Pedobacter heparinus: Phep_1328
Help
Entry
Phep_1328 CDS
T00978
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16091
Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
phe
Pedobacter heparinus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
phe02000
]
Phep_1328
Transporters [BR:
phe02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Phep_1328
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
SdrD_B
SpaA
EMC7_beta-sandw
NOMO_3rd
DUF2490
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACU03543
UniProt:
C6XSY2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1580222..1582618)
Genome browser
AA seq
798 aa
AA seq
DB search
MRITGILFFCLLPFFIRAQQLEISGKIKFRETAAEGATITLTTVNQRRISDANGGFSFKG
LPSGKYHVRVSFTGARRFDQTVEIKDKSIDIVVTLEEAQAVQLDEVDVTRVNDRVADKLM
QVEGTAIYAGKKTEVINLKNINANLATNNARQVYARIAGLNIWEYDGAGLQLGIGGRGLN
PSRVSNFNMRQNGYDISADALGYPESYYTPPTETLDRIEIVRGAASLQYGTQFGGMINFK
MKKGPTDKQLEFTSRQTLGSFGFFNSFNSVGGQVKKLNYYAFYQYKKGDSWRPNGHFDQN
TAYAHLDYAFTNKLKLTAEYTHMDYLAQQPGGLTDEQFEADPSVSVRARNWFKVKWNLFN
LSLDYQLGEHTKLNWINYHLAAGREALGVLSYINRPDPGEGTPRDLMADKYDNYGSELRV
LHQYSLFNNQTSSLLIGARAYKGLTFKKQGDADTGLGPDFNFLNSQPNKSDFRFPGTNLA
LFAENIFQITSKLSITPGARFEYIYTGAKGNYTQFQFGVPDLTRTDNKSNPRSFVLFGIG
TSYKPHPTIELYANISQNYRSINFTDLRVQNQNARVDSLLKDERGYTADGGVRGNLKDWL
YYDLSVFYLKYNDRIGSVFTTDANNMIYRLRTNVADSRNIGFESLIEADLLKAFTQGASK
YKLMAYTNFSLINARYIHTDNTAIKDKEVEFVPPLLFRTGLSFGNKTFNTSLQYAYVAQH
FSDATNAESTPTAVDGIVPAYQIVDFSASYNWKWFTLSGSINNLMNEKYFTRRADGYPGP
GILPSDPRTYYMTLQFKL
NT seq
2397 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaataaccggcatcttgtttttttgtcttctgcctttttttatccgtgcacagcaa
ctggaaatatccggaaaaattaaattccgtgaaacagcagcagaaggtgcaaccataact
ttaactacagtaaatcagcgtagaataagtgatgcgaatggtggctttagttttaaagga
ctgccatccggaaaatatcatgtccgtgtatcctttacgggagccaggcgctttgatcaa
actgttgaaataaaagataaaagcattgatattgttgtaacgcttgaggaagcacaagct
gtgcagttggatgaagttgatgtcaccagggttaacgatcgggttgccgataagctgatg
caggtagaaggaactgcaatttatgccggaaaaaagactgaggtcatcaatttaaaaaac
atcaatgccaacctggctaccaataatgcaaggcaggtatacgcccggattgccggtctg
aatatctgggagtatgatggtgctgggctacaattgggtattggtggtcgtggcctgaac
cccagcagggtatcaaactttaatatgaggcaaaacggatatgatattagtgccgatgct
ttgggctatccagaaagctattataccccaccaaccgaaactttagatagaatagaaatt
gtacggggtgccgcaagcttacaatacggcacacaatttggcggtatgattaattttaag
atgaaaaagggtcctacagataagcaacttgagtttacaagcaggcaaaccctcggctcg
tttggttttttcaactcttttaacagcgttggcggacaagtaaaaaaactaaattattat
gctttttatcaatataaaaagggtgatagctggcgaccaaacggtcactttgaccaaaat
accgcttatgcccacctagattatgcctttaccaacaaactaaagttaactgccgaatat
acccatatggactacctggcacaacaaccaggaggcttaaccgatgaacagtttgaagca
gatccttcagtatctgtaagggctagaaactggtttaaggtaaaatggaatttatttaac
ttaagccttgattaccagctcggcgagcataccaaactcaattggataaactatcattta
gctgctggcagggaagctttaggggttttaagctatatcaatcgccctgatccgggtgaa
ggcacaccaagggatttgatggctgataaatatgacaattacggttcagaactcagggta
ttgcaccaatacagtttatttaacaaccagaccagcagtttactcataggtgcaagagca
tataaggggttaacatttaaaaaacagggcgatgcagatacgggattaggacctgatttt
aactttttaaacagtcaacccaataagtccgatttccggtttccgggtacaaatttagcc
ttgtttgcggagaacatttttcagataaccagtaaattgagtattacccccggtgcccga
ttcgagtatatttataccggcgctaaaggaaattacacacaatttcaatttggtgttccc
gatttgacaagaaccgacaacaaaagcaacccacgctcatttgttctctttggcataggc
acttcttataaaccacaccctaccattgaactttatgccaatatttcccaaaactacagg
tcaatcaattttaccgatttaagggtacagaatcaaaatgcaagggttgattctttattg
aaagatgaaagaggctacactgctgatggtggtgtaagagggaatttaaaagattggctg
tattatgatttaagtgtattttatcttaaatacaacgacaggattggctcagtttttacc
accgatgccaacaatatgatataccggttaagaacaaacgtagcagatagccgaaatatt
ggtttcgaaagtttgatagaagctgatttattaaaggcttttactcaaggtgcaagtaag
tataaactgatggcttataccaatttttcgttaataaatgcgcggtatatccatacagat
aatacagcaataaaagataaagaagtagaatttgtaccaccactattgtttcgtacaggg
ctatcgttcgggaataaaacatttaataccagtttacaatatgcttacgtagcacaacat
ttttctgatgctaccaatgcagaaagtacaccaacagcggtagacggtattgtgcctgcc
taccaaattgtcgatttttcggccagttacaactggaagtggtttaccctgtcgggcagc
atcaataacctgatgaacgaaaaatactttacacgcagggcagatgggtatcccgggcct
ggaatactaccttccgatccgcgtacttattatatgaccttacaatttaaattataa
DBGET
integrated database retrieval system