Polaribacter huanghezhanensis: KCTC32516_00356
Help
Entry
KCTC32516_00356 CDS
T09192
Symbol
oprF_1
Name
(GenBank) Outer membrane porin F
Organism
phg
Polaribacter huanghezhanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
OmpA
TSP_3
LysM2_CERK1_LYK3_4_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKD85018
LinkDB
All DBs
Position
367716..369503
Genome browser
AA seq
595 aa
AA seq
DB search
MRKVTVLLFISLSLTSLIGQNKLGDNKQENSIKNILLNNSNSWAVGGGVSNFIMHGDLRS
LGTGNLGNFWNFGAYAYVDKMFNPLLGLEFKVNYSKISGGAQYFSNIYNILYVNQTKISN
NLFFKGTAYGFELNLILSFSNLYAINTRKWNTSGYFGVGYHQYDSALYEKLPDGSNNLLV
NFGRNPSRNSVFEASSVYISTQLGIKYRINKRVDLEFRPSWYFNYEDHLDATISNKQNWE
TFFVTHLGVTIKLGKKKIFTIWGGDSEKQEPFKVVDSDKDGVLDNLDVEPNTPLGAAVYG
NGRAIDSDQDGIQDYKDKCPSKPGPVSNNGCPVILKKKSPPVIKQQIALLGTSIYFKTNS
SQIKDISLTVLDEIIGLMKNIPDSNFIIEGHTDNKSYPTYNLKLSQERAEAVKNYCIAAG
IDSSRLKAIGYGETRPKYSNSTAGSRQLNRRVDIKPLSKIEFTKFIESKNLTNTDTTIVV
NKVQANNSTNNKVNEVQASYHVVKKGETLYSIAKKNHTTVKQLMHTNALKNTILFIGQKL
SIEKNKNNFHIVQKDETLYSIAVKYKLTIDHLKQLNHLKGNTIYINQELKIAADN
NT seq
1788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggaaagttactgtattgctatttatttcacttagcttaacatctttaattggtcaa
aataaacttggtgataacaaacaagaaaatagcataaaaaacatattattgaacaatagc
aatagttgggcagttggtggtggagttagtaattttattatgcatggagatttacgatct
cttggaacaggtaatcttgggaatttttggaattttggggcgtatgcatatgtcgataaa
atgttcaatcctttattaggtttggaatttaaagtaaattactctaaaatttctggtggt
gcacaatatttttcaaacatatataatattctttacgtaaatcaaacaaaaatttcaaac
aacctattttttaaaggcacagcttatggcttcgagttaaatttaattctaagtttttca
aacttatatgcaatcaatacccgaaaatggaatacttcaggttattttggtgtaggctat
catcaatacgattctgctctctacgaaaaacttcctgatggctcaaataatttattagtt
aatttcggaagaaacccttcaagaaatagtgtttttgaagctagttctgtttatatctct
acacaactgggtataaagtatagaataaacaaaagggtagatcttgagtttagaccatct
tggtattttaattatgaagatcatttagatgctacaatatctaacaaacaaaattgggaa
actttttttgtaactcatcttggagtaactataaaacttggaaagaaaaaaatatttact
atttgggggggcgactctgaaaaacaagaaccctttaaggtagttgattctgataaggat
ggggtactagacaatttagatgttgagccaaatactccattaggagctgcggtttatggt
aacggaagagccattgactcagatcaagatggcattcaagattataaagataaatgccct
tctaaaccaggaccagtaagtaacaatggctgcccagtaatacttaaaaaaaaatcaccc
cctgttattaaacagcaaattgccttattgggcacaagtatctactttaaaacaaatagc
agtcagatcaaagatatttcacttacagttttagacgagattatcgggcttatgaaaaac
atacctgattctaattttattattgaaggacatactgataataaaagttatcccacttac
aatttaaaactctcacaagagcgggctgaggctgttaaaaactattgtattgctgcgggt
attgacagcagtaggttaaaggctattggttatggtgaaaccagacctaaatactcgaat
agcacagctggtagtcgacaattaaatagacgagtagatattaaacctttatcaaaaata
gaattcaccaagtttatagaatctaaaaacctcacaaataccgatactactattgttgtc
aataaagtacaggctaataacagcacgaataacaaagttaacgaagtacaagcatcctat
cacgtcgtaaagaaaggagaaaccttatatagtattgccaaaaaaaatcatacgacagta
aaacagctaatgcatacaaatgcattgaaaaacacgattctttttataggtcaaaaactt
agcattgaaaaaaataaaaacaacttccacatcgttcaaaaagacgaaacactttattct
attgcagtaaaatataagctaacaatagaccatttaaaacagttgaatcacttaaaagga
aatacaatctacatcaatcaagaacttaaaatagcagcggacaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
