KEGG   Prevotella herbatica: prwr041_25360
Entry
prwr041_25360     CDS       T08008                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K06877  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein
Organism
pher  Prevotella herbatica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pher00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09194 Poorly characterized
   99996 General function prediction only
    prwr041_25360
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C ResIII MZB Zn_ribbon_3 RUBY_RBDX FeoB_Cyto
Other DBs
NCBI-ProteinID: BCS86643
LinkDB
Position
complement(3370445..3375643)
AA seq 1732 aa
MNDPIKIYEDLKETYLKYINSAIPFFDEHYNSERRDLMSETGTICKSPIVELIPQYKGKA
SIDEFCCKENISNDLSEFVQCGLFYNDKSEKRVLYSHQYDSLKEAFINRKNIVVTTGTGS
GKTECFILPIIADLLTESKKWGSERTRAMRTMILYPLNALAEDQMIRLRKCLNSRRTNNK
GALDWLDRNRQGNRFYFGRYTGSTPVSGNSENTKNKLQYEKKQLEVDWEAANLAAQKSEN
TELLYHVPCMECDNGEMWSRQSMQDNSPDIMITNYSMLNVMLMREIESPIFESTKQWLEE
DPKHVFHLIIDELHTYCGTSGTEVAYLIRVLLDRLGLTPDSPQVQFLATSASLEMNDQTK
DFLCEFFGLNKFDFEDRFCIFSGDEQSIPQQPMTKLPIDALVQYADPSKTEQEKKETLLH
TLHCKSFYEVSEKYSLDKWIIFSMYGDNGKIAATDIINMATRMGVSGKNALLFVASVLKI
ICKSKGNKGFILPIRVHFFFRAINGLWACSNQVCDCVSQENRFKGRLLGKLYKNPRSICS
CGHSALEVIICESCGEAFLGGYIVNKNGKTYLSADMPIGKAMYGVLWKGHVISEEEWVNV
NYNSLTGEYKKDKRGEYLLRIQKSENETKFPVVCPQCEVKYKITDQNSITPLRRHSVGLQ
KVNQVLADSLIRSMKNAKDETAKVILFSDSRQAAAKLSAGIELDHYRDVVRWLMLHALKG
DDEVINFLKQFQAKDRIIQSREENDKMIALSNKNIYASLIQMIRSKRYGLTEQEAIELKF
KFKNIENIGFPYITSDVFSGLLKIGTNPAGPKPSLSTNLFSGAWWNLFDFKEYRKKDGLG
DYAEEYYNKICLANRQELLISLFANKKKSFEAMKLGYISCIQTNNMDNRLEQLINSTVRI
LGEKRRITGYDSKYPTPKSFPMSVRKMINSIYGSKHVRQIIELLKETMRGMEILDKNYIQ
LTGKGIAFVKSYLGMEYWICPICKTVHLQPSNGICTNCQSRLTIHKTITAQDLQDPQDYY
LSLVNDTNDIYRLHCEEMTGQTSKSDSRRRQRLFQDIFLNDETPIVDGIDLLSVTTTMEA
GVDIGSLSVVMMGNVPPQRFNYQQRVGRAGRRGNPLAVALTIAKGSSHDQTHYQEPERMV
SSSPKDPYLEVRIKEIAERIIYKEVLYHVFLNSQVSSANDNIHGNFGNVFDWEPTNKLIA
EKWIKYHTNEIKHIIEVVTKETLITDNDRKSILKNMQTEFIGRISDIASSTDFTQDSLSE
RLANAGMLPMFGFPTRTRNLYLNKPDKLPAEDIVTRDLDMAINSFAPGHELVKDKKIFKA
VGVADYKYNRQNMVSLKENSLNVYRKPLFRCKNCGYSTLSIESDKATCPICSKPMERINV
CSPLGFCVDYNMEAKDFNGSFDWYTPNSDIKLDCEDHLEDCSPVNNLQIRNNIVPDQGLV
HLVNDNNGKLYNFGLNSDDIWISPDAYPQEIKDSLPLKSRKKLAFVVTKTTGVMTLGFIE
VPDNICLVPLSENENYIAVKSAFYSWGYLLRRSIAIYLDIDTTELEIGYGISPVTHKPEV
FIVEKLENGSGYCNYLSGRKYPNIPFDAMIKPLLEGGYLYEHLLNSQHRDSCLSSCYDCI
RDYSNQQNHALLDWRLGLDLARLSANDAAEISFNVDYWKDMLDKNLVYLLRKRHFNIKNN
GELYLAYDENSQVRGIIVHPLWSAEYINRLLDKYNIGNIEIISIFELTRSLY
NT seq 5199 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgatcctataaaaatatatgaagacttaaaggaaacctatttaaagtatattaat
agtgctattcctttctttgatgaacactataatagtgagagacgtgatttgatgtctgaa
