Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_2346
Help
Entry
PI2015_2346 CDS
T04164
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
Pathway
pia02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pia00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PI2015_2346
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
K319L-like_PKD
SprB
TraQ_transposon
ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ55622
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2611931..2617018)
Genome browser
AA seq
1695 aa
AA seq
DB search
MKLPSQGFGLLLMLFFLVACDRTSVSSDTSKEFTIELVRAPLSVEVGQSAVIEVQLQQNG
QNIDGASYLWMEESVLPLGLVSNSNQGFFVAPSNIEQASIRVTASFSGMSLSKDITIDIT
SPVDVIGDVESLEVTGPTEVSSEHKVILNAAYTVNGLVDSDKEISWELLSEQTVSWQQID
NRVEVTAPNVFQDTELFFSAQTEDASGLLFDTIVVLTVKPRGISFVNQINTGTGKVDANS
QSSHTVKQSTSGQTVHLTAKAEKSGGGGSFTYEWQQVSGTTVDLIDSASQTTSFIAPKQP
GKLEFKVTATEVSSGKSTSQTQLVEIKPGPLQPQQGAKHQVYNGHGSVSLTAEVNGGTGP
FTYKWTQTKGPDAMISSVNGKTTEVTPPEVTTDTDFQWVVQVTDADGHQVSITHDIQVKA
TAPLSVQIIKPKGCTTNCLVEEGDFVYPAATITSTLDRVSVLWESSDVAFTDATTEHPVF
VVPNVNSETGIRVNVTVTDGTNTVSDSLLYTAKPVFKLAPHQNQIGSHLATGPGVSTAAP
VQVESGKTFKPSIDVHVPPLDNGASLSYLWTVIEPNPKPNDLIIAGDNTAQPIINAPSVS
SNTNIKLQATITYTSPEGKVITKTTDTQFQAVPVNAPSKPTLALSMAGHESVYSGHVVHP
KTTVMNASGPLNYQWAQLSGPTITIADDKTDSPSFTAPSVSGHQDIVIEVEVSDGSALAK
AQMTVTVDPVVAPPKLPLMVTASNDATVTANETVKPRVSLGNTFGSLSYLWVETTSIGIS
LTDPNTATPSFIAPNGPATVTLEVIVNDTANGSATDSVTYHVNNVLQVTAGAATRTLAEG
NTLNLLASAKDADGAVSYAWTLADAGTTSLTKTSIINGSSSNASLELPNVDADTTIKLQV
TATDSVNTATATVAVTIQDRHMSVDLGADFDLSPSQTGYLNANVAGGKPPYTYSWTDDTN
AALSSISDANPSFIAPSLTHEVELNYNLTVIDSLGNTAKDSVVVTVPALPLLVSAGNDFS
IAESLSDVQLHGSVQHANEPVYTWTQISGSDVTPLKNANTLNASFTSPAKAAGTSEDLVF
ELSVTSNGRVKKDQVTVTVQGQPDISAHVTPVLYVNEGQIVSLVGTVIDADSSSPATVQS
LTWSQLPTAASTITLSNSSVKGDVRSLTSTFIAPAYGNENQYIFTFAAQGTGNKVSQTAM
VEVLAAPSISAGADLRVRAGQTVILNATGSSLASYQWTQTAGIPIVALSGANQYNASFTA
PDVTSDTTLTFTVVGMPIVGGASQQDMINVVVYEPTIVVMPKSATDITLTEGDPKLDVTV
DFISSVGSAPITPTTISWTVTPSTAPADTFAPLNAATISINPQTGTAGTYKLDIVAGDTP
DHYQAGNQSYTVLIKPAAPATLPLVDSRKLTAALKSINADLTSLNGIDKLVSLHAPVITG
GTPPYTYSWTPPAKGVVLSGETTDNPTATISKPASECTYIGGDITLTVTDTKGQTVSATL
PIKNSRGGDAVNPTPTSPVSCDVCRGPKFICERSHKTAVCGSDAAGNPESLASAEFYKYQ
YCINDVENLIDGSRYVTRRCATAETVNKELESRAKNSAWLGKLISVGTDPAVGCQQYNVH
DLQDAHFSCSFICKGKVGGGFESGGARGCNIETVPVVNHNSIQLLESDYPVPTVPATIPG
TGSPGACPNGIQPAM
NT seq
5088 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattgcctagtcaaggttttggtttacttttaatgctattctttctagtggcctgt
gaccgaacctcagtgtcttcagatacaagtaaagaatttacaattgagttggtccgagcg
cctttatccgtagaagtgggtcaatctgcagtgattgaggttcagttacaacaaaatgga
