Prevotella herbatica: prwr041_11620
Help
Entry
prwr041_11620 CDS
T08008
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
pher
Prevotella herbatica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Reg_prop
HATPase_c
Response_reg
HTH_18
HTH_AraC
HisKA
SGL
Y_Y_Y
HATPase_c_3
RIFIN
HPTransfase
HATPase_c_2
DUF2254
HTH_8
Rrf2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BCS85269
LinkDB
All DBs
Position
complement(1578874..1582854)
Genome browser
AA seq
1326 aa
AA seq
DB search
MKCFLILLSLLFTVNTNAQIGKLYNGDNQLSSSFVNNVFQDKDGYMWIATRNGLNRYDGY
QFKILKKENKVFGLTSNYINCVYQDSQGTLFIGTNNGVQKMVNGKFEDFVLLRPNGKRIK
TYITGILQLKNGDIIVSSSGYGVMKLKGKYGTPYAKIPKNTNYIVHMLEDKHGQLWLVTE
DKGLLCIKGNSIKQYFLSANEKASIKDGDICEDKKGNIYVGTNGMGLWKLNNGAKQFALI
KSTAKMPIKDLYIDHQGNVLLGCDGIGLYVYYPNTGQLSANPFYSNDISLPKTKIQTIVE
DRNGNIWLGMMQKGVFMQPAKRRNFGYMGPKLGTFNYIGTNCVTSIIQDTRRRLWVGTDK
DGLYLLDSNKKLIRHYTNVPGAILCMSEDKFGRIWIGSYQQGCGWVDGESAAYHPVDIKA
GGSSSIFGMDVDKSGNIWFATMGQGLIRLNLTDYSITQYRMKEGADLNRHINSLPNDYLA
KIKVSHDGTKIYVASSVGMSCLDIKSGSWLSVFGNNCPNYATFSRIVCEDHQGHIWMGTN
DGLYCYNLKSRQSKMYTMQNGLPDNGIACIEQDKKGRLWIGTDHGLCCMTTEGKVISCYY
ANNGLQSNEFSDGASFVCKDGHTMYFGGTDGINWFDAIKTNNMSWKANVIITGIIIGNKE
RNTDIMGDNFNLEYEDNSFSIHLSTLTYDDPNNITYLYSINGEEWTRLQPGMNEITFSHL
SPGTYKFRVKAMYNNMSSQIKEFTMHISSPWYSSTVAYILYLIIIGVIIYFIYHYQKRKE
YDRMQIQEHIHAEQMGEAKLRFFMNISHDIRTPMTLIVSPLLQLIKEDDDMHRRSVYETI
KRNAERILHLINQMMDLRKIDKGMLTMHMQETDMVNFIDDVYSLFSDQAKIKDIDFNFTH
DSDALSLWIDRHNFDKVLVNIISNAFKFTPTGGKIDIELTHNDSEANITIRDNGEKIPEE
NIKRIFERFYQAQNSANDNNMGTGIGLDLARSLVELHYGDIQAHNIENGDGCEFVVTLPL
GNSHLKPEEMVTEDDDNKKTDLIELSEENDLSGVEDNKMSPDKIDILNEQLSNRKRQTIV
IAEDDDEIRQYLERELSGDFYVIACPNGKEALTAIMKEIPSLIISDVMMPVMDGNELCSR
VKSNINTNHIPVIMLTAKSRDEDRLEGLEMGADTYIVKPFNLDILRRTIINLLHQRELLR
NKFNGSESQENNLEKINVESPDNKLLNRIMSVINNNLSDPSLNVDMIAQEVGISRVHLHR
KMKELTNQTPHDFIRNLRLKQAAHLLEQGYQNITEVMFACGFTNPASFSTMFKNLYGRSP
REYMKN
NT seq
3981 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatgctttttaattttactatcactactatttactgttaataccaatgcacagatc
ggcaaactatacaatggggacaaccaactgtcaagtagttttgtcaacaatgtttttcaa
gacaaggacggttacatgtggattgcaacacgcaatggtttgaacagatatgacggatac
caattcaaaattttgaaaaaggaaaacaaggtattcggactaacaagcaactatattaac
tgtgtataccaagacagccaaggaacattattcattggcacaaataatggtgtgcagaaa
atggttaatggaaaatttgaggattttgtcctacttaggccaaacggcaaaagaataaaa
acatacataacagggattctgcaacttaaaaacggtgatatcatcgttagtagttctgga
tatggagtaatgaaactaaaaggaaaatatggaactccttatgctaaaatacccaaaaac
acgaattatatagttcacatgctggaggacaaacacggtcaactgtggttggttacagaa
gacaagggattactatgcattaaggggaacagtataaaacaatattttcttagtgcaaac
gagaaagcatccataaaagacggggatatttgcgaagacaaaaaaggaaacatatatgta
ggcaccaatggaatgggactatggaaattaaacaacggtgcaaaacagtttgcgctgata
aagtctactgccaaaatgcctatcaaagatttatatattgaccatcaaggaaatgtattg
cttggatgcgacggtatcggattatatgtttactatcctaacactggtcagctttcagca
aatccattctatagcaatgacataagtcttcctaagacaaaaatacaaactattgttgaa
gaccggaacggaaatatatggcttggaatgatgcaaaagggcgtattcatgcaacctgct
aaaagacgaaatttcggatacatgggtccaaaacttggaacgttcaattatataggaaca
aactgcgttacaagtatcattcaagatacccgacgcagactatgggttggtacggataaa
