Pediculus humanus corporis (human body louse): Phum_PHUM182300
Help
Entry
Phum_PHUM182300 CDS
T01223
Name
(RefSeq) DNA mismatch repair protein pms2, putative
KO
K10858
DNA mismatch repair protein PMS2
Organism
phu
Pediculus humanus corporis (human body louse)
Pathway
phu03430
Mismatch repair
phu03460
Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03430 Mismatch repair
Phum_PHUM182300
03460 Fanconi anemia pathway
Phum_PHUM182300
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
phu03400
]
Phum_PHUM182300
DNA repair and recombination proteins [BR:
phu03400
]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
MutL homologs
Phum_PHUM182300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_mis_repair
HATPase_c_3
MutL_C
HATPase_c
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8239992
NCBI-ProteinID:
XP_002425208
UniProt:
E0VGG4
LinkDB
All DBs
AA seq
712 aa
AA seq
DB search
MVEFIRPIDKTTINQICSGQVVLTLATAVKELLENSLDAGATSIQIKLEEYGSKVIEVID
NGCGVNEDNFQALTLKHHTSKISEFSDIYNVKTFGFRGEALSSLCTLSSVTITTQHINAQ
IGAVLKFDHNGIIKSNTKIHRKVGTTVRLENLFCTLPIRRTEFLKNLKKEFSKMCTVLYA
YGLISTGVRITCTNHVVTKSKFQNKNDQDNLKKNFTTTIMDIEGKSIEFNINSIFGIKEK
QNLLKFVQKNPSLETLKEFNIESKKFNSELYKIEGYISSCSHGCGKSGSNRQFYYINQRP
IDHPKIFKLVNETYHQFNSHEDPFVILHIKVEDGLFDINLVPDKRQVLVQNENFLLATLK
ESLLDMFKLIPSTLKVNNIGLLNIKFENDKSSDKVNCTQLENEKEKFNLKKSEDLKMNLK
RFQYSSQNLNNTNNSNMSESIPSNKISNNFISNTSCSSKDMFVQKKLKDFLVSDSADNDQ
QLNDVTENLKTEMTKSPPKSKQLLFPTQNFSNYKITIENSNDNKRKLEEKIINNISIDQI
NQVYEPKRIKYDENITGHVAEIKSETLEFENISNNLEEQEEKNGGLDINTEKYDEGLDNK
FRRSDIFIIDQHASDEKYNFEMLKLKTVMQCQKMVNPETLNLTVDKEELMLEHEEIFKKN
GFHFIFDETQVPTKRIKLTSVPMSKSIVFGKNDVEELLFLLEEVTTDKIIIR
NT seq
2139 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgaatttatacgacccattgataaaacaaccattaatcaaatatgttccggccag
gttgttcttactttggcaacagcagtaaaagaattactagagaacagccttgatgcgggt
gccacaagtattcaaattaaattagaggaatatggtagtaaggtaattgaagtcattgac
aatggttgcggtgttaacgaagataatttccaggctctgactttaaaacatcacacatcg
aaaatttcagaattttcagatatatataatgttaaaacttttggctttagaggagaagca
ttaagttcattatgtactttaagttcagtgaccataactactcaacatataaatgctcag
ataggtgcagttttaaaatttgatcataatggaattattaaaagcaatactaaaattcat
agaaaggtaggaacaacagttaggttagaaaatttgttttgtactcttccgattagaaga
acagaatttttaaaaaatcttaaaaaagaattttctaaaatgtgcacagtattgtatgct
tatggacttatttccactggagtaagaataacttgtactaatcatgtagtaacaaagtct
aaatttcaaaataaaaatgatcaagataatttaaaaaagaatttcacaactacaataatg
gatatcgaaggaaaatccatcgaatttaatataaattcaatttttggcattaaagaaaag
caaaatttgttaaaatttgtacagaaaaatcccagtttagaaactttaaaagaatttaat
attgaaagtaaaaaatttaattccgaattgtataaaattgaaggatatataagttcttgc
agtcatggttgtggaaaatctggttcgaatagacaattttactatattaatcagaggccg
attgatcatcctaaaatttttaaattagttaatgaaacatatcatcaatttaattctcat
gaagatccttttgttatactacacattaaagtagaagatggtttattcgatattaattta
gttcctgacaaacgtcaagttttagttcaaaatgaaaattttcttttggcaacacttaaa
gaatctcttctcgacatgtttaaacttattccctctacattaaaagtgaacaatataggt
ttgttaaatattaaattcgaaaatgataaatcatctgataaagttaattgtacacaattg
gaaaatgaaaaagaaaaatttaacttaaaaaaaagtgaagatttgaaaatgaatcttaaa
agatttcaatattcgtctcaaaatttaaacaacacaaataattcaaacatgtcggaatcg
attccatcaaataaaatttcaaataattttatttcaaatacctcttgttcgagtaaagat
atgttcgtacaaaaaaaattaaaagattttcttgtaagtgattctgcggataacgatcaa
caactaaatgatgtaacggaaaatttaaaaacggaaatgacgaaatcaccaccgaaatca
aaacaattactttttccgacacagaatttttcaaattataaaattacgattgaaaattca
aatgataacaaaagaaaattagaagaaaaaataataaataatatttcaattgatcaaatt
aatcaggtatacgaacctaaacgaataaaatatgatgaaaacatcaccggtcacgttgca
gaaatcaaatctgaaactcttgaattcgaaaatatttctaataacctagaagaacaagaa
gaaaaaaatggcggattagatattaatacagaaaaatatgatgaaggtttagataataaa
ttcaggagatcagacatatttattattgatcaacatgcaagcgatgaaaaatataatttt
gaaatgttaaaattaaaaacggttatgcaatgtcaaaaaatggtcaatccggaaacatta
aatttaaccgtcgacaaagaagaattaatgttagaacatgaagaaatatttaaaaaaaat
ggattccattttatttttgacgaaacccaagtcccgaccaagagaataaaattaacgagc
gttccaatgagtaaaagtatcgttttcggtaaaaacgacgttgaggaattattatttttg
ttagaagaagtcactactgataagataattataaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