acaggaactatatgcaaatcaccaattgttgaacttatccctcaatataaaggcaaagcc
tctatagatgaattctgttgtaaggaaaatatatctaatgatttgtcggaattcgtacaa
tgtggtctattttataatgataaatctgaaaaaagagttttatattcacatcaatatgat
tctctaaaggaagcttttattaatagaaaaaacatagttgtaacgactggtactggttct
ggtaaaacagaatgttttattctccctattattgcagatttgctaacagaatcaaaaaaa
tggggaagtgagcgaaccagggctatgagaacaatgattctgtatccgttaaatgctttg
gctgaggatcaaatgattaggcttcgtaaatgtctaaatagtcgtagaactaataataaa
ggagcattagattggctagataggaatcgtcaagggaaccggttttattttggtaggtat
actggcagtactcctgttagtggtaatagtgaaaatacaaagaataagttgcaatatgaa
aaaaaacaacttgaggttgattgggaagctgcgaatttagcggcacaaaagtctgagaat
acagaattactctatcatgtgccatgtatggaatgtgacaatggtgaaatgtggagtcgt
cagtctatgcaagataattccccagatataatgataacaaattatagcatgcttaatgtt
atgttgatgagggaaatagaatcacctatttttgaaagtacaaagcagtggcttgaagaa
gatcctaaacatgttttccatttgattattgatgaattgcatacatattgtggaacatct
ggaacagaagttgcatatctaataagagttttattagacagattaggcttgacaccagat
tctcctcaggttcaattccttgcaacaagtgcatctctagaaatgaatgatcaaacaaaa
gattttctttgtgagttctttggtcttaacaaatttgactttgaagatcgtttctgtata
ttctcaggagatgaacaatctatcccacaacaacctatgacaaaattgccaattgacgcc
ttagttcagtatgctgacccgagtaagactgagcaagaaaaaaaagagacactattgcat
acgttgcattgtaaaagtttttatgaagtttctgaaaaatatagtttagacaaatggatt
atattttctatgtatggtgataatggtaaaattgcagctacagatataataaacatggca
acacgaatgggagtgtcaggaaagaatgctttactatttgttgcttctgtacttaagatt
atttgtaaatctaaaggtaataaagggtttattttaccaattagagtacacttctttttt
cgtgctataaatggtctatgggcttgttctaatcaagtctgtgattgtgtaagccaagaa
aatagatttaaaggacgattactaggaaaattatataagaatccacgctcaatttgtagt
tgtggacattctgcattagaagtaatcatatgtgaaagttgtggagaggcatttttagga
ggttatattgttaataaaaacggtaaaacgtatcttagtgctgatatgcctatcggcaag
gccatgtatggagttctttggaagggtcatgtgatttctgaagaagaatgggtgaatgtt
aactataatagtttaactggagaatataaaaaagataagcgcggagaatatctccttcgg
attcaaaaatcagagaatgaaaccaaatttcctgtagtttgtccacagtgcgaagtaaaa
tataaaattactgatcaaaatagcatcacaccattgagaagacatagcgtaggtttgcaa
aaagtaaatcaagttttagctgactctttaataagatcaatgaaaaatgctaaggatgaa
acggctaaagttattttgttttctgatagtcgtcaagctgcggcaaagttatcggcagga
atagaattagatcattatcgtgatgttgttcggtggcttatgcttcatgctttgaaaggc
gatgacgaagttattaatttcctaaaacaatttcaggcgaaagatagaattatacagtct
agagaagaaaacgataaaatgatagctcttagtaataaaaatatatatgctagtttgatc
caaatgattcggagtaaacgctatggattaactgaacaagaggctatagaactaaaattt
aagtttaaaaatattgaaaatataggtttcccatatataacttctgatgtgtttagtggt
ctgttaaaaattggaactaatccggcagggcctaaaccttctttatctactaatttattt
tcaggagcatggtggaatttgtttgatttcaaagaatatagaaaaaaagatggtctagga
gattatgccgaagaatattataataaaatttgtcttgcaaacagacaggaactgctaatt
agtttgtttgctaacaagaaaaaatcttttgaagcgatgaagttgggatatatttcttgt
attcaaactaataatatggataatcgactagagcaacttataaattctactgttagaatt