caaaatattgatggcgcgagttacctttggatggaagagagtgtattaccacttggctta
gttagtaatagtaaccaagggttctttgtagcaccgtcaaatattgagcaagctagcatt
cgtgtaacagctagtttctcaggtatgtcgctaagcaaggatatcaccatagacattacc
tcaccggttgacgttattggagatgttgagtcattagaggttacaggcccaacggaagtt
tcttctgaacacaaggtcattttaaatgcggcttatacggttaatgggttggttgatagt
gacaaggagataagttgggaactattaagtgaacaaacagtatcttggcaacaaatagat
aatcgagtcgaggttacagcacctaatgtttttcaggacacagagttatttttctcagca
caaactgaagacgccagcggcttgttgtttgatacgattgtggttctcacggttaagcca
aggggcatcagctttgttaaccagattaatactggaacgggcaaagttgatgcaaactct
caatcgtcacatacagttaagcaaagcacttcagggcaaacagtccacttaacagcaaaa
gccgaaaagtctggtggcggtggaagcttcacctatgaatggcagcaagtgagcggtacc
acagtagacttaatagacagtgccagccaaaccacatctttcattgcgcccaagcagccg
ggaaaactcgaatttaaagtaacagctacggaagtcagtagcgggaaaagcacatcacag
acacagctagtagaaataaagcctggacctttacagcctcagcaaggtgctaagcatcaa
gtatacaatggtcatggttctgttagtttgactgccgaggttaatggtggcacggggcct
tttacctataaatggacgcaaacaaaaggtccagacgctatgataagtagtgttaatgga
aaaactaccgaggttacgccgccagaggttacaaccgataccgattttcaatgggtagta
caagtaactgatgccgatggccatcaagtgagtattacacacgatattcaagtgaaggca
actgcgcctttgtcggtacagattattaaaccaaagggctgcaccaccaactgtttagtt
gaagaaggggattttgtgtatcctgcagcaactatcaccagtacgcttgatcgtgtatca
gtgttgtgggagagtagcgatgttgcctttacagatgcgacaacagagcaccctgtgttt
gttgtgcctaatgtcaattcagaaacaggtattagagtcaatgttactgtgacagatggc
accaatactgtttccgattcgctactttataccgctaaacctgtatttaagctggcacct
catcaaaaccaaataggtagtcacttggcaacaggccctggagtcagtacagcagctcct
gttcaggtagaatccggcaaaacttttaaaccaagcatcgatgtccatgtccccccttta
gataacggggcatctctttcttacctatggacggtgattgagccaaatccaaaacctaat
gacttgataattgctggtgacaatacagctcagcccatcattaatgcgccatcagtaagc
agtaataccaacattaagcttcaggcaaccattacctatacctcacctgaaggtaaggtg
attactaaaactactgatactcagtttcaggcagtacctgttaatgcgccaagcaaaccc
acacttgcgctcagtatggctgggcatgaaagcgtatacagtggtcatgtggtgcaccca
aaaacgacagtgatgaacgccagtggtcccttaaactatcagtgggcgcaattaagtggc
ccaaccattacgattgcagatgataaaacggattcgccaagtttcaccgctcctagtgtg
agcggccatcaagatattgtaatagaagtcgaagtgagcgatgggtcagccttagcaaaa
gcacaaatgactgtgacagttgatccagtagtcgcaccaccgaagttgccgttaatggta
accgcctctaatgatgcgaccgtaactgcaaatgagacagtgaagccgagagtcagtctt
ggcaacacctttggttcactcagttatttatgggtagaaaccactagtataggcattagc
cttacagatccaaacaccgctactccaagctttatcgcaccgaatggccctgctactgtg
acccttgaagtgatagtaaatgatacggctaacggctctgctaccgatagtgtcacttac
catgtgaacaatgttttgcaagtaacagctggtgcagcaacacgcacattggctgaaggt
aataccctcaatttattggcatcggctaaagatgccgatggtgcggtaagctatgcatgg
actcttgctgatgccggcacaacatcactgacgaaaacaagcattatcaacggatcctca
