Pediculus humanus corporis (human body louse): Phum_PHUM210110
Help
Entry
Phum_PHUM210110 CDS
T01223
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K12600
superkiller protein 3
Organism
phu
Pediculus humanus corporis (human body louse)
Pathway
phu03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phu00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
Phum_PHUM210110
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
phu03019
]
Phum_PHUM210110
Messenger RNA biogenesis [BR:
phu03019
]
Eukaryotic type
mRNA degradation factors
3'-5' decay
Ski complex
Phum_PHUM210110
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_11
TPR_CcmH_CycH
TPR_1
TPR_19
TPR_12
TPR_16
TPR_17
TPR_2
TPR_8
ARM_TT21_5th
Sel1
Fis1_TPR_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8237376
NCBI-ProteinID:
XP_002425571
UniProt:
E0VHH7
LinkDB
All DBs
AA seq
1309 aa
AA seq
DB search
MNSKEIKIILKAAKENLDQKDYKSAIKNCKSILKEDGNNYMALVFYGAAIQETEQKSEAP
KAYKKAVEILPDHNLAWRGLACYYEKYECKNNSKELIKVYEKLATLENEFTKFSDVIDKL
QKLSILHCDTSSVDAIYNLISTADNEKKLLIYKFIINVLEENLTEEFKVRYENSLQYLLS
VTPPLKDKNDIFKKYLKFLYKQNNYERIILEGNKILESHLNDAVLLEWICKAYTELPESV
LKTNSPDICPKRAYDQLLTIIPDSYLGLFCKGLNELYHGDLIIANDELLNATKIKQDSGM
IWFYLCTCQILLYHFENAEESALKALKCFNNNKKYKNMITDCEIKLLQSLCELNEKEKWL
EAEKLGMKLLESNCDSLNVYQSFAIALIKLENYSKAEQYINKIKSHEEIVEYLNILMLKQ
QNKINDCKKRLEELNAKPHDNFIFWLELGKIYFSEKNEKLSLSCLLKAAKLNQWCYLNFL
FLGHYYSSLLKDFEKARRCYQKAFQLNSTNVEVCRCLSDIYRTLGKEDLNLQLLSAATVI
NPKSKWAWLKLGLHYLSVNQAKEAIKSLQIAVRTTWECLGDAYFAQGAYTSAIKSYQKTL
DLESNSIYPIFQIARIKHMIGSFSESVQEFRLINSKATDYIPALKGHSEACISLMKQYLS
QHMNGLAQDICQEAVYYLIKCLELRKNLICIWKLLGDCCLLISNLPKKYCQLKISCWLMN
DFKMEDKEILILDKVQILKLGCKCFCQAIAINGNFPNLWYDLAYAYNSMVKISKTEESRK
QMRKLACSSIKKSIMLNGNCWESWNLYGIILSSKELENYYLAQHCFIKALTLNDTNAIAW
TNLGALYLSLNDLQLANLAFTEAQKFDQDYVHCWVGQAIIAYRTGHHEAMDLFRHSTQLG
FNSEGCLGYSAFVIRTLLNIKNKNDKDYVYSIKNMNAIPVSVDLLTWYTDRFTDNPWAFN
MLGLLLERKQLYKGSADAFYKALELLGERNENNTSRLDKILLNYSRVLSNMNRYEEAIKH
LKLIKIPTFANQCELAFAFFKAKLYEDSYSSYETTLEWFASDTEMKSHILVAMAAVVYLH
QGHEDAKILLMQSCQLKPASVQGLFACCALGMLHSNLELSELALKELNAYRDDPNYLSHI
ALFKSYIYLFKGQKEKSIRAFYDVIHRHPVTPSVWLSLSLLMLHLHESCNKKSAARCAEV
ALATGRSSIDVSKVMSLVSLSNLLCGEGLKSLRSSQKAVHMFPDVTENWVVLLASVLSKS
LQRESTKEIGWLKKMITYIRRKFASSKQMTQWLSNNNRKIDAMADKLVS
NT seq
3930 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagtaaagaaattaaaataattttaaaagcggcaaaagaaaatttagatcaaaaa
gattataaatcggccataaagaattgcaagtcaatattaaaagaagatgggaataattat
atggcattagttttttacggtgctgcgatacaagaaaccgaacaaaaatccgaggctcca
aaagcttataaaaaagccgttgaaattttacctgatcataatttagcatggagaggatta
gcttgttattatgaaaaatatgaatgtaaaaataattcaaaagaacttattaaagtctat
gaaaaattagctaccttagaaaatgaatttacaaaattttccgatgttattgataaatta
caaaaattatcaatattacattgtgacacatcaagtgttgatgcaatatataatttaatt
tctaccgctgataatgaaaaaaaattgttaatttataaatttattatcaatgttttagaa
gaaaatttaacggaggaatttaaagttcgatatgaaaattccttgcagtatttattatca
gtgactcctccattaaaagataaaaatgatatatttaaaaaatatttaaaatttttatac
aaacaaaataattatgaaaggattattttggaagggaacaaaattttagaatcacattta
aatgatgcagttttattagagtggatatgcaaagcttacacagaacttcccgaaagtgta
ttgaaaacaaattcaccagacatttgccctaaaagagcatatgatcaattattaaccatc
atacctgattcatatttaggattattttgtaaaggacttaatgaattatatcatggcgat