cttggagaaaagcggaggatcacaggatatgattcaaagtatccaactccaaagtccttc
cctatgtctgttagaaagatgattaattctatttatggtagtaaacatgtgaggcaaata
atagaattactgaaagagactatgcgtggtatggagattcttgataagaattacatacag
ctaacaggtaagggaatcgcatttgttaaatcatacttgggaatggaatattggatatgt
ccaatatgtaaaacagtacatcttcagccatcaaatggaatctgtaccaattgtcaaagt
agattgacaattcataaaactataacagcacaagacttacaggatcctcaagattattat
ttgtcgttggtaaatgatacaaatgatatctatagattacattgtgaagaaatgacagga
caaacttctaagtcagactcgcgtagacgtcagagattatttcaagatatttttcttaat
gatgaaacaccaattgttgatggtattgatttacttagtgtcaccaccacaatggaggct
ggtgttgatattggttctttatctgtagttatgatgggtaatgtgccaccacaacgtttt
aattatcaacaacgtgtaggtcgagcagggagaagaggtaacccactagcagtagcgttg
actatagcaaaaggaagtagtcatgatcagacacactatcaagaacctgaacgcatggtg
tcttcctctccaaaagatccttatcttgaggttagaataaaagagatcgctgaaagaatt
atttataaggaagtgctttatcacgtattcttgaactctcaagtttcttccgcaaatgat
aatattcatggtaattttggaaatgtttttgattgggaaccaacgaataagcttattgct
gaaaaatggataaaatatcatactaatgagattaaacatattattgaggttgtaacaaaa
gagactcttataacagataatgataggaaatctattttgaaaaatatgcaaactgagttt
attggtagaatatctgatattgcttccagcactgactttactcaagattcattgagtgaa
aggttggccaatgcaggtatgttacccatgtttggatttcctacaagaacaaggaactta
tatttgaacaaacctgacaaattgccggctgaagatatcgttactagagacttagacatg
gctattaattcttttgctcctgggcatgaacttgtaaaagataaaaagatttttaaggca
gttggtgtggctgactataaatacaatcgccaaaatatggtatctttgaaagaaaatagt
ctaaatgtttatcgtaaaccactttttagatgcaagaattgtggctattctactttatct
atagagagcgataaagccacatgtcctatttgctcgaaacctatggagagaataaatgta
tgttcccctttaggtttttgcgtagattataatatggaggctaaggactttaatggctct
tttgattggtatactcctaatagtgatataaaactagactgtgaagatcatcttgaagat
tgttccccagtaaataatttgcagataagaaacaatatagtcccagaccaggggttagtt
caccttgtaaatgacaataatggtaagctatataattttggattaaatagcgatgatatt
tggatatctccagatgcatatcctcaggagataaaagactctttgcccttaaaatctaga
aagaaattagcatttgttgttacaaaaactactggggttatgactcttggctttatcgaa
gttccagacaatatatgtttagtaccattatcagagaatgagaactatattgcggttaag
tctgcattctattcttgggggtatttattgcgaagatctattgcaatatatttggatata
gatacaacagagctagaaattggctatggcatttcacctgtcactcataagccagaagtc
tttatagttgaaaaacttgaaaatggttctggttactgtaactatttaagtggcagaaaa
tatccaaatataccatttgacgcaatgataaaacctttattagaaggtggatatttgtat
gaacatttattaaattctcagcaccgagatagttgtttatcatcatgctatgattgcatt
agagattattcaaaccaacagaaccatgcattgttagattggcgcttagggcttgattta
gcaagactatcagctaatgatgctgcggaaattagttttaatgtagattattggaaagat
atgcttgacaaaaatcttgtatatcttttgcgcaaaagacattttaatattaaaaacaat
ggcgaactttatttagcctacgatgagaactctcaagtaagaggaataattgtgcatcca
ttatggtctgctgaatatattaatcgtttgttagataaatataatataggtaatattgaa
atcatttcaatatttgaattgacaagatctttgtattag

DBGET integrated database retrieval system