Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_0556
Help
Entry
PI2015_0556 CDS
T04164
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16091
Fe(3+) dicitrate transport protein
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pia00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pia02000
]
PI2015_0556
Transporters [BR:
pia02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PI2015_0556
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Med26_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ53878
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(608986..611142)
Genome browser
AA seq
718 aa
AA seq
DB search
MNPKFLVSTLATAVALSFSATAIAKDTSNKEQRFEQITVIGSQQAINDIPGSATFISEEE
LQKFQFTDISRVLASVPGVYVQEEDGYGLRPNIGMRGTGTGRNDKISVMEDGVLVAPAPY
SAPSAYYFPTMGRMESIEVLKGAASVKYGPRTTGGVLNLLSRSLPTEPNSSKGMVDAALG
SDGYYKGHAYFGKEKNNTAGLIEVFTYGADGFKELPVGNDNTGFEKTDLLLKFGHTFGQN
DAHNLELKIKYSDETSDETYMGLTDEDYKQSPYRRYAASQNDEMNTRHNAYQLNYAYRFG
DGYEFLATAYLNDFHRNWYKASKVSESYLEQYSAFEANPTSEGIEGIGIKANNRDYQAKG
IQSELHIPAGDHYVTVGVRYHEDEMDRFQWEDKYTLNQDLSLTLTEQGVPGSDSNRVDSA
EASTLFIQDEWTIDALVVSAGLRYEDITITREEWSKSDPTRSNGLTKDVSNDTEILVPSL
GATYTLNENVTLLAGIQKGYAPAAPGNADQEEEESVNIEFGSRFNMDGFSGEVIAFYSDY
DNMHGNCTAAVGCSDDNIGDQYNYGEVEVAGFEFSAARTFATDTAMFPVKLTYTYTDSEF
KNDFDSEIWGAVEKGDAMPYVPENQVALSLGAEFSAFVVNSQIRYVSDAHANLTQSGLNA
IDSRVVWDLAAKYLIDENQKVYLSVDNLFDKTYVANRSNGGIQPGKPRTVQMGYTYSF
NT seq
2157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccctaagtttttagtatctactttggcaactgcggttgctttgtcttttagtgct
actgcaatagcaaaagacaccagcaataaagaacaacgctttgaacaaattactgttatt
ggctctcagcaagcaattaacgatattcctggttcggctacgtttatttctgaagaagaa
cttcaaaaattccagtttaccgatatttctcgcgttttagcgtctgttccgggcgtttac
gtgcaagaagaagacggttatggccttcgtcctaatattggtatgcgcggcacaggtact
ggtcgtaacgataaaatatcagtaatggaagacggtgtattagttgcaccagcaccatat
tcagcaccttctgcttactacttccctactatgggtcgtatggagtctattgaagtatta
aaaggcgcagcctcagtcaagtacggcccgcgtactacaggtggtgttttaaacttactt
tcgcgcagcttaccaactgagccaaatagctcaaaaggtatggtagatgcagcccttggg
agcgacggttactacaaaggccacgcttactttggtaaagaaaaaaacaacacagcaggc
ttaattgaagtatttacttacggcgcagacggctttaaagagctgccagtaggcaatgac
aacaccggctttgaaaaaacagatttactattaaagtttggccatacgtttggtcaaaac
gatgcgcataatcttgagctaaaaattaagtactctgacgaaacatcagacgaaacatac
atgggcttaactgacgaagactataaacaaagtccttaccgtcgttatgctgcatcgcaa
aacgatgaaatgaatacgcgccacaacgcataccaacttaactatgcataccgttttggt
gatggctatgagtttttagctacggcttacttaaacgattttcatcgtaactggtataaa
gccagcaaagtaagcgaaagctaccttgagcaatacagtgcatttgaagcaaacccaaca
agcgaaggtattgaaggtattggtattaaagctaataaccgcgattaccaagccaaaggt
attcagtctgaattacatattccggcaggcgatcactatgtgactgttggcgtacgttac
cacgaagacgaaatggatcgttttcaatgggaagacaaatacacacttaatcaagaccta
agcttaacgcttacagagcaaggcgttccgggctctgatagcaaccgcgtagatagcgca
gaagcaagcaccttgtttattcaagatgagtggacaattgatgcattagtagtaagtgca
ggccttcgttatgaagacattactattacgcgtgaagagtggtctaaatcagatccaaca
cgcagcaacggtttaactaaagatgtgtcgaacgacactgaaattttagtcccgtcacta
ggtgctacttacacgcttaacgaaaacgtaacgctacttgcgggcattcaaaaaggttat
gcaccagctgcacctggtaatgctgaccaagaagaagaagaaagtgtaaacattgagttt
ggctctcgcttcaatatggatggctttagcggtgaagtaattgcgttttactcagactac
gacaacatgcacggtaactgtactgcagcggttggttgtagcgacgacaacattggcgac
caatacaactacggtgaagtagaagtagcgggctttgaatttagtgcagcacgtactttt
gcaactgatacagctatgttcccagttaaattaacgtacacctacacagactctgagttt
aaaaacgattttgattcagaaatttggggcgcggtagaaaaaggcgatgcaatgccttac
gtaccagaaaaccaagtagcgttatcgttaggtgctgagttttctgcgtttgtagttaac
agccaaatacgttacgtatctgatgcgcatgctaacttaacgcaatcgggcttaaacgca
attgatagccgcgtagtatgggatttagctgctaaatacttaatcgatgaaaatcaaaaa
gtatacctaagcgttgataacttgtttgataaaacatacgttgctaaccgttcaaacggt
ggcattcagccaggtaagccgcgtacggtacagatgggctacacttatagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system