Primulina huaijiensis: 140962859
Help
Entry
140962859 CDS
T11038
Name
(RefSeq) transcription elongation factor SPT6-like isoform X1
Organism
phua Primulina huaijiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SH2_2
HHH_7
YqgF
SPT6_acidic
HTH_44
Spt6_S1
Tex_central_region
HHH_3
HHH_9
Tex_N
S1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140962859
NCBI-ProteinID:
XP_073278008
LinkDB
All DBs
Position
17:4436031..4446604
Genome browser
AA seq
2195 aa
AA seq
DB search
MAGRKVVSADDDATGFQNEGDDGLYEDLAEDDDEDEDDDGLDAYERDGFIVDDLDEEDEE
DNCGERQKKKKKKKREAERSYLLDEDDYELLQESNISVPRPNLQNKKLKRLKKAQGDTKE
ESSQFSGERQHNGSEKGWRTAEERLKYRLFGDDDGQSLEDMDEEDEQQEKQDVDIAEEDE
MADFIVDEDQVDEHGAPIRRKKQPRSMQQSGIPSSALQEAHEIFGDVEDLLKIRKLEAVD
TFGEAGERSLEDQFDPSVLSEKYMTGRDEQIRKIDIPERIQIYEESTGLTPLDEISIEVE
SEWIYNQLVSGLVPFYGKSADATEGSDELKGHIAKYLELLHVQKLDVPFIAMYRKEEISC
LLKDPDDPEAYLQADPIEKPKLKRHKVLWTIRDLDQKWLLLLKRKGTLQSYYAKRFKEEI
RRVYDETKLNLNQQLFESITMSLKAANSESEVDDVDSKFSLHFPPDEVVLDEGTYKRPKR
KSHYSICSKAGLWEVANRFSYSSEQFGLQISLEKMRMDELEDAKEAPEEMASNFICMMFE
TPQAVLKGARHMAAVEISCEPSVRKHVRSIFMDNAVVSTSPTPDGNAAINSFHMFSGVKW
LRDKPLSRFEDAQWLLIQKAEEEKLLQVTIKLPEAVLDKLLSDSWDYYLSDGVSKSSQLW
NEQRKKILQDAFHNILLPSMEKAARSWLTSRSKTWLLEEYGKLLWDKVSVAPYQRKENNI
SSNEEAAPRVLACCWGPGKPATTFVMLDSSGEIEDVLNAGCLNLRGQSVNDLQRKKNDQQ
RVQKFMMDHQPHVVVLGAANLSCTRLKDDIYEIIFKLVEDNPRDSQKIDSLNIVYGDESL
PRLYENSRISVDQLPSQEGIIRRAVALGRYLQNPLAMAATLCGPGREILSWKLNPLEKFL
TPDEKYGMVEQVMIDATNQVGLDINLASSHEWLFSPLQFISGLGARKAASLQRSLVRAGA
IFTRKDLLTSHGLGKKVFINAVGFLRVRRSGLSSSSSQFIDLLDNTRIHPESYSLAQDFA
KDVYCESMNNEVNDDDDDDLLEIAIEHVRENPHLLTAVDVHEYAEQKKRQNKKETLNDIR
LELMDGFQDRRKSHEEPNQDDEFYMIAGEAEETLSEGRIVQATVRRVQEDRAICNLDSGL
TGILSKEDYTDDWRDINELNDKLHEGDILTCRIKSIQKNRYQVFLTCRESEMRSYRFQNN
QIVDPYFHEERNTLQPKQEIAHKEEFSKKLFKPRMIVHPQFKNITADEAFEFLRDKEAGE
SVIRPSLRGPSYLTLTLKVCDGVFANKDIVEGQKELKDITSLLQIGKKLKIGEDTFEDLD
EVMDRYVDPLIAHLKTMLNYRKFMKGTKTDIDELLRIEKAKIPTKIVYCLGLSYDHPGTF
ILTYIRSVNPHHEYIGLYPKGFKFRKRMFGDVDRLVAYFQKHIDDPHSSGPTIQSAAAMV
PIRSFGSGDDWGGSNNNDGDRGGSQSMDGDKTFGMGSRGGRGDSQNGGRGRGRGRGRGRG
RGRGRDSYGDGMPDKHDFDHDSQKWGSDNDKGVDWGGGASGSAGGWGGGDGSGNTGSWSG
VGGGSKGDGNCGGGGSGSAGGWGGGGSGSGNTGGWGVAGGGIKSGSNWGGGGSGGAGGLG
GGGDRTESSGGWGGGGRGGDRSGSAGGQGGGDDNGNNGGWGGAGGGSKTDGNWGGGGSGG
AGGWGGGGGDQSGSAGGGNKSDGNWGGGRCGNAGGWAGVGGGGRGGAGGWGGGRGGSQRG
SAGNCEMGGDGNKTDGSWGGCRSGDTKGWGEGESGTTIVGGDGGGGQSGSTGGSTGHGGS
GKTGGWGGGGRDNADGGDRGASGGSGGNGGGSGRAGTWGGGGNDSDGGSANAGSWGGSGG
GSGSAGAWGDAGGTDAGGGSVRPGGWGGGSNNRSTGSMGEGIGSGSTGGWGGVGSHRSAG
GGDRGSGWGSGGDGGSTDGWKGGGHDNAGGDWGGSHGALGDTKGGGRGWGGGRGSSAGGR
YGRSGGTGGRRGGSSSRSTDGRGGGTGSGSTGGWGGDRGSTGGWKGVGQKNTGTGWGGSH
GASGDNKGGGAGWGGGHGSSGGDGGGGGQSGGAGAWGESGGANDGGWVGSASGGTGAWGV
AGSSNAGGGNTSTGGWGGSSSTAGRGGGTGSGSTGGWGSGGGSETTDSGGGNAGGWGVSG
TKKEGGGGWGQGSDAAGNSGWGSSKKSSEAGKGGW
NT seq
6588 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggcagaaaagtggtctctgctgatgacgacgctactggatttcagaacgaggga
gatgatgggctgtacgaagatctagctgaggatgacgatgaagatgaagatgacgacgga
ctggatgcttatgagagagatgggtttattgtggatgatctggacgaggaagatgaagag
gacaactgtggtgagagacaaaagaagaagaaaaaaaagaaaagggaggctgagaggagt
tatttgctcgacgaggatgattatgaactactccaggaaagcaacatttctgttcctcgt
ccaaaccttcagaataagaagcttaagcgactaaagaaggctcagggggatacaaaagaa
gagtcatctcagttttctggtgaacggcagcataatggaagtgaaaaggggtggcgaaca
gccgaggagagacttaaatatagattgtttggtgatgatgatggacaatcgcttgaggac
atggatgaagaggacgaacagcaggaaaaacaggacgtagatattgctgaagaggatgaa
atggctgattttattgttgatgaagaccaagtagatgagcatggagctcctataaggagg
aaaaagcaaccaaggagcatgcaacaatcaggaattccatcatccgctctccaagaagct
catgaaatatttggcgatgtggaagaccttttgaagattcgcaagttggaagctgtggat
acctttggtgaagctggtgagaggagcctcgaagatcagtttgatccaagtgtactttct
gagaagtatatgacaggaagggatgagcagattcggaaaatagacattcccgagaggatt
cagatatatgaggaaagtactggtctcaccccattagatgagattagtatcgaagtggag
agcgagtggatatataatcaacttgtcagtggtctagttcctttctatggtaagagtgcg
gatgcgacggaaggatcagatgaactcaagggacatattgccaaatatctagaattacta
catgttcagaagttagatgttccattcattgcgatgtacaggaaggaggagatctcgtgc
ctattaaaggatccagacgatcctgaagcttatctccaagctgatcctatcgagaaacct
aagttgaagcgccacaaggtgctctggacaatccgggacctggatcagaagtggctgctt
cttctgaaaagaaagggtacactccagtcatactacgctaaacgtttcaaagaagaaatt
cgaagagtatatgatgagacaaaactgaatttaaatcaacaactctttgaatcaattacc
atgtcactcaaggctgcaaattcagaaagtgaggttgatgatgttgactcaaaatttagt
ttacatttccccccagatgaagttgtcttagatgaaggtacgtataaaagaccgaaaagg
aagtcacactacagcatttgcagtaaagctggcctatgggaggtagcaaataggttcagt
tatagctctgagcaattcggattgcagatttctctggagaaaatgaggatggatgagttg
gaggatgcaaaggaggcaccagaggaaatggcttctaattttatatgtatgatgtttgag
acgcctcaagctgtgttgaaaggcgctaggcacatggctgccgtggagataagctgtgaa
ccttcagtccggaaacatgtccgcagtatctttatggataatgcagtggtgtcaactagt
cctacacctgatggaaatgcagccattaattcatttcacatgttttctggagtgaagtgg
ttacgggacaagccgcttagcagatttgaggatgcgcagtggctgctgattcaaaaggct
gaagaggagaagcttctgcaggtcaccatcaagttaccagaagcagtccttgataagtta
ttaagcgactcgtgggattattatctgagtgatggtgtaagtaaatcttctcaattatgg
aacgagcagaggaagaagatacttcaagatgcatttcacaatattcttctaccatcaatg
gagaaagcagcaagatcctggttgactagtagatcaaaaacctggttgcttgaagaatat
ggaaaattattgtgggataaagtgtctgtggcaccatatcagcggaaagaaaataatatc
agttcaaatgaagaagctgcacccagggttttggcttgctgttggggccccggaaagcca
gctacaacttttgtgatgttggattcatcgggagaaattgaagatgtgttgaatgctgga
tgccttaatcttcgtggtcaaagtgtaaatgatctgcaacgtaagaaaaatgatcaacag
cgagtgcagaaatttatgatggaccaccaaccccatgttgttgttctaggagcagctaat
ttgtcttgtactcggctgaaggatgatatttatgagataattttcaagctggtggaggat
aatccaagagactctcaaaaaatcgatagtctgaatattgtttatggtgacgaatctctt
ccacgtctgtatgaaaattcccgtatatcagtcgatcagcttccttcgcaagaaggtatt
attcggcgtgctgtggctcttggacgttatcttcagaatccattagccatggctgcaact
ttatgtggaccgggtagggagatattatcttggaaacttaatcccctggagaaatttctc
actcctgatgagaagtatgggatggttgaacaagttatgatagacgcaacaaaccaagtg
ggtcttgatattaacttggcttcgagtcatgaatggttattttctcccttgcagttcatt
tctgggcttggagccagaaaagcagcttctctgcaaaggtccctagtaagagctggggcc
attttcactaggaaagacctgttgacatctcatggtcttggtaaaaaggtttttatcaat
gctgttggatttctgcgagtccggcgaagcggactgagttctagcagtagtcaatttatt
gatttgttagacaacacaagaatacatccagaatcctacagccttgcccaagattttgca
aaggatgtttactgtgaatccatgaataatgaagtgaatgatgatgacgatgatgatttg
ctagaaattgctattgagcatgttagagagaatcctcatttgttgacggctgtggatgtt
catgaatatgccgaacagaaaaaacgtcagaacaaaaaagaaacccttaatgatataaga
ttggagttgatggatgggtttcaggatcgtcgcaaatcacatgaagaacctaatcaggat
gatgaattttacatgattgctggagaggcggaagaaactctgtctgaaggaagaattgtt
caagcaacagttcgcagggttcaagaagatagagctatttgcaacctagattctggactg
acgggcatacttagcaaggaagattacactgatgattggagggatatcaatgaattgaat
gataaactgcacgagggtgatattttaacctgcagaatcaaatccattcagaagaaccgc
tatcaagtgtttttaacttgtagagaaagtgaaatgaggagctaccgtttccagaacaat
cagattgtggatccgtactttcacgaagagcgcaataccttacagcccaagcaggaaata
gctcataaagaggagttttcaaagaaactttttaagccaaggatgattgttcacccgcag
ttcaaaaatattacagctgatgaagcttttgagtttctccgggacaaagaagctggtgaa
agtgttattcgtcccagtttacgcgggccttcgtatttgactttaacgctgaaagtttgt
gatggggtttttgctaacaaggacatagttgaaggtcaaaaggaactcaaggacatcaca
agcttgctccaaatcggaaagaaattgaaaattggagaggatacatttgaggatcttgat
gaggtaatggatcgatacgtggacccattaatagctcatttgaagacaatgttaaattat
aggaaatttatgaagggcactaaaactgatattgacgagctccttagaatcgaaaaagct
aagattccaacaaaaattgtgtattgccttgggttatcttatgaccatcctggcacattc
atcctgacttacataagaagtgtgaatccacatcatgagtacattggtctctatccaaag
ggatttaagttccgtaaacgaatgttcggggacgtagaccgtcttgttgcatattttcag
aaacacattgatgatccacacagttctggtccaacaattcaatcagctgctgctatggtg
ccaatcagaagttttggttctggtgatgactggggtggttcaaacaataatgacggtgat
cggggtggaagccaatctatggatggagataaaacttttggaatgggttctagaggaggt
agaggtgactctcaaaatggtgggcgtgggcgtgggcgtgggcgtgggcgtgggcgcggg
cgcggtcggggtcgtgactcctatggtgatggcatgcctgacaaacatgactttgatcat
gactcacaaaagtggggttctgacaatgacaaaggtgttgactggggaggtggggcaagt
ggaagcgccggtggttggggtggtggtgatggcagtggaaatactggtagttggagtggt
gttggaggtggaagtaaaggtgatggtaattgcggaggtggtggaagtggaagtgctggt
ggttggggtggcggcggcagcggcagtggaaatactggtggttggggtgttgctggaggt
ggaattaaaagtggcagtaattggggaggtgggggaagtggaggtgctggtggtttgggt
ggaggaggtgaccgaactgaaagttctggtggttggggcggtggtggcagaggaggtgac
agaagcggaagtgctggtggtcagggtggtggtgatgacaatggaaataatggtggttgg
ggtggtgccggaggtggaagtaaaacagacggtaattggggaggtggtggaagtggaggt
gctggtggttggggtggcggaggaggtgaccaaagtggaagcgctggtggtggaaacaaa
agtgatggcaattggggtggtggcagatgtggaaatgccggtggttgggctggtgttgga
ggtggtggacgtggaggtgctggtggttggggtggtggcagaggaggtagccaaagggga
agtgctggtaattgtgaaatgggaggcgatggaaataaaactgatggcagttggggtggt
tgcagaagtggagacaccaagggttggggtgagggcgaaagtggaaccactatagttggt
ggtgatggaggaggtggccaaagtggaagcactggtggtagcactggtcatggtggcagt
ggaaaaactggtggctggggaggaggtggacgtgacaatgctgatggtggtgatcgtggt
gcttcaggtggtagtgggggtaatggtggtggaagtggaagggctggtacctggggaggt
ggtggaaatgacagcgatggtggcagtgcaaatgctggttcctggggtggtagcggaggt
ggaagtggaagtgctggtgcttggggagatgctggtgggacagatgctggtggcggaagt
gtaaggcctggtggttggggtggtggcagtaacaatagaagtactggtagcatgggtgaa
ggtattggaagtggtagcaccggtggttggggtggtgttggtagccatagaagtgctggt
ggtggagatagaggtagtggttggggaagtggtggtgacggaggaagcactgatggttgg
aaaggtggtggacatgacaatgctggtggtgattggggtggcagccatggtgctttaggg
gataccaaaggtggcggccgtggttggggtggcggccgtggttcttcagctggtggcaga
tatggtcgaagtggaggcactggtggtaggcgtggtggcagtagcagcagaagcactgat
ggcaggggtggaggtactggaagtggaagcaccggtggttggggtggtgacagaggaagc
actggcggttggaaaggagttggacaaaagaatactggtactggttggggtggtagccat
ggtgcttcaggtgataacaaaggtggaggtgctggttggggtggcggacatggttcttca
ggtggagatggaggtggaggtggtcaaagtggaggtgcaggtgcctggggagaaagtgga
ggtgcaaatgatggtggttgggttggtagcgcaagtggaggcaccggtgcttggggagtt
gccggtagttcaaatgctggcggtggcaatacaagtactggtggttggggcggcagcagc
agcactgctggcaggggtggaggtacaggaagtggaagcaccggtggttggggtagtggt
ggtggcagtgaaaccactgacagtggtggtggaaatgccggtggctggggagtcagcggt
actaagaaagaaggtggaggtgggtgggggcagggaagtgatgcagcaggtaattcagga
tggggcagtagcaagaagagctcagaagctggtaaaggaggctggtga
DBGET
integrated database retrieval system
