggtggtaagggtaaggggcggtggctcaattacacagagtaattct
ccgctttacattgtagatggattcccggtagcctctatatctgacatcgcaccgcaggat
atcgaatcggttgatatcttaaaagatgcttcttccacagctatttatggttcaaggggt
gccaatggggtggtactggttaccacaaaaggtggtaaaagtggtaaaacgaatatcagc
tataatgtatttaccggtaccagaaaactagccaataaactggatgttttaacacctttt
gattatgcatcctggcagtacgaaagagcacttttgagcaatgcactcgatgtgtatacc
aaatatctgggcaactatcaggatatagacctttacagaaatacaccggccaacgattgg
caggagctggtttttggcaggacaggtactacttttaaccagaacctgaacatcagcgga
gggggtgaaaaaacaaaatatagccttagccatagttttgtaaaagacaaatccattatg
cagctctccagttatgaacggcaaaacgttaactttaaaatgaaccataaactgtacagt
aagcttacactggatgttggactacgttatgcagatactaaaacaaaaggcgggggcgta
aatgaacagaatgaggtatcttctgcagattcgcgtttaaaaaacgccatgatctatccg
ccatttccaatacaggggcttactacaactactgaaacggatgatacatttaatttgtat
gatccattggtatctatttctgataatgaccaatacatccaccgtaaaacctataattta
agtgctgcacttacctacgaaatcatagataaccttaagttgcgctcagaagtcggttat
gacggttacagaaatgaccaggaccggttttatggtacaacaacctattatgtaagaaat
gtacccaccagcgaaaaccagaaccttccagcaattattttttccaataccaacaggaac
agcctgagaaatacaaatacgctgagctatagcttcaataaactgttgaaaaaagaccac
aatcttaccgtattggccggacaggaattcattaaaattgaggaaggtacaatgaccaat
gtagtacatggcttccctaaaacatttacttttcagaacgccagggttttgtctacccag
ggtaaggcaaactccatagataataatttttcccctgatgataagcttttgtcgtttttt
ggcagggccaattatgattatctgggccgatatttgttaagcgcgacattcagggccgac
ggctcttcgaaattttcaactgaaaaccgctggggatatttcccttctgtttctgcagcc
tggagaatttcagaagagagctttatggaggatactaaatcatggctggcagacctgaaa
ttaagggccagctatggtactgcagggaataacaatattccacccggacaaatcgctcaa
acgtttcaaaattctaccaccacctgggtaaatgggtttaacagctattgggcaccatcc
aaaattatggccaatccggatttgaaatgggaaaccactgttacaaggaatattggtgtc
gattttgccctgtttaattctaaagttacaggtacaattgatgcctatttgaaccgcaca
aacgaccttttaattcaattcccggtttcaggaactggttatgattttcagttccggaac
attggaaaaacccagaataaaggtttagagttctcggcaagctggaacgcggtaaagaaa
tccaattttgatctgtctgtgaatgcaaatataagtttcaatagaaataaggtaatttca
ttaggtacagtaaaaaacattaacggtacatccggatgggcctcaacagaaattggtgtg
gattatctggtagaagaaggagcctcgattggcagaatttacggctaccagagtgatggc
aggtatgaagtttcagattttacgggatacaatgctgccacagggaactggacattaaaa
gatggtgtagccgatgcaagtacggttattagtacgctgcgtccgggatctatgaaactt
aaaaatcttacgggcgacctgaagattgatcagaacgataagactgtaattgggaatgcc
aatcccctgcatacaggtggcttttctatcaattccagaatctatagttttgatataggt
gctttctttaactggagttatggcaacgatatctataatgcaaataaaatagaatacact
tctaccagtaagtacaattcaagaaacatgatctcaactatggcaacgggcaatcgctgg
acaaacctgcgggcagatgggacgatcagtaacgatccggccgaattgactgctatgaac
gcgaataccacgctctggtcgccctatatgaggtcttttgtgttgagcgactgggccata
gaagatggatcttttttaaggttgtctaccataacactgggttataccctacccagaaat
ttatcagctaaactaaaaatgcaaaaattaagattatatgcatcagcttataatttatgg
ctgttaaccgattattcagggtttgaccccgaagtttcgacaaggcgcaaaacagggtta
acgccgggagttgattattcagcttatccaagaagcagatcttttgtttttggattgaat
gttaatttttag
DBGET
integrated database retrieval system