ttgataattgctaatgatgaattactaaatgcgacaaagataaaacaagattccggtatg
atttggttttatttatgcacctgtcaaattttactctatcattttgaaaatgcagaagaa
agcgctttaaaagctttaaaatgttttaataataataaaaaatataaaaacatgataact
gattgcgaaatcaaattactgcaatcattatgcgaattaaatgaaaaagaaaagtggctc
gaagcggaaaaactaggcatgaaattattagaatctaattgtgatagtttaaatgtttat
caatcgtttgccatagctttaattaagttagaaaattactccaaagctgaacagtatata
aataaaatcaaatctcatgaagaaatagtagaatatttaaatatacttatgttaaaacaa
cagaataaaataaacgattgtaaaaaaagattagaagaattaaatgcaaagccacatgat
aattttattttttggttagaattaggtaaaatttattttagcgagaaaaatgaaaaatta
agtttgtcatgcttacttaaagctgctaaactcaatcaatggtgctatttaaatttttta
tttttgggtcattattactcgtctttacttaaggattttgaaaaggcaaggagatgttat
caaaaagcatttcaattaaattcaacaaatgttgaagtttgcagatgtttgagtgacatt
tacaggacattaggaaaagaggatcttaatttacaacttttatctgctgccacagttatt
aacccaaaatcaaaatgggcctggttaaaattaggattacattatttatccgtcaaccaa
gccaaagaagccataaaaagccttcaaattgctgttcggactacctgggagtgtttggga
gatgcttatttcgcacaaggagcttacacatcagcaataaaatcatatcagaaaactttg
gatttagaatcgaattcgatttatccaatttttcaaatagcaagaataaaacacatgatt
ggatcattttcagaatcagtacaagaatttagattgattaattccaaagccacagattat
attcctgctcttaagggtcattcagaagcatgtatatcattaatgaaacaatatctttct
caacatatgaatggtttggctcaagatatttgtcaagaggctgtttattatttaatcaag
tgccttgaattgagaaaaaatttaatatgcatttggaaattactcggagattgttgcctt
ttaatttcgaatctaccaaaaaaatattgccaattgaaaatatcatgttggttgatgaac
gatttcaaaatggaggacaaggaaattttgatattagataaggttcaaattctcaaatta
ggttgtaaatgtttttgtcaagccatagcaatcaatgggaattttccaaatctttggtac
gatttagcatacgcatataacagcatggttaaaataagcaagacggaggaaagtaggaaa
caaatgagaaaattggcatgttcgtccattaaaaaaagtatcatgcttaatggaaattgt
tgggaaagttggaatttgtacggtattattctatcgtcaaaagaattagaaaattattat
ttagctcaacattgtttcataaaggctttaacgttaaacgatacaaatgcaattgcttgg
accaatttgggtgcactttatttaagtctaaacgatttacaattggccaatttggcattt
accgaagcgcaaaaatttgatcaggattacgttcattgttgggtcggtcaggccataata
gcttacagaactggtcatcacgaagccatggatctcttcaggcattcgacgcaattagga
ttcaattctgagggttgtttgggttactccgcattcgttattcgaactcttttaaatatt
aaaaataaaaacgataaagattatgtttacagtataaaaaatatgaatgcgatacctgta
tccgtcgaccttttaacctggtacacggatcgttttacggataatccctgggcttttaac
atgctaggtttattattagagaggaaacagctttataaaggatcggcggatgctttttac
aaagctctggaattattgggagaaagaaacgaaaataatacttcgagattggataaaatt
ttactcaattacagccgagtactttccaacatgaatcgttacgaagaagcgataaaacat
ttgaaattgattaaaattccaacgtttgccaatcagtgcgaattagcttttgcatttttc
aaagccaaactttacgaggattcatattcgtcgtacgaaacgacgctcgaatggttcgcc
tcggacacggaaatgaaatctcacattctcgtcgcaatggccgccgtcgtgtatttacat
cagggacacgaggatgcaaaaatacttttaatgcaatcgtgtcaattaaaaccggcatcg
gttcagggactttttgcttgttgcgctctcggaatgttgcattcgaatttggaactctcg
gaattggcattgaaagaattgaacgcgtacagagacgatccaaattatttaagtcacatc
gcccttttcaaatcctatatttatttatttaagggacaaaaagaaaaatcgattcgagct
ttttatgacgtcatacacaggcatccggttacaccttccgtttggttgagtttatccctg
ttaatgttgcacctacacgaaagttgtaataaaaaaagcgcggcaagatgtgcggaagtg
gctttggcaacgggacgatcgtcgatcgacgtttccaaagtcatgtcgctcgtgagtttg
agtaaccttttatgcggagaaggtttgaaaagtttgagatcgtcacagaaagccgttcac
atgtttccggacgtgacggaaaattgggtcgttttattggcatccgttttgtcgaaatcg
ttgcagagagagtcaacgaaagaaatcggatggttgaaaaaaatgattacgtacataagg
agaaaatttgcgagttcgaaacaaatgacgcaatggttgagcaataataataggaaaata
gatgctatggcggataaattagtgagttga
DBGET
integrated database retrieval system