KEGG   Prevotella herbatica: prwr041_04780
Entry
prwr041_04780     CDS       T08008                                 
Name
(GenBank) RagB/SusD family nutrient uptake outer membrane protein
  KO
K21572  starch-binding outer membrane protein, SusD/RagB family
Organism
pher  Prevotella herbatica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pher00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pher02000]
    prwr041_04780
Transporters [BR:pher02000]
 Other transporters
  Accessory factors involved in transport [TC:8]
   prwr041_04780
SSDB
Motif
Pfam: SusD_RagB SusD-like_3
Other DBs
NCBI-ProteinID: BCS84585
UniProt: A0ABM7NVQ0
LinkDB
Position
complement(653036..654742)
AA seq 568 aa
MKKIIIYAFVAITLMFSGCNDMLDKSPRDTFTNNTTFWSNANAVESYSNKFYDNYIGYNS
KGDLGWFYFKSFSDDQVNPTFDDWTYKTIPSTSSDWTDGSKEIRRVNYLIQGLSSSSLTN
GEKARFMAIGRLNRAWEYYQMVRKFGNMQWMQDVITDPDDNRIYGSRTDRDVVIDSVLSD
LNYAVANLDDVSDKTAWSKQMALAMKSDVCLYEGTFCKYRTTADNGKAPDLSRAQKYLNE
SVTASEAIMNSGKFALSTNYGDIYNSLSLGSNKEIIFYRNYEKDMVMHSLVDYTCNSTEQ
FGISKDAFDAFLFLDGKPKANTTLNTDDKAVINSGGNYSVSRMLSQRDKRLSLLVDSIIS
FAGHGWARVNNMGVSASPQMTSSTGYTVRKYDNMSLDSYYRINIGTGYTDAPLYWYAVIL
LNEAEAKAELGTITQSDLDKTINLLQSRVGLKPMTLLPDADPANNMGVSNLLWEIRRCRR
CELMTDNWYRYWDLVRWHQLDKLDTSKNPDIMLGANLSNISNVGVNVTTDKYMIGNTKTR
TYDSKYYLYPIPTGQITLSPETGQNLGW
NT seq 1707 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaagattataatatatgcctttgtagcaatcactttgatgttctctggctgcaat
gatatgctggataagtctcctcgtgacacatttacaaataataccactttctggagtaat
gccaatgcggttgagagctacagtaacaaattctatgataactatattgggtataattca
aagggtgatttgggatggttctatttcaaaagcttttctgatgatcaggtaaacccaacg
tttgatgactggacttataaaacgattcctagtacctcaagcgactggactgatggttcc
aaagagatacgtcgtgtaaactatctcattcagggattgtcttcttcatcacttacaaat
ggagagaaagcacgctttatggcgattggacgtttaaatcgtgcatgggaatattatcaa
atggtaagaaagtttggtaatatgcagtggatgcaagatgtaatcacagatcctgatgac
aatagaatttatggttcacgtacagaccgtgatgttgtcatagattcagtgcttagtgat
ttaaactatgccgtagctaatcttgatgatgtaagtgataagacggcatggagcaaacag
atggcattggcgatgaagagtgatgtatgcctttatgagggtacattctgcaagtatcgt
acaactgctgataatggaaaggcacctgatttgtcacgtgcacagaaataccttaacgag
tcagttacagcttccgaggcaatcatgaactctggtaagtttgctttgagtaccaattac
ggagacatatataattcactttctcttggtagtaataaggagataatattctatcgtaat
tacgaaaaggatatggttatgcattcgttagtggactatacctgtaattctacagagcag
tttggaatctctaaggatgcctttgatgcatttctgtttcttgatggcaagcctaaagcg
aataccactctaaatacagacgataaggctgtaatcaattctggtggcaactattctgtt
agcagaatgctttctcaaagagataaacgtttaagtttacttgtagactctattataagt
tttgctggtcatggatgggcgcgtgtcaacaatatgggcgtttctgcttctcctcagatg
acatcttctacaggatatacagtaagaaagtatgataatatgagccttgattcatattat
cgcattaatattggtactggatatacagatgctccgctttattggtatgccgtgatatta
ttgaatgaggcagaagctaaggctgagttgggaactattacgcaatcagatcttgacaag
actattaatcttttgcagagtcgcgtaggattaaagccgatgacattgctacctgatgcc
gacccagcaaacaatatgggagtaagtaatctattgtgggagattagacgatgcagacgt
tgtgagcttatgacagacaattggtatagatattgggacttggtgcgttggcatcagtta
gataaacttgatacaagcaagaatcctgatattatgcttggagcaaatttaagcaatatc
agtaatgtaggtgttaatgtaacaacagataaatatatgattggtaatacaaaaactcgc
acatacgatagcaagtattacctttatcctatacctaccggacaaattactctaagtcct
gaaacaggacaaaaccttggttggtga

DBGET integrated database retrieval system