Prevotella herbatica: prwr041_04560
Help
Entry
prwr041_04560 CDS
T08008
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
pher
Prevotella herbatica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
Y_Y_Y
HTH_18
HisKA
SGL
HTH_AraC
DUF5074
HATPase_c_5
HATPase_c_3
DUF2139
He_PIG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCS84563
LinkDB
All DBs
Position
complement(612509..616351)
Genome browser
AA seq
1280 aa
AA seq
DB search
MQDGLRSNAVRNLVQDKFGFIWLGTDNGLCRYDGINVHYYTILQQGTDQFISALQNTDKG
LLVGTAHGAYLFDYKSETFIPFARVIRKQINHFSPDADGNIWMATMGQGVVRYNPKTGYS
RLYHFAANKDNISQVFVDSRNQIFAITNWGKYSIYKLNKATNCFIPLNTHGGNYGSLAIT
KAYDGSILLGTWENGLCRINDDGSIETLLSPSLSGTAHHIHTLFAQSSQTVLIGCDDGLI
SFNPQTGQWHVVNEHAEGRVSLSEKFIYSIMCDNEGGLWFGTFYGGANYLSPVGERFSNY
TCHDKVNGFCGNVISRFCEDSNGSLWIASDDGGLNRMSVSSHKFISYPGSATLSKYNVHA
LCNDGKYLWIGTYTNGVIRLDKSTGAMKKYTQQQGLYGSSSYAIYKDHNGNIWAATMEGI
NCYDSSTDSFRKICLTEGLTIDIKEDKNGFMWFATQGGGLIKYNVVTKRFKTYRHSKKQG
SISSDQINCIHIGENAQILIATSNGICKYEQHSDTFKPILLDADIADVGSIIEDQGILWI
STIHGIIRYAKGESLQLFNRYDGLYSEIFQPNAGIKTSDGCIYFGTTSGFIGFYPYQIKA
NNIPPAVYITGLELFNKPVNVGDDRLPESLNSIKKLNLSYKDHMFSISFASLSYCSPEKN
QYAYMLDGFDKEWNYVGNQHKATYTNIPAGTYTFRVKATNNDGLWSSKEATLLIVIHPPF
WWTLPAKLIYIILILAAIYFSMQYKLKGAENKHKEEIRKLNIKQEEDTRKARLNFFTMIA
HEIRTPVTLIIGPLESIKNELCEKHSAFSSQLSIIDRNAHRLLELVNQLLDFSKVQQQGL
LVNYDSCNIAELLSSVAERFAPSFHQKGISFYATYPPKDFVAVIDREGITKVVSNLMSNA
LKYSRSLVKLDCSVNPIDNTFTIVVEDNGDGISKTDLKRIFNPFFQASDNKPGTGIGLSI
VKQIVEQHHGTVNVVSEKGKGAKFIITLSDAINEKTDKQAVASESISQENTNADSYQSDE
LDNNTQSNISESVPTMLIVDDDPDMLTFISSNFAKSYTLFTAQNGVEALEILHKKTVSLI
VSDWMMPEMDGAELCRRIRKDYTISHIPFIMLTAKTDNDSKAESMDCGADAYIEKPFSMK
YLEACIRNMIEMRHLLMQKFSSLPSEPISRIANTTVDDEFLTHMNAIIEDNISNTELNVA
FLASELGISRSGLFAKIKALADVTPNEMIQVIRLRRAAVLLQQNKYRINEVCYMVGFNSP
SYFTKCFQKQFGTKPGEHLA
NT seq
3843 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaagatgggctgcgttcaaatgcagtcaggaatcttgtccaggataaatttggtttc
atttggcttggcactgataatggactgtgtcgatatgatggaataaacgttcattactat
acgatcttacagcagggaactgatcaatttatatctgcattgcaaaataccgataaaggt
ctgttagtcggtacagctcatggcgcatatctgtttgattataagtcggagacgtttata
ccatttgcaagagtaatacgaaagcagataaatcatttttctcctgatgcagatggtaat
atatggatggctacaatgggacaaggcgttgttagatataatcctaaaacagggtattct
cgtttatatcattttgcggcgaataaagacaatatatcacaggtgtttgttgatagtcgt
aatcaaatttttgccataacaaattggggtaagtattcaatttataaactaaacaaagcc
accaactgttttattcctttgaatacccatggtggtaattacggatctttggcaataacc
aaagcttatgatggtagtattctgttgggaacatgggaaaatgggctctgcagaataaat
gatgatggaagtattgaaacattattgagtccttcactatcaggaacagcacaccatatc
catacgcttttcgcccagtcatcccaaacggtgcttattggttgcgatgatggcttgatt
tcttttaatccgcagacagggcagtggcatgttgtgaatgaacatgccgaaggaagagtc
tcgctaagtgagaagtttatttattcaatcatgtgtgacaatgaaggaggattatggttt
ggcacattttatggtggagcaaattatttgtcgcctgttggagaacgtttctctaattat
acatgtcacgacaaagtaaacggcttctgcggaaacgtaatatctcgtttttgtgaagat
agtaacggcagtctttggattgccagcgatgatggcggacttaatcgcatgtctgtttct
agtcataaatttatatcctatccgggaagtgccacactttctaagtataatgttcatgcg