gatggattatatcttctggatagcaacaaaaaactgataaggcactacacaaacgttcct
ggagcgattttgtgcatgtctgaagataaattcggacgtatctggattggcagctatcag
cagggatgcggatgggttgacggagaatccgcagcataccatcctgttgacataaaagca
ggaggtagttcaagcatattcggtatggatgttgacaaaagtggcaacatctggtttgct
actatgggacaaggacttataagactaaatctcaccgactatagcatcacacaatacaga
atgaaagagggtgccgatcttaacagacatattaactcacttccaaacgactatcttgcc
aagattaaagtttcacatgacggaacgaaaatatatgtggctagttctgtaggaatgagt
tgtcttgatataaagagcggtagctggctcagtgttttcggaaacaactgtccaaattat
gctactttctcacgcattgtatgtgaagatcatcaaggacatatatggatgggtacaaac
gatgggctttactgctataatcttaaaagcagacaaagtaaaatgtacaccatgcaaaat
ggtctgcctgataatggaattgcctgtattgaacaagacaagaaagggcgtttgtggata
ggaactgaccatggattatgctgtatgacaacagaaggaaaggtgataagttgctactat
gctaacaatggtcttcaaagtaatgaattctcagatggagcatctttcgtgtgtaaagac
ggacacacgatgtatttcggaggtactgatggtatcaactggtttgatgcaattaagacc
aacaacatgtcgtggaaagcgaatgttattattacagggataataatcggcaataaagaa
agaaatactgatattatgggcgacaatttcaatctggaatatgaggacaattctttttct
atccacctttctacgctcacatacgatgatccaaacaatattacttacctatacagtata
aacggtgaagagtggactcgtctgcaaccaggcatgaatgagattactttcagccacctt
tctcctggtacatataagttccgagtaaaagccatgtataacaacatgtcttcacaaata
aaggaattcactatgcacatatcttcaccatggtatagttctacggttgcttatattcta
tatttaatcatcatcggcgtaataatatatttcatataccattatcaaaagcgcaaggaa
tatgaccgaatgcagattcaggagcatattcatgcagaacagatgggtgaagctaagttg
aggtttttcatgaacatcagccatgatatacgcacccctatgacgcttatagtctcacca
ttgcttcaattaatcaaggaagatgatgatatgcatcgtcgaagtgtgtatgaaacgata
aagagaaatgccgagcgcatacttcatcttattaatcagatgatggaccttagaaagatc
gataagggtatgcttactatgcacatgcaagagactgatatggtgaatttcatagatgat
gtttattcattgttcagcgatcaagcaaagataaaagacattgatttcaattttacccac
gatagtgatgccttgtctttatggatagacagacacaacttcgataaagtattggttaat
atcatctcgaatgcattcaagttcactcctactggtggaaaaattgatattgaacttacg
cataacgattctgaagcaaatattaccataagagacaacggagaaaaaattccggaagag
aatatcaaacgcatttttgaacgcttttatcaagctcaaaactccgcaaacgataataat
atgggcactggaataggacttgaccttgcccgttcgttagtagaacttcattatggtgat
attcaggcacataacattgagaatggtgacggttgtgaatttgtcgttacgctaccactt
ggcaattcacatcttaaaccagaagagatggtcaccgaagatgatgataacaaaaagact
gatttaattgaactgagcgaagagaatgatttgtctggcgttgaagataataaaatgagc
cctgataagattgacatcctcaacgagcagttatctaaccgtaagagacaaacgatagta
atagcagaggatgatgacgaaatcagacaataccttgagcgcgaattatctggagatttc
tacgtaatagcttgtccaaatggtaaggaagctttaacggctatcatgaaagaaattcct
tctcttattattagcgatgtcatgatgcccgtcatggacggtaacgaactttgttcacgc
gtaaagagcaatatcaatactaaccatatccctgttataatgcttactgctaaaagccgt
gacgaagaccgacttgagggattggaaatgggtgctgatacatatatcgtaaagcctttc
aatctggatatacttcgacgcacgatcataaacttgctacatcaacgtgaactactgcgt
aataaattcaacggatctgaatcacaagagaacaaccttgagaagataaatgttgaatca
cctgataacaaacttctaaaccgcattatgagcgtcataaacaataaccttagcgaccca
tccttaaatgtggacatgattgctcaggaagttggaattagtcgtgtacacctacataga
aagatgaaggaactaacaaatcaaactcctcacgacttcatacgcaacctaagattaaaa
caggcagcacatttattggaacagggataccagaatattactgaagtaatgttcgcatgc
ggattcacaaatccagcatcattctcaacaatgttcaaaaacctatacggtaggtctcca
cgtgaatatatgaagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
