KEGG   Pedobacter heparinus: Phep_1328
Entry
Phep_1328         CDS       T00978                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K16091  Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
phe  Pedobacter heparinus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:phe00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:phe02000]
    Phep_1328
Transporters [BR:phe02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   Phep_1328
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Plug SdrD_B SpaA EMC7_beta-sandw NOMO_3rd DUF2490
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACU03543
UniProt: C6XSY2
LinkDB
Position
complement(1580222..1582618)
AA seq 798 aa
MRITGILFFCLLPFFIRAQQLEISGKIKFRETAAEGATITLTTVNQRRISDANGGFSFKG
LPSGKYHVRVSFTGARRFDQTVEIKDKSIDIVVTLEEAQAVQLDEVDVTRVNDRVADKLM
QVEGTAIYAGKKTEVINLKNINANLATNNARQVYARIAGLNIWEYDGAGLQLGIGGRGLN
PSRVSNFNMRQNGYDISADALGYPESYYTPPTETLDRIEIVRGAASLQYGTQFGGMINFK
MKKGPTDKQLEFTSRQTLGSFGFFNSFNSVGGQVKKLNYYAFYQYKKGDSWRPNGHFDQN
TAYAHLDYAFTNKLKLTAEYTHMDYLAQQPGGLTDEQFEADPSVSVRARNWFKVKWNLFN
LSLDYQLGEHTKLNWINYHLAAGREALGVLSYINRPDPGEGTPRDLMADKYDNYGSELRV
LHQYSLFNNQTSSLLIGARAYKGLTFKKQGDADTGLGPDFNFLNSQPNKSDFRFPGTNLA
LFAENIFQITSKLSITPGARFEYIYTGAKGNYTQFQFGVPDLTRTDNKSNPRSFVLFGIG
TSYKPHPTIELYANISQNYRSINFTDLRVQNQNARVDSLLKDERGYTADGGVRGNLKDWL
YYDLSVFYLKYNDRIGSVFTTDANNMIYRLRTNVADSRNIGFESLIEADLLKAFTQGASK
YKLMAYTNFSLINARYIHTDNTAIKDKEVEFVPPLLFRTGLSFGNKTFNTSLQYAYVAQH
FSDATNAESTPTAVDGIVPAYQIVDFSASYNWKWFTLSGSINNLMNEKYFTRRADGYPGP
GILPSDPRTYYMTLQFKL
NT seq 2397 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagaataaccggcatcttgtttttttgtcttctgcctttttttatccgtgcacagcaa
ctggaaatatccggaaaaattaaattccgtgaaacagcagcagaaggtgcaaccataact
ttaactacagtaaatcagcgtagaataagtgatgcgaatggtggctttagttttaaagga
ctgccatccggaaaatatcatgtccgtgtatcctttacgggagccaggcgctttgatcaa
actgttgaaataaaagataaaagcattgatattgttgtaacgcttgaggaagcacaagct
gtgcagttggatgaagttgatgtcaccagggttaacgatcgggttgccgataagctgatg
caggtagaaggaactgcaatttatgccggaaaaaagactgaggtcatcaatttaaaaaac
atcaatgccaacctggctaccaataatgcaaggcaggtatacgcccggattgccggtctg
aatatctgggagtatgatggtgctgggctacaattgggtattggtggtcgtggcctgaac
cccagcagggtatcaaactttaatatgaggcaaaacggatatgatattagtgccgatgct
ttgggctatccagaaagctattataccccaccaaccgaaactttagatagaatagaaatt
gtacggggtgccgcaagcttacaatacggcacacaatttggcggtatgattaattttaag
atgaaaaagggtcctacagataagcaacttgagtttacaagcaggcaaaccctcggctcg
tttggttttttcaactcttttaacagcgttggcggacaagtaaaaaaactaaattattat
gctttttatcaatataaaaagggtgatagctggcgaccaaacggtcactttgaccaaaat
accgcttatgcccacctagattatgcctttaccaacaaactaaagttaactgccgaatat
acccatatggactacctggcacaacaaccaggaggcttaaccgatgaacagtttgaagca
gatccttcagtatctgtaagggctagaaactggtttaaggtaaaatggaatttatttaac
ttaagccttgattaccagctcggcgagcataccaaactcaattggataaactatcattta
gctgctggcagggaagctttaggggttttaagctatatcaatcgccctgatccgggtgaa
ggcacaccaagggatttgatggctgataaatatgacaattacggttcagaactcagggta
ttgcaccaatacagtttatttaacaaccagaccagcagtttactcataggtgcaagagca
tataaggggttaacatttaaaaaacagggcgatgcagatacgggattaggacctgatttt
aactttttaaacagtcaacccaataagtccgatttccggtttccgggtacaaatttagcc
ttgtttgcggagaacatttttcagataaccagtaaattgagtattacccccggtgcccga
ttcgagtatatttataccggcgctaaaggaaattacacacaatttcaatttggtgttccc
gatttgacaagaaccgacaacaaaagcaacccacgctcatttgttctctttggcataggc
acttcttataaaccacaccctaccattgaactttatgccaatatttcccaaaactacagg
tcaatcaattttaccgatttaagggtacagaatcaaaatgcaagggttgattctttattg
aaagatgaaagaggctacactgctgatggtggtgtaagagggaatttaaaagattggctg
tattatgatttaagtgtattttatcttaaatacaacgacaggattggctcagtttttacc
accgatgccaacaatatgatataccggttaagaacaaacgtagcagatagccgaaatatt
ggtttcgaaagtttgatagaagctgatttattaaaggcttttactcaaggtgcaagtaag
tataaactgatggcttataccaatttttcgttaataaatgcgcggtatatccatacagat
aatacagcaataaaagataaagaagtagaatttgtaccaccactattgtttcgtacaggg
ctatcgttcgggaataaaacatttaataccagtttacaatatgcttacgtagcacaacat
ttttctgatgctaccaatgcagaaagtacaccaacagcggtagacggtattgtgcctgcc
taccaaattgtcgatttttcggccagttacaactggaagtggtttaccctgtcgggcagc
atcaataacctgatgaacgaaaaatactttacacgcagggcagatgggtatcccgggcct
ggaatactaccttccgatccgcgtacttattatatgaccttacaatttaaattataa

DBGET integrated database retrieval system