tcgaatgcaagcttagagcttcccaatgtggatgctgatactacgatcaaactgcaagtt
acggcaacggattcggtcaatacggctaccgccacggttgcagtgaccattcaagatcgc
cacatgagtgtcgacttgggcgccgactttgatttatcaccctcgcaaacggggtactta
aatgcgaatgttgcaggagggaaaccgccctacacctatagttggacagatgatacgaat
gccgcactaagcagtatcagtgatgcgaacccatcatttatcgcgccgtctctgacccat
gaagtagagcttaactacaacctgacggtaatcgacagtttgggtaatacggctaaagat
agcgttgttgtgaccgtacccgctttacctttactggtcagcgctggtaatgatttttct
attgctgaaagtttaagtgatgtgcagttgcacggcagtgtgcaacatgccaatgaacca
gtttatacttggacgcagatttcaggctcagatgtcacccctttaaaaaatgcaaatact
ttgaatgcatcatttacctctccagctaaagctgcgggcaccagcgaagacctggtattt
gaactctcggttactagtaatggtcgagtcaaaaaagaccaagtaacagttacagtgcaa
ggccagcccgatatatcggcacatgttactcctgttctttatgtcaatgaaggacaaatc
gttagtttagtcggtacggtgatcgatgcagactcaagcagccctgcaacggtgcaaagt
ttaacgtggagccaacttcctacggcggccagtaccattacgctcagcaatagcagcgtc
aagggcgatgttcgcagtttaaccagtacctttatcgctccagcctatggaaacgagaac
caatatatcttcacttttgccgcacaaggaacaggtaataaagtatcacaaacggcgatg
gtggaagtattggctgcgcctagtattagtgctggtgctgatctgcgcgtgcgcgcaggg
caaacagttattctaaatgcaacgggcagcagtctcgccagttatcaatggacgcaaacg
gcaggaataccaatagttgcgctaagtggtgccaatcaatataacgcctcatttacggca
cctgatgtgacgagcgatacaacgctcacttttactgtggtcgggatgccaatagtaggt
ggtgcttcgcagcaagacatgataaatgtcgtggtttatgaaccgactattgttgtaatg
ccaaaaagtgcaacagacataaccttaactgaaggtgatccaaagttagatgttactgta
gattttataagcagcgtaggttctgcaccgataacaccaacgactatttcgtggaccgtt
acgccgagtaccgcgccagccgataccttcgctcctctgaatgcagctaccattagcatc
aacccgcaaacaggcactgctggtacctataaactcgacatagtagctggtgatacgcca
gatcattatcaggctggcaaccaaagttatacagtgctgatcaaaccagcagctccggca
actttaccgttagtcgacagtcgcaaactgacagccgcacttaaaagcataaacgcggat
ctgacttcgctaaatggtatcgataagttagtaagtttgcatgcaccggtaattactggt
ggcacaccaccctacacctatagctggacaccaccagccaaaggcgtggtgctaagtggt
gaaacaaccgacaacccaacggcaaccattagcaaacctgcgagtgaatgcacctatatc
ggaggggatattacgctgacggtcactgatactaaaggtcaaacggtcagcgccaccttg
cctataaaaaacagccgtggaggagatgcggttaacccaacaccgacatcaccagtatca
tgcgatgtgtgccgtggaccgaaatttatctgcgagcgctcgcacaagactgctgtttgt
ggctctgatgctgctggtaatcctgaatcattggcttccgctgagttttacaaatatcaa
tattgcatcaatgatgtcgaaaacctcattgatggatcacgttatgtgacacgtcgatgt
gccaccgctgaaacagtgaataaagagttggagagtcgggcaaaaaactctgcatggtta
ggtaaactcatttccgttggcactgaccccgctgttggctgtcagcagtataacgtgcac
gatttacaagatgcgcactttagttgctccttcatttgtaaaggtaaagtcggtggtggc
ttcgaatcaggtggcgctcgcgggtgtaatattgaaaccgtaccggtagtcaaccacaat
tccatacaattactagagagcgattacccagtgccaacagtgccggccactattcctggc
acaggctcaccaggtgcttgtcctaacggcattcaacctgctatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system