ttgtgcaatgacggtaaatatttatggataggaacatatacaaatggagtcattcgtttg
gataagtctactggtgctatgaagaaatacacacagcaacagggactttatggcagcagt
agttacgccatttataaagaccataatggaaatatatgggctgccacgatggaaggcata
aattgctatgattcatctactgattcgtttcgtaaaatatgtctcacagaaggactaaca
atagatattaaagaggacaaaaatggctttatgtggtttgccactcaaggtggaggactt
ataaaatacaacgtcgtcacaaaaagatttaagacatatcgtcatagcaagaagcaaggc
tctatatcttcagatcagattaactgcattcatataggcgaaaacgctcagattcttatc
gctacatctaatggtatctgcaaatatgaacaacattccgacacgttcaaacctattctt
cttgatgccgatatagccgatgttggaagtattattgaagatcagggaattctttggata
tcaaccatccatggtatcatcagatatgccaaaggagagagtctgcagttgtttaatcgc
tatgatggtctttattcagaaatttttcaacctaatgcgggtataaagacatcagacgga
tgcatctattttggaacaacaagtggctttattggtttctatccataccagataaaggca
aacaatattccgccagctgtatatatcacgggattagaactctttaacaagcctgttaat
gtaggtgatgacaggttgccggagtcgcttaacagtataaagaaattaaacttgtcgtat
aaggaccacatgttcagcatatcttttgcgagtctaagctattgcagccctgaaaaaaat
caatatgcctatatgcttgatggatttgacaaggaatggaactatgttggcaatcagcat
aaagcaacatatacaaatatacctgccggaacatatactttcagggttaaggctaccaat
aatgacggattgtggagttcaaaagaggcaacgcttcttattgttattcatccaccattc
tggtggactctgcccgcaaagcttatatacattatattgatattagcggcaatatatttc
agcatgcagtataaactgaaaggtgcagaaaacaagcataaggaggaaatacgcaagtta
aatattaaacaggaagaggatacacgtaaggcaaggcttaacttctttacgatgatagca
catgagattcgcactcctgtgactcttattatcggaccgctagagagcatcaaaaatgaa
ttatgcgagaagcactctgcttttagttcgcaattatctattattgatcgtaatgcacac
cgtttgctagaacttgtaaatcaattgttggatttcagtaaggttcagcaacaaggtctg
cttgttaattatgattcgtgtaatatagccgaactgttgagttctgtcgcagagaggttt
gctccgtcttttcatcaaaagggcatttctttttatgcaacatatccccctaaagatttt
gtagctgtaatagaccgtgagggaataactaaggttgtaagcaatttgatgtcaaacgct
cttaaatattctcgttcacttgtaaaacttgattgcagtgtaaatcctatcgacaatacg
tttactattgtggttgaagataatggcgacggaataagtaagactgacttgaaacgcatc
ttcaatccattctttcaggctagcgacaataagccaggaacaggtattggattgagtatt
gttaagcagatagtagaacagcatcatggaacggtgaatgttgtatctgaaaaaggaaaa
ggggcaaagtttatcattactttgtcggatgcgataaatgaaaagactgataaacaagca
gtagctagtgaaagcatctcacaagaaaacacgaatgcagatagttatcaaagtgatgaa
ttagacaataatacgcagtcaaatataagcgagtctgttccaacgatgctcatcgttgat
gatgatcctgatatgctgacattcatatcatctaattttgccaagtcatatacattgttt
acagcacagaatggagttgaggctttagaaatattacataagaagacagtttcattgatt
gtcagtgactggatgatgccagaaatggatggtgctgaattgtgccgcagaatacgtaaa
gattatacaataagtcatattccttttatcatgcttacagccaagacggataacgattcc
aaagcagaaagtatggattgtggtgcagatgcatatattgaaaagcctttctcaatgaaa
tatttagaagcctgtattcgtaacatgatagaaatgcgtcatttgcttatgcagaagttc
tcaagtctgccatctgaaccaatttctagaatagcaaatacaacggttgacgacgaattt
cttacgcatatgaatgctattattgaggacaatatatctaatacagaactcaacgtggct
tttcttgcttctgaactcggaataagccgaagcggactgtttgcaaagataaaggctttg
gctgatgttacgccgaatgaaatgatacaggtgataagactccgccgtgcagctgtgctt
ttgcagcaaaacaagtatcgtataaatgaagtgtgttacatggtgggattcaacagtcca
agctattttacaaagtgttttcaaaagcaattcgggacaaagccgggagaacatttggca
tag
DBGET
integrated database retrieval system