Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_1992
Help
Entry
PI2015_1992 CDS
T04164
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pia00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pia02000
]
PI2015_1992
Transporters [BR:
pia02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PI2015_1992
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ55277
UniProt:
A0ABM6N4J1
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2221256..2224147)
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MLNNKVSKAVRLAIAFGAASTAAFSASSFAAEEENAEKVERIEVTGSRILREGAISPSPV
TVITGEDLVSTGALNIGEVLNKLPALATTYSLANSGRFIGTAGISLLDLRGMGSERTLVL
VDGKRHVSSAPGTSSVDTNTIPSSWIEKVEIITGGASAVYGADAVTGVVNFILKKDITGF
NVSATKGFADNSSYQNEKYTFSYGKDFAEGRGNAAFSVEYNTQNSLNALDNPWTATSYAS
MPYDVVTGQSRPEGQIDSEAYPDRIVVPNAGYYLISNQGTVWNPNTGGILGKFNGDSSLN
DVYTGAIDDGQFCGSAGCDFINLRQYSEIQPKFDRVNFNFKTNYDVTDELNAYFQAKYSK
TEGENIGQPFFRFFSGANMIQRDNAFLSADTAALMDEEGLSMIGVNKMYNDVGRRLEENT
RETTRFVAGIQGYITDDWSMDISLVHGKSEIERINGANVILANYANAIDAVFDDSGNIVC
RSETARADGCVAANIMGDGAISQEAIDYVTTTSIGTSEIKQTVFNATFSNSAIYELPAGM
VGFAGGVEYRDETSVTIEDAFAKTGATFFNALGETDGGYDVTEAFFELSVPLIEDVFLID
TLVFDTAVRYADYSTIGDATSWKLGLDWTITPELRARFTVSEAMRAPNIDELFSGQSQSF
ANVDDKCKVSELDQLSDAGRAIRAANCAALGVPADFDSSYDSATLETLVGGNPDLQPEES
RSITAGIVYQPEWLEGFSVTADYWEIDIDDTISGIGFQTIIDRCVDSPTGIDNQFCGLIT
RDPNTSEITLLKGFALNIARSLNSGVDFEVGYDFDALGGSFGTSFIGTYLIEAKDYPFSA
EPENYTDYEGVLGNETWQGSISVDYTYENLVVDFSTRFINGVELYNPTQIEANPNPSNEM
RYGSYFITDASVAYNFDSGVGFKLGVDNLFNRGLPGSTTGTGAGSAIYDNIGRFAYLQAT
YKF
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaacaataaagtttcaaaagctgttcgtttagcgatagcttttggtgcagcttct
acagctgctttctcagcaagttcatttgctgcagaagaagaaaatgcagaaaaagtagaa
cgcattgaagtaacaggttcacgtatattacgtgaaggcgctatttcaccatcgccggta
accgtaattacgggcgaagacttagttagcactggtgctttgaatatcggtgaagtacta
aacaaactaccagccttagcaactacctattcacttgcaaactcaggccgttttatcggt
actgctggtatcagtttattagatttacgtggtatgggcagtgaacgtacattagtacta
gttgacggtaaacgtcatgtttctagtgccccaggaacatcttctgttgatacgaatacc
attccaagctcttggattgaaaaagttgagattattactggtggtgcgtctgcggtatat
ggtgccgatgcggtaacgggtgtagttaacttcatattaaagaaagatattactggtttt
aatgtatctgcaacgaaaggttttgcagataatagttcttatcaaaatgaaaaatatact
ttttcttacggtaaagattttgctgaagggcgtggtaatgctgcattctctgtagaatat
aatacacaaaactcattgaatgctttagacaacccttggactgcaacatcgtatgcatcc
atgccatatgatgttgtgacaggtcaatctcgcccagaaggtcaaattgatagcgaagct
tatccggatagaatagtagtccctaatgctggttattatttaatttcaaatcaaggaact
gtttggaatccaaatacaggtggtattttaggtaaatttaatggtgatagctcattaaac
gatgtttatacaggtgctattgatgatggccaattctgtggaagcgctggttgtgatttc
attaacttacgccaatattcagaaatacaacctaagtttgatcgcgttaattttaacttt
aaaacgaattatgacgtaacagatgaattaaacgcatattttcaagctaaatattctaaa
acagaaggtgaaaatataggccaacctttcttccgcttctttagtggcgcaaatatgata
cagcgagataatgcatttttatcagctgacactgcagcattgatggatgaagaagggcta
tcaatgatcggtgtaaacaaaatgtacaacgatgttggtcgccgtttagaagaaaatact
cgtgaaacaactcggtttgtagcaggtatccaaggctatattactgatgattggtctatg
gatatctctttagttcatggtaagtcagagatagaacgtattaatggcgcaaatgttatt
ttggctaattatgctaacgctattgatgctgtgtttgatgacagtggcaatatcgtttgt
cgtagtgaaactgctcgtgcagatggttgtgttgcagcaaatataatgggtgacggcgca
attagccaagaagcaattgactatgtgacaacaacatcaattggtacatcagaaatcaag
caaactgtattcaatgcaacatttagtaattcggcaatttatgaactaccagcgggtatg
gttggttttgctggtggtgttgagtaccgtgatgaaacaagtgtgacgattgaagatgct
tttgctaaaacaggggctacattctttaatgcacttggtgaaacggatggtggttatgat
gtaacagaagcgttttttgaactatcagtaccattaattgaagatgtattcttaatcgat
actttagtgtttgacacagctgtacgttatgctgattattcaactataggtgatgctaca
agctggaaattaggcttagattggactattacgcctgaattacgtgctcgttttacagta
tctgaagcgatgcgtgcgccaaacattgatgaactcttttctggacaaagtcagtcattt
gccaatgtagatgataaatgtaaagtatctgagcttgatcagttgagtgatgcaggccga
gctattcgtgcagctaactgtgcagcgcttggtgtacctgctgattttgactcaagttat
gatagcgcaacgcttgagactttagttggtggtaatccagacctacagccagaagaatct
agatcaattacggcaggtattgtttaccagccagaatggttagaaggctttagtgtaaca
gccgattactgggaaattgatattgatgacacaattagtggtattgggtttcaaactatc
atagaccgttgtgtagattcaccaactggtattgacaatcaattctgtggtcttataact
cgtgatccaaatacaagtgaaattaccttattaaaaggttttgcacttaatatcgcacgc
agtcttaattctggtgtagattttgaggtgggttatgattttgatgctctaggtggtagt
tttggtactagctttattggtacttatttgattgaagcaaaggattatcctttctcagct
gagcctgaaaattacacagactatgaaggtgtattaggtaatgaaacatggcagggtagt
atttctgttgattatacttatgaaaacctggttgtagattttagcacacgctttattaac
ggtgttgagttatacaatcctacacaaatagaagcaaaccctaacccgtcaaatgaaatg
cgttacggttcatattttataactgatgcttcagtcgcttataactttgacagtggtgtt
ggctttaagttaggtgttgataacttattcaatcgtggcttaccaggaagtacgactggc
acaggtgcaggctcagcgatttacgataatattggtcgatttgcctacctacaagctact
tacaